MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	CGCT	2	8	1370	1377	0 %	25 %	25 %	50 %	325284807
2	NC_015170	TCCA	2	8	1388	1395	25 %	25 %	0 %	50 %	325284807
3	NC_015170	GCCC	2	8	1637	1644	0 %	0 %	25 %	75 %	325284808
4	NC_015170	GCTG	2	8	1759	1766	0 %	25 %	50 %	25 %	325284808
5	NC_015170	CCAG	2	8	2528	2535	25 %	0 %	25 %	50 %	325284808
6	NC_015170	CGCT	2	8	4090	4097	0 %	25 %	25 %	50 %	325284809
7	NC_015170	GGCT	2	8	4318	4325	0 %	25 %	50 %	25 %	325284809
8	NC_015170	CGGC	2	8	4829	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	325284810
9	NC_015170	GGCA	2	8	5255	5262	25 %	0 %	50 %	25 %	325284810
10	NC_015170	GAGG	2	8	5285	5292	25 %	0 %	75 %	0 %	325284810
11	NC_015170	GGCC	2	8	6083	6090	0 %	0 %	50 %	50 %	325284811
12	NC_015170	CATC	2	8	6475	6482	25 %	25 %	0 %	50 %	325284811
13	NC_015170	GGCA	2	8	7021	7028	25 %	0 %	50 %	25 %	325284811
14	NC_015170	CGCC	2	8	7119	7126	0 %	0 %	25 %	75 %	325284811
15	NC_015170	GCCT	2	8	7211	7218	0 %	25 %	25 %	50 %	325284811
16	NC_015170	GGGC	2	8	8016	8023	0 %	0 %	75 %	25 %	325284812
17	NC_015170	CCTG	2	8	8370	8377	0 %	25 %	25 %	50 %	325284812
18	NC_015170	CCAC	2	8	8830	8837	25 %	0 %	0 %	75 %	325284813
19	NC_015170	CACT	2	8	9019	9026	25 %	25 %	0 %	50 %	325284813
20	NC_015170	GGGT	2	8	9035	9042	0 %	25 %	75 %	0 %	325284813
21	NC_015170	TGGC	2	8	9408	9415	0 %	25 %	50 %	25 %	325284813
22	NC_015170	AGGC	2	8	9758	9765	25 %	0 %	50 %	25 %	325284813
23	NC_015170	CGGG	2	8	10840	10847	0 %	0 %	75 %	25 %	325284813
24	NC_015170	GCCT	2	8	10871	10878	0 %	25 %	25 %	50 %	325284813
25	NC_015170	GCCC	2	8	10995	11002	0 %	0 %	25 %	75 %	325284813
26	NC_015170	GCCT	2	8	11004	11011	0 %	25 %	25 %	50 %	325284813
27	NC_015170	TGCT	2	8	11030	11037	0 %	50 %	25 %	25 %	325284813
28	NC_015170	GCCT	2	8	11237	11244	0 %	25 %	25 %	50 %	325284813
29	NC_015170	GCGT	2	8	11292	11299	0 %	25 %	50 %	25 %	325284813
30	NC_015170	GGCT	2	8	11343	11350	0 %	25 %	50 %	25 %	325284813
31	NC_015170	TCAC	2	8	11690	11697	25 %	25 %	0 %	50 %	325284814
32	NC_015170	GTGG	2	8	11897	11904	0 %	25 %	75 %	0 %	325284814
33	NC_015170	CCAT	2	8	12009	12016	25 %	25 %	0 %	50 %	325284814
34	NC_015170	GGCG	2	8	12186	12193	0 %	0 %	75 %	25 %	325284814
35	NC_015170	CGGC	2	8	13820	13827	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
36	NC_015170	GCGT	2	8	13897	13904	0 %	25 %	50 %	25 %	325284816
37	NC_015170	GGCG	2	8	14393	14400	0 %	0 %	75 %	25 %	325284816
38	NC_015170	GGCC	3	12	14717	14728	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
39	NC_015170	CCGG	2	8	14769	14776	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
40	NC_015170	ACCT	2	8	15416	15423	25 %	25 %	0 %	50 %	325284817
41	NC_015170	GCAG	2	8	15476	15483	25 %	0 %	50 %	25 %	325284817
42	NC_015170	CTGG	2	8	15940	15947	0 %	25 %	50 %	25 %	325284817
43	NC_015170	CGGG	2	8	16446	16453	0 %	0 %	75 %	25 %	325284818
44	NC_015170	GACG	2	8	17112	17119	25 %	0 %	50 %	25 %	325284819
45	NC_015170	CGAC	2	8	17507	17514	25 %	0 %	25 %	50 %	325284819
46	NC_015170	CATC	2	8	17806	17813	25 %	25 %	0 %	50 %	325284820
47	NC_015170	CGTG	2	8	18037	18044	0 %	25 %	50 %	25 %	325284820
