MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016629	CAG	2	6	59793	59798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298447
1002	NC_016629	GA	3	6	59851	59856	50 %	0 %	50 %	0 %	374298447
1003	NC_016629	TCC	2	6	59868	59873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298447
1004	NC_016629	GCCAA	2	10	59883	59892	40 %	0 %	20 %	40 %	374298447
1005	NC_016629	ACG	2	6	59956	59961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298447
1006	NC_016629	GC	3	6	60070	60075	0 %	0 %	50 %	50 %	374298447
1007	NC_016629	GCC	3	9	60150	60158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298447
1008	NC_016629	GGT	2	6	60245	60250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298447
1009	NC_016629	GCT	2	6	60256	60261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298447
1010	NC_016629	TCG	2	6	60281	60286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298447
1011	NC_016629	GCCT	2	8	60348	60355	0 %	25 %	25 %	50 %	374298447
1012	NC_016629	CGG	2	6	60385	60390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298447
1013	NC_016629	CGC	2	6	60681	60686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298448
1014	NC_016629	CAT	2	6	60808	60813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298448
1015	NC_016629	GCC	2	6	60853	60858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298448
1016	NC_016629	CGG	2	6	60898	60903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298448
1017	NC_016629	CTG	2	6	60980	60985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298448
1018	NC_016629	GCT	2	6	61015	61020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298448
1019	NC_016629	CAT	2	6	61198	61203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298448
1020	NC_016629	CAC	2	6	61228	61233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298448
1021	NC_016629	TTTGG	2	10	61292	61301	0 %	60 %	40 %	0 %	374298448
1022	NC_016629	CG	3	6	61342	61347	0 %	0 %	50 %	50 %	374298448
1023	NC_016629	AGA	2	6	61895	61900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298449
1024	NC_016629	TCA	2	6	61954	61959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298449
1025	NC_016629	GC	3	6	61995	62000	0 %	0 %	50 %	50 %	374298449
1026	NC_016629	CGA	2	6	62063	62068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298449
1027	NC_016629	ACG	2	6	62190	62195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298449
1028	NC_016629	GCT	2	6	62300	62305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298449
1029	NC_016629	GGC	2	6	62331	62336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298449
1030	NC_016629	ACA	2	6	62365	62370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298449
1031	NC_016629	CGA	2	6	62402	62407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298449
1032	NC_016629	CTA	2	6	62426	62431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298449
1033	NC_016629	CGG	2	6	62462	62467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298449
1034	NC_016629	AGGT	2	8	62670	62677	25 %	25 %	50 %	0 %	374298450
1035	NC_016629	GCT	2	6	62756	62761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1036	NC_016629	CAGC	2	8	62764	62771	25 %	0 %	25 %	50 %	374298450
1037	NC_016629	CGCAA	2	10	62911	62920	40 %	0 %	20 %	40 %	374298450
1038	NC_016629	CG	3	6	62929	62934	0 %	0 %	50 %	50 %	374298450
1039	NC_016629	CGT	2	6	63025	63030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1040	NC_016629	GCT	2	6	63127	63132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1041	NC_016629	GAA	2	6	63206	63211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298450
1042	NC_016629	ATG	2	6	63279	63284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298450
1043	NC_016629	CCA	2	6	63325	63330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298450
1044	NC_016629	ACCCG	2	10	63350	63359	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
1045	NC_016629	CGC	2	6	63367	63372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298450
1046	NC_016629	CAG	2	6	63407	63412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1047	NC_016629	GCCA	2	8	63491	63498	25 %	0 %	25 %	50 %	374298450
1048	NC_016629	CAG	2	6	63512	63517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1049	NC_016629	CTCG	2	8	63526	63533	0 %	25 %	25 %	50 %	374298450
1050	NC_016629	CAG	3	9	63572	63580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1051	NC_016629	ATG	2	6	63771	63776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298450
1052	NC_016629	AGC	2	6	63786	63791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1053	NC_016629	GCA	2	6	63856	63861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1054	NC_016629	A	6	6	63975	63980	100 %	0 %	0 %	0 %	374298450
1055	NC_016629	TGCC	2	8	64000	64007	0 %	25 %	25 %	50 %	374298450
1056	NC_016629	ACGGCC	2	12	64008	64019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298450
1057	NC_016629	AGGGCC	2	12	64071	64082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374298450
1058	NC_016629	CCCG	2	8	64105	64112	0 %	0 %	25 %	75 %	374298450
1059	NC_016629	AGG	2	6	64138	64143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298450
1060	NC_016629	CCG	2	6	64182	64187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298450
1061	NC_016629	CGG	2	6	64208	64213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298450
1062	NC_016629	AGCC	2	8	64296	64303	25 %	0 %	25 %	50 %	374298450
