MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 23223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014961	TCA	2	6	283190	283195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100506
5002	NC_014961	AGC	2	6	283203	283208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100506
5003	NC_014961	GAG	2	6	283290	283295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100506
5004	NC_014961	CTTG	2	8	283308	283315	0 %	50 %	25 %	25 %	320100506
5005	NC_014961	AGG	2	6	283342	283347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100506
5006	NC_014961	AGC	2	6	283600	283605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100506
5007	NC_014961	CA	3	6	283639	283644	50 %	0 %	0 %	50 %	320100506
5008	NC_014961	GGA	2	6	283715	283720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100506
5009	NC_014961	ATGG	2	8	283768	283775	25 %	25 %	50 %	0 %	320100506
5010	NC_014961	GAG	2	6	283780	283785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100506
5011	NC_014961	CCT	2	6	283815	283820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100506
5012	NC_014961	AGCC	2	8	283830	283837	25 %	0 %	25 %	50 %	320100506
5013	NC_014961	GAT	2	6	283852	283857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100506
5014	NC_014961	CGC	2	6	283874	283879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100506
5015	NC_014961	TGA	2	6	283940	283945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100506
5016	NC_014961	ACT	2	6	283983	283988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100506
5017	NC_014961	GCA	2	6	284075	284080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100507
5018	NC_014961	TCG	2	6	284117	284122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100507
5019	NC_014961	ATCC	2	8	284225	284232	25 %	25 %	0 %	50 %	320100507
5020	NC_014961	C	6	6	284234	284239	0 %	0 %	0 %	100 %	320100507
5021	NC_014961	GAG	2	6	284266	284271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100507
5022	NC_014961	TA	3	6	284307	284312	50 %	50 %	0 %	0 %	320100507
5023	NC_014961	CTC	2	6	284349	284354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100507
5024	NC_014961	AC	3	6	284377	284382	50 %	0 %	0 %	50 %	320100507
5025	NC_014961	CATG	2	8	284392	284399	25 %	25 %	25 %	25 %	320100507
5026	NC_014961	GAGG	2	8	284415	284422	25 %	0 %	75 %	0 %	320100507
5027	NC_014961	CAG	2	6	284427	284432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100507
5028	NC_014961	CAAGC	2	10	284466	284475	40 %	0 %	20 %	40 %	320100507
5029	NC_014961	ACA	2	6	284483	284488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100507
5030	NC_014961	CGG	2	6	284502	284507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100507
5031	NC_014961	AC	3	6	284546	284551	50 %	0 %	0 %	50 %	320100507
5032	NC_014961	GGAG	2	8	284559	284566	25 %	0 %	75 %	0 %	320100507
5033	NC_014961	GTG	2	6	284575	284580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100507
5034	NC_014961	AGT	2	6	284610	284615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100507
5035	NC_014961	GA	3	6	284619	284624	50 %	0 %	50 %	0 %	320100507
5036	NC_014961	GGA	2	6	284659	284664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100507
5037	NC_014961	GCA	2	6	284677	284682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100507
5038	NC_014961	GCC	2	6	284707	284712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100507
5039	NC_014961	TGA	2	6	284747	284752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100507
5040	NC_014961	CTC	2	6	284767	284772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100507
5041	NC_014961	GCG	2	6	284855	284860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100507
5042	NC_014961	GGA	2	6	284919	284924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100507
5043	NC_014961	CAC	2	6	284985	284990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100507
5044	NC_014961	GAG	2	6	285125	285130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100508
5045	NC_014961	AT	3	6	285207	285212	50 %	50 %	0 %	0 %	320100508
5046	NC_014961	AGG	2	6	285273	285278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100508
5047	NC_014961	TAC	2	6	285309	285314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100508
5048	NC_014961	GAG	2	6	285338	285343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100508
5049	NC_014961	GAA	2	6	285440	285445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100508
5050	NC_014961	AGG	3	9	285451	285459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100508
5051	NC_014961	GAG	2	6	285486	285491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100508
5052	NC_014961	GAA	2	6	285723	285728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100509
5053	NC_014961	GCA	2	6	285743	285748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100509
5054	NC_014961	AT	3	6	285829	285834	50 %	50 %	0 %	0 %	320100509
5055	NC_014961	CAG	2	6	285851	285856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100509
5056	NC_014961	GGT	2	6	285963	285968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100509
