MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 73767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016629	TGA	2	6	360817	360822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298712
6502	NC_016629	CCA	2	6	360865	360870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298712
6503	NC_016629	GCC	2	6	360911	360916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298712
6504	NC_016629	CCCT	2	8	360962	360969	0 %	25 %	0 %	75 %	374298712
6505	NC_016629	GAA	2	6	360986	360991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298712
6506	NC_016629	GAT	2	6	361013	361018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298712
6507	NC_016629	GCC	2	6	361038	361043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298712
6508	NC_016629	CGA	2	6	361093	361098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298712
6509	NC_016629	GATGTC	2	12	361214	361225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374298712
6510	NC_016629	CGG	2	6	361291	361296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298712
6511	NC_016629	CTT	2	6	361340	361345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298712
6512	NC_016629	ACTG	2	8	361362	361369	25 %	25 %	25 %	25 %	374298712
6513	NC_016629	ATG	2	6	361413	361418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298712
6514	NC_016629	TAG	2	6	361429	361434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
6515	NC_016629	TGA	2	6	361472	361477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
6516	NC_016629	TCG	2	6	361510	361515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6517	NC_016629	GTC	2	6	361635	361640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6518	NC_016629	CGT	2	6	361802	361807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6519	NC_016629	ACC	2	6	361836	361841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298713
6520	NC_016629	CTT	2	6	361842	361847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298713
6521	NC_016629	TGA	2	6	361916	361921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
6522	NC_016629	GCG	2	6	361956	361961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6523	NC_016629	GCG	2	6	361982	361987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6524	NC_016629	CTC	2	6	362025	362030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298713
6525	NC_016629	ACG	2	6	362078	362083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6526	NC_016629	CGG	2	6	362210	362215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6527	NC_016629	GCG	2	6	362229	362234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6528	NC_016629	CAGG	2	8	362294	362301	25 %	0 %	50 %	25 %	374298713
6529	NC_016629	ACC	2	6	362374	362379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298713
6530	NC_016629	CGG	2	6	362384	362389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6531	NC_016629	CAG	2	6	362409	362414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6532	NC_016629	GCC	2	6	362442	362447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298713
6533	NC_016629	GGC	2	6	362505	362510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6534	NC_016629	GTA	2	6	362514	362519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
6535	NC_016629	CAT	2	6	362541	362546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298713
6536	NC_016629	AGA	2	6	362555	362560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298713
6537	NC_016629	CGTA	2	8	362590	362597	25 %	25 %	25 %	25 %	374298713
6538	NC_016629	TTC	2	6	362694	362699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298713
6539	NC_016629	TCT	2	6	362753	362758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298713
6540	NC_016629	CGG	2	6	362768	362773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6541	NC_016629	TCG	2	6	362788	362793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6542	NC_016629	GC	3	6	362829	362834	0 %	0 %	50 %	50 %	374298713
6543	NC_016629	TCC	2	6	362881	362886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298713
6544	NC_016629	TGG	2	6	362894	362899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298713
6545	NC_016629	TGA	2	6	362900	362905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
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6547	NC_016629	CAC	2	6	362976	362981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298713
6548	NC_016629	GC	3	6	363035	363040	0 %	0 %	50 %	50 %	374298713
6549	NC_016629	ATGG	2	8	363069	363076	25 %	25 %	50 %	0 %	374298713
6550	NC_016629	CCA	2	6	363209	363214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298713
6551	NC_016629	CGT	2	6	363221	363226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298713
6552	NC_016629	GCG	2	6	363235	363240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298713
6553	NC_016629	CG	3	6	363515	363520	0 %	0 %	50 %	50 %	374298713
6554	NC_016629	TGA	2	6	363575	363580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298713
6555	NC_016629	GGAT	2	8	363610	363617	25 %	25 %	50 %	0 %	374298713
6556	NC_016629	TACG	2	8	363654	363661	25 %	25 %	25 %	25 %	374298713
6557	NC_016629	TTGA	2	8	363698	363705	25 %	50 %	25 %	0 %	374298713
6558	NC_016629	GCG	2	6	363775	363780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298714
6559	NC_016629	GCG	2	6	363835	363840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298714
6560	NC_016629	GCC	2	6	363858	363863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298714
6561	NC_016629	GAT	2	6	363864	363869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298714
6562	NC_016629	GCC	2	6	364014	364019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298714
6563	NC_016629	CGT	2	6	364056	364061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298714
6564	NC_016629	GTA	2	6	364128	364133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298714
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6569	NC_016629	GAT	2	6	364431	364436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298714
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6573	NC_016629	GACCTT	2	12	364758	364769	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374298714
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6980	NC_016629	GTC	2	6	387011	387016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298731
6981	NC_016629	AAC	2	6	387017	387022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298731
6982	NC_016629	GCATG	2	10	387064	387073	20 %	20 %	40 %	20 %	374298731
6983	NC_016629	CGA	2	6	387135	387140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298731
6984	NC_016629	TGC	2	6	387156	387161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298731
6985	NC_016629	GGA	2	6	387224	387229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298731
6986	NC_016629	CCA	2	6	387240	387245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298731
6987	NC_016629	GCT	2	6	387271	387276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298731
6988	NC_016629	TTC	2	6	387281	387286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298731
6989	NC_016629	GCT	2	6	387581	387586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298732
6990	NC_016629	GCTGG	2	10	387632	387641	0 %	20 %	60 %	20 %	374298732
6991	NC_016629	CGG	2	6	387746	387751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298732
6992	NC_016629	GCG	2	6	387929	387934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298733
6993	NC_016629	CCA	2	6	388033	388038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298733
6994	NC_016629	TCGAAC	2	12	388041	388052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374298733
6995	NC_016629	GACC	2	8	388054	388061	25 %	0 %	25 %	50 %	374298733
6996	NC_016629	GAT	2	6	388082	388087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298733
6997	NC_016629	GTG	2	6	388098	388103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298733
6998	NC_016629	CAGGT	2	10	388396	388405	20 %	20 %	40 %	20 %	374298734
6999	NC_016629	CG	3	6	388444	388449	0 %	0 %	50 %	50 %	374298734
7000	NC_016629	TTGCGC	2	12	388485	388496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298734

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