MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfotomaculum carboxydivorans CO-1-SRB chromosome

Total Repeats: 968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015565	GAAAAA	2	12	4207	4218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333922242
2	NC_015565	CATGGA	2	12	4491	4502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922243
3	NC_015565	TGGCGG	2	12	4815	4826	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333922243
4	NC_015565	GCAAAA	2	12	4976	4987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333922243
5	NC_015565	CCCGGG	2	12	5642	5653	0 %	0 %	50 %	50 %	333922243
6	NC_015565	TGATTT	2	12	7106	7117	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333922244
7	NC_015565	AGGTTT	2	12	21863	21874	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333922253
8	NC_015565	ATGTGG	2	12	23411	23422	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333922255
9	NC_015565	TCCCAA	2	12	28196	28207	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333922258
10	NC_015565	AAAACC	2	12	29130	29141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922259
11	NC_015565	CAGCGG	2	12	31773	31784	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333922263
12	NC_015565	ATAACC	2	12	35077	35088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333922264
13	NC_015565	ACTTTA	2	12	37122	37133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333922265
14	NC_015565	CTTAAA	2	12	45872	45883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333922277
15	NC_015565	GCCAAT	2	12	46796	46807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922278
16	NC_015565	GGTGCT	2	12	52417	52428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333922285
17	NC_015565	CCTGGG	2	12	52504	52515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333922285
18	NC_015565	TACACC	2	12	56560	56571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333922289
19	NC_015565	TACAGA	2	12	57939	57950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333922291
20	NC_015565	ATATGA	2	12	61195	61206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922294
21	NC_015565	CACAGC	2	12	62370	62381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333922295
22	NC_015565	CCTGGG	2	12	72337	72348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333922305
23	NC_015565	GCCTAA	2	12	74197	74208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922307
24	NC_015565	ACAACC	2	12	74231	74242	50 %	0 %	0 %	50 %	333922307
25	NC_015565	GATGTA	2	12	76264	76275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922308
26	NC_015565	TCTGCT	2	12	78833	78844	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333922312
27	NC_015565	CTGGAA	2	12	83548	83559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922319
28	NC_015565	TGAGGC	2	12	84656	84667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333922320
29	NC_015565	GTGGAT	2	12	84732	84743	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333922320
30	NC_015565	CCAGAG	2	12	88693	88704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922324
31	NC_015565	TTGGCA	2	12	90288	90299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922326
32	NC_015565	GTGGAA	2	12	94749	94760	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333922332
33	NC_015565	CTGCAA	2	12	98100	98111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922335
34	NC_015565	AGCGGA	2	12	98177	98188	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333922335
35	NC_015565	GCCAAG	2	12	98226	98237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922335
36	NC_015565	GAGGCA	2	12	100670	100681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333922336
37	NC_015565	TAGAGG	2	12	103324	103335	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333922338
38	NC_015565	ATGAAA	2	12	104415	104426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333922341
39	NC_015565	GACCCC	2	12	104782	104793	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333922341
40	NC_015565	AAGGTA	2	12	107618	107629	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922346
41	NC_015565	TGGCGG	2	12	109928	109939	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333922348
42	NC_015565	TAACCC	2	12	112828	112839	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333922349
43	NC_015565	GGGATG	2	12	113047	113058	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333922349
44	NC_015565	CCGGTA	2	12	113959	113970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333922350
45	NC_015565	CCAACC	2	12	116921	116932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922351
46	NC_015565	GGGGAT	2	12	123054	123065	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333922356
47	NC_015565	ATGGGC	2	12	123693	123704	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333922356
48	NC_015565	CCCAAC	2	12	133375	133386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333922364
49	NC_015565	ATTGAA	2	12	136628	136639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922366
50	NC_015565	ACCAAA	2	12	137387	137398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922366
51	NC_015565	TAGAAG	2	12	138234	138245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922366
52	NC_015565	TGGCAT	2	12	142772	142783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922370
53	NC_015565	ATTGAA	2	12	144946	144957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922372
54	NC_015565	ACCAAA	2	12	145705	145716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333922372
55	NC_015565	TAGAAG	2	12	146552	146563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922372
56	NC_015565	TGGCAT	2	12	151090	151101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922376
57	NC_015565	CCGGAA	2	12	157893	157904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922382
58	NC_015565	AAATCC	2	12	163391	163402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333922387
59	NC_015565	GAAGTG	2	12	170226	170237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333922394
60	NC_015565	GGCGGT	2	12	172731	172742	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333922397
61	NC_015565	GGCCAG	2	12	173171	173182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333922398
62	NC_015565	CGGTAA	2	12	177311	177322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922402
63	NC_015565	GCAAAG	2	12	188180	188191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333922406
64	NC_015565	GGAAAA	2	12	190666	190677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922407
65	NC_015565	GTTTTG	2	12	192357	192368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333922409