48	NC_015170	GGAC	2	8	18118	18125	25 %	0 %	50 %	25 %	325284820
49	NC_015170	GACG	2	8	18175	18182	25 %	0 %	50 %	25 %	325284820
50	NC_015170	TGCC	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	325284820
51	NC_015170	CCGA	2	8	18491	18498	25 %	0 %	25 %	50 %	325284820
52	NC_015170	CGAC	2	8	18624	18631	25 %	0 %	25 %	50 %	325284820
53	NC_015170	CGAT	2	8	18738	18745	25 %	25 %	25 %	25 %	325284820
54	NC_015170	GACC	2	8	18873	18880	25 %	0 %	25 %	50 %	325284821
55	NC_015170	GGGC	2	8	19720	19727	0 %	0 %	75 %	25 %	325284822
56	NC_015170	GCTC	2	8	19974	19981	0 %	25 %	25 %	50 %	325284822
57	NC_015170	CACC	2	8	20083	20090	25 %	0 %	0 %	75 %	325284822
58	NC_015170	GGTG	2	8	20473	20480	0 %	25 %	75 %	0 %	325284823
59	NC_015170	CTGG	2	8	20878	20885	0 %	25 %	50 %	25 %	325284823
60	NC_015170	GCGG	2	8	20914	20921	0 %	0 %	75 %	25 %	325284823
61	NC_015170	GGCG	2	8	22204	22211	0 %	0 %	75 %	25 %	325284824
62	NC_015170	GGCG	2	8	22318	22325	0 %	0 %	75 %	25 %	325284824
63	NC_015170	GCCT	2	8	22563	22570	0 %	25 %	25 %	50 %	325284824
64	NC_015170	GCGA	2	8	23386	23393	25 %	0 %	50 %	25 %	325284826
65	NC_015170	CAGC	2	8	24387	24394	25 %	0 %	25 %	50 %	325284827
66	NC_015170	GCGG	2	8	24700	24707	0 %	0 %	75 %	25 %	325284828
67	NC_015170	GACC	2	8	24988	24995	25 %	0 %	25 %	50 %	325284828
68	NC_015170	GACG	2	8	25116	25123	25 %	0 %	50 %	25 %	325284829
69	NC_015170	AAGG	2	8	26236	26243	50 %	0 %	50 %	0 %	325284829
70	NC_015170	GGCC	2	8	26659	26666	0 %	0 %	50 %	50 %	325284830
71	NC_015170	TTCG	2	8	27627	27634	0 %	50 %	25 %	25 %	325284830
72	NC_015170	CTGC	2	8	28169	28176	0 %	25 %	25 %	50 %	325284830
73	NC_015170	CTGG	2	8	28392	28399	0 %	25 %	50 %	25 %	325284831
74	NC_015170	GCAG	2	8	29030	29037	25 %	0 %	50 %	25 %	325284832
75	NC_015170	GCAC	2	8	29171	29178	25 %	0 %	25 %	50 %	325284832
76	NC_015170	CCGC	2	8	29544	29551	0 %	0 %	25 %	75 %	325284832
77	NC_015170	CAAG	2	8	29622	29629	50 %	0 %	25 %	25 %	325284832
78	NC_015170	TCGC	2	8	29767	29774	0 %	25 %	25 %	50 %	325284832
79	NC_015170	CTTG	2	8	30147	30154	0 %	50 %	25 %	25 %	325284832
80	NC_015170	CTGC	2	8	30921	30928	0 %	25 %	25 %	50 %	325284832
81	NC_015170	AGCG	2	8	31031	31038	25 %	0 %	50 %	25 %	325284832
82	NC_015170	CTGG	2	8	31769	31776	0 %	25 %	50 %	25 %	325284833
83	NC_015170	AGCC	2	8	31852	31859	25 %	0 %	25 %	50 %	325284833
84	NC_015170	TCCG	2	8	31967	31974	0 %	25 %	25 %	50 %	325284833
85	NC_015170	GCCG	2	8	32204	32211	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
86	NC_015170	GCCC	2	8	32272	32279	0 %	0 %	25 %	75 %	325284833
87	NC_015170	CGGC	2	8	32428	32435	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
88	NC_015170	GGGC	2	8	32911	32918	0 %	0 %	75 %	25 %	325284833
89	NC_015170	CCAG	2	8	33930	33937	25 %	0 %	25 %	50 %	325284834
90	NC_015170	CCCG	2	8	34073	34080	0 %	0 %	25 %	75 %	325284834
91	NC_015170	CCAC	2	8	34177	34184	25 %	0 %	0 %	75 %	325284834
92	NC_015170	CTGG	2	8	35656	35663	0 %	25 %	50 %	25 %	325284835
93	NC_015170	GCCC	2	8	35889	35896	0 %	0 %	25 %	75 %	325284835
94	NC_015170	ACCG	2	8	36197	36204	25 %	0 %	25 %	50 %	325284835