5057	NC_014961	CAGG	2	8	285981	285988	25 %	0 %	50 %	25 %	320100509
5058	NC_014961	CTC	2	6	286060	286065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100509
5059	NC_014961	CTGA	2	8	286069	286076	25 %	25 %	25 %	25 %	320100509
5060	NC_014961	GGA	2	6	286092	286097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100509
5061	NC_014961	GGA	2	6	286111	286116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100509
5062	NC_014961	TC	3	6	286158	286163	0 %	50 %	0 %	50 %	320100509
5063	NC_014961	TGC	2	6	286175	286180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100509
5064	NC_014961	GAA	2	6	286275	286280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100509
5065	NC_014961	GAC	2	6	286306	286311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100509
5066	NC_014961	AT	3	6	286324	286329	50 %	50 %	0 %	0 %	320100509
5067	NC_014961	CAG	2	6	286355	286360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100509
5068	NC_014961	GGC	2	6	286461	286466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100509
5069	NC_014961	AGG	2	6	286498	286503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100509
5070	NC_014961	GCCCCT	2	12	286567	286578	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320100509
5071	NC_014961	TGA	2	6	286762	286767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100510
5072	NC_014961	TGC	2	6	286813	286818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100510
5073	NC_014961	AGG	2	6	287064	287069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100510
5074	NC_014961	GTAT	2	8	287135	287142	25 %	50 %	25 %	0 %	320100510
5075	NC_014961	GAC	3	9	287148	287156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100510
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5078	NC_014961	CTC	2	6	287328	287333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100510
5079	NC_014961	CTC	2	6	287364	287369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100510
5080	NC_014961	CAA	2	6	287405	287410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100510
5081	NC_014961	GGA	2	6	287423	287428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100510
5082	NC_014961	GAG	2	6	287453	287458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100510
5083	NC_014961	TGA	2	6	287524	287529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100510
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5088	NC_014961	TGA	2	6	287818	287823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100510
5089	NC_014961	TCG	2	6	287836	287841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100510
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5091	NC_014961	TTC	2	6	287937	287942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100511
5092	NC_014961	TGC	2	6	288020	288025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100511
5093	NC_014961	CGT	2	6	288086	288091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100511
5094	NC_014961	TGA	2	6	288131	288136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100511
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5101	NC_014961	GGTA	2	8	288569	288576	25 %	25 %	50 %	0 %	320100511
5102	NC_014961	CTA	2	6	288770	288775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100511
5103	NC_014961	GA	3	6	288858	288863	50 %	0 %	50 %	0 %	320100511
5104	NC_014961	TCC	2	6	288891	288896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100511
5105	NC_014961	TGA	2	6	288905	288910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100511
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5108	NC_014961	ACC	2	6	289218	289223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100512
5109	NC_014961	GCATAG	2	12	289228	289239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320100512
5110	NC_014961	ATG	2	6	289252	289257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100512
5111	NC_014961	TTG	2	6	289259	289264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100512
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5113	NC_014961	CTT	2	6	289386	289391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100512
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5116	NC_014961	AC	3	6	289452	289457	50 %	0 %	0 %	50 %	320100512
5117	NC_014961	TGG	2	6	289700	289705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100512
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5121	NC_014961	CCG	2	6	289963	289968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100512
5122	NC_014961	TTC	2	6	290014	290019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100512
5123	NC_014961	ATT	2	6	290076	290081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100512
5124	NC_014961	ATA	2	6	290136	290141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100512
5125	NC_014961	TCC	2	6	290166	290171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100512
5126	NC_014961	TC	3	6	290184	290189	0 %	50 %	0 %	50 %	320100512
5127	NC_014961	CTT	2	6	290515	290520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100513
