MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017310	TCG	2	6	253793	253798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5003	NC_017310	GGAT	2	8	253822	253829	25 %	25 %	50 %	0 %	387152068
5004	NC_017310	GGC	2	6	253881	253886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5005	NC_017310	CG	4	8	253938	253945	0 %	0 %	50 %	50 %	387152068
5006	NC_017310	CGTGG	2	10	253975	253984	0 %	20 %	60 %	20 %	387152068
5007	NC_017310	GCC	2	6	253996	254001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152068
5008	NC_017310	GGC	2	6	254007	254012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5009	NC_017310	GGA	2	6	254100	254105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5010	NC_017310	GGA	2	6	254121	254126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5011	NC_017310	TGG	2	6	254138	254143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152068
5012	NC_017310	GCG	2	6	254170	254175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5013	NC_017310	GT	3	6	254189	254194	0 %	50 %	50 %	0 %	387152068
5014	NC_017310	GAG	2	6	254218	254223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5015	NC_017310	AG	3	6	254238	254243	50 %	0 %	50 %	0 %	387152068
5016	NC_017310	CAT	2	6	254505	254510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152068
5017	NC_017310	TCA	2	6	254516	254521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152068
5018	NC_017310	CGC	2	6	254559	254564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152068
5019	NC_017310	GCC	2	6	254572	254577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152068
5020	NC_017310	CGA	2	6	254616	254621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5021	NC_017310	CCA	2	6	254654	254659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152068
5022	NC_017310	AGG	2	6	254660	254665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5023	NC_017310	GC	3	6	254698	254703	0 %	0 %	50 %	50 %	387152068
5024	NC_017310	GAG	2	6	254722	254727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5025	NC_017310	CGG	2	6	254750	254755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5026	NC_017310	GCGG	2	8	254770	254777	0 %	0 %	75 %	25 %	387152068
5027	NC_017310	GTG	2	6	254800	254805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152068
5028	NC_017310	CGG	3	9	254840	254848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5029	NC_017310	CAG	2	6	254851	254856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5030	NC_017310	GCG	2	6	254857	254862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5031	NC_017310	GGCG	2	8	254907	254914	0 %	0 %	75 %	25 %	387152068
5032	NC_017310	AG	3	6	254922	254927	50 %	0 %	50 %	0 %	387152068
5033	NC_017310	CG	3	6	254944	254949	0 %	0 %	50 %	50 %	387152068
5034	NC_017310	GGA	2	6	254973	254978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
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5036	NC_017310	GCG	2	6	255032	255037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152068
5037	NC_017310	GAT	2	6	255055	255060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152068
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5039	NC_017310	TGG	2	6	255107	255112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152068
5040	NC_017310	TCA	2	6	255116	255121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152068
5041	NC_017310	TGC	2	6	255164	255169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5042	NC_017310	AGG	2	6	255181	255186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152068
5043	NC_017310	AGC	2	6	255275	255280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5044	NC_017310	TCG	2	6	255290	255295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152068
5045	NC_017310	GAT	2	6	255354	255359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152068
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5049	NC_017310	GAA	2	6	255775	255780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152069
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5054	NC_017310	GGC	2	6	255940	255945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152069
5055	NC_017310	GCC	2	6	256001	256006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152069
5056	NC_017310	CGA	2	6	256098	256103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152069
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5058	NC_017310	GTG	2	6	256231	256236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152069
5059	NC_017310	TCG	2	6	256298	256303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152069
5060	NC_017310	CAG	2	6	256342	256347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152069
5061	NC_017310	CGC	2	6	256359	256364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152069
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5121	NC_017310	CGA	2	6	259516	259521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152071
5122	NC_017310	CTT	2	6	259523	259528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152071
5123	NC_017310	TGA	2	6	259609	259614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152071
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5125	NC_017310	GAC	2	6	259679	259684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152071
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5132	NC_017310	TGC	2	6	260121	260126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152071
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5154	NC_017310	TGA	2	6	261649	261654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152072
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5159	NC_017310	CG	3	6	261832	261837	0 %	0 %	50 %	50 %	387152072
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5230	NC_017310	CTG	2	6	265465	265470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152075
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5236	NC_017310	G	6	6	265707	265712	0 %	0 %	100 %	0 %	387152075
5237	NC_017310	TC	3	6	265734	265739	0 %	50 %	0 %	50 %	387152075
5238	NC_017310	GGT	2	6	265800	265805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152075
5239	NC_017310	GCA	2	6	265806	265811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152075
5240	NC_017310	CCT	2	6	265848	265853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152075
5241	NC_017310	GAC	2	6	265867	265872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152075
5242	NC_017310	GC	3	6	265927	265932	0 %	0 %	50 %	50 %	387152075
5243	NC_017310	GTC	2	6	265951	265956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152075
5244	NC_017310	CAT	2	6	266025	266030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152075
5245	NC_017310	AG	3	6	266037	266042	50 %	0 %	50 %	0 %	387152075
5246	NC_017310	GGGCC	2	10	266137	266146	0 %	0 %	60 %	40 %	387152075
5247	NC_017310	CAG	2	6	266180	266185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152075
5248	NC_017310	GGT	2	6	266208	266213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152075
5249	NC_017310	GCG	2	6	266275	266280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152075
5250	NC_017310	CGT	2	6	266334	266339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152075
5251	NC_017310	GCG	2	6	266345	266350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152075
5252	NC_017310	TC	3	6	266356	266361	0 %	50 %	0 %	50 %	387152075
5253	NC_017310	GTG	2	6	266383	266388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152075
5254	NC_017310	GGT	2	6	266421	266426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152075
