MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016629	CGC	2	6	170176	170181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298538
3002	NC_016629	GC	3	6	170180	170185	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3003	NC_016629	CAG	2	6	170213	170218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298538
3004	NC_016629	CGC	2	6	170233	170238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298538
3005	NC_016629	CG	4	8	170287	170294	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3006	NC_016629	GCT	2	6	170335	170340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298538
3007	NC_016629	CCGG	2	8	170382	170389	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3008	NC_016629	GAT	2	6	170390	170395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298538
3009	NC_016629	TCG	2	6	170406	170411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298538
3010	NC_016629	CG	3	6	170417	170422	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3011	NC_016629	GGCC	2	8	170431	170438	0 %	0 %	50 %	50 %	374298538
3012	NC_016629	CTTGAC	2	12	170492	170503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374298538
3013	NC_016629	TGA	2	6	170522	170527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298538
3014	NC_016629	CCG	2	6	170866	170871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298539
3015	NC_016629	CTT	2	6	171045	171050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298539
3016	NC_016629	GGT	2	6	171147	171152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3017	NC_016629	CGG	2	6	171204	171209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298539
3018	NC_016629	ACC	2	6	171230	171235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298539
3019	NC_016629	TGG	2	6	171266	171271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3020	NC_016629	CAG	2	6	171289	171294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3021	NC_016629	GCA	2	6	171330	171335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3022	NC_016629	CTG	2	6	171424	171429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3023	NC_016629	GC	3	6	171445	171450	0 %	0 %	50 %	50 %	374298539
3024	NC_016629	CTG	2	6	171487	171492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3025	NC_016629	CCG	2	6	171514	171519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298539
3026	NC_016629	GCG	2	6	171527	171532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298539
3027	NC_016629	CGG	2	6	171549	171554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298539
3028	NC_016629	TGCGCC	2	12	171566	171577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298539
3029	NC_016629	TCGGCG	2	12	171590	171601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374298539
3030	NC_016629	GGC	2	6	171726	171731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298539
3031	NC_016629	CCT	3	9	171746	171754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298539
3032	NC_016629	CAC	2	6	171762	171767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298539
3033	NC_016629	CCCG	2	8	171801	171808	0 %	0 %	25 %	75 %	374298539
3034	NC_016629	CG	3	6	171893	171898	0 %	0 %	50 %	50 %	374298539
3035	NC_016629	ACG	2	6	171899	171904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3036	NC_016629	TTC	2	6	171910	171915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298539
3037	NC_016629	GGA	2	6	172026	172031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298539
3038	NC_016629	AGG	2	6	172130	172135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298539
3039	NC_016629	GC	3	6	172271	172276	0 %	0 %	50 %	50 %	374298539
3040	NC_016629	CGCC	2	8	172338	172345	0 %	0 %	25 %	75 %	374298539
3041	NC_016629	GC	3	6	172362	172367	0 %	0 %	50 %	50 %	374298539
3042	NC_016629	CTG	2	6	172372	172377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3043	NC_016629	GCT	2	6	172395	172400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3044	NC_016629	AGC	2	6	172421	172426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3045	NC_016629	AAG	2	6	172477	172482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298539
3046	NC_016629	ATC	2	6	172483	172488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298539
3047	NC_016629	CAG	2	6	172489	172494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3048	NC_016629	CAA	2	6	172527	172532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298539
3049	NC_016629	CAA	2	6	172602	172607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298539
3050	NC_016629	TGG	2	6	172693	172698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3051	NC_016629	ACA	2	6	172718	172723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298539
3052	NC_016629	GAG	2	6	172750	172755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298539
3053	NC_016629	ACG	2	6	172757	172762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3054	NC_016629	GAA	2	6	172884	172889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298539
3055	NC_016629	TGG	2	6	172895	172900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3056	NC_016629	GAG	2	6	172936	172941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298539
3057	NC_016629	GC	3	6	173079	173084	0 %	0 %	50 %	50 %	374298539
3058	NC_016629	AGC	2	6	173111	173116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3059	NC_016629	TGG	3	9	173120	173128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298539
3060	NC_016629	CAC	3	9	173223	173231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298539