95	NC_015170	CTTT	2	8	36844	36851	0 %	75 %	0 %	25 %	325284836
96	NC_015170	CCAG	3	12	37025	37036	25 %	0 %	25 %	50 %	325284836
97	NC_015170	GAAC	2	8	37176	37183	50 %	0 %	25 %	25 %	325284836
98	NC_015170	CTGG	2	8	41304	41311	0 %	25 %	50 %	25 %	325284837
99	NC_015170	ATTG	2	8	41829	41836	25 %	50 %	25 %	0 %	325284837
100	NC_015170	TGAG	2	8	42003	42010	25 %	25 %	50 %	0 %	325284838
101	NC_015170	CCCG	2	8	42329	42336	0 %	0 %	25 %	75 %	325284838
102	NC_015170	AGGG	2	8	42608	42615	25 %	0 %	75 %	0 %	325284838
103	NC_015170	GTCC	2	8	42805	42812	0 %	25 %	25 %	50 %	325284838
104	NC_015170	GGCC	2	8	42842	42849	0 %	0 %	50 %	50 %	325284838
105	NC_015170	CGCC	2	8	43042	43049	0 %	0 %	25 %	75 %	325284838
106	NC_015170	TGCG	2	8	43146	43153	0 %	25 %	50 %	25 %	325284838
107	NC_015170	GCCC	2	8	43495	43502	0 %	0 %	25 %	75 %	325284838
108	NC_015170	GCAC	2	8	43693	43700	25 %	0 %	25 %	50 %	325284838
109	NC_015170	TGCC	2	8	44084	44091	0 %	25 %	25 %	50 %	325284838
110	NC_015170	CATC	2	8	44653	44660	25 %	25 %	0 %	50 %	325284839
111	NC_015170	ACTG	2	8	45131	45138	25 %	25 %	25 %	25 %	325284839
112	NC_015170	CATC	2	8	45397	45404	25 %	25 %	0 %	50 %	325284839
113	NC_015170	TGGA	2	8	46171	46178	25 %	25 %	50 %	0 %	325284841
114	NC_015170	CAGG	2	8	46945	46952	25 %	0 %	50 %	25 %	325284841
115	NC_015170	AGGG	2	8	47528	47535	25 %	0 %	75 %	0 %	325284841
116	NC_015170	CGAG	2	8	48654	48661	25 %	0 %	50 %	25 %	325284842
117	NC_015170	GCGG	2	8	48669	48676	0 %	0 %	75 %	25 %	325284842
118	NC_015170	TGAA	2	8	49535	49542	50 %	25 %	25 %	0 %	325284843
119	NC_015170	CCCG	2	8	49882	49889	0 %	0 %	25 %	75 %	325284843
120	NC_015170	CCCG	2	8	51443	51450	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
121	NC_015170	GCCC	2	8	51509	51516	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
122	NC_015170	GCCC	2	8	51713	51720	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
123	NC_015170	CCCT	2	8	52476	52483	0 %	25 %	0 %	75 %	325284845
124	NC_015170	GCTG	2	8	52537	52544	0 %	25 %	50 %	25 %	325284845
125	NC_015170	CCCG	2	8	53059	53066	0 %	0 %	25 %	75 %	325284845
126	NC_015170	GCGG	2	8	54175	54182	0 %	0 %	75 %	25 %	325284846
127	NC_015170	ACGG	2	8	54308	54315	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
128	NC_015170	GCAA	2	8	54534	54541	50 %	0 %	25 %	25 %	325284847
129	NC_015170	GCTG	2	8	54892	54899	0 %	25 %	50 %	25 %	325284847
130	NC_015170	GGGC	2	8	54947	54954	0 %	0 %	75 %	25 %	325284847
131	NC_015170	GCGG	2	8	54961	54968	0 %	0 %	75 %	25 %	325284847
132	NC_015170	GACG	2	8	55077	55084	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
133	NC_015170	AGGC	2	8	55365	55372	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
134	NC_015170	ACCG	2	8	55703	55710	25 %	0 %	25 %	50 %	325284847
135	NC_015170	GCAG	2	8	55749	55756	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
136	NC_015170	CCAG	2	8	56229	56236	25 %	0 %	25 %	50 %	325284848
137	NC_015170	CGTC	2	8	57657	57664	0 %	25 %	25 %	50 %	325284849
138	NC_015170	GGCG	3	12	57883	57894	0 %	0 %	75 %	25 %	325284849
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.