MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	TC	3	6	1137	1142	0 %	50 %	0 %	50 %	325284232
2	NC_015162	CG	3	6	4084	4089	0 %	0 %	50 %	50 %	325284234
3	NC_015162	GT	3	6	4782	4787	0 %	50 %	50 %	0 %	325284234
4	NC_015162	AG	3	6	4922	4927	50 %	0 %	50 %	0 %	325284235
5	NC_015162	TC	3	6	5480	5485	0 %	50 %	0 %	50 %	325284235
6	NC_015162	AT	3	6	5809	5814	50 %	50 %	0 %	0 %	325284235
7	NC_015162	TC	3	6	5836	5841	0 %	50 %	0 %	50 %	325284235
8	NC_015162	TA	3	6	5951	5956	50 %	50 %	0 %	0 %	325284235
9	NC_015162	TC	3	6	6177	6182	0 %	50 %	0 %	50 %	325284236
10	NC_015162	CA	3	6	14569	14574	50 %	0 %	0 %	50 %	325284246
11	NC_015162	CA	4	8	14605	14612	50 %	0 %	0 %	50 %	325284246
12	NC_015162	TG	3	6	15727	15732	0 %	50 %	50 %	0 %	325284248
13	NC_015162	GC	3	6	15885	15890	0 %	0 %	50 %	50 %	325284249
14	NC_015162	GC	3	6	15972	15977	0 %	0 %	50 %	50 %	325284249
15	NC_015162	GA	3	6	16217	16222	50 %	0 %	50 %	0 %	325284249
16	NC_015162	CG	3	6	17415	17420	0 %	0 %	50 %	50 %	325284252
17	NC_015162	CA	3	6	17816	17821	50 %	0 %	0 %	50 %	325284253
18	NC_015162	GC	3	6	20844	20849	0 %	0 %	50 %	50 %	325284259
19	NC_015162	GC	3	6	21607	21612	0 %	0 %	50 %	50 %	325284260
20	NC_015162	CG	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	325284267
21	NC_015162	GC	3	6	25147	25152	0 %	0 %	50 %	50 %	325284268
22	NC_015162	CG	3	6	26554	26559	0 %	0 %	50 %	50 %	325284270
23	NC_015162	CG	3	6	26769	26774	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
24	NC_015162	CG	3	6	27709	27714	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
25	NC_015162	CG	4	8	28038	28045	0 %	0 %	50 %	50 %	325284271
26	NC_015162	TC	3	6	30202	30207	0 %	50 %	0 %	50 %	325284274
27	NC_015162	GC	3	6	31412	31417	0 %	0 %	50 %	50 %	325284277
28	NC_015162	GC	3	6	32887	32892	0 %	0 %	50 %	50 %	325284280
29	NC_015162	GC	3	6	34146	34151	0 %	0 %	50 %	50 %	325284282
30	NC_015162	GC	4	8	35704	35711	0 %	0 %	50 %	50 %	325284284
31	NC_015162	AC	3	6	38498	38503	50 %	0 %	0 %	50 %	325284285
32	NC_015162	GC	3	6	38628	38633	0 %	0 %	50 %	50 %	325284286
33	NC_015162	TG	3	6	39752	39757	0 %	50 %	50 %	0 %	325284286
34	NC_015162	GC	3	6	40206	40211	0 %	0 %	50 %	50 %	325284286
35	NC_015162	GC	3	6	40665	40670	0 %	0 %	50 %	50 %	325284287
36	NC_015162	AC	3	6	41376	41381	50 %	0 %	0 %	50 %	325284288
37	NC_015162	GC	3	6	43099	43104	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
38	NC_015162	GC	3	6	43192	43197	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
39	NC_015162	GC	3	6	43595	43600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284290
40	NC_015162	GC	3	6	44228	44233	0 %	0 %	50 %	50 %	325284291
41	NC_015162	GC	3	6	44721	44726	0 %	0 %	50 %	50 %	325284291
42	NC_015162	CG	4	8	45593	45600	0 %	0 %	50 %	50 %	325284292
43	NC_015162	AG	3	6	46398	46403	50 %	0 %	50 %	0 %	325284293
44	NC_015162	CG	3	6	47854	47859	0 %	0 %	50 %	50 %	325284294
45	NC_015162	AC	3	6	48880	48885	50 %	0 %	0 %	50 %	325284295
46	NC_015162	TC	3	6	50365	50370	0 %	50 %	0 %	50 %	325284295
