MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
2	NC_016629	TAC	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
3	NC_016629	GCC	2	6	380	385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
4	NC_016629	GCA	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
5	NC_016629	CCAAG	2	10	465	474	40 %	0 %	20 %	40 %	374298387
6	NC_016629	CA	3	6	544	549	50 %	0 %	0 %	50 %	374298387
7	NC_016629	GAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298387
8	NC_016629	TCA	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
9	NC_016629	TGC	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
10	NC_016629	CAGGA	2	10	725	734	40 %	0 %	40 %	20 %	374298387
11	NC_016629	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298387
12	NC_016629	GGA	2	6	868	873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298387
13	NC_016629	TCC	2	6	882	887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298387
14	NC_016629	GCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
15	NC_016629	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
16	NC_016629	GCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
17	NC_016629	GCT	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
18	NC_016629	CT	3	6	1328	1333	0 %	50 %	0 %	50 %	374298387
19	NC_016629	CGCA	2	8	1378	1385	25 %	0 %	25 %	50 %	374298387
20	NC_016629	CGCA	2	8	1454	1461	25 %	0 %	25 %	50 %	374298387
21	NC_016629	AAG	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298387
22	NC_016629	TTA	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298388
23	NC_016629	GCC	2	6	1937	1942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
24	NC_016629	GCA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
25	NC_016629	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	374298388
26	NC_016629	ACC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
27	NC_016629	GCA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
28	NC_016629	CCA	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
29	NC_016629	CCA	2	6	2304	2309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
30	NC_016629	CCA	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
31	NC_016629	CGG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
32	NC_016629	CGC	2	6	2388	2393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
33	NC_016629	CGG	2	6	2400	2405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
34	NC_016629	TCC	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298388
35	NC_016629	GGCGC	2	10	2641	2650	0 %	0 %	60 %	40 %	374298388
36	NC_016629	GTC	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298389
37	NC_016629	CAG	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
38	NC_016629	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
39	NC_016629	CGCAG	2	10	2822	2831	20 %	0 %	40 %	40 %	374298389
40	NC_016629	GCC	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298389
41	NC_016629	CGG	2	6	2960	2965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298389
42	NC_016629	AGG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298389
43	NC_016629	GC	3	6	3204	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	374298389
44	NC_016629	CGGC	2	8	3265	3272	0 %	0 %	50 %	50 %	374298389
45	NC_016629	TGA	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
46	NC_016629	ATG	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
47	NC_016629	CG	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
48	NC_016629	GCC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
49	NC_016629	TGA	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
50	NC_016629	CGTCCA	2	12	3777	3788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374298390
51	NC_016629	GCA	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298390
52	NC_016629	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
53	NC_016629	CG	3	6	3897	3902	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
54	NC_016629	GCCG	2	8	3906	3913	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
55	NC_016629	GC	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
56	NC_016629	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
57	NC_016629	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
58	NC_016629	GCG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
59	NC_016629	CCA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298390
60	NC_016629	GC	4	8	4111	4118	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
61	NC_016629	TCC	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
62	NC_016629	TCC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
63	NC_016629	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
64	NC_016629	GCC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
65	NC_016629	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
66	NC_016629	GGT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
67	NC_016629	GC	3	6	4388	4393	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
68	NC_016629	CG	3	6	4401	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
69	NC_016629	GC	3	6	4433	4438	0 %	0 %	50 %	50 %	374298390
70	NC_016629	GTC	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
71	NC_016629	GC	4	8	4526	4533	0 %	0 %	50 %	50 %	374298391
72	NC_016629	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298391
73	NC_016629	CCT	3	9	4623	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
74	NC_016629	GCA	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
75	NC_016629	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
76	NC_016629	TGC	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
77	NC_016629	TCT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298391
78	NC_016629	CGC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
79	NC_016629	GCA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
80	NC_016629	GTC	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
