MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017310	GCC	2	6	25844	25849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151895
502	NC_017310	CGG	2	6	25941	25946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151895
503	NC_017310	TGG	2	6	25971	25976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151895
504	NC_017310	AAG	2	6	25981	25986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151895
505	NC_017310	TC	3	6	26031	26036	0 %	50 %	0 %	50 %	387151895
506	NC_017310	GCA	2	6	26052	26057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
507	NC_017310	CAG	2	6	26071	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
508	NC_017310	TCG	2	6	26093	26098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151895
509	NC_017310	AAC	2	6	26183	26188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151895
510	NC_017310	GAG	2	6	26197	26202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151895
511	NC_017310	TGC	2	6	26215	26220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151895
512	NC_017310	CCA	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151895
513	NC_017310	TGA	2	6	26313	26318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151895
514	NC_017310	CGA	2	6	26349	26354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
515	NC_017310	GAT	2	6	26389	26394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151895
516	NC_017310	CGT	2	6	26412	26417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151895
517	NC_017310	GGC	2	6	26421	26426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151895
518	NC_017310	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	387151895
519	NC_017310	GCA	2	6	26490	26495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
520	NC_017310	GAG	2	6	26567	26572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151895
521	NC_017310	ATG	2	6	26582	26587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151895
522	NC_017310	CGG	2	6	26598	26603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151895
523	NC_017310	CGG	2	6	26706	26711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151895
524	NC_017310	CGT	2	6	26718	26723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151895
525	NC_017310	GCA	2	6	26754	26759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
526	NC_017310	GCA	2	6	26766	26771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151895
527	NC_017310	CGC	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151896
528	NC_017310	GTGCC	2	10	26973	26982	0 %	20 %	40 %	40 %	387151896
529	NC_017310	GAT	2	6	27023	27028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151896
530	NC_017310	GCCCG	2	10	27119	27128	0 %	0 %	40 %	60 %	387151896
531	NC_017310	CGA	2	6	27355	27360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151896
532	NC_017310	GGGCCG	2	12	27377	27388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
533	NC_017310	CCT	2	6	27448	27453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151896
534	NC_017310	GGC	2	6	27467	27472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
535	NC_017310	GTC	2	6	27479	27484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151896
536	NC_017310	GCG	2	6	27570	27575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
537	NC_017310	CAG	2	6	27653	27658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151896
538	NC_017310	GC	4	8	27695	27702	0 %	0 %	50 %	50 %	387151896
539	NC_017310	CGG	2	6	27738	27743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
540	NC_017310	CAG	2	6	27860	27865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151896
541	NC_017310	TCG	2	6	27888	27893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151896
542	NC_017310	CAGG	2	8	27928	27935	25 %	0 %	50 %	25 %	387151896
543	NC_017310	ACC	2	6	27942	27947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151896
544	NC_017310	GCC	2	6	27987	27992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151896
545	NC_017310	CGT	2	6	27999	28004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151896
546	NC_017310	CCA	2	6	28041	28046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151896
547	NC_017310	GC	5	10	28084	28093	0 %	0 %	50 %	50 %	387151896
548	NC_017310	GGA	2	6	28134	28139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151896
549	NC_017310	CCG	2	6	28176	28181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151896
550	NC_017310	GCC	2	6	28193	28198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151896
551	NC_017310	CTT	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151896
552	NC_017310	GTC	2	6	28325	28330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151896
553	NC_017310	CGG	2	6	28401	28406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
554	NC_017310	CGAA	2	8	28681	28688	50 %	0 %	25 %	25 %	387151896
555	NC_017310	CAG	2	6	28757	28762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151896
556	NC_017310	GCCA	2	8	28775	28782	25 %	0 %	25 %	50 %	387151896
557	NC_017310	GGC	2	6	28790	28795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
558	NC_017310	GGC	2	6	28825	28830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151896
559	NC_017310	CAT	2	6	29452	29457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151897
560	NC_017310	CAT	2	6	29482	29487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151897
