MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 2917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015170	GCC	2	6	48747	48752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284842
1002	NC_015170	CCG	2	6	48792	48797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284842
1003	NC_015170	CGG	2	6	48801	48806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284842
1004	NC_015170	CAG	2	6	48814	48819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284842
1005	NC_015170	CAG	2	6	48832	48837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284842
1006	NC_015170	GCC	2	6	48851	48856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284842
1007	NC_015170	TGGCGA	2	12	48879	48890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284842
1008	NC_015170	ACCAG	2	10	48915	48924	40 %	0 %	20 %	40 %	325284842
1009	NC_015170	GGC	2	6	49024	49029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284842
1010	NC_015170	CAG	2	6	49042	49047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284842
1011	NC_015170	GCC	2	6	49066	49071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284842
1012	NC_015170	TGG	2	6	49080	49085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284842
1013	NC_015170	CAG	2	6	49236	49241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284842
1014	NC_015170	TGAA	2	8	49535	49542	50 %	25 %	25 %	0 %	325284843
1015	NC_015170	GCC	2	6	49568	49573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284843
1016	NC_015170	GAT	2	6	49600	49605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284843
1017	NC_015170	CGC	2	6	49824	49829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284843
1018	NC_015170	GGT	2	6	49834	49839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284843
1019	NC_015170	CTG	2	6	49876	49881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284843
1020	NC_015170	CCCG	2	8	49882	49889	0 %	0 %	25 %	75 %	325284843
1021	NC_015170	TGG	3	9	49902	49910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284843
1022	NC_015170	TCA	2	6	49980	49985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284843
1023	NC_015170	GCG	2	6	50000	50005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1024	NC_015170	TTC	2	6	50071	50076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284843
1025	NC_015170	GC	3	6	50134	50139	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
1026	NC_015170	GGT	2	6	50251	50256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284843
1027	NC_015170	GGC	2	6	50257	50262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1028	NC_015170	CAC	3	9	50278	50286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284843
1029	NC_015170	GCG	2	6	50304	50309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1030	NC_015170	GCA	2	6	50370	50375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284843
1031	NC_015170	CCT	2	6	50388	50393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284843
1032	NC_015170	GCC	2	6	50404	50409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284843
1033	NC_015170	GC	3	6	50410	50415	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
1034	NC_015170	GCA	2	6	50448	50453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284843
1035	NC_015170	TGA	2	6	50508	50513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284843
1036	NC_015170	CAG	2	6	50527	50532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284843
1037	NC_015170	CGG	2	6	50796	50801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1038	NC_015170	TCA	2	6	50829	50834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284843
1039	NC_015170	CGT	2	6	50970	50975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284843
1040	NC_015170	GAT	2	6	50983	50988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284843
1041	NC_015170	GGC	2	6	50989	50994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1042	NC_015170	GCG	2	6	50999	51004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1043	NC_015170	GTCCAC	2	12	51031	51042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284843
1044	NC_015170	CGG	2	6	51066	51071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284843
1045	NC_015170	GCC	2	6	51175	51180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1046	NC_015170	GCA	2	6	51212	51217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1047	NC_015170	CCG	2	6	51269	51274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1048	NC_015170	GCC	2	6	51323	51328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1049	NC_015170	CCG	3	9	51335	51343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1050	NC_015170	GGT	2	6	51396	51401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284844
1051	NC_015170	CGG	2	6	51419	51424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284844
1052	NC_015170	CCCG	2	8	51443	51450	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
1053	NC_015170	CGA	2	6	51494	51499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1054	NC_015170	GCCC	2	8	51509	51516	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
1055	NC_015170	CAGCG	2	10	51529	51538	20 %	0 %	40 %	40 %	325284844
1056	NC_015170	TCC	2	6	51550	51555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284844
1057	NC_015170	GGC	2	6	51611	51616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284844
1058	NC_015170	GCCC	2	8	51713	51720	0 %	0 %	25 %	75 %	325284844
