MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016629	CGTGCC	2	12	115948	115959	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298488
2003	NC_016629	GCCCT	2	10	116042	116051	0 %	20 %	20 %	60 %	374298488
2004	NC_016629	GCC	2	6	116066	116071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298488
2005	NC_016629	CCGGC	2	10	116079	116088	0 %	0 %	40 %	60 %	374298488
2006	NC_016629	AAT	2	6	116111	116116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298488
2007	NC_016629	TGC	2	6	116145	116150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298488
2008	NC_016629	GGCC	2	8	116158	116165	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
2009	NC_016629	GTG	2	6	116186	116191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298488
2010	NC_016629	G	6	6	116274	116279	0 %	0 %	100 %	0 %	374298488
2011	NC_016629	GCC	2	6	116294	116299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298488
2012	NC_016629	C	6	6	116319	116324	0 %	0 %	0 %	100 %	374298488
2013	NC_016629	GCCG	2	8	116337	116344	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
2014	NC_016629	CCATG	2	10	116380	116389	20 %	20 %	20 %	40 %	374298488
2015	NC_016629	CTGGCC	2	12	116408	116419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298488
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2017	NC_016629	GCC	2	6	116455	116460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298488
2018	NC_016629	GGTC	2	8	116463	116470	0 %	25 %	50 %	25 %	374298488
2019	NC_016629	GC	3	6	116655	116660	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
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2021	NC_016629	GC	3	6	116774	116779	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
2022	NC_016629	CAT	2	6	116845	116850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298488
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2039	NC_016629	CAGAC	2	10	117709	117718	40 %	0 %	20 %	40 %	374298488
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2043	NC_016629	CTG	2	6	117920	117925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298488
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2051	NC_016629	A	6	6	118290	118295	100 %	0 %	0 %	0 %	374298488
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2054	NC_016629	TCA	2	6	118715	118720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298489
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2059	NC_016629	CAG	2	6	120420	120425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298490
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2113	NC_016629	GCTC	2	8	123249	123256	0 %	25 %	25 %	50 %	374298493
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2120	NC_016629	CGG	2	6	123627	123632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298493
2121	NC_016629	AGGCC	2	10	123651	123660	20 %	0 %	40 %	40 %	374298493
2122	NC_016629	GCC	2	6	123775	123780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298493
2123	NC_016629	GC	3	6	123896	123901	0 %	0 %	50 %	50 %	374298493
2124	NC_016629	CGT	2	6	123927	123932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298493
2125	NC_016629	CAC	2	6	123964	123969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298493
2126	NC_016629	GCG	2	6	124038	124043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298493
2127	NC_016629	CCT	2	6	124080	124085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298493
2128	NC_016629	ATG	2	6	124097	124102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298493
2129	NC_016629	CGTCCA	2	12	124137	124148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374298493
2130	NC_016629	CCA	2	6	124176	124181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298493
2131	NC_016629	GGATG	2	10	124182	124191	20 %	20 %	60 %	0 %	374298493
2132	NC_016629	CTTC	2	8	124209	124216	0 %	50 %	0 %	50 %	374298493
2133	NC_016629	CTC	2	6	124234	124239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298493
2134	NC_016629	GAT	2	6	124249	124254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298493
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2137	NC_016629	CCTCGC	2	12	124332	124343	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374298493
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2141	NC_016629	GCT	2	6	124530	124535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298493
2142	NC_016629	GAT	2	6	124543	124548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298493
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2144	NC_016629	ATG	2	6	124640	124645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298493
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2152	NC_016629	TCC	2	6	125027	125032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298493
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2195	NC_016629	ACGGC	2	10	127594	127603	20 %	0 %	40 %	40 %	374298494
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2201	NC_016629	AGCC	2	8	127825	127832	25 %	0 %	25 %	50 %	374298495
2202	NC_016629	TGA	2	6	127835	127840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298495
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2212	NC_016629	TGA	2	6	128461	128466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298496
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2229	NC_016629	AGC	2	6	129153	129158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298496
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2233	NC_016629	GCGCA	2	10	129375	129384	20 %	0 %	40 %	40 %	374298496
2234	NC_016629	CGA	2	6	129406	129411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298496