561	NC_017310	CCG	2	6	29517	29522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151897
562	NC_017310	CAA	2	6	29524	29529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151897
563	NC_017310	GAT	2	6	29572	29577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151897
564	NC_017310	CGC	2	6	29658	29663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151897
565	NC_017310	CACTG	2	10	29761	29770	20 %	20 %	20 %	40 %	387151897
566	NC_017310	GCC	2	6	29792	29797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151897
567	NC_017310	GAAG	2	8	29818	29825	50 %	0 %	50 %	0 %	387151897
568	NC_017310	CCA	2	6	29847	29852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151897
569	NC_017310	GGC	2	6	29870	29875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151897
570	NC_017310	GCG	2	6	29880	29885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151897
571	NC_017310	ATG	2	6	29894	29899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151897
572	NC_017310	GGC	2	6	29900	29905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151897
573	NC_017310	GGC	2	6	29909	29914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151897
574	NC_017310	ATG	2	6	29927	29932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151897
575	NC_017310	CGC	2	6	30577	30582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151898
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581	NC_017310	AG	3	6	30653	30658	50 %	0 %	50 %	0 %	387151898
582	NC_017310	AGCC	2	8	30714	30721	25 %	0 %	25 %	50 %	387151898
583	NC_017310	TGG	2	6	30826	30831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151898
584	NC_017310	CCGGC	2	10	30844	30853	0 %	0 %	40 %	60 %	387151898
585	NC_017310	GAG	2	6	30854	30859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151898
586	NC_017310	CAC	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151898
587	NC_017310	CAT	2	6	30959	30964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151898
588	NC_017310	GCC	2	6	30974	30979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151898
589	NC_017310	GTC	2	6	31010	31015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151898
590	NC_017310	TGA	2	6	31030	31035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151898
591	NC_017310	AGC	3	9	31056	31064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151898
592	NC_017310	GCC	2	6	31067	31072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151898
593	NC_017310	CAA	2	6	31081	31086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151898
594	NC_017310	CCA	2	6	31126	31131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151898
595	NC_017310	GCC	2	6	31142	31147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151898
596	NC_017310	ATGCGC	2	12	31196	31207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387151898
597	NC_017310	AGC	2	6	31277	31282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151898
598	NC_017310	AG	3	6	31335	31340	50 %	0 %	50 %	0 %	387151898
599	NC_017310	GTG	2	6	31407	31412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151898
600	NC_017310	CGCGT	2	10	31430	31439	0 %	20 %	40 %	40 %	387151898
601	NC_017310	G	7	7	31455	31461	0 %	0 %	100 %	0 %	387151898
602	NC_017310	GCC	2	6	31515	31520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151898
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604	NC_017310	GGT	2	6	31634	31639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151898
605	NC_017310	CTG	2	6	31658	31663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151898
606	NC_017310	CGG	3	9	31672	31680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151898
607	NC_017310	GC	3	6	31769	31774	0 %	0 %	50 %	50 %	387151898
608	NC_017310	AGG	2	6	31780	31785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151898
609	NC_017310	CAG	2	6	31802	31807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151898
610	NC_017310	GAA	2	6	31817	31822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151898
611	NC_017310	AAG	2	6	31850	31855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151898
612	NC_017310	ATG	2	6	31875	31880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151898
613	NC_017310	CCA	2	6	32619	32624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151899
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615	NC_017310	ACGTG	2	10	32680	32689	20 %	20 %	40 %	20 %	387151899
616	NC_017310	CGAAC	2	10	32692	32701	40 %	0 %	20 %	40 %	387151899
617	NC_017310	GCTG	2	8	32748	32755	0 %	25 %	50 %	25 %	387151899
618	NC_017310	GC	3	6	32797	32802	0 %	0 %	50 %	50 %	387151899
619	NC_017310	CGG	2	6	32826	32831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151899
620	NC_017310	CCT	2	6	32844	32849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151899
621	NC_017310	GA	3	6	32859	32864	50 %	0 %	50 %	0 %	387151899
622	NC_017310	TGCT	2	8	32888	32895	0 %	50 %	25 %	25 %	387151899
623	NC_017310	TGA	2	6	32931	32936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151899
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626	NC_017310	GGC	2	6	33169	33174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151899
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631	NC_017310	GCC	2	6	33409	33414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151899
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