MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017310	GGC	2	6	51270	51275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151911
1002	NC_017310	GAA	2	6	51305	51310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151911
1003	NC_017310	CCT	2	6	51338	51343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151911
1004	NC_017310	GA	3	6	51391	51396	50 %	0 %	50 %	0 %	387151911
1005	NC_017310	GAC	2	6	51406	51411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151911
1006	NC_017310	GGGAA	2	10	51532	51541	40 %	0 %	60 %	0 %	387151912
1007	NC_017310	GAG	2	6	51570	51575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151912
1008	NC_017310	CAG	2	6	51579	51584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1009	NC_017310	GCG	2	6	51630	51635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1010	NC_017310	ACC	2	6	51647	51652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151912
1011	NC_017310	AGT	2	6	51653	51658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151912
1012	NC_017310	TTC	2	6	51711	51716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151912
1013	NC_017310	GCTG	2	8	51719	51726	0 %	25 %	50 %	25 %	387151912
1014	NC_017310	TCG	2	6	51787	51792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1015	NC_017310	CGA	2	6	52013	52018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1016	NC_017310	GTG	2	6	52021	52026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151912
1017	NC_017310	GCG	2	6	52057	52062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1018	NC_017310	GCG	2	6	52077	52082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1019	NC_017310	CAC	2	6	52083	52088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151912
1020	NC_017310	ATC	2	6	52156	52161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151912
1021	NC_017310	CGG	2	6	52169	52174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1022	NC_017310	GCG	2	6	52181	52186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1023	NC_017310	CCAGCG	2	12	52241	52252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387151912
1024	NC_017310	GAA	2	6	52299	52304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151912
1025	NC_017310	GGT	2	6	52359	52364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151912
1026	NC_017310	AGA	2	6	52427	52432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151912
1027	NC_017310	ATGG	2	8	52455	52462	25 %	25 %	50 %	0 %	387151912
1028	NC_017310	GGC	2	6	52467	52472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1029	NC_017310	GC	3	6	52516	52521	0 %	0 %	50 %	50 %	387151912
1030	NC_017310	TGC	2	6	52532	52537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1031	NC_017310	TCG	2	6	52546	52551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1032	NC_017310	CTT	2	6	52560	52565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151912
1033	NC_017310	CGG	2	6	52679	52684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151912
1034	NC_017310	CGT	2	6	52766	52771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1035	NC_017310	AGGA	2	8	52780	52787	50 %	0 %	50 %	0 %	387151912
1036	NC_017310	CGA	2	6	52868	52873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151912
1037	NC_017310	GAT	2	6	53642	53647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1038	NC_017310	CGC	2	6	53660	53665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151913
1039	NC_017310	ACC	2	6	53703	53708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151913
1040	NC_017310	TCA	2	6	53827	53832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151913
1041	NC_017310	GATG	2	8	53848	53855	25 %	25 %	50 %	0 %	387151913
1042	NC_017310	GGC	2	6	53912	53917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1043	NC_017310	AGA	2	6	53943	53948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151913
1044	NC_017310	AGC	3	9	53967	53975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1045	NC_017310	ATCC	2	8	53976	53983	25 %	25 %	0 %	50 %	387151913
1046	NC_017310	GCG	2	6	54018	54023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1047	NC_017310	GCG	2	6	54066	54071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1048	NC_017310	ATG	2	6	54072	54077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1049	NC_017310	GAC	2	6	54083	54088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1050	NC_017310	GGGC	2	8	54118	54125	0 %	0 %	75 %	25 %	387151913
1051	NC_017310	GGC	2	6	54127	54132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1052	NC_017310	CCA	2	6	54163	54168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151913
1053	NC_017310	GAT	2	6	54224	54229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1054	NC_017310	GCC	2	6	54230	54235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151913
1055	NC_017310	GAT	2	6	54239	54244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1056	NC_017310	GCA	2	6	54274	54279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1057	NC_017310	GGGC	2	8	54280	54287	0 %	0 %	75 %	25 %	387151913
1058	NC_017310	GCG	2	6	54308	54313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1059	NC_017310	TC	3	6	54316	54321	0 %	50 %	0 %	50 %	387151913
1060	NC_017310	AGC	2	6	54375	54380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1061	NC_017310	CGC	2	6	54391	54396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151913
1062	NC_017310	G	6	6	54458	54463	0 %	0 %	100 %	0 %	387151913
1063	NC_017310	GAC	2	6	54467	54472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1064	NC_017310	CCA	2	6	54532	54537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151913
