MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 3809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015162	CGA	2	6	29346	29351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284272
502	NC_015162	AGC	2	6	29367	29372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284272
503	NC_015162	CGGGC	2	10	29628	29637	0 %	0 %	60 %	40 %	325284273
504	NC_015162	CCT	2	6	29672	29677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284273
505	NC_015162	GCG	2	6	29758	29763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284273
506	NC_015162	CGG	2	6	29829	29834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284273
507	NC_015162	ACA	2	6	29845	29850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284273
508	NC_015162	GCG	2	6	29899	29904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284273
509	NC_015162	ATG	2	6	29913	29918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284273
510	NC_015162	ACG	2	6	29994	29999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284274
511	NC_015162	TGC	2	6	30060	30065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284274
512	NC_015162	TC	3	6	30202	30207	0 %	50 %	0 %	50 %	325284274
513	NC_015162	CGGCG	2	10	30220	30229	0 %	0 %	60 %	40 %	325284274
514	NC_015162	GCCC	2	8	30236	30243	0 %	0 %	25 %	75 %	325284274
515	NC_015162	CCG	2	6	30262	30267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284274
516	NC_015162	CCCCGG	2	12	30358	30369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284275
517	NC_015162	GCGAGC	2	12	30396	30407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284275
518	NC_015162	GAC	2	6	30433	30438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284275
519	NC_015162	CAA	2	6	30439	30444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284275
520	NC_015162	A	6	6	30569	30574	100 %	0 %	0 %	0 %	325284275
521	NC_015162	GAA	2	6	30589	30594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284275
522	NC_015162	GCT	2	6	30613	30618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284275
523	NC_015162	GCG	2	6	30623	30628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284275
524	NC_015162	CCA	2	6	30634	30639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284275
525	NC_015162	AACG	2	8	30683	30690	50 %	0 %	25 %	25 %	325284275
526	NC_015162	AGC	2	6	30711	30716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284275
527	NC_015162	CGC	2	6	30721	30726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284275
528	NC_015162	GAAA	2	8	30730	30737	75 %	0 %	25 %	0 %	325284275
529	NC_015162	GCG	2	6	30740	30745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284275
530	NC_015162	ATC	2	6	30810	30815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284276
531	NC_015162	CGAGAC	2	12	30839	30850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284276
532	NC_015162	CTG	3	9	30855	30863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284276
533	NC_015162	GCC	2	6	30879	30884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284276
534	NC_015162	CGC	2	6	30892	30897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284276
535	NC_015162	CCGC	2	8	30910	30917	0 %	0 %	25 %	75 %	325284276
536	NC_015162	GCT	2	6	30969	30974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284276
537	NC_015162	CTGG	2	8	30992	30999	0 %	25 %	50 %	25 %	325284276
538	NC_015162	GCG	2	6	31007	31012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284276
539	NC_015162	CGC	2	6	31058	31063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284276
540	NC_015162	CTG	2	6	31101	31106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284276
541	NC_015162	GCA	3	9	31341	31349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284277
542	NC_015162	CGC	2	6	31387	31392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284277
543	NC_015162	GC	3	6	31412	31417	0 %	0 %	50 %	50 %	325284277
544	NC_015162	GCG	2	6	31426	31431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284277
545	NC_015162	ATC	2	6	31505	31510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284277
546	NC_015162	GCG	2	6	31516	31521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284277
547	NC_015162	GCGG	2	8	31565	31572	0 %	0 %	75 %	25 %	325284278
548	NC_015162	CTG	2	6	31617	31622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284278
549	NC_015162	CTG	2	6	31638	31643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284278
550	NC_015162	GCT	2	6	31695	31700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284278
551	NC_015162	GCT	2	6	31729	31734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284278
552	NC_015162	CCA	2	6	32000	32005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284279
553	NC_015162	ACC	2	6	32044	32049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284279
554	NC_015162	A	6	6	32166	32171	100 %	0 %	0 %	0 %	325284279
555	NC_015162	CAA	2	6	32174	32179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284279
556	NC_015162	GCG	3	9	32245	32253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284279
557	NC_015162	GCG	2	6	32332	32337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284279
558	NC_015162	CCA	2	6	32362	32367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284279