66	NC_015565	CGGCGC	2	12	194723	194734	0 %	0 %	50 %	50 %	333922411
67	NC_015565	AAGGAA	2	12	195114	195125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333922411
68	NC_015565	ATTTCT	2	12	198222	198233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333922413
69	NC_015565	GGCCCG	2	12	198863	198874	0 %	0 %	50 %	50 %	333922413
70	NC_015565	GGCCAA	2	12	203569	203580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333922419
71	NC_015565	TTGATA	2	12	205899	205910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922421
72	NC_015565	AACTCA	2	12	213790	213801	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333922431
73	NC_015565	TAAAGT	2	12	218032	218043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922435
74	NC_015565	GAAGCT	2	12	218880	218891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922437
75	NC_015565	AATTAA	2	12	219287	219298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922437
76	NC_015565	GGTCTG	2	12	220465	220476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333922439
77	NC_015565	GGATGT	2	12	222032	222043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333922440
78	NC_015565	CGATGC	2	12	224270	224281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333922440
79	NC_015565	AGATGA	2	12	225956	225967	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922441
80	NC_015565	CAGGCC	2	12	226899	226910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333922441
81	NC_015565	TTTGAA	2	12	227571	227582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922441
82	NC_015565	TGGTGC	2	12	228750	228761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333922443
83	NC_015565	GGCTAA	2	12	231555	231566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922446
84	NC_015565	TACTCC	2	12	234214	234225	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333922449
85	NC_015565	TTAAAC	2	12	237686	237697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333922456
86	NC_015565	AATTGA	2	12	240407	240418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922463
87	NC_015565	AAGCAA	2	12	244879	244890	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333922472
88	NC_015565	GAAGTT	2	12	245555	245566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922474
89	NC_015565	AGATTG	2	12	246424	246435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922476
90	NC_015565	GCCGGG	2	12	249370	249381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922479
91	NC_015565	CCATAG	2	12	255770	255781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922488
92	NC_015565	AATGCC	2	12	260130	260141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922492
93	NC_015565	TGGTGC	2	12	260587	260598	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333922492
94	NC_015565	ACCGCC	2	12	261036	261047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333922492
95	NC_015565	TCCGCC	2	12	266477	266488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	333922495
96	NC_015565	CAGGAG	2	12	267464	267475	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333922496
97	NC_015565	GAATTG	2	12	268732	268743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922497
98	NC_015565	TATCAA	2	12	270787	270798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333922499
99	NC_015565	AACTAA	2	12	271740	271751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333922500
100	NC_015565	CCCTGG	2	12	271791	271802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333922500
101	NC_015565	AAATTC	2	12	274444	274455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333922501
102	NC_015565	GGCCCA	2	12	276767	276778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333922503
103	NC_015565	GGAGCA	2	12	281371	281382	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333922506
104	NC_015565	TTAAAT	2	12	282101	282112	50 %	50 %	0 %	0 %	333922507
105	NC_015565	CCACTG	2	12	284512	284523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333922508
106	NC_015565	TATAAA	2	12	288935	288946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333922512
107	NC_015565	AAAAGA	2	12	296037	296048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333922517
108	NC_015565	TTTTAT	2	12	296867	296878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333922517
109	NC_015565	ATGTAT	2	12	297779	297790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922520
110	NC_015565	ATAAGG	2	12	298247	298258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922520
111	NC_015565	GAAATT	2	12	308369	308380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922526
112	NC_015565	TGAATA	2	12	308707	308718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922526
113	NC_015565	AGAACG	2	12	308781	308792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333922526
114	NC_015565	CCACTA	2	12	309018	309029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333922526
115	NC_015565	TAGAAT	2	12	314676	314687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333922531
116	NC_015565	AAATAA	2	12	317646	317657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333922533
117	NC_015565	AATTTA	2	12	318006	318017	50 %	50 %	0 %	0 %	333922534
118	NC_015565	GGTAAT	2	12	326054	326065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922539
119	NC_015565	AAAAAT	2	12	326322	326333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333922539
120	NC_015565	TGTATG	2	12	328693	328704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333922540
121	NC_015565	GCTAAA	2	12	334032	334043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333922546
122	NC_015565	TTTAAG	2	12	335578	335589	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922548
123	NC_015565	CGGGGG	2	12	336506	336517	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	333922549
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125	NC_015565	GGCTCT	2	12	339066	339077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333922549
126	NC_015565	TTGGCT	2	12	346109	346120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333922559
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132	NC_015565	GCTCAT	2	12	363981	363992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333922576
133	NC_015565	TGATGC	2	12	364642	364653	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922577
134	NC_015565	ACCTTT	2	12	365587	365598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333922577
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137	NC_015565	CTGACA	2	12	380153	380164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922593
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141	NC_015565	TTGATA	2	12	391716	391727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922599