5255	NC_017310	GAC	2	6	266445	266450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152075
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5257	NC_017310	GCGT	3	12	266473	266484	0 %	25 %	50 %	25 %	387152075
5258	NC_017310	CTCGCC	2	12	266488	266499	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387152075
5259	NC_017310	CAG	2	6	266570	266575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152076
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5261	NC_017310	GCG	2	6	266635	266640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152076
5262	NC_017310	GAC	2	6	266663	266668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152076
5263	NC_017310	TCG	2	6	266694	266699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152076
5264	NC_017310	TGA	3	9	266710	266718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152076
5265	NC_017310	GGGC	2	8	266719	266726	0 %	0 %	75 %	25 %	387152076
5266	NC_017310	CGC	2	6	266728	266733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152076
5267	NC_017310	TCA	2	6	266757	266762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152076
5268	NC_017310	GCG	3	9	266768	266776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152076
5269	NC_017310	CAG	2	6	266777	266782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152076
5270	NC_017310	CAG	3	9	266810	266818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152076
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5272	NC_017310	GAA	2	6	266918	266923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152076
5273	NC_017310	GCG	3	9	267059	267067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152076
5274	NC_017310	TGA	2	6	267133	267138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152076
5275	NC_017310	CG	3	6	267153	267158	0 %	0 %	50 %	50 %	387152076
5276	NC_017310	GCAAT	2	10	267170	267179	40 %	20 %	20 %	20 %	387152076
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5300	NC_017310	GATG	2	8	268469	268476	25 %	25 %	50 %	0 %	387152078
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5349	NC_017310	GCTG	2	8	270604	270611	0 %	25 %	50 %	25 %	387152079
5350	NC_017310	CTG	3	9	270609	270617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152079
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5356	NC_017310	TCG	2	6	270857	270862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152079
5357	NC_017310	TCGAT	2	10	270963	270972	20 %	40 %	20 %	20 %	387152079
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5360	NC_017310	GCC	2	6	271150	271155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152079
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5362	NC_017310	GAA	2	6	272014	272019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152080
5363	NC_017310	TTC	3	9	272053	272061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152080
5364	NC_017310	GAT	2	6	272062	272067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152080
5365	NC_017310	GAA	2	6	272068	272073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152080
5366	NC_017310	GCT	2	6	272195	272200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152080
5367	NC_017310	CGA	2	6	272235	272240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152080
5368	NC_017310	TCG	2	6	272369	272374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152080
5369	NC_017310	GGT	2	6	272382	272387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152080
5370	NC_017310	ACA	2	6	272402	272407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152080
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5375	NC_017310	TG	3	6	272709	272714	0 %	50 %	50 %	0 %	387152080
5376	NC_017310	TCA	2	6	272729	272734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152080
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5381	NC_017310	GTC	2	6	273365	273370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152081
5382	NC_017310	AGACG	2	10	273433	273442	40 %	0 %	40 %	20 %	387152081
5383	NC_017310	GGC	2	6	273449	273454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152081
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5386	NC_017310	TCG	2	6	273618	273623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152081
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5391	NC_017310	TGT	2	6	273880	273885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152081
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5402	NC_017310	GATC	2	8	274273	274280	25 %	25 %	25 %	25 %	387152081
5403	NC_017310	GTG	2	6	274284	274289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152081
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5405	NC_017310	TG	3	6	274563	274568	0 %	50 %	50 %	0 %	387152082
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5431	NC_017310	CTTGGC	2	12	276320	276331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152083
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5462	NC_017310	CAT	3	9	278463	278471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152086
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5464	NC_017310	CAT	2	6	278487	278492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152086
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5470	NC_017310	GC	3	6	278702	278707	0 %	0 %	50 %	50 %	387152087
5471	NC_017310	G	6	6	278757	278762	0 %	0 %	100 %	0 %	387152087
5472	NC_017310	CTT	2	6	278846	278851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152087
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5478	NC_017310	G	8	8	279379	279386	0 %	0 %	100 %	0 %	387152088
5479	NC_017310	GC	3	6	279389	279394	0 %	0 %	50 %	50 %	387152088
5480	NC_017310	TCC	2	6	279493	279498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152088
5481	NC_017310	ATG	2	6	279504	279509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152088
5482	NC_017310	TCCC	2	8	279541	279548	0 %	25 %	0 %	75 %	387152088
5483	NC_017310	C	6	6	279546	279551	0 %	0 %	0 %	100 %	387152088
5484	NC_017310	G	6	6	279626	279631	0 %	0 %	100 %	0 %	387152088
5485	NC_017310	GGC	2	6	279643	279648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152088
5486	NC_017310	CGGCG	2	10	279685	279694	0 %	0 %	60 %	40 %	387152088
5487	NC_017310	CT	3	6	279700	279705	0 %	50 %	0 %	50 %	387152088
5488	NC_017310	CCG	2	6	279735	279740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152088
5489	NC_017310	C	6	6	279749	279754	0 %	0 %	0 %	100 %	387152088
5490	NC_017310	GCG	2	6	279767	279772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152088
5491	NC_017310	TCCC	2	8	279774	279781	0 %	25 %	0 %	75 %	387152088
5492	NC_017310	TGC	2	6	279812	279817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152088
5493	NC_017310	CCG	2	6	279904	279909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152088
5494	NC_017310	GTC	2	6	279966	279971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152088
5495	NC_017310	CGT	2	6	280012	280017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152089
5496	NC_017310	GCT	3	9	280041	280049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152089
5497	NC_017310	CTTC	2	8	280110	280117	0 %	50 %	0 %	50 %	387152089
5498	NC_017310	CAT	3	9	280206	280214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152089
5499	NC_017310	TGC	2	6	280229	280234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152089
5500	NC_017310	CGT	2	6	280335	280340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152089

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