MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 3809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015162	AAG	2	6	55316	55321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284298
1002	NC_015162	GCG	2	6	55327	55332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284298
1003	NC_015162	TGACCA	2	12	55334	55345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325284298
1004	NC_015162	CAT	2	6	55359	55364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284298
1005	NC_015162	GAA	2	6	55384	55389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284298
1006	NC_015162	CAG	2	6	55490	55495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1007	NC_015162	GAG	2	6	55516	55521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284298
1008	NC_015162	ACC	2	6	55550	55555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284298
1009	NC_015162	CGG	2	6	55572	55577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284298
1010	NC_015162	ACC	2	6	55594	55599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284298
1011	NC_015162	GCC	2	6	55654	55659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284298
1012	NC_015162	AGC	2	6	55671	55676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1013	NC_015162	GAA	2	6	55687	55692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284298
1014	NC_015162	AAG	2	6	55703	55708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284298
1015	NC_015162	CTG	2	6	55726	55731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1016	NC_015162	GCA	2	6	55733	55738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1017	NC_015162	TCG	2	6	55793	55798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1018	NC_015162	ATG	2	6	55810	55815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284298
1019	NC_015162	ACC	2	6	55832	55837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284298
1020	NC_015162	TCC	2	6	55871	55876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284298
1021	NC_015162	C	6	6	55897	55902	0 %	0 %	0 %	100 %	325284298
1022	NC_015162	AAC	2	6	55924	55929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284298
1023	NC_015162	GCC	2	6	55978	55983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284298
1024	NC_015162	CAT	2	6	55992	55997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284298
1025	NC_015162	GC	4	8	56086	56093	0 %	0 %	50 %	50 %	325284298
1026	NC_015162	GGC	2	6	56137	56142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284298
1027	NC_015162	A	6	6	56173	56178	100 %	0 %	0 %	0 %	325284298
1028	NC_015162	GCA	2	6	56264	56269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1029	NC_015162	CAAAGA	2	12	56358	56369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325284298
1030	NC_015162	AGG	2	6	56414	56419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284298
1031	NC_015162	AG	3	6	56562	56567	50 %	0 %	50 %	0 %	325284298
1032	NC_015162	CGC	2	6	56604	56609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284298
1033	NC_015162	CAG	2	6	56614	56619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1034	NC_015162	CAC	2	6	56728	56733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284299
1035	NC_015162	ACG	2	6	56739	56744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284299
1036	NC_015162	TGC	2	6	56886	56891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284299
1037	NC_015162	GCC	2	6	56900	56905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284299
1038	NC_015162	GGA	2	6	56914	56919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284299
1039	NC_015162	CCT	2	6	56931	56936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284300
1040	NC_015162	TCG	2	6	56939	56944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1041	NC_015162	GGCCAA	2	12	56952	56963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1042	NC_015162	ATC	2	6	57148	57153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284300
1043	NC_015162	TGC	2	6	57191	57196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1044	NC_015162	CGC	2	6	57370	57375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284300
1045	NC_015162	TGG	2	6	57389	57394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284300
1046	NC_015162	CGG	2	6	57476	57481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284300
1047	NC_015162	TGA	2	6	57485	57490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284300
1048	NC_015162	GCAC	2	8	57507	57514	25 %	0 %	25 %	50 %	325284300
1049	NC_015162	CA	3	6	57603	57608	50 %	0 %	0 %	50 %	325284300
1050	NC_015162	CGT	2	6	57626	57631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1051	NC_015162	CTG	2	6	57673	57678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1052	NC_015162	AGC	2	6	57682	57687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1053	NC_015162	GGC	2	6	57702	57707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284300
1054	NC_015162	CTC	2	6	57723	57728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284300
1055	NC_015162	GGT	2	6	57735	57740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284300
1056	NC_015162	GAA	2	6	57750	57755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284300
1057	NC_015162	CGCTCC	2	12	57771	57782	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325284300