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147	NC_015565	CAATGG	2	12	411395	411406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333922618
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152	NC_015565	AAGATA	2	12	415226	415237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333922620
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157	NC_015565	GTACCA	2	12	431832	431843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333922639
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217	NC_015565	TGGCGG	2	12	641731	641742	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333922811
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220	NC_015565	GATGAA	2	12	647611	647622	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922815
221	NC_015565	TACAAC	2	12	649702	649713	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333922817
222	NC_015565	GCATGC	2	12	651551	651562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333922821
223	NC_015565	GGGGCC	2	12	654326	654337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922824
224	NC_015565	CGGTGC	2	12	655868	655879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333922825
225	NC_015565	ATGCTG	2	12	657119	657130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922826
226	NC_015565	GCCGGG	2	12	657917	657928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333922826
227	NC_015565	CCCGCA	2	12	659142	659153	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333922827
228	NC_015565	ATTATC	2	12	663799	663810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333922833
229	NC_015565	GAAGAG	2	12	679458	679469	50 %	0 %	50 %	0 %	333922845
230	NC_015565	AGAAAC	2	12	680822	680833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333922846
231	NC_015565	ACGGGG	2	12	681550	681561	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333922847
232	NC_015565	ATGGCT	2	12	694420	694431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922852
233	NC_015565	AGATTT	2	12	702359	702370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333922857
234	NC_015565	TGGTAA	2	12	704522	704533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333922857
235	NC_015565	AGCAAA	2	12	709622	709633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333922861
236	NC_015565	ATTTAA	2	12	713308	713319	50 %	50 %	0 %	0 %	333922863
237	NC_015565	TATTAA	2	12	717171	717182	50 %	50 %	0 %	0 %	333922868
238	NC_015565	AAATTT	2	12	718464	718475	50 %	50 %	0 %	0 %	333922869
239	NC_015565	AGTGAA	2	12	723852	723863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333922873
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243	NC_015565	CCTGGC	2	12	730958	730969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333922879
244	NC_015565	TGGCTA	2	12	731209	731220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922879
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246	NC_015565	CTTAGC	2	12	736693	736704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333922886
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251	NC_015565	TATCGA	2	12	759902	759913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333922908
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255	NC_015565	TTGGCA	2	12	766245	766256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333922914
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268	NC_015565	AGAGGA	2	12	793067	793078	50 %	0 %	50 %	0 %	333922940
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330	NC_015565	GAGCAG	2	12	967525	967536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333923087
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332	NC_015565	CCGTTA	2	12	968927	968938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333923089
333	NC_015565	GAAAAA	2	12	969225	969236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333923089
334	NC_015565	GCTGCC	2	12	969675	969686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333923089
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337	NC_015565	CCATAG	2	12	999445	999456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333923109
338	NC_015565	CCGGTA	2	12	1007821	1007832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333923113
339	NC_015565	GGCCCA	2	12	1007855	1007866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333923113
340	NC_015565	GGCCAT	2	12	1008748	1008759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333923114
341	NC_015565	CCGCCA	3	18	1009592	1009609	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	333923114
342	NC_015565	CAATCC	2	12	1010191	1010202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333923114
343	NC_015565	GAAATG	2	12	1014209	1014220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333923117
344	NC_015565	CGCCAT	2	12	1015204	1015215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333923117
345	NC_015565	GCCAGG	2	12	1020240	1020251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333923122
346	NC_015565	CCAGGG	2	12	1027985	1027996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	333923131
347	NC_015565	TTAGTT	2	12	1028036	1028047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333923131
348	NC_015565	TTACCA	2	12	1030700	1030711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333923133
349	NC_015565	TAAAGA	2	12	1035097	1035108	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333923139
350	NC_015565	TAACGA	2	12	1035616	1035627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333923139
351	NC_015565	TTAACG	2	12	1041147	1041158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333923145
352	NC_015565	TAGCTT	2	12	1043044	1043055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333923147
353	NC_015565	GATATT	2	12	1049542	1049553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333923152
354	NC_015565	CATGAT	2	12	1054670	1054681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333923155
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361	NC_015565	GGTGGC	2	12	1068841	1068852	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333923167
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445	NC_015565	TACCCT	2	12	1354756	1354767	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333923423
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458	NC_015565	CTTTGG	2	12	1389957	1389968	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333923457
459	NC_015565	GGGGTA	2	12	1392454	1392465	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333923460
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