MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	GCAGCC	2	12	2495	2506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284808
2	NC_015170	GCGGGC	2	12	2560	2571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284808
3	NC_015170	TGATCG	2	12	3467	3478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325284809
4	NC_015170	CTCGGC	2	12	4616	4627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284810
5	NC_015170	TGACGG	2	12	7829	7840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284812
6	NC_015170	TTTCGG	2	12	10111	10122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325284813
7	NC_015170	AGTGGC	2	12	10193	10204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284813
8	NC_015170	GCCAGG	2	12	13313	13324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284815
9	NC_015170	GCCCGC	2	12	13325	13336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284815
10	NC_015170	CGCTGG	2	12	14038	14049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284816
11	NC_015170	TGCGGG	2	12	17366	17377	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284819
12	NC_015170	GCGCCT	2	12	18160	18171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284820
13	NC_015170	CACCGC	2	12	19546	19557	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284822
14	NC_015170	GGGCGT	2	12	21769	21780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284824
15	NC_015170	GGCCTG	2	12	22361	22372	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284824
16	NC_015170	ACGGCG	2	12	26093	26104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284829
17	NC_015170	GTGCGG	2	12	27790	27801	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284830
18	NC_015170	GAGGGT	2	12	29395	29406	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	325284832
19	NC_015170	GAGAGC	2	12	30551	30562	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325284832
20	NC_015170	TTGACC	2	12	35625	35636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325284835
21	NC_015170	GCGTTC	2	12	41617	41628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284837
22	NC_015170	GGCCAG	2	12	43958	43969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284838
23	NC_015170	CAGCTC	2	12	44219	44230	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284838
24	NC_015170	CCGCAC	2	12	45266	45277	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284839
25	NC_015170	CTGAAG	2	12	45635	45646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284839
26	NC_015170	GCGCAC	2	12	47229	47240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284841
27	NC_015170	TGGCGA	2	12	48879	48890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284842
28	NC_015170	GTCCAC	2	12	51031	51042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284843
29	NC_015170	GCCCCA	2	12	56098	56109	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284848
30	NC_015170	AGGCGG	2	12	57116	57127	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325284849
31	NC_015170	CTCGTC	2	12	57472	57483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325284849
32	NC_015170	GTGAAC	2	12	57862	57873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284849
33	NC_015170	AGGTGT	2	12	58566	58577	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325284849
34	NC_015170	GCTGAA	2	12	58980	58991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284849
35	NC_015170	GGCAAG	2	12	61156	61167	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325284850
36	NC_015170	GCAGCC	2	12	65921	65932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284855
37	NC_015170	GCTGAC	2	12	66498	66509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284855
38	NC_015170	GCTGTC	2	12	71127	71138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284860
39	NC_015170	CCCCGG	2	12	73182	73193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284862
40	NC_015170	GGCCGG	2	12	74040	74051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284862
41	NC_015170	GGGCCG	2	12	74889	74900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284863
42	NC_015170	TGGTGC	2	12	76264	76275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284864
43	NC_015170	CGCTGG	2	12	80240	80251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284867
44	NC_015170	AGGCTG	2	12	80299	80310	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284867
45	NC_015170	TACGGG	2	12	82229	82240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284868
46	NC_015170	CCAGCT	2	12	85717	85728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284871
47	NC_015170	AGGTCG	2	12	86127	86138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284871
48	NC_015170	CAGCGC	2	12	87892	87903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284873
49	NC_015170	GCCAGC	2	12	88178	88189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284873
50	NC_015170	CCCACC	2	12	88301	88312	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	325284873
51	NC_015170	GCCCAG	3	18	88546	88563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284873
52	NC_015170	CGGGGG	2	12	88649	88660	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	325284874
53	NC_015170	ACGCGA	2	12	88725	88736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284874
54	NC_015170	CGTCCT	2	12	90861	90872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325284876
55	NC_015170	CGGCAC	2	12	94361	94372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284879
56	NC_015170	CAGCTG	2	12	95845	95856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284880
57	NC_015170	CGCAGC	2	12	96179	96190	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284880
58	NC_015170	AGGCAC	2	12	98739	98750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284882
59	NC_015170	GTCGAG	2	12	98873	98884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284882
60	NC_015170	CAGCGC	2	12	102629	102640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284886
61	NC_015170	GCTGCC	2	12	103298	103309	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284887
62	NC_015170	GTGCAG	2	12	105198	105209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284890
63	NC_015170	TGCGGG	2	12	105416	105427	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284890
64	NC_015170	CCAGCA	2	12	106696	106707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284891
65	NC_015170	TTTGCC	2	12	106955	106966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325284891
66	NC_015170	CGCTGC	2	12	108426	108437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284893
67	NC_015170	GCCACC	2	12	109012	109023	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284893
68	NC_015170	CCGGGA	2	12	110597	110608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284894
69	NC_015170	GGGCCG	2	12	111240	111251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284895
70	NC_015170	GCTGGG	2	12	113084	113095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284897
71	NC_015170	CTGGAC	2	12	114518	114529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284899
72	NC_015170	CAGCGC	2	12	117746	117757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284902
73	NC_015170	TCGCGG	2	12	119880	119891	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284904
74	NC_015170	CGGCTG	2	12	121464	121475	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284906
75	NC_015170	ACCTGC	2	12	124487	124498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284909
76	NC_015170	GCTGGG	2	12	125643	125654	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325284909
77	NC_015170	GCTGCG	2	12	126486	126497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284909
78	NC_015170	CGCCTT	2	12	126564	126575	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325284909
79	NC_015170	CTGGCG	2	12	127314	127325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.