MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017310	GCG	2	6	228630	228635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152049
4502	NC_017310	CAG	2	6	228675	228680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152049
4503	NC_017310	CAG	2	6	228732	228737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152049
4504	NC_017310	GGA	2	6	228851	228856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152049
4505	NC_017310	T	6	6	228953	228958	0 %	100 %	0 %	0 %	387152050
4506	NC_017310	CCG	2	6	228959	228964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152050
4507	NC_017310	ACT	2	6	228972	228977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152050
4508	NC_017310	CAT	2	6	229001	229006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152050
4509	NC_017310	CGA	2	6	229199	229204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4510	NC_017310	TGC	2	6	229300	229305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4511	NC_017310	TGGG	2	8	229338	229345	0 %	25 %	75 %	0 %	387152050
4512	NC_017310	GAT	2	6	229370	229375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152050
4513	NC_017310	CG	3	6	229399	229404	0 %	0 %	50 %	50 %	387152050
4514	NC_017310	CAC	3	9	229415	229423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152050
4515	NC_017310	GGA	2	6	229460	229465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152050
4516	NC_017310	GAC	2	6	229497	229502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4517	NC_017310	CAT	2	6	229532	229537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152050
4518	NC_017310	GCG	2	6	229538	229543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4519	NC_017310	CGA	2	6	229547	229552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4520	NC_017310	CGA	2	6	229565	229570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4521	NC_017310	GTG	2	6	229572	229577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152050
4522	NC_017310	GGATG	2	10	229593	229602	20 %	20 %	60 %	0 %	387152050
4523	NC_017310	CGGCCC	2	12	229610	229621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152050
4524	NC_017310	TC	3	6	229667	229672	0 %	50 %	0 %	50 %	387152050
4525	NC_017310	GT	3	6	229738	229743	0 %	50 %	50 %	0 %	387152050
4526	NC_017310	TCT	2	6	229753	229758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152050
4527	NC_017310	CGC	2	6	229759	229764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152050
4528	NC_017310	GCCATG	2	12	229812	229823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4529	NC_017310	TGG	2	6	229837	229842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152050
4530	NC_017310	TGT	2	6	229888	229893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152050
4531	NC_017310	CGT	2	6	229901	229906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4532	NC_017310	CGT	2	6	229949	229954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4533	NC_017310	GCC	2	6	229955	229960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152050
4534	NC_017310	CCA	2	6	230017	230022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152050
4535	NC_017310	GCTG	2	8	230129	230136	0 %	25 %	50 %	25 %	387152050
4536	NC_017310	TGG	2	6	230212	230217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152050
4537	NC_017310	GCT	2	6	230297	230302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4538	NC_017310	GCG	2	6	230392	230397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4539	NC_017310	GGC	2	6	230408	230413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4540	NC_017310	CAT	2	6	230459	230464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152050
4541	NC_017310	GCT	2	6	230528	230533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4542	NC_017310	GC	3	6	230538	230543	0 %	0 %	50 %	50 %	387152050
4543	NC_017310	AGG	2	6	230572	230577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152050
4544	NC_017310	CGT	2	6	230640	230645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4545	NC_017310	GT	3	6	230655	230660	0 %	50 %	50 %	0 %	387152050
4546	NC_017310	GCG	2	6	230690	230695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4547	NC_017310	GCC	2	6	230739	230744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152050
4548	NC_017310	CAC	2	6	230765	230770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152050
4549	NC_017310	ACG	2	6	230776	230781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152050
4550	NC_017310	GGC	2	6	230910	230915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4551	NC_017310	GC	3	6	230977	230982	0 %	0 %	50 %	50 %	387152050
4552	NC_017310	G	6	6	231041	231046	0 %	0 %	100 %	0 %	387152050
4553	NC_017310	TC	3	6	231050	231055	0 %	50 %	0 %	50 %	387152050
4554	NC_017310	GGC	2	6	231064	231069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4555	NC_017310	CA	3	6	231093	231098	50 %	0 %	0 %	50 %	387152050
4556	NC_017310	GCG	2	6	231196	231201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4557	NC_017310	GCG	2	6	231260	231265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152050
4558	NC_017310	CAT	2	6	231290	231295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152050
4559	NC_017310	GC	3	6	231345	231350	0 %	0 %	50 %	50 %	387152050
4560	NC_017310	GGA	2	6	231368	231373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152050
4561	NC_017310	TGA	2	6	231436	231441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152050
4562	NC_017310	CAG	2	6	231964	231969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152051
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4564	NC_017310	CGA	2	6	232067	232072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152051
4565	NC_017310	GCA	2	6	232100	232105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152051
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4568	NC_017310	CGA	2	6	232247	232252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152051
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4572	NC_017310	TGG	2	6	232833	232838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152052
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4577	NC_017310	GCGG	2	8	233218	233225	0 %	0 %	75 %	25 %	387152052
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4580	NC_017310	CGA	2	6	233299	233304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152052