559	NC_015162	ACT	2	6	32413	32418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284279
560	NC_015162	A	6	6	32466	32471	100 %	0 %	0 %	0 %	325284279
561	NC_015162	GCC	2	6	32494	32499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284279
562	NC_015162	GGAC	2	8	32515	32522	25 %	0 %	50 %	25 %	325284279
563	NC_015162	GCC	2	6	32559	32564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284279
564	NC_015162	GAC	2	6	32601	32606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284279
565	NC_015162	GCCA	2	8	32611	32618	25 %	0 %	25 %	50 %	325284279
566	NC_015162	CAG	2	6	32629	32634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284279
567	NC_015162	TGCCC	2	10	32654	32663	0 %	20 %	20 %	60 %	325284279
568	NC_015162	CGG	2	6	32669	32674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284279
569	NC_015162	GGC	2	6	32685	32690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284279
570	NC_015162	CCG	2	6	32721	32726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284279
571	NC_015162	GAC	2	6	32733	32738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284279
572	NC_015162	GCA	2	6	32857	32862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284280
573	NC_015162	GC	3	6	32887	32892	0 %	0 %	50 %	50 %	325284280
574	NC_015162	CAGC	2	8	32899	32906	25 %	0 %	25 %	50 %	325284280
575	NC_015162	CTG	2	6	32921	32926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284280
576	NC_015162	CCG	2	6	32941	32946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284280
577	NC_015162	AGC	2	6	32982	32987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284280
578	NC_015162	AGC	2	6	33003	33008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284280
579	NC_015162	GGC	2	6	33517	33522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284281
580	NC_015162	CTG	2	6	33544	33549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284281
581	NC_015162	GACC	2	8	33594	33601	25 %	0 %	25 %	50 %	325284281
582	NC_015162	GGC	2	6	33620	33625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284281
583	NC_015162	GGT	2	6	33645	33650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284281
584	NC_015162	C	6	6	33655	33660	0 %	0 %	0 %	100 %	325284281
585	NC_015162	AGCA	2	8	33680	33687	50 %	0 %	25 %	25 %	325284281
586	NC_015162	CAC	2	6	33765	33770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284281
587	NC_015162	CCAG	2	8	33806	33813	25 %	0 %	25 %	50 %	325284281
588	NC_015162	TGA	2	6	33888	33893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325284281
589	NC_015162	CTG	2	6	34021	34026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284282
590	NC_015162	CAC	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284282
591	NC_015162	GC	3	6	34146	34151	0 %	0 %	50 %	50 %	325284282
592	NC_015162	CTG	2	6	34168	34173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284282
593	NC_015162	CCG	2	6	34211	34216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284282
594	NC_015162	CGG	2	6	34350	34355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284282
595	NC_015162	CCTGGC	2	12	34365	34376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284282
596	NC_015162	CGG	2	6	34482	34487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284282
597	NC_015162	CTG	2	6	34625	34630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284283
598	NC_015162	CGG	2	6	34795	34800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284283
599	NC_015162	CTC	2	6	34807	34812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325284283
600	NC_015162	GTT	2	6	34891	34896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325284283
601	NC_015162	CAGC	2	8	34926	34933	25 %	0 %	25 %	50 %	325284283
602	NC_015162	CAC	2	6	34957	34962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325284283
603	NC_015162	AAC	2	6	34982	34987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284283
604	NC_015162	GCC	2	6	35058	35063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284283
605	NC_015162	CGG	2	6	35074	35079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284283
606	NC_015162	GCG	2	6	35097	35102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284283
607	NC_015162	GCT	2	6	35107	35112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284283
608	NC_015162	G	7	7	35145	35151	0 %	0 %	100 %	0 %	325284283
609	NC_015162	CGT	2	6	35215	35220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284283
610	NC_015162	GTG	2	6	35243	35248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284283
611	NC_015162	GCA	2	6	35499	35504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
612	NC_015162	CTG	2	6	35569	35574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284284
613	NC_015162	CAG	3	9	35595	35603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
614	NC_015162	CAA	2	6	35612	35617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284284
615	NC_015162	GAC	2	6	35647	35652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
616	NC_015162	GC	4	8	35704	35711	0 %	0 %	50 %	50 %	325284284
617	NC_015162	ACAA	2	8	35807	35814	75 %	0 %	0 %	25 %	325284284
618	NC_015162	GAGTG	2	10	35859	35868	20 %	20 %	60 %	0 %	325284284
619	NC_015162	CGG	2	6	35883	35888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284284