81	NC_016629	GA	3	6	4856	4861	50 %	0 %	50 %	0 %	374298391
82	NC_016629	CAG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
83	NC_016629	CCT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
84	NC_016629	CGGC	2	8	5007	5014	0 %	0 %	50 %	50 %	374298391
85	NC_016629	GGCAGG	2	12	5030	5041	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374298391
86	NC_016629	CGC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
87	NC_016629	CGG	2	6	5064	5069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
88	NC_016629	TCA	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298392
89	NC_016629	CCG	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298392
90	NC_016629	CCA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
91	NC_016629	GCCGC	2	10	5388	5397	0 %	0 %	40 %	60 %	374298392
92	NC_016629	ATG	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298392
93	NC_016629	CGG	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
94	NC_016629	CCA	2	6	5551	5556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
95	NC_016629	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
96	NC_016629	CCA	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
97	NC_016629	CAC	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
98	NC_016629	CGT	3	9	5737	5745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
99	NC_016629	TCC	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298393
100	NC_016629	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
101	NC_016629	GTA	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
102	NC_016629	GTC	4	12	5918	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
103	NC_016629	CAC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298393
104	NC_016629	CTT	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
105	NC_016629	CGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
106	NC_016629	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298393
107	NC_016629	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
108	NC_016629	ATG	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
109	NC_016629	TCG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
110	NC_016629	CG	3	6	6250	6255	0 %	0 %	50 %	50 %	374298393
111	NC_016629	CGC	3	9	6298	6306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
112	NC_016629	CTT	2	6	6359	6364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
113	NC_016629	GC	3	6	6373	6378	0 %	0 %	50 %	50 %	374298393
114	NC_016629	GCA	2	6	6729	6734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298394
115	NC_016629	CGCA	2	8	6827	6834	25 %	0 %	25 %	50 %	374298394
116	NC_016629	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298394
117	NC_016629	TCC	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298394
118	NC_016629	GGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298394
119	NC_016629	CGGC	2	8	6945	6952	0 %	0 %	50 %	50 %	374298394
120	NC_016629	GCC	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298394
121	NC_016629	TTG	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298394
122	NC_016629	TA	3	6	7155	7160	50 %	50 %	0 %	0 %	374298394
123	NC_016629	CTT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
124	NC_016629	CTT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
125	NC_016629	TCAT	2	8	7279	7286	25 %	50 %	0 %	25 %	374298395
126	NC_016629	ACGCAT	2	12	7302	7313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374298395
127	NC_016629	G	6	6	7379	7384	0 %	0 %	100 %	0 %	374298395
128	NC_016629	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
129	NC_016629	GCC	2	6	7491	7496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
130	NC_016629	ACCG	2	8	7589	7596	25 %	0 %	25 %	50 %	374298395
131	NC_016629	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
132	NC_016629	CCT	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298395
133	NC_016629	GCGG	2	8	7899	7906	0 %	0 %	75 %	25 %	374298395
134	NC_016629	TGG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
135	NC_016629	GCC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
136	NC_016629	CTG	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
137	NC_016629	GAC	2	6	8005	8010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298395
138	NC_016629	TTG	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298395
139	NC_016629	GCC	2	6	8068	8073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
140	NC_016629	A	6	6	8161	8166	100 %	0 %	0 %	0 %	374298395
141	NC_016629	TTC	2	6	8173	8178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298395
142	NC_016629	TGG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
143	NC_016629	CG	3	6	8339	8344	0 %	0 %	50 %	50 %	374298395
144	NC_016629	GC	3	6	8374	8379	0 %	0 %	50 %	50 %	374298395
145	NC_016629	ACT	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298395
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147	NC_016629	GGC	2	6	8572	8577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298395
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152	NC_016629	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
153	NC_016629	CTGG	2	8	8784	8791	0 %	25 %	50 %	25 %	374298395
154	NC_016629	ACG	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298396
155	NC_016629	TCTCC	2	10	9364	9373	0 %	40 %	0 %	60 %	374298396
156	NC_016629	CCAGC	2	10	9391	9400	20 %	0 %	20 %	60 %	374298396
157	NC_016629	AC	3	6	9559	9564	50 %	0 %	0 %	50 %	374298396
158	NC_016629	GCG	2	6	9591	9596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298396
159	NC_016629	GGCG	2	8	9640	9647	0 %	0 %	75 %	25 %	374298396
160	NC_016629	GGT	2	6	9661	9666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298396
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165	NC_016629	GCC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298397
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173	NC_016629	CGGG	2	8	10714	10721	0 %	0 %	75 %	25 %	374298397