3061	NC_016629	CAT	2	6	173338	173343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298539
3062	NC_016629	TGC	2	6	173348	173353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298539
3063	NC_016629	CATT	2	8	173362	173369	25 %	50 %	0 %	25 %	374298539
3064	NC_016629	TCA	2	6	173558	173563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298540
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3066	NC_016629	CCT	2	6	173630	173635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298540
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3068	NC_016629	GCC	2	6	173835	173840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298540
3069	NC_016629	CTC	2	6	173976	173981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298540
3070	NC_016629	CAG	2	6	174003	174008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298540
3071	NC_016629	TCG	2	6	174025	174030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298540
3072	NC_016629	CTT	2	6	174048	174053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298540
3073	NC_016629	TAT	2	6	174613	174618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298541
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3075	NC_016629	CTG	2	6	174653	174658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298541
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3080	NC_016629	GCAT	2	8	174990	174997	25 %	25 %	25 %	25 %	374298541
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3083	NC_016629	GCT	2	6	175255	175260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298541
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3085	NC_016629	TGG	2	6	175323	175328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298541
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3088	NC_016629	GAAG	2	8	175489	175496	50 %	0 %	50 %	0 %	374298541
3089	NC_016629	GC	3	6	175553	175558	0 %	0 %	50 %	50 %	374298541
3090	NC_016629	CAGGCC	2	12	175562	175573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298541
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3093	NC_016629	GC	3	6	175683	175688	0 %	0 %	50 %	50 %	374298541
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3099	NC_016629	GGC	2	6	175759	175764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298541
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3103	NC_016629	GACCA	2	10	175961	175970	40 %	0 %	20 %	40 %	374298541
3104	NC_016629	CTG	2	6	175973	175978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298541
3105	NC_016629	CGC	2	6	175987	175992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298541
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3108	NC_016629	CGA	2	6	176044	176049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298541
3109	NC_016629	GTG	2	6	176075	176080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298541
3110	NC_016629	CG	3	6	176125	176130	0 %	0 %	50 %	50 %	374298541
3111	NC_016629	GCC	2	6	176174	176179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298541
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3113	NC_016629	CGGC	2	8	176241	176248	0 %	0 %	50 %	50 %	374298541
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3119	NC_016629	CGCC	2	8	176593	176600	0 %	0 %	25 %	75 %	374298542
3120	NC_016629	GCC	3	9	176613	176621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298542
3121	NC_016629	CCG	2	6	176626	176631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298542
3122	NC_016629	CCTT	2	8	176656	176663	0 %	50 %	0 %	50 %	374298542
3123	NC_016629	GCG	2	6	176671	176676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298542
3124	NC_016629	CTG	2	6	176811	176816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298542
3125	NC_016629	TCT	2	6	176831	176836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298542
3126	NC_016629	CTG	3	9	176865	176873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298542
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3140	NC_016629	GCAAG	2	10	178003	178012	40 %	0 %	40 %	20 %	374298545
3141	NC_016629	GCC	2	6	178015	178020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298545
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3143	NC_016629	TTG	2	6	178032	178037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298545
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3152	NC_016629	TGC	3	9	178674	178682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298545
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3162	NC_016629	TCA	2	6	179155	179160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298545
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3226	NC_016629	CTG	2	6	182043	182048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298546
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3239	NC_016629	CCA	2	6	182431	182436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298546
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3241	NC_016629	CGA	2	6	182462	182467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298546
3242	NC_016629	CCA	2	6	182476	182481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298546
3243	NC_016629	GCGG	2	8	182486	182493	0 %	0 %	75 %	25 %	374298546
3244	NC_016629	GGA	2	6	182495	182500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298546
3245	NC_016629	TGC	2	6	182590	182595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298546
3246	NC_016629	CCCTGG	3	18	182662	182679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298546