47	NC_015162	GC	3	6	51028	51033	0 %	0 %	50 %	50 %	325284295
48	NC_015162	GA	3	6	51537	51542	50 %	0 %	50 %	0 %	325284295
49	NC_015162	TG	3	6	51815	51820	0 %	50 %	50 %	0 %	325284295
50	NC_015162	GA	3	6	53004	53009	50 %	0 %	50 %	0 %	325284295
51	NC_015162	CG	3	6	54364	54369	0 %	0 %	50 %	50 %	325284297
52	NC_015162	AC	3	6	55077	55082	50 %	0 %	0 %	50 %	325284298
53	NC_015162	GC	4	8	56086	56093	0 %	0 %	50 %	50 %	325284298
54	NC_015162	AG	3	6	56562	56567	50 %	0 %	50 %	0 %	325284298
55	NC_015162	CA	3	6	57603	57608	50 %	0 %	0 %	50 %	325284300
56	NC_015162	GT	3	6	58308	58313	0 %	50 %	50 %	0 %	325284300
57	NC_015162	GA	3	6	59889	59894	50 %	0 %	50 %	0 %	325284301
58	NC_015162	AC	3	6	60279	60284	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
59	NC_015162	AC	3	6	60494	60499	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
60	NC_015162	CA	3	6	60766	60771	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
61	NC_015162	CA	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
62	NC_015162	GC	3	6	61063	61068	0 %	0 %	50 %	50 %	325284302
63	NC_015162	GC	3	6	63205	63210	0 %	0 %	50 %	50 %	325284305
64	NC_015162	CA	3	6	64063	64068	50 %	0 %	0 %	50 %	325284306
65	NC_015162	AG	3	6	64302	64307	50 %	0 %	50 %	0 %	325284306
66	NC_015162	GC	3	6	64548	64553	0 %	0 %	50 %	50 %	325284307
67	NC_015162	AC	3	6	65218	65223	50 %	0 %	0 %	50 %	325284308
68	NC_015162	GC	3	6	65492	65497	0 %	0 %	50 %	50 %	325284308
69	NC_015162	GC	3	6	66017	66022	0 %	0 %	50 %	50 %	325284309
70	NC_015162	TC	3	6	66290	66295	0 %	50 %	0 %	50 %	325284309
71	NC_015162	CA	3	6	66705	66710	50 %	0 %	0 %	50 %	325284309
72	NC_015162	CA	3	6	66800	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	325284309
73	NC_015162	TC	3	6	68955	68960	0 %	50 %	0 %	50 %	325284312
74	NC_015162	GC	3	6	70383	70388	0 %	0 %	50 %	50 %	325284314
75	NC_015162	AC	3	6	71202	71207	50 %	0 %	0 %	50 %	325284316
76	NC_015162	TG	3	6	72248	72253	0 %	50 %	50 %	0 %	325284316
77	NC_015162	CG	3	6	72820	72825	0 %	0 %	50 %	50 %	325284317
78	NC_015162	CA	3	6	73478	73483	50 %	0 %	0 %	50 %	325284318
79	NC_015162	CA	3	6	73981	73986	50 %	0 %	0 %	50 %	325284319
80	NC_015162	GA	3	6	75422	75427	50 %	0 %	50 %	0 %	325284321
81	NC_015162	TC	3	6	76854	76859	0 %	50 %	0 %	50 %	325284322
82	NC_015162	CT	3	6	76944	76949	0 %	50 %	0 %	50 %	325284323
83	NC_015162	GC	3	6	76973	76978	0 %	0 %	50 %	50 %	325284323
84	NC_015162	CT	3	6	78078	78083	0 %	50 %	0 %	50 %	325284325
85	NC_015162	GT	3	6	78375	78380	0 %	50 %	50 %	0 %	325284325
86	NC_015162	AG	3	6	79676	79681	50 %	0 %	50 %	0 %	325284326
87	NC_015162	CT	3	6	79687	79692	0 %	50 %	0 %	50 %	325284326
88	NC_015162	CA	3	6	81718	81723	50 %	0 %	0 %	50 %	325284328
89	NC_015162	CA	3	6	84331	84336	50 %	0 %	0 %	50 %	325284331
90	NC_015162	GC	3	6	85671	85676	0 %	0 %	50 %	50 %	325284333
91	NC_015162	GC	3	6	85834	85839	0 %	0 %	50 %	50 %	325284333
92	NC_015162	GT	3	6	86076	86081	0 %	50 %	50 %	0 %	325284333