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2239	NC_016629	CCAG	2	8	129700	129707	25 %	0 %	25 %	50 %	374298497
2240	NC_016629	GCC	2	6	129713	129718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298497
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2242	NC_016629	GCC	2	6	129764	129769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298497
2243	NC_016629	GCA	2	6	129802	129807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298497
2244	NC_016629	ATG	2	6	129816	129821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298497
2245	NC_016629	CCG	2	6	129828	129833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298497
2246	NC_016629	GCC	2	6	129861	129866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298497
2247	NC_016629	GCG	2	6	129956	129961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298497
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2251	NC_016629	CG	3	6	130128	130133	0 %	0 %	50 %	50 %	374298497
2252	NC_016629	GC	3	6	130203	130208	0 %	0 %	50 %	50 %	374298497
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2261	NC_016629	CGG	2	6	131121	131126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298498
2262	NC_016629	GCC	2	6	131152	131157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298498
2263	NC_016629	GCA	2	6	131208	131213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298498
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2268	NC_016629	TGC	3	9	131462	131470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298498
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2270	NC_016629	TCC	2	6	131499	131504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298498
2271	NC_016629	GGC	2	6	131506	131511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298498
2272	NC_016629	TTTTG	2	10	131565	131574	0 %	80 %	20 %	0 %	374298498
2273	NC_016629	TGG	2	6	131600	131605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298498
2274	NC_016629	TGG	2	6	131615	131620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298498
2275	NC_016629	TGG	2	6	131636	131641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298498
2276	NC_016629	GCCGC	3	15	131642	131656	0 %	0 %	40 %	60 %	374298498
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2280	NC_016629	GC	3	6	131812	131817	0 %	0 %	50 %	50 %	374298498
2281	NC_016629	CGA	2	6	131899	131904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298499
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2354	NC_016629	GAAG	2	8	134422	134429	50 %	0 %	50 %	0 %	374298500
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2359	NC_016629	TCGGC	2	10	134703	134712	0 %	20 %	40 %	40 %	374298500
2360	NC_016629	CAT	2	6	134767	134772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298500
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2362	NC_016629	TGC	2	6	134967	134972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298500
2363	NC_016629	TCA	2	6	135009	135014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298500
2364	NC_016629	GTG	2	6	135089	135094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298500
2365	NC_016629	TTC	2	6	135134	135139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298501
2366	NC_016629	GCA	2	6	135141	135146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2367	NC_016629	CG	3	6	135196	135201	0 %	0 %	50 %	50 %	374298501
2368	NC_016629	CCG	2	6	135238	135243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298501
2369	NC_016629	TCC	2	6	135303	135308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298501
2370	NC_016629	GCG	3	9	135336	135344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298501
2371	NC_016629	AGC	2	6	135403	135408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2372	NC_016629	GACAAG	2	12	135411	135422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374298501
2373	NC_016629	GCC	2	6	135537	135542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298501
2374	NC_016629	GTCC	2	8	135557	135564	0 %	25 %	25 %	50 %	374298501
2375	NC_016629	CCT	2	6	135580	135585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298501
2376	NC_016629	GTCC	2	8	135613	135620	0 %	25 %	25 %	50 %	374298501
2377	NC_016629	ACC	2	6	135633	135638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298501
2378	NC_016629	CAG	2	6	135666	135671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2379	NC_016629	CGA	2	6	135707	135712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2380	NC_016629	GCCAG	2	10	135715	135724	20 %	0 %	40 %	40 %	374298501
2381	NC_016629	TGC	2	6	135736	135741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2382	NC_016629	ACT	2	6	135745	135750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298501
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2384	NC_016629	GCT	2	6	135893	135898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298501
2385	NC_016629	GC	3	6	135980	135985	0 %	0 %	50 %	50 %	374298501
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2390	NC_016629	CGG	2	6	136132	136137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298501
2391	NC_016629	CAT	2	6	136243	136248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298502
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2393	NC_016629	CTG	2	6	136356	136361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298502
2394	NC_016629	ACGCC	2	10	136468	136477	20 %	0 %	20 %	60 %	374298502
2395	NC_016629	CCT	2	6	136501	136506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298502
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2399	NC_016629	GCG	2	6	136840	136845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298502
