MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 1465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015163	GAA	2	6	34193	34198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284489
502	NC_015163	TCC	2	6	34297	34302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284489
503	NC_015163	TGC	2	6	34303	34308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284489
504	NC_015163	CCA	2	6	34473	34478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284489
505	NC_015163	TCG	2	6	34501	34506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284489
506	NC_015163	CGT	2	6	34515	34520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284489
507	NC_015163	GAAC	2	8	34530	34537	50 %	0 %	25 %	25 %	325284489
508	NC_015163	CAG	2	6	34910	34915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
509	NC_015163	GAT	2	6	35002	35007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284490
510	NC_015163	GAG	2	6	35014	35019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284490
511	NC_015163	ATCA	2	8	35021	35028	50 %	25 %	0 %	25 %	325284490
512	NC_015163	CGC	2	6	35064	35069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284490
513	NC_015163	AAGAA	2	10	35075	35084	80 %	0 %	20 %	0 %	325284490
514	NC_015163	AGC	2	6	35109	35114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
515	NC_015163	TCG	2	6	35142	35147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284490
516	NC_015163	TGA	2	6	35281	35286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284490
517	NC_015163	CTC	2	6	35333	35338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284490
518	NC_015163	TGG	2	6	35370	35375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284490
519	NC_015163	CGT	2	6	35417	35422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284490
520	NC_015163	GAC	2	6	35468	35473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
521	NC_015163	GGAA	2	8	35481	35488	50 %	0 %	50 %	0 %	325284490
522	NC_015163	CGA	2	6	35527	35532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
523	NC_015163	CGA	2	6	35571	35576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
524	NC_015163	TCA	2	6	35598	35603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284490
525	NC_015163	AGC	2	6	35646	35651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
526	NC_015163	CAG	2	6	35674	35679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284490
527	NC_015163	AAG	2	6	35684	35689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284490
528	NC_015163	AG	3	6	35840	35845	50 %	0 %	50 %	0 %	325284490
529	NC_015163	CTG	2	6	35927	35932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284490
530	NC_015163	AGG	2	6	35953	35958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284490
531	NC_015163	GAAGT	2	10	35964	35973	40 %	20 %	40 %	0 %	325284490
532	NC_015163	TC	3	6	36189	36194	0 %	50 %	0 %	50 %	325284491
533	NC_015163	TTC	2	6	36255	36260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284491
534	NC_015163	TCC	2	6	36315	36320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284491
535	NC_015163	GCC	2	6	36367	36372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284491
536	NC_015163	CCA	2	6	36400	36405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284491
537	NC_015163	GCT	2	6	36422	36427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284491
538	NC_015163	GCA	2	6	36446	36451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284491
539	NC_015163	GCT	2	6	36483	36488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284491
540	NC_015163	AG	3	6	36492	36497	50 %	0 %	50 %	0 %	325284491
541	NC_015163	GCA	2	6	36518	36523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284491
542	NC_015163	CAG	2	6	36559	36564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284491
543	NC_015163	CGG	2	6	36607	36612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284491
544	NC_015163	TTTC	2	8	36660	36667	0 %	75 %	0 %	25 %	325284491
545	NC_015163	GACG	2	8	36707	36714	25 %	0 %	50 %	25 %	325284491
546	NC_015163	GCT	2	6	36734	36739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284491
547	NC_015163	TTG	2	6	36747	36752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284491
548	NC_015163	CAC	2	6	36810	36815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284491
549	NC_015163	TCCG	2	8	36838	36845	0 %	25 %	25 %	50 %	325284491
550	NC_015163	CTG	2	6	36919	36924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284491
551	NC_015163	GGT	2	6	36938	36943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284491
552	NC_015163	T	8	8	37000	37007	0 %	100 %	0 %	0 %	325284492
553	NC_015163	ATG	2	6	37038	37043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284492
554	NC_015163	GCT	2	6	37051	37056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284492
555	NC_015163	CTTC	2	8	37060	37067	0 %	50 %	0 %	50 %	325284492
556	NC_015163	CTT	2	6	37073	37078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284492
557	NC_015163	AGC	2	6	37181	37186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284492
558	NC_015163	CACTGG	4	24	37765	37788	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284493
559	NC_015163	CGG	2	6	37873	37878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284493
560	NC_015163	GAC	2	6	37893	37898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284493
561	NC_015163	GCA	2	6	37931	37936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284493
562	NC_015163	TCA	2	6	38092	38097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284493
563	NC_015163	ACT	2	6	38238	38243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284493
564	NC_015163	GAAT	2	8	38304	38311	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