93	NC_015162	GC	4	8	87246	87253	0 %	0 %	50 %	50 %	325284335
94	NC_015162	GC	3	6	87533	87538	0 %	0 %	50 %	50 %	325284335
95	NC_015162	CA	3	6	89948	89953	50 %	0 %	0 %	50 %	325284339
96	NC_015162	GT	3	6	90781	90786	0 %	50 %	50 %	0 %	325284341
97	NC_015162	CT	4	8	91865	91872	0 %	50 %	0 %	50 %	325284342
98	NC_015162	CA	3	6	91927	91932	50 %	0 %	0 %	50 %	325284342
99	NC_015162	AG	3	6	92332	92337	50 %	0 %	50 %	0 %	325284342
100	NC_015162	GC	3	6	92954	92959	0 %	0 %	50 %	50 %	325284343
101	NC_015162	CT	3	6	93671	93676	0 %	50 %	0 %	50 %	325284345
102	NC_015162	AC	3	6	95097	95102	50 %	0 %	0 %	50 %	325284348
103	NC_015162	CG	3	6	97151	97156	0 %	0 %	50 %	50 %	325284348
104	NC_015162	CG	3	6	98205	98210	0 %	0 %	50 %	50 %	325284349
105	NC_015162	CA	3	6	98433	98438	50 %	0 %	0 %	50 %	325284350
106	NC_015162	TG	3	6	99361	99366	0 %	50 %	50 %	0 %	325284352
107	NC_015162	TG	3	6	100123	100128	0 %	50 %	50 %	0 %	325284353
108	NC_015162	AG	3	6	100148	100153	50 %	0 %	50 %	0 %	325284353
109	NC_015162	GT	3	6	101723	101728	0 %	50 %	50 %	0 %	325284355
110	NC_015162	GT	3	6	101972	101977	0 %	50 %	50 %	0 %	325284355
111	NC_015162	GC	4	8	103234	103241	0 %	0 %	50 %	50 %	325284358
112	NC_015162	GA	3	6	103419	103424	50 %	0 %	50 %	0 %	325284358
113	NC_015162	CT	3	6	103875	103880	0 %	50 %	0 %	50 %	325284360
114	NC_015162	TC	3	6	103924	103929	0 %	50 %	0 %	50 %	325284360
115	NC_015162	TG	3	6	105608	105613	0 %	50 %	50 %	0 %	325284362
116	NC_015162	GT	3	6	111024	111029	0 %	50 %	50 %	0 %	325284364
117	NC_015162	AC	3	6	112099	112104	50 %	0 %	0 %	50 %	325284364
118	NC_015162	TG	3	6	115410	115415	0 %	50 %	50 %	0 %	325284369
119	NC_015162	GC	3	6	115583	115588	0 %	0 %	50 %	50 %	325284369
120	NC_015162	AG	3	6	117682	117687	50 %	0 %	50 %	0 %	325284373
121	NC_015162	GC	3	6	119286	119291	0 %	0 %	50 %	50 %	325284374
122	NC_015162	GC	3	6	120383	120388	0 %	0 %	50 %	50 %	325284376
123	NC_015162	CA	3	6	121244	121249	50 %	0 %	0 %	50 %	325284377
124	NC_015162	CA	3	6	121840	121845	50 %	0 %	0 %	50 %	325284379
125	NC_015162	GA	3	6	121879	121884	50 %	0 %	50 %	0 %	325284379
126	NC_015162	AT	3	6	123217	123222	50 %	50 %	0 %	0 %	325284381
127	NC_015162	CA	3	6	128002	128007	50 %	0 %	0 %	50 %	325284387
128	NC_015162	CA	3	6	128275	128280	50 %	0 %	0 %	50 %	325284387
129	NC_015162	AT	3	6	128587	128592	50 %	50 %	0 %	0 %	325284388
130	NC_015162	CG	4	8	133893	133900	0 %	0 %	50 %	50 %	325284391
131	NC_015162	CA	3	6	134038	134043	50 %	0 %	0 %	50 %	325284391
132	NC_015162	CG	3	6	134698	134703	0 %	0 %	50 %	50 %	325284392
133	NC_015162	CT	3	6	135563	135568	0 %	50 %	0 %	50 %	325284393
134	NC_015162	GC	3	6	135601	135606	0 %	0 %	50 %	50 %	325284393
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139	NC_015162	AG	3	6	140706	140711	50 %	0 %	50 %	0 %	325284396
140	NC_015162	AC	3	6	142072	142077	50 %	0 %	0 %	50 %	325284400
141	NC_015162	CG	3	6	142193	142198	0 %	0 %	50 %	50 %	325284400
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.