1059	NC_015170	CGC	2	6	51722	51727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1060	NC_015170	GCC	2	6	51793	51798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1061	NC_015170	GTG	2	6	51874	51879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284844
1062	NC_015170	GCG	2	6	51951	51956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284844
1063	NC_015170	GCA	2	6	51961	51966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1064	NC_015170	GCT	2	6	51977	51982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1065	NC_015170	CCA	2	6	51983	51988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284844
1066	NC_015170	CCG	2	6	51992	51997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1067	NC_015170	CGC	2	6	52037	52042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284844
1068	NC_015170	CAG	2	6	52050	52055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1069	NC_015170	GCA	2	6	52217	52222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284844
1070	NC_015170	GGA	2	6	52260	52265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284844
1071	NC_015170	TGG	2	6	52277	52282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284844
1072	NC_015170	CCCT	2	8	52476	52483	0 %	25 %	0 %	75 %	325284845
1073	NC_015170	G	7	7	52491	52497	0 %	0 %	100 %	0 %	325284845
1074	NC_015170	GCT	2	6	52505	52510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1075	NC_015170	GCTG	2	8	52537	52544	0 %	25 %	50 %	25 %	325284845
1076	NC_015170	GCC	2	6	52557	52562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284845
1077	NC_015170	GAC	2	6	52587	52592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1078	NC_015170	TG	3	6	52601	52606	0 %	50 %	50 %	0 %	325284845
1079	NC_015170	TGC	2	6	52672	52677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1080	NC_015170	CCA	2	6	52693	52698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284845
1081	NC_015170	GGC	3	9	52727	52735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1082	NC_015170	GCG	2	6	52803	52808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1083	NC_015170	CTG	2	6	52809	52814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1084	NC_015170	GCT	2	6	52826	52831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1085	NC_015170	AGG	2	6	52846	52851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284845
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1087	NC_015170	CGG	2	6	52928	52933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1088	NC_015170	CGG	2	6	52952	52957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1089	NC_015170	GGC	2	6	52982	52987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1090	NC_015170	CGA	2	6	53000	53005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1091	NC_015170	GCT	2	6	53021	53026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1092	NC_015170	CCCG	2	8	53059	53066	0 %	0 %	25 %	75 %	325284845
1093	NC_015170	GCC	2	6	53074	53079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284845
1094	NC_015170	CTG	2	6	53097	53102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1095	NC_015170	CGG	2	6	53218	53223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1096	NC_015170	GGC	2	6	53225	53230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284845
1097	NC_015170	CAC	2	6	53250	53255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284845
1098	NC_015170	GCT	2	6	53270	53275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284845
1099	NC_015170	T	7	7	54106	54112	0 %	100 %	0 %	0 %	325284846
1100	NC_015170	CGC	2	6	54135	54140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284846
1101	NC_015170	GCG	2	6	54157	54162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284846
1102	NC_015170	GCGG	2	8	54175	54182	0 %	0 %	75 %	25 %	325284846
1103	NC_015170	CGA	2	6	54204	54209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284846
1104	NC_015170	CGG	2	6	54219	54224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284846
1105	NC_015170	ACGG	2	8	54308	54315	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
1106	NC_015170	TTG	2	6	54341	54346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284847
1107	NC_015170	GCT	2	6	54499	54504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284847
1108	NC_015170	GCC	2	6	54516	54521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284847
1109	NC_015170	GCAA	2	8	54534	54541	50 %	0 %	25 %	25 %	325284847
1110	NC_015170	GGACT	2	10	54574	54583	20 %	20 %	40 %	20 %	325284847
1111	NC_015170	GCT	2	6	54611	54616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284847
1112	NC_015170	CGA	2	6	54625	54630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284847
1113	NC_015170	GCC	2	6	54656	54661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284847
1114	NC_015170	GCA	2	6	54670	54675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284847
1115	NC_015170	GCT	3	9	54703	54711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284847
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1117	NC_015170	CAC	2	6	54844	54849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284847
1118	NC_015170	ACC	2	6	54860	54865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284847
1119	NC_015170	GCTG	2	8	54892	54899	0 %	25 %	50 %	25 %	325284847
1120	NC_015170	GAC	2	6	54911	54916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284847
1121	NC_015170	GGGC	2	8	54947	54954	0 %	0 %	75 %	25 %	325284847
1122	NC_015170	GCGG	2	8	54961	54968	0 %	0 %	75 %	25 %	325284847