565	NC_015163	GAT	2	6	38374	38379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284494
566	NC_015163	GAAT	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	325284494
567	NC_015163	ACC	2	6	38435	38440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284494
568	NC_015163	ATG	2	6	38459	38464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284495
569	NC_015163	GAT	2	6	38488	38493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284495
570	NC_015163	GGC	2	6	38495	38500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284495
571	NC_015163	TCA	2	6	38529	38534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284495
572	NC_015163	ATG	2	6	38537	38542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284495
573	NC_015163	CAT	2	6	38629	38634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284495
574	NC_015163	CAG	2	6	38642	38647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284495
575	NC_015163	TGG	2	6	38673	38678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284495
576	NC_015163	GCA	2	6	38710	38715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284495
577	NC_015163	GAT	2	6	38725	38730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284495
578	NC_015163	ATG	2	6	38819	38824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284495
579	NC_015163	CTG	2	6	38834	38839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284495
580	NC_015163	AGA	2	6	38865	38870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284495
581	NC_015163	CAT	2	6	38881	38886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284495
582	NC_015163	CAG	2	6	38918	38923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284495
583	NC_015163	AAGT	2	8	38939	38946	50 %	25 %	25 %	0 %	325284495
584	NC_015163	TTG	2	6	39032	39037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284496
585	NC_015163	CTGGA	2	10	39160	39169	20 %	20 %	40 %	20 %	325284496
586	NC_015163	TGC	2	6	39170	39175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284496
587	NC_015163	GTG	2	6	39254	39259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284496
588	NC_015163	AAG	2	6	39260	39265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284496
589	NC_015163	GAC	2	6	39298	39303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284496
590	NC_015163	GCG	2	6	39360	39365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284496
591	NC_015163	GAA	2	6	39379	39384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284496
592	NC_015163	TGGCC	2	10	39506	39515	0 %	20 %	40 %	40 %	325284496
593	NC_015163	CTG	2	6	39526	39531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284496
594	NC_015163	GTG	2	6	39571	39576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284496
595	NC_015163	AC	3	6	39623	39628	50 %	0 %	0 %	50 %	325284496
596	NC_015163	GAA	2	6	39673	39678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284496
597	NC_015163	TTC	2	6	39691	39696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284497
598	NC_015163	GCT	3	9	39702	39710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284497
599	NC_015163	CTG	2	6	39730	39735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284497
600	NC_015163	TC	3	6	39753	39758	0 %	50 %	0 %	50 %	325284497
601	NC_015163	ATG	2	6	39814	39819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284497
602	NC_015163	ACC	2	6	39880	39885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284497
603	NC_015163	CGT	2	6	39905	39910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284497
604	NC_015163	G	6	6	39921	39926	0 %	0 %	100 %	0 %	325284497
605	NC_015163	CCG	2	6	39957	39962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284497
606	NC_015163	CTG	2	6	39982	39987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284497
607	NC_015163	GACAG	2	10	40041	40050	40 %	0 %	40 %	20 %	325284497
608	NC_015163	CT	3	6	40057	40062	0 %	50 %	0 %	50 %	325284497
609	NC_015163	CA	3	6	40070	40075	50 %	0 %	0 %	50 %	325284497
610	NC_015163	TGCG	2	8	40154	40161	0 %	25 %	50 %	25 %	325284497
611	NC_015163	GGC	2	6	40167	40172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284497
612	NC_015163	TGA	2	6	40208	40213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284497
613	NC_015163	CGC	2	6	40224	40229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284497
614	NC_015163	TGA	2	6	40443	40448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284497
615	NC_015163	AC	3	6	40497	40502	50 %	0 %	0 %	50 %	325284497
616	NC_015163	GCGG	2	8	40507	40514	0 %	0 %	75 %	25 %	325284497
617	NC_015163	CAGA	2	8	40534	40541	50 %	0 %	25 %	25 %	325284497
618	NC_015163	GCA	2	6	40543	40548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284497
619	NC_015163	CCG	2	6	40589	40594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284497
620	NC_015163	GGGT	2	8	40667	40674	0 %	25 %	75 %	0 %	325284497
621	NC_015163	GTG	2	6	40723	40728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284497
622	NC_015163	GGGCA	2	10	40738	40747	20 %	0 %	60 %	20 %	325284497
623	NC_015163	GGC	2	6	41422	41427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284498
624	NC_015163	GCG	2	6	41434	41439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284498
625	NC_015163	GCA	2	6	41440	41445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284498
626	NC_015163	CACG	2	8	41524	41531	25 %	0 %	25 %	50 %	325284498
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869	NC_015163	GA	3	6	60794	60799	50 %	0 %	50 %	0 %	325284510
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1000	NC_015163	CAG	2	6	68902	68907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284517

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