MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016629	GCCG	2	8	30166	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	374298415
502	NC_016629	CTC	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298415
503	NC_016629	CGC	2	6	30282	30287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298415
504	NC_016629	GCC	2	6	30448	30453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298415
505	NC_016629	GGC	2	6	30487	30492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298415
506	NC_016629	GAA	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298415
507	NC_016629	A	6	6	30550	30555	100 %	0 %	0 %	0 %	374298415
508	NC_016629	GCAG	2	8	30678	30685	25 %	0 %	50 %	25 %	374298416
509	NC_016629	CGG	2	6	30698	30703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298416
510	NC_016629	AGT	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
511	NC_016629	CTC	2	6	30860	30865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298416
512	NC_016629	CG	3	6	30876	30881	0 %	0 %	50 %	50 %	374298416
513	NC_016629	CCA	2	6	30932	30937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298416
514	NC_016629	CGTC	2	8	30981	30988	0 %	25 %	25 %	50 %	374298416
515	NC_016629	GAT	2	6	30995	31000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
516	NC_016629	CAG	2	6	31048	31053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298417
517	NC_016629	GTC	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298417
518	NC_016629	GATC	2	8	31137	31144	25 %	25 %	25 %	25 %	374298417
519	NC_016629	CGG	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298417
520	NC_016629	CCA	2	6	31197	31202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298417
521	NC_016629	CGA	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298417
522	NC_016629	CTC	2	6	31360	31365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298418
523	NC_016629	CAG	2	6	31369	31374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
524	NC_016629	TCG	2	6	31376	31381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
525	NC_016629	TCC	2	6	31409	31414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298418
526	NC_016629	GCT	2	6	31437	31442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
527	NC_016629	CTC	2	6	31489	31494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298418
528	NC_016629	CAG	2	6	31522	31527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
529	NC_016629	ATG	2	6	31553	31558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298418
530	NC_016629	GCG	2	6	31642	31647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298418
531	NC_016629	GAC	2	6	31665	31670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
532	NC_016629	CCG	2	6	31695	31700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
533	NC_016629	AGC	2	6	31711	31716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
534	NC_016629	GTC	2	6	31741	31746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
535	NC_016629	AGC	2	6	31850	31855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
536	NC_016629	GGT	2	6	31911	31916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298418
537	NC_016629	TGG	2	6	31917	31922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298418
538	NC_016629	GGC	2	6	31977	31982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298418
539	NC_016629	TCT	2	6	31983	31988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298418
540	NC_016629	AGT	2	6	32022	32027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298418
541	NC_016629	CGC	2	6	32055	32060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
542	NC_016629	GGT	2	6	32074	32079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298418
543	NC_016629	CAG	2	6	32089	32094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
544	NC_016629	GC	3	6	32108	32113	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
545	NC_016629	CCA	2	6	32127	32132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298418
546	NC_016629	GCTG	2	8	32148	32155	0 %	25 %	50 %	25 %	374298418
547	NC_016629	GGAC	2	8	32173	32180	25 %	0 %	50 %	25 %	374298418
548	NC_016629	CAG	2	6	32182	32187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
549	NC_016629	TTG	2	6	32198	32203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298418
550	NC_016629	AGC	2	6	32231	32236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
551	NC_016629	GGCC	2	8	32259	32266	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
552	NC_016629	GTC	2	6	32434	32439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
553	NC_016629	CGC	2	6	32445	32450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
554	NC_016629	CTGG	2	8	32485	32492	0 %	25 %	50 %	25 %	374298418
555	NC_016629	CGC	2	6	32516	32521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
556	NC_016629	GC	4	8	32545	32552	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
557	NC_016629	GGC	2	6	32560	32565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298418
558	NC_016629	AGG	2	6	32610	32615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298418
559	NC_016629	CTT	2	6	32626	32631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298418
560	NC_016629	ACC	2	6	32633	32638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298418
561	NC_016629	TGC	2	6	32643	32648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
562	NC_016629	TGGC	2	8	32666	32673	0 %	25 %	50 %	25 %	374298418
563	NC_016629	GC	3	6	32715	32720	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
564	NC_016629	TGGT	2	8	32774	32781	0 %	50 %	50 %	0 %	374298418
565	NC_016629	CAG	2	6	32815	32820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
566	NC_016629	GCT	2	6	32874	32879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
567	NC_016629	GCCCAG	2	12	32899	32910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298418
568	NC_016629	GC	3	6	32971	32976	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
569	NC_016629	GCC	2	6	33014	33019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
570	NC_016629	TCCAGG	2	12	33089	33100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374298418
571	NC_016629	CG	4	8	33129	33136	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
572	NC_016629	ATCTTG	2	12	33146	33157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374298418
573	NC_016629	CG	3	6	33187	33192	0 %	0 %	50 %	50 %	374298418
574	NC_016629	CAG	2	6	33193	33198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
575	NC_016629	CAC	2	6	33226	33231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298418
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577	NC_016629	AGC	2	6	33542	33547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298419
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581	NC_016629	ACT	2	6	33822	33827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298419
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583	NC_016629	GCG	2	6	33981	33986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298419
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587	NC_016629	CAT	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298419
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589	NC_016629	TCC	2	6	34287	34292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298420
590	NC_016629	CT	3	6	34310	34315	0 %	50 %	0 %	50 %	374298420
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593	NC_016629	GCC	2	6	34418	34423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298420
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595	NC_016629	GC	3	6	34565	34570	0 %	0 %	50 %	50 %	374298420
596	NC_016629	GC	3	6	34615	34620	0 %	0 %	50 %	50 %	374298420
597	NC_016629	GCA	2	6	34756	34761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298420
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609	NC_016629	GAG	2	6	35098	35103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298421
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611	NC_016629	GCA	2	6	35227	35232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298421
612	NC_016629	CG	3	6	35235	35240	0 %	0 %	50 %	50 %	374298421
613	NC_016629	AGT	2	6	35271	35276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298421
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620	NC_016629	GC	3	6	35602	35607	0 %	0 %	50 %	50 %	374298421
621	NC_016629	GCC	2	6	35611	35616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298421
622	NC_016629	GGC	2	6	35692	35697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298421
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626	NC_016629	TGA	2	6	35874	35879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298421
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