1065	NC_017310	CGG	3	9	54562	54570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1066	NC_017310	GAA	2	6	54602	54607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151913
1067	NC_017310	ACC	2	6	54618	54623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151913
1068	NC_017310	C	6	6	54696	54701	0 %	0 %	0 %	100 %	387151913
1069	NC_017310	CAG	2	6	54743	54748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151913
1070	NC_017310	CCA	2	6	54787	54792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151913
1071	NC_017310	TGA	2	6	54811	54816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1072	NC_017310	GCG	2	6	54822	54827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151913
1073	NC_017310	CACC	2	8	54838	54845	25 %	0 %	0 %	75 %	387151913
1074	NC_017310	ATG	2	6	54852	54857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151913
1075	NC_017310	CGT	2	6	54963	54968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151914
1076	NC_017310	GCA	2	6	55023	55028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151914
1077	NC_017310	GGGCAA	2	12	55048	55059	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387151914
1078	NC_017310	CGAA	2	8	55106	55113	50 %	0 %	25 %	25 %	387151914
1079	NC_017310	TGCCA	2	10	55133	55142	20 %	20 %	20 %	40 %	387151914
1080	NC_017310	AAG	2	6	55151	55156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151914
1081	NC_017310	GCC	2	6	55163	55168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151914
1082	NC_017310	CGTGA	2	10	55186	55195	20 %	20 %	40 %	20 %	387151914
1083	NC_017310	GC	3	6	55250	55255	0 %	0 %	50 %	50 %	387151914
1084	NC_017310	TCC	2	6	55310	55315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151914
1085	NC_017310	CCA	2	6	55365	55370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151914
1086	NC_017310	TGCC	2	8	55380	55387	0 %	25 %	25 %	50 %	387151914
1087	NC_017310	TGA	2	6	55395	55400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151914
1088	NC_017310	AGA	2	6	55445	55450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151914
1089	NC_017310	GCC	2	6	55554	55559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151915
1090	NC_017310	GC	3	6	55603	55608	0 %	0 %	50 %	50 %	387151915
1091	NC_017310	GCG	2	6	55740	55745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151915
1092	NC_017310	TGCA	2	8	55749	55756	25 %	25 %	25 %	25 %	387151915
1093	NC_017310	CGG	2	6	55770	55775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151915
1094	NC_017310	GGGGT	2	10	55962	55971	0 %	20 %	80 %	0 %	387151915
1095	NC_017310	CGT	2	6	56041	56046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151915
1096	NC_017310	TCA	2	6	56053	56058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151915
1097	NC_017310	GAAGT	2	10	56102	56111	40 %	20 %	40 %	0 %	387151915
1098	NC_017310	CGG	2	6	56122	56127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151915
1099	NC_017310	CTG	2	6	56179	56184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151915
1100	NC_017310	GTG	2	6	56256	56261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151915
1101	NC_017310	CTG	2	6	56294	56299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151915
1102	NC_017310	AG	3	6	56322	56327	50 %	0 %	50 %	0 %	387151915
1103	NC_017310	GAC	2	6	56342	56347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151915
1104	NC_017310	CTG	2	6	56452	56457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151915
1105	NC_017310	GCG	2	6	56467	56472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151915
1106	NC_017310	GCG	2	6	56512	56517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151915
1107	NC_017310	GAC	2	6	57113	57118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151916
1108	NC_017310	CCG	2	6	57131	57136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151916
1109	NC_017310	GCATCC	2	12	57211	57222	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387151916
1110	NC_017310	CTG	2	6	57328	57333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151916
1111	NC_017310	GGC	2	6	57356	57361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151916
1112	NC_017310	CAC	2	6	57395	57400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151916
1113	NC_017310	CGCA	2	8	57416	57423	25 %	0 %	25 %	50 %	387151916
1114	NC_017310	CAG	3	9	57441	57449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151916
1115	NC_017310	ATG	2	6	57456	57461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151916
1116	NC_017310	GCG	2	6	57534	57539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151916
1117	NC_017310	GAC	2	6	57540	57545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151916
1118	NC_017310	GCAGG	2	10	57635	57644	20 %	0 %	60 %	20 %	387151916
1119	NC_017310	GTG	2	6	57666	57671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151916
1120	NC_017310	GCT	2	6	57674	57679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151916
1121	NC_017310	GA	3	6	57748	57753	50 %	0 %	50 %	0 %	387151916
1122	NC_017310	GCC	2	6	57855	57860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151916
1123	NC_017310	TCT	2	6	57861	57866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151916
1124	NC_017310	CCG	2	6	57900	57905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151916
1125	NC_017310	TGA	2	6	57913	57918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151916
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1499	NC_017310	TG	3	6	78855	78860	0 %	50 %	50 %	0 %	387151931
1500	NC_017310	GCA	2	6	78869	78874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151931

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