174	NC_016629	GCCTG	2	10	10777	10786	0 %	20 %	40 %	40 %	374298397
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180	NC_016629	GC	3	6	11108	11113	0 %	0 %	50 %	50 %	374298398
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243	NC_016629	GAA	2	6	14317	14322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298400
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249	NC_016629	GCC	2	6	14749	14754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298400
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253	NC_016629	GCTC	2	8	15172	15179	0 %	25 %	25 %	50 %	374298401
254	NC_016629	TTG	2	6	15222	15227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298401
255	NC_016629	CTG	2	6	15323	15328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298401
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257	NC_016629	ACC	2	6	15441	15446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298401
258	NC_016629	CTG	2	6	15464	15469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298401
259	NC_016629	GAG	2	6	15502	15507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298401
260	NC_016629	CCT	3	9	15545	15553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298401
261	NC_016629	CGCA	2	8	15587	15594	25 %	0 %	25 %	50 %	374298401
262	NC_016629	AGC	2	6	16092	16097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298402
263	NC_016629	GGC	2	6	16175	16180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298402
264	NC_016629	CAG	2	6	16205	16210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298402
265	NC_016629	AGC	2	6	16212	16217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298402
266	NC_016629	TGG	2	6	16285	16290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298402
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272	NC_016629	GCA	2	6	16438	16443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298402
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343	NC_016629	CG	3	6	20452	20457	0 %	0 %	50 %	50 %	374298407
344	NC_016629	ACCA	2	8	20474	20481	50 %	0 %	0 %	50 %	374298407
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347	NC_016629	CAT	2	6	20641	20646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298407
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382	NC_016629	GCT	2	6	22384	22389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298409
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384	NC_016629	T	6	6	22480	22485	0 %	100 %	0 %	0 %	374298409
385	NC_016629	GGC	2	6	22491	22496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298409
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387	NC_016629	CGC	2	6	22654	22659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298409
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389	NC_016629	CCT	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298409
390	NC_016629	CGC	2	6	22702	22707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298409
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392	NC_016629	CCG	2	6	23098	23103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298410
393	NC_016629	CTC	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298410
394	NC_016629	CAG	2	6	23134	23139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298410
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402	NC_016629	TGA	2	6	24627	24632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298411
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410	NC_016629	AC	3	6	25067	25072	50 %	0 %	0 %	50 %	374298411
411	NC_016629	T	6	6	25080	25085	0 %	100 %	0 %	0 %	374298411
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419	NC_016629	GCA	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
420	NC_016629	CGG	2	6	26033	26038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
421	NC_016629	TGG	2	6	26044	26049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298412
422	NC_016629	ATG	2	6	26056	26061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298412
423	NC_016629	GCG	2	6	26127	26132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
424	NC_016629	GCG	2	6	26167	26172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
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429	NC_016629	CCT	2	6	26339	26344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
430	NC_016629	ACC	2	6	26361	26366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
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436	NC_016629	CGG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
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448	NC_016629	CCA	2	6	27139	27144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
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460	NC_016629	CCGGG	2	10	27744	27753	0 %	0 %	60 %	40 %	374298413
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462	NC_016629	CAC	2	6	27817	27822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298413
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489	NC_016629	CGG	2	6	29534	29539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298414
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493	NC_016629	GC	3	6	29805	29810	0 %	0 %	50 %	50 %	374298415
494	NC_016629	CTT	2	6	29824	29829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298415
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496	NC_016629	GCA	2	6	29982	29987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298415
497	NC_016629	ATG	2	6	29996	30001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298415
498	NC_016629	GAA	2	6	30061	30066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298415
499	NC_016629	CGAT	2	8	30095	30102	25 %	25 %	25 %	25 %	374298415
500	NC_016629	GCG	2	6	30153	30158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298415

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