1058	NC_015162	ACC	2	6	57787	57792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284300
1059	NC_015162	CAG	2	6	57802	57807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1060	NC_015162	TCA	2	6	57878	57883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284300
1061	NC_015162	CGA	2	6	57915	57920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1062	NC_015162	ACG	2	6	58114	58119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1063	NC_015162	TGA	2	6	58130	58135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284300
1064	NC_015162	CGC	2	6	58140	58145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284300
1065	NC_015162	CTG	2	6	58165	58170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1066	NC_015162	CTG	2	6	58189	58194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1067	NC_015162	TCA	2	6	58211	58216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284300
1068	NC_015162	GAA	2	6	58249	58254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284300
1069	NC_015162	GAG	2	6	58261	58266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284300
1070	NC_015162	AGC	2	6	58292	58297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1071	NC_015162	GT	3	6	58308	58313	0 %	50 %	50 %	0 %	325284300
1072	NC_015162	CGCTG	2	10	58377	58386	0 %	20 %	40 %	40 %	325284300
1073	NC_015162	TGG	2	6	58499	58504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284300
1074	NC_015162	CCGC	2	8	58556	58563	0 %	0 %	25 %	75 %	325284300
1075	NC_015162	GAA	2	6	58567	58572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284300
1076	NC_015162	G	7	7	58591	58597	0 %	0 %	100 %	0 %	325284300
1077	NC_015162	CCA	2	6	58607	58612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284300
1078	NC_015162	GCC	2	6	58672	58677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284300
1079	NC_015162	AGC	2	6	58717	58722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
1080	NC_015162	GGAC	2	8	58753	58760	25 %	0 %	50 %	25 %	325284300
1081	NC_015162	TGA	2	6	58820	58825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284300
1082	NC_015162	GCC	2	6	58856	58861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284300
1083	NC_015162	CGC	2	6	58966	58971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284301
1084	NC_015162	GTC	2	6	58987	58992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1085	NC_015162	CAG	2	6	59023	59028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1086	NC_015162	TGC	2	6	59033	59038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1087	NC_015162	GCG	2	6	59055	59060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284301
1088	NC_015162	ATC	2	6	59065	59070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284301
1089	NC_015162	GGCC	2	8	59073	59080	0 %	0 %	50 %	50 %	325284301
1090	NC_015162	GCT	2	6	59100	59105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1091	NC_015162	GAT	2	6	59109	59114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284301
1092	NC_015162	CGA	2	6	59118	59123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1093	NC_015162	GGC	2	6	59146	59151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284301
1094	NC_015162	CAA	2	6	59172	59177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284301
1095	NC_015162	AGG	2	6	59189	59194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284301
1096	NC_015162	AAG	2	6	59197	59202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284301
1097	NC_015162	TCC	2	6	59208	59213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284301
1098	NC_015162	GAA	2	6	59292	59297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284301
1099	NC_015162	GCT	2	6	59304	59309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1100	NC_015162	TGG	2	6	59456	59461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284301
1101	NC_015162	GGA	2	6	59481	59486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284301
1102	NC_015162	AGG	2	6	59544	59549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284301
1103	NC_015162	CTG	3	9	59620	59628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1104	NC_015162	CGA	2	6	59631	59636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1105	NC_015162	GCT	2	6	59667	59672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1106	NC_015162	CAT	2	6	59700	59705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284301
1107	NC_015162	GGC	2	6	59757	59762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284301
1108	NC_015162	GCA	2	6	59852	59857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1109	NC_015162	GA	3	6	59889	59894	50 %	0 %	50 %	0 %	325284301
1110	NC_015162	GAG	2	6	59920	59925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284301
1111	NC_015162	CTGCG	2	10	59929	59938	0 %	20 %	40 %	40 %	325284301
1112	NC_015162	CAC	2	6	59975	59980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284301
1113	NC_015162	TGG	2	6	59981	59986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284301
1114	NC_015162	GTG	2	6	59988	59993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284301
1115	NC_015162	CGC	2	6	60075	60080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284301
1116	NC_015162	AGCGA	2	10	60104	60113	40 %	0 %	40 %	20 %	325284301