1063	NC_016629	CG	3	6	64378	64383	0 %	0 %	50 %	50 %	374298450
1064	NC_016629	CAG	2	6	64472	64477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1065	NC_016629	GCCA	2	8	64523	64530	25 %	0 %	25 %	50 %	374298450
1066	NC_016629	CG	3	6	64564	64569	0 %	0 %	50 %	50 %	374298450
1067	NC_016629	GC	3	6	64643	64648	0 %	0 %	50 %	50 %	374298450
1068	NC_016629	CCTGG	2	10	64678	64687	0 %	20 %	40 %	40 %	374298450
1069	NC_016629	GCCG	2	8	64726	64733	0 %	0 %	50 %	50 %	374298450
1070	NC_016629	ACCCG	2	10	64827	64836	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
1071	NC_016629	CGCC	2	8	64852	64859	0 %	0 %	25 %	75 %	374298450
1072	NC_016629	CCA	2	6	64876	64881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298450
1073	NC_016629	CCA	2	6	64901	64906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298450
1074	NC_016629	CAG	3	9	64910	64918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1075	NC_016629	ACC	2	6	64957	64962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298450
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1077	NC_016629	GCA	2	6	65077	65082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298450
1078	NC_016629	GCT	2	6	65364	65369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298451
1079	NC_016629	GGC	2	6	65401	65406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298451
1080	NC_016629	CATT	2	8	65460	65467	25 %	50 %	0 %	25 %	374298451
1081	NC_016629	CAC	2	6	65560	65565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298451
1082	NC_016629	CGA	2	6	65599	65604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298451
1083	NC_016629	TCG	2	6	65646	65651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298451
1084	NC_016629	AGT	2	6	65670	65675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298451
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1086	NC_016629	TC	3	6	65796	65801	0 %	50 %	0 %	50 %	374298451
1087	NC_016629	ATCCTT	2	12	65863	65874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374298451
1088	NC_016629	ACC	2	6	65921	65926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298451
1089	NC_016629	TCT	2	6	66003	66008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298451
1090	NC_016629	GCC	2	6	66040	66045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298451
1091	NC_016629	GAC	2	6	66079	66084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298451
1092	NC_016629	T	6	6	66091	66096	0 %	100 %	0 %	0 %	374298451
1093	NC_016629	GATC	2	8	66102	66109	25 %	25 %	25 %	25 %	374298451
1094	NC_016629	ATA	2	6	66144	66149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298451
1095	NC_016629	CAG	2	6	66160	66165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298451
1096	NC_016629	ACA	2	6	66171	66176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298451
1097	NC_016629	CTT	2	6	66838	66843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298452
1098	NC_016629	TTG	2	6	66849	66854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298452
1099	NC_016629	CGGC	2	8	66883	66890	0 %	0 %	50 %	50 %	374298452
1100	NC_016629	GC	4	8	66945	66952	0 %	0 %	50 %	50 %	374298452
1101	NC_016629	CGC	2	6	66979	66984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298452
1102	NC_016629	CAT	2	6	67037	67042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298452
1103	NC_016629	CGA	2	6	67057	67062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298452
1104	NC_016629	TGG	2	6	67084	67089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298452
1105	NC_016629	GCCG	2	8	67123	67130	0 %	0 %	50 %	50 %	374298452
1106	NC_016629	CCT	2	6	67174	67179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298452
1107	NC_016629	CAC	2	6	67193	67198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298452
1108	NC_016629	CGT	2	6	67225	67230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298452
1109	NC_016629	AGG	2	6	67245	67250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298452
1110	NC_016629	CGC	2	6	67318	67323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298452
1111	NC_016629	CTT	2	6	67328	67333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298452
1112	NC_016629	CGA	2	6	67372	67377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298452
1113	NC_016629	GGCG	2	8	67378	67385	0 %	0 %	75 %	25 %	374298452
1114	NC_016629	CCTT	2	8	67386	67393	0 %	50 %	0 %	50 %	374298452
1115	NC_016629	GAATC	2	10	67482	67491	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
1116	NC_016629	CGG	2	6	67492	67497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298452
1117	NC_016629	ATG	2	6	67506	67511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298452
1118	NC_016629	ATCC	2	8	67552	67559	25 %	25 %	0 %	50 %	374298452
1119	NC_016629	GTC	2	6	67562	67567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298452
1120	NC_016629	ATGCA	2	10	67619	67628	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
1121	NC_016629	GC	3	6	68271	68276	0 %	0 %	50 %	50 %	374298453
1122	NC_016629	GC	3	6	68295	68300	0 %	0 %	50 %	50 %	374298453
1123	NC_016629	GAT	2	6	68335	68340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298453
1124	NC_016629	GA	3	6	68390	68395	50 %	0 %	50 %	0 %	374298453
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1126	NC_016629	GC	3	6	68498	68503	0 %	0 %	50 %	50 %	374298453
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