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4589	NC_017310	ACG	2	6	233898	233903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152052
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4591	NC_017310	GGT	2	6	234300	234305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152053
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4593	NC_017310	CTG	3	9	234355	234363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152053
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4600	NC_017310	G	6	6	234584	234589	0 %	0 %	100 %	0 %	387152053
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4604	NC_017310	CG	3	6	234745	234750	0 %	0 %	50 %	50 %	387152053
4605	NC_017310	CTG	2	6	234760	234765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152053
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4608	NC_017310	CAT	2	6	234852	234857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152053
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4619	NC_017310	CGGG	2	8	235264	235271	0 %	0 %	75 %	25 %	387152053
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4743	NC_017310	GGGAT	2	10	240441	240450	20 %	20 %	60 %	0 %	387152059
4744	NC_017310	AGT	2	6	240475	240480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152059
4745	NC_017310	GCA	2	6	240502	240507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152059
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4747	NC_017310	GGGC	2	8	240638	240645	0 %	0 %	75 %	25 %	387152059
4748	NC_017310	CG	3	6	240697	240702	0 %	0 %	50 %	50 %	387152059
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4755	NC_017310	TTG	3	9	241269	241277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152059
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4766	NC_017310	GTG	2	6	241908	241913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152060
4767	NC_017310	GCCT	2	8	241941	241948	0 %	25 %	25 %	50 %	387152060
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4774	NC_017310	CTG	2	6	242210	242215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152060
4775	NC_017310	CCGC	2	8	242229	242236	0 %	0 %	25 %	75 %	387152060
4776	NC_017310	CTT	2	6	242257	242262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152060
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4851	NC_017310	ATGGGC	2	12	246312	246323	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387152062
4852	NC_017310	TTC	2	6	246332	246337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152062
4853	NC_017310	TTC	2	6	246344	246349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152062
4854	NC_017310	TTG	2	6	246366	246371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152062
4855	NC_017310	TCG	2	6	246387	246392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
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4857	NC_017310	ATC	2	6	246407	246412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152062
4858	NC_017310	CG	3	6	246417	246422	0 %	0 %	50 %	50 %	387152062
4859	NC_017310	GTC	2	6	246458	246463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
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4862	NC_017310	CGT	2	6	246649	246654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
4863	NC_017310	CGA	2	6	246724	246729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152062
4864	NC_017310	GCT	3	9	246733	246741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
4865	NC_017310	TGC	2	6	246849	246854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
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4867	NC_017310	GTC	2	6	246896	246901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152062
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4875	NC_017310	CCA	2	6	247623	247628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152063
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4880	NC_017310	CA	3	6	247838	247843	50 %	0 %	0 %	50 %	387152063
4881	NC_017310	CGG	2	6	247869	247874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152063
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4967	NC_017310	AGT	2	6	251678	251683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152067
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4980	NC_017310	GAT	2	6	252054	252059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152067
4981	NC_017310	CACG	2	8	252065	252072	25 %	0 %	25 %	50 %	387152067
4982	NC_017310	CTT	2	6	252096	252101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152067
4983	NC_017310	TGA	2	6	252119	252124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152067
4984	NC_017310	GCACGG	2	12	252188	252199	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387152067
4985	NC_017310	GGC	2	6	252231	252236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152067
4986	NC_017310	TTG	2	6	252310	252315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152067
4987	NC_017310	TCA	2	6	252494	252499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152067
4988	NC_017310	GGT	2	6	252516	252521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152067
4989	NC_017310	GAT	2	6	252522	252527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152067
4990	NC_017310	GTC	2	6	252540	252545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152067
4991	NC_017310	TGA	2	6	252569	252574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152067
4992	NC_017310	CTT	2	6	252597	252602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152067
4993	NC_017310	TGG	3	9	252689	252697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152067
4994	NC_017310	GCC	2	6	252888	252893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152067
4995	NC_017310	ACA	2	6	252923	252928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387152067
4996	NC_017310	CAT	2	6	253377	253382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152068
4997	NC_017310	TCA	2	6	253397	253402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152068
4998	NC_017310	GTTCTG	2	12	253417	253428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387152068
4999	NC_017310	GC	3	6	253614	253619	0 %	0 %	50 %	50 %	387152068
5000	NC_017310	TC	3	6	253669	253674	0 %	50 %	0 %	50 %	387152068

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