1117	NC_015162	GAA	2	6	60199	60204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284301
1118	NC_015162	AC	3	6	60279	60284	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
1119	NC_015162	GGGC	2	8	60300	60307	0 %	0 %	75 %	25 %	325284301
1120	NC_015162	GAG	2	6	60343	60348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284301
1121	NC_015162	CAC	2	6	60363	60368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284301
1122	NC_015162	GCT	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1123	NC_015162	AC	3	6	60494	60499	50 %	0 %	0 %	50 %	325284301
1124	NC_015162	TCG	2	6	60521	60526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284301
1125	NC_015162	TGC	2	6	60639	60644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284302
1126	NC_015162	GCA	2	6	60668	60673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284302
1127	NC_015162	GCT	2	6	60685	60690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284302
1128	NC_015162	CTG	2	6	60737	60742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284302
1129	NC_015162	GCG	2	6	60760	60765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284302
1130	NC_015162	CA	3	6	60766	60771	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
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1132	NC_015162	CGG	2	6	60909	60914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284302
1133	NC_015162	CA	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	325284302
1134	NC_015162	GCA	2	6	60942	60947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284302
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1137	NC_015162	GC	3	6	61063	61068	0 %	0 %	50 %	50 %	325284302
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1141	NC_015162	CTG	2	6	61352	61357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284302
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1145	NC_015162	CAT	2	6	61681	61686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284303
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1149	NC_015162	AACCCG	2	12	61968	61979	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284303
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1154	NC_015162	CAG	2	6	62068	62073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284303
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1233	NC_015162	TTCA	2	8	65823	65830	25 %	50 %	0 %	25 %	325284308
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1235	NC_015162	CCTC	2	8	65951	65958	0 %	25 %	0 %	75 %	325284309
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1239	NC_015162	CTG	2	6	66083	66088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284309
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1241	NC_015162	GCC	2	6	66193	66198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284309
1242	NC_015162	GACG	2	8	66213	66220	25 %	0 %	50 %	25 %	325284309
1243	NC_015162	TGC	2	6	66272	66277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284309
1244	NC_015162	TC	3	6	66290	66295	0 %	50 %	0 %	50 %	325284309
1245	NC_015162	C	6	6	66344	66349	0 %	0 %	0 %	100 %	325284309
1246	NC_015162	TCT	2	6	66354	66359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284309
1247	NC_015162	GAA	3	9	66394	66402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284309
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1249	NC_015162	GCA	2	6	66500	66505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284309
1250	NC_015162	TCCT	2	8	66529	66536	0 %	50 %	0 %	50 %	325284309
1251	NC_015162	GAC	2	6	66604	66609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284309
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1253	NC_015162	GGT	2	6	66677	66682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284309
1254	NC_015162	CA	3	6	66705	66710	50 %	0 %	0 %	50 %	325284309
1255	NC_015162	GCTG	2	8	66711	66718	0 %	25 %	50 %	25 %	325284309
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1374	NC_015162	CGG	2	6	72712	72717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284317
1375	NC_015162	GAT	2	6	72791	72796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284317
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1377	NC_015162	GCC	2	6	72892	72897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284317
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1382	NC_015162	CGC	2	6	73171	73176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284317
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1492	NC_015162	AATG	2	8	78366	78373	50 %	25 %	25 %	0 %	325284325
1493	NC_015162	GT	3	6	78375	78380	0 %	50 %	50 %	0 %	325284325
1494	NC_015162	CGG	2	6	78383	78388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284325
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1496	NC_015162	CTG	2	6	78456	78461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284325
1497	NC_015162	GTG	2	6	78490	78495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284325
1498	NC_015162	CCA	2	6	78729	78734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284326
1499	NC_015162	AGG	2	6	78741	78746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284326
1500	NC_015162	AGGC	2	8	78825	78832	25 %	0 %	50 %	25 %	325284326

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