2400	NC_016629	TC	3	6	136848	136853	0 %	50 %	0 %	50 %	374298502
2401	NC_016629	CTG	2	6	136882	136887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298502
2402	NC_016629	CAGG	2	8	136889	136896	25 %	0 %	50 %	25 %	374298502
2403	NC_016629	ACA	2	6	136907	136912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298502
2404	NC_016629	GGC	2	6	136964	136969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298502
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2407	NC_016629	GAG	2	6	137116	137121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298503
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2412	NC_016629	GCCG	2	8	137411	137418	0 %	0 %	50 %	50 %	374298503
2413	NC_016629	GAG	2	6	137671	137676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298503
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2429	NC_016629	TCA	2	6	138484	138489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298505
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2433	NC_016629	CTG	2	6	138537	138542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298505
2434	NC_016629	GCT	2	6	138545	138550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298505
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2439	NC_016629	GCT	2	6	138818	138823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298505
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2446	NC_016629	TCT	2	6	139415	139420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298507
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2448	NC_016629	GAT	2	6	139477	139482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298507
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2451	NC_016629	CAT	2	6	139608	139613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298507
2452	NC_016629	GCTC	2	8	139705	139712	0 %	25 %	25 %	50 %	374298507
2453	NC_016629	TCA	2	6	139742	139747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298507
2454	NC_016629	GCCAA	2	10	139751	139760	40 %	0 %	20 %	40 %	374298507
2455	NC_016629	GGC	2	6	139799	139804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298508
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2457	NC_016629	CGG	2	6	139831	139836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298508
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2460	NC_016629	ATCCTG	2	12	140021	140032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374298508
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2463	NC_016629	ATT	2	6	140185	140190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298508
2464	NC_016629	TGC	2	6	140232	140237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298508
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2469	NC_016629	TGC	2	6	140523	140528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298508
2470	NC_016629	GCA	2	6	140626	140631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298508
2471	NC_016629	TGCC	2	8	140634	140641	0 %	25 %	25 %	50 %	374298508
2472	NC_016629	ATG	2	6	140746	140751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298509
2473	NC_016629	GAT	2	6	140865	140870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298509
2474	NC_016629	GGTCT	2	10	140881	140890	0 %	40 %	40 %	20 %	374298509
2475	NC_016629	GGCCA	2	10	140983	140992	20 %	0 %	40 %	40 %	374298509
2476	NC_016629	TGC	2	6	140999	141004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298509
2477	NC_016629	GC	3	6	141007	141012	0 %	0 %	50 %	50 %	374298509
2478	NC_016629	GCT	2	6	141041	141046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298509
2479	NC_016629	GGT	2	6	141057	141062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298509
2480	NC_016629	GC	3	6	141135	141140	0 %	0 %	50 %	50 %	374298509
2481	NC_016629	GGCG	2	8	141228	141235	0 %	0 %	75 %	25 %	374298509
2482	NC_016629	GCA	2	6	141267	141272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298509
2483	NC_016629	GCG	2	6	141298	141303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298509
2484	NC_016629	GCG	2	6	141347	141352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298509
2485	NC_016629	GTT	2	6	141380	141385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298509
2486	NC_016629	CCG	2	6	141440	141445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298509
2487	NC_016629	AGC	2	6	141462	141467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298509
2488	NC_016629	GCCTG	2	10	141497	141506	0 %	20 %	40 %	40 %	374298509
2489	NC_016629	ATC	2	6	141508	141513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298509
2490	NC_016629	CGC	2	6	141514	141519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298509
2491	NC_016629	GCCT	2	8	141545	141552	0 %	25 %	25 %	50 %	374298509
2492	NC_016629	CG	3	6	141554	141559	0 %	0 %	50 %	50 %	374298509
2493	NC_016629	GCT	2	6	141561	141566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298509
2494	NC_016629	TACG	2	8	141592	141599	25 %	25 %	25 %	25 %	374298509
2495	NC_016629	TCC	2	6	141646	141651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298509
2496	NC_016629	GAG	2	6	141655	141660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298509
2497	NC_016629	ATA	2	6	141836	141841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298510
2498	NC_016629	TTC	2	6	141842	141847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298510
2499	NC_016629	TCG	2	6	141875	141880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298510
2500	NC_016629	CGA	2	6	141891	141896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298510

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