3247	NC_016629	GCCG	2	8	182687	182694	0 %	0 %	50 %	50 %	374298546
3248	NC_016629	CAT	2	6	182702	182707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298546
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3250	NC_016629	CAT	2	6	182738	182743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298546
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3252	NC_016629	CTG	2	6	182946	182951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298546
3253	NC_016629	GCT	2	6	182966	182971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298546
3254	NC_016629	GGC	2	6	182972	182977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298546
3255	NC_016629	TCG	2	6	183076	183081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298546
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3260	NC_016629	CCG	2	6	183430	183435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298547
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3262	NC_016629	GCG	2	6	183491	183496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298547
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3264	NC_016629	GC	3	6	183674	183679	0 %	0 %	50 %	50 %	374298547
3265	NC_016629	ATC	2	6	183816	183821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298547
3266	NC_016629	TAG	2	6	183847	183852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298547
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3269	NC_016629	GGA	2	6	183952	183957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298547
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3271	NC_016629	ATC	2	6	183970	183975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298547
3272	NC_016629	TCCAGG	2	12	184027	184038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374298547
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3274	NC_016629	A	6	6	184089	184094	100 %	0 %	0 %	0 %	374298547
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3278	NC_016629	CGCC	2	8	184159	184166	0 %	0 %	25 %	75 %	374298547
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3332	NC_016629	TCCGC	2	10	187367	187376	0 %	20 %	20 %	60 %	374298550
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3339	NC_016629	CCG	2	6	187923	187928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298551
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3347	NC_016629	A	6	6	188214	188219	100 %	0 %	0 %	0 %	374298551
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3360	NC_016629	TAC	2	6	188981	188986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298552
3361	NC_016629	GCTG	2	8	188997	189004	0 %	25 %	50 %	25 %	374298552
3362	NC_016629	GGC	2	6	189005	189010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298552
3363	NC_016629	AAG	2	6	189056	189061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298552
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3365	NC_016629	GCCT	2	8	189180	189187	0 %	25 %	25 %	50 %	374298552
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3381	NC_016629	TAC	2	6	190223	190228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298553
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3383	NC_016629	AGC	2	6	190248	190253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298553
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3389	NC_016629	CGG	3	9	190644	190652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298554
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3391	NC_016629	CG	3	6	190784	190789	0 %	0 %	50 %	50 %	374298554
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3397	NC_016629	TCG	2	6	191123	191128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298554
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3481	NC_016629	CCT	2	6	195323	195328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298561
3482	NC_016629	CAG	2	6	195375	195380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298561
3483	NC_016629	GCTG	2	8	195422	195429	0 %	25 %	50 %	25 %	374298561
3484	NC_016629	AGCC	2	8	195454	195461	25 %	0 %	25 %	50 %	374298561
3485	NC_016629	AATG	2	8	195764	195771	50 %	25 %	25 %	0 %	374298562
3486	NC_016629	CGAG	2	8	195786	195793	25 %	0 %	50 %	25 %	374298562
3487	NC_016629	ACG	2	6	195800	195805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3488	NC_016629	GCC	2	6	195814	195819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
3489	NC_016629	GTC	2	6	196000	196005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3490	NC_016629	CTG	2	6	196009	196014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3491	NC_016629	GCC	2	6	196021	196026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298562
3492	NC_016629	CTT	2	6	196104	196109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298562
3493	NC_016629	GGT	2	6	196183	196188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
3494	NC_016629	CG	3	6	196269	196274	0 %	0 %	50 %	50 %	374298562
3495	NC_016629	CGA	2	6	196302	196307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3496	NC_016629	GGC	2	6	196494	196499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298562
3497	NC_016629	TGC	2	6	196565	196570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298562
3498	NC_016629	TGG	2	6	196604	196609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298562
3499	NC_016629	ACCT	2	8	196618	196625	25 %	25 %	0 %	50 %	374298562
3500	NC_016629	CAC	2	6	196632	196637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298562

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