MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_017310	TGCCGA	2	12	2615938	2615949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387154151
50003	NC_017310	CCG	2	6	2615965	2615970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154151
50004	NC_017310	CGA	2	6	2615980	2615985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154151
50005	NC_017310	GTG	2	6	2616000	2616005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154151
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50115	NC_017310	CGC	2	6	2620937	2620942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154156
50116	NC_017310	TGA	2	6	2620955	2620960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154156
50117	NC_017310	CCG	2	6	2621058	2621063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154156
50118	NC_017310	CG	3	6	2621062	2621067	0 %	0 %	50 %	50 %	387154156
50119	NC_017310	GTGAGC	2	12	2621092	2621103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387154156
50120	NC_017310	GCC	2	6	2621173	2621178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154156
50121	NC_017310	GCC	3	9	2621193	2621201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154156
50122	NC_017310	GCG	2	6	2621203	2621208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154156
50123	NC_017310	GAA	2	6	2621226	2621231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154156
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50131	NC_017310	GCG	2	6	2621534	2621539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154157
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50133	NC_017310	AGC	3	9	2621703	2621711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154157
50134	NC_017310	GGT	2	6	2621756	2621761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154157
50135	NC_017310	CGC	2	6	2621788	2621793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154157
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50143	NC_017310	GCA	2	6	2622289	2622294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154157
50144	NC_017310	GTG	2	6	2622315	2622320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154157
50145	NC_017310	TGGC	2	8	2622415	2622422	0 %	25 %	50 %	25 %	387154157
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50151	NC_017310	CGC	2	6	2622620	2622625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154157
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50201	NC_017310	GGT	2	6	2624865	2624870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154159
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50203	NC_017310	ACG	2	6	2624896	2624901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154159
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50214	NC_017310	TGCC	2	8	2625307	2625314	0 %	25 %	25 %	50 %	387154160
50215	NC_017310	GCA	2	6	2625337	2625342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50216	NC_017310	ATG	2	6	2625429	2625434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154160
50217	NC_017310	GCC	2	6	2625539	2625544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154160
50218	NC_017310	CG	3	6	2625590	2625595	0 %	0 %	50 %	50 %	387154160
50219	NC_017310	CGA	2	6	2625634	2625639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50220	NC_017310	CGG	2	6	2625718	2625723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154160
50221	NC_017310	CAG	2	6	2625761	2625766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50222	NC_017310	TG	3	6	2625778	2625783	0 %	50 %	50 %	0 %	387154160
50223	NC_017310	AGC	2	6	2625856	2625861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50224	NC_017310	GCA	2	6	2625862	2625867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50225	NC_017310	CGC	2	6	2625951	2625956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154160
50226	NC_017310	GTC	2	6	2625965	2625970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50227	NC_017310	GGT	2	6	2626066	2626071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154160
50228	NC_017310	CGA	2	6	2626142	2626147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154160
50229	NC_017310	CACCCG	2	12	2626171	2626182	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387154160
50230	NC_017310	GGC	2	6	2626235	2626240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154160
50231	NC_017310	CGC	2	6	2626282	2626287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154160
50232	NC_017310	CGG	2	6	2626290	2626295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154160
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50320	NC_017310	CCA	2	6	2630659	2630664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387154165
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50322	NC_017310	CTG	2	6	2630907	2630912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154165
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50328	NC_017310	CAA	3	9	2631074	2631082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154165
50329	NC_017310	CGC	2	6	2631137	2631142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154165
50330	NC_017310	CGA	2	6	2631227	2631232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154165
50331	NC_017310	ATC	2	6	2631252	2631257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154165
50332	NC_017310	CGA	2	6	2631323	2631328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154165
50333	NC_017310	CAT	2	6	2631419	2631424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154165