620	NC_015162	GCA	3	9	35910	35918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
621	NC_015162	CTT	2	6	35970	35975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325284284
622	NC_015162	AGA	2	6	35996	36001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284284
623	NC_015162	GCTG	2	8	36051	36058	0 %	25 %	50 %	25 %	325284284
624	NC_015162	GAG	2	6	36115	36120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284284
625	NC_015162	GCA	2	6	36154	36159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
626	NC_015162	AAG	2	6	36229	36234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284284
627	NC_015162	AGG	2	6	36281	36286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284284
628	NC_015162	GAC	2	6	36364	36369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
629	NC_015162	AGA	2	6	36423	36428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284284
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632	NC_015162	GAA	3	9	36670	36678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284284
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635	NC_015162	CAG	2	6	36836	36841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284284
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649	NC_015162	TGC	2	6	38518	38523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284285
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651	NC_015162	CTG	2	6	38553	38558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284285
652	NC_015162	GC	3	6	38628	38633	0 %	0 %	50 %	50 %	325284286
653	NC_015162	CCCT	2	8	38717	38724	0 %	25 %	0 %	75 %	325284286
654	NC_015162	AAG	2	6	38744	38749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325284286
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662	NC_015162	GAC	2	6	39046	39051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284286
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754	NC_015162	GCG	2	6	43784	43789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284290
755	NC_015162	GCT	2	6	43845	43850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284290
756	NC_015162	GCG	2	6	43853	43858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284290
757	NC_015162	GCT	2	6	43914	43919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284290
758	NC_015162	GCG	2	6	43922	43927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284290
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880	NC_015162	CGC	2	6	49600	49605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284295
881	NC_015162	GAAAGC	2	12	49609	49620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284295
882	NC_015162	AGC	2	6	49681	49686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284295
883	NC_015162	GCC	2	6	49694	49699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284295
884	NC_015162	AGG	2	6	49741	49746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284295
885	NC_015162	CGA	2	6	49783	49788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284295
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892	NC_015162	CTG	2	6	50240	50245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284295
893	NC_015162	G	6	6	50282	50287	0 %	0 %	100 %	0 %	325284295
894	NC_015162	CTG	2	6	50303	50308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284295
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900	NC_015162	GAG	2	6	50630	50635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284295
901	NC_015162	GCC	2	6	50639	50644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284295
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912	NC_015162	CGG	2	6	50969	50974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284295
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954	NC_015162	CGA	2	6	52690	52695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284295
955	NC_015162	AGC	2	6	52863	52868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284295
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986	NC_015162	GTG	2	6	54670	54675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325284298
987	NC_015162	ACG	2	6	54701	54706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
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991	NC_015162	CGA	2	6	54876	54881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
992	NC_015162	CTG	2	6	54904	54909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284298
993	NC_015162	CGC	2	6	54996	55001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284298
994	NC_015162	CAT	2	6	55011	55016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325284298
995	NC_015162	ACA	2	6	55062	55067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325284298
996	NC_015162	AC	3	6	55077	55082	50 %	0 %	0 %	50 %	325284298
997	NC_015162	TGGCA	2	10	55143	55152	20 %	20 %	40 %	20 %	325284298
998	NC_015162	CGG	2	6	55195	55200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284298
999	NC_015162	GCA	2	6	55207	55212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284298
1000	NC_015162	AGG	2	6	55281	55286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325284298

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