1123	NC_015170	GCG	2	6	55018	55023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284847
1124	NC_015170	GACG	2	8	55077	55084	25 %	0 %	50 %	25 %	325284847
1125	NC_015170	AGC	2	6	55161	55166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284847
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1130	NC_015170	GCG	2	6	55307	55312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284847
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1150	NC_015170	TGC	2	6	56262	56267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284848
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1235	NC_015170	TCCAC	2	10	60264	60273	20 %	20 %	0 %	60 %	325284850
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1245	NC_015170	GGC	2	6	60675	60680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284850
1246	NC_015170	CGG	2	6	60692	60697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284850
1247	NC_015170	CAG	2	6	60727	60732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284850
1248	NC_015170	AGC	2	6	60797	60802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284850
1249	NC_015170	CCG	2	6	60863	60868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284850
1250	NC_015170	GCA	2	6	60902	60907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284850
1251	NC_015170	TGG	2	6	61022	61027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284850
1252	NC_015170	CTG	2	6	61030	61035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284850
1253	NC_015170	CGA	2	6	61044	61049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284850
1254	NC_015170	GCG	2	6	61077	61082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284850
1255	NC_015170	GCCCA	2	10	61119	61128	20 %	0 %	20 %	60 %	325284850
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1261	NC_015170	CCT	2	6	61339	61344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284850
1262	NC_015170	CGA	2	6	61487	61492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284850
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1265	NC_015170	GACT	2	8	61602	61609	25 %	25 %	25 %	25 %	325284850
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1272	NC_015170	GCTGC	2	10	62556	62565	0 %	20 %	40 %	40 %	325284851
1273	NC_015170	GAT	2	6	62568	62573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284851
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1278	NC_015170	CCGCC	2	10	63074	63083	0 %	0 %	20 %	80 %	325284853
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1281	NC_015170	C	6	6	63325	63330	0 %	0 %	0 %	100 %	325284853
1282	NC_015170	CAA	2	6	63375	63380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284853
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1284	NC_015170	GGT	2	6	63461	63466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284853
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1296	NC_015170	TGG	2	6	64590	64595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284854
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1320	NC_015170	CGG	2	6	66439	66444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284855
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1322	NC_015170	GCTGAC	2	12	66498	66509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284855
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1329	NC_015170	AGTGG	2	10	66983	66992	20 %	20 %	60 %	0 %	325284856
1330	NC_015170	GCG	2	6	67012	67017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284856
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1333	NC_015170	GCA	2	6	67081	67086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284856
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1354	NC_015170	CGC	2	6	67844	67849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284857
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1356	NC_015170	CA	3	6	67890	67895	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
1357	NC_015170	AAC	2	6	67900	67905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284857
1358	NC_015170	GGT	2	6	67946	67951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284857
1359	NC_015170	AGG	2	6	67969	67974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284857
1360	NC_015170	GGC	2	6	67983	67988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284857
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1362	NC_015170	GCT	2	6	68045	68050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284857
1363	NC_015170	GAC	2	6	68100	68105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284857
1364	NC_015170	GGCG	2	8	68153	68160	0 %	0 %	75 %	25 %	325284857
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1370	NC_015170	GCG	2	6	68401	68406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284858
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1372	NC_015170	TGG	2	6	68436	68441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284858
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1496	NC_015170	CGG	2	6	74213	74218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284862
1497	NC_015170	AGC	2	6	74234	74239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284862
1498	NC_015170	GGT	2	6	74253	74258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284862
1499	NC_015170	CGG	2	6	74261	74266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284862
1500	NC_015170	CTG	2	6	74280	74285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284862

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