50334	NC_017310	CTC	2	6	2631474	2631479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154165
50335	NC_017310	GCCT	2	8	2631717	2631724	0 %	25 %	25 %	50 %	387154165
50336	NC_017310	GCTG	2	8	2631725	2631732	0 %	25 %	50 %	25 %	387154165
50337	NC_017310	GCA	2	6	2631809	2631814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154165
50338	NC_017310	G	6	6	2631887	2631892	0 %	0 %	100 %	0 %	387154165
50339	NC_017310	CGA	2	6	2631893	2631898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154165
50340	NC_017310	TCA	2	6	2631976	2631981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154165
50341	NC_017310	CCG	2	6	2631982	2631987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154165
50342	NC_017310	CG	3	6	2632012	2632017	0 %	0 %	50 %	50 %	387154165
50343	NC_017310	ACA	2	6	2632080	2632085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154166
50344	NC_017310	TAC	2	6	2632097	2632102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154166
50345	NC_017310	GCG	2	6	2632112	2632117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154166
50346	NC_017310	TC	3	6	2632120	2632125	0 %	50 %	0 %	50 %	387154166
50347	NC_017310	GAC	2	6	2632172	2632177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154166
50348	NC_017310	CGCC	2	8	2632243	2632250	0 %	0 %	25 %	75 %	387154166
50349	NC_017310	TG	3	6	2632251	2632256	0 %	50 %	50 %	0 %	387154166
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50351	NC_017310	GCA	2	6	2632303	2632308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154166
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50353	NC_017310	CTGC	2	8	2632375	2632382	0 %	25 %	25 %	50 %	387154166
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50379	NC_017310	TCC	2	6	2633610	2633615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154167
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50382	NC_017310	GC	3	6	2633793	2633798	0 %	0 %	50 %	50 %	387154167
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50448	NC_017310	CTCTCC	2	12	2637737	2637748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154173
50449	NC_017310	GCC	2	6	2637806	2637811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154173
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50451	NC_017310	ACG	2	6	2637852	2637857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154173
50452	NC_017310	GCGGT	2	10	2637862	2637871	0 %	20 %	60 %	20 %	387154173
50453	NC_017310	TCC	2	6	2637921	2637926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154173
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50461	NC_017310	GAA	2	6	2638489	2638494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154174
50462	NC_017310	AC	3	6	2638526	2638531	50 %	0 %	0 %	50 %	387154174
50463	NC_017310	TCC	2	6	2638583	2638588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387154174
50464	NC_017310	TCG	2	6	2638622	2638627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154174
50465	NC_017310	GGA	2	6	2638644	2638649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387154174
50466	NC_017310	TGT	2	6	2639213	2639218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387154175
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50470	NC_017310	TTC	2	6	2639396	2639401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154175
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50474	NC_017310	TCG	2	6	2639677	2639682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154176
50475	NC_017310	CATGGG	2	12	2639690	2639701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387154176
50476	NC_017310	GTG	2	6	2639757	2639762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387154176
50477	NC_017310	CATG	2	8	2639765	2639772	25 %	25 %	25 %	25 %	387154176
50478	NC_017310	TCT	2	6	2639801	2639806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387154176
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50482	NC_017310	GCAG	2	8	2639886	2639893	25 %	0 %	50 %	25 %	387154176
50483	NC_017310	GCC	2	6	2639895	2639900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154176
50484	NC_017310	CAT	2	6	2639901	2639906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387154176
50485	NC_017310	GGA	2	6	2639912	2639917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387154176
50486	NC_017310	CGG	2	6	2640083	2640088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387154176
50487	NC_017310	GCC	2	6	2640099	2640104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387154176
50488	NC_017310	C	7	7	2640182	2640188	0 %	0 %	0 %	100 %	387154176
50489	NC_017310	CGT	2	6	2640212	2640217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387154176
50490	NC_017310	CGA	2	6	2640326	2640331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387154176
50491	NC_017310	TCGAA	2	10	2640346	2640355	40 %	20 %	20 %	20 %	387154176
50492	NC_017310	ACA	2	6	2640412	2640417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154176
50493	NC_017310	CAA	2	6	2640521	2640526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387154176
50494	NC_017310	AGA	2	6	2640538	2640543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387154176
50495	NC_017310	AGG	2	6	2640557	2640562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387154176
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50497	NC_017310	GAT	2	6	2640710	2640715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387154177
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