5128	NC_014961	CCT	2	6	290527	290532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5129	NC_014961	CCT	3	9	290569	290577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5130	NC_014961	GGT	2	6	290592	290597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100513
5131	NC_014961	CTT	2	6	290699	290704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100513
5132	NC_014961	CTC	2	6	290789	290794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5133	NC_014961	ACC	2	6	290841	290846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100513
5134	NC_014961	TCC	2	6	290885	290890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5135	NC_014961	CGC	3	9	290965	290973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100513
5136	NC_014961	CAGC	2	8	291097	291104	25 %	0 %	25 %	50 %	320100513
5137	NC_014961	TTC	2	6	291105	291110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100513
5138	NC_014961	GAA	2	6	291119	291124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100513
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5140	NC_014961	CCT	2	6	291187	291192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5141	NC_014961	CTC	2	6	291263	291268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5142	NC_014961	TCC	2	6	291436	291441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5143	NC_014961	TGCC	2	8	291446	291453	0 %	25 %	25 %	50 %	320100513
5144	NC_014961	GAA	2	6	291500	291505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100513
5145	NC_014961	CCCG	2	8	291521	291528	0 %	0 %	25 %	75 %	320100513
5146	NC_014961	CTT	2	6	291545	291550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100513
5147	NC_014961	GAA	2	6	291575	291580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100513
5148	NC_014961	CTT	2	6	291629	291634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100513
5149	NC_014961	CTC	2	6	291758	291763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100513
5150	NC_014961	GTT	2	6	291774	291779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100513
5151	NC_014961	TCA	2	6	291862	291867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100513
5152	NC_014961	AT	3	6	291888	291893	50 %	50 %	0 %	0 %	320100513
5153	NC_014961	TA	4	8	291904	291911	50 %	50 %	0 %	0 %	320100513
5154	NC_014961	CTAG	2	8	292305	292312	25 %	25 %	25 %	25 %	320100514
5155	NC_014961	CCT	2	6	292329	292334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100514
5156	NC_014961	TCC	2	6	292342	292347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100514
5157	NC_014961	CCT	2	6	292392	292397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100514
5158	NC_014961	CCT	2	6	292400	292405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100514
5159	NC_014961	ATG	2	6	292412	292417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100514
5160	NC_014961	TC	3	6	292426	292431	0 %	50 %	0 %	50 %	320100514
5161	NC_014961	AGT	2	6	292432	292437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100514
5162	NC_014961	AAT	2	6	292443	292448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100514
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5164	NC_014961	ATG	2	6	292961	292966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100515
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5172	NC_014961	CGT	2	6	293193	293198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100515
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5191	NC_014961	GAG	3	9	293710	293718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100515
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5194	NC_014961	GGAT	2	8	293777	293784	25 %	25 %	50 %	0 %	320100515
5195	NC_014961	GAG	2	6	293803	293808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100515
5196	NC_014961	ATAGAT	2	12	293842	293853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	320100515
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5200	NC_014961	CCT	2	6	294171	294176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100516
5201	NC_014961	CCCCCT	2	12	294213	294224	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320100516
5202	NC_014961	AGG	2	6	294264	294269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100516
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5204	NC_014961	TGC	2	6	294301	294306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100516
5205	NC_014961	CTG	2	6	294362	294367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100516
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5209	NC_014961	C	6	6	294549	294554	0 %	0 %	0 %	100 %	320100516
5210	NC_014961	AGG	2	6	294565	294570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100516
5211	NC_014961	CCT	2	6	294645	294650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100516
5212	NC_014961	GA	3	6	294667	294672	50 %	0 %	50 %	0 %	320100516
5213	NC_014961	TA	3	6	294735	294740	50 %	50 %	0 %	0 %	320100516
5214	NC_014961	CCAGC	2	10	294773	294782	20 %	0 %	20 %	60 %	320100516
5215	NC_014961	AAGC	2	8	294794	294801	50 %	0 %	25 %	25 %	320100516
5216	NC_014961	AGCC	2	8	295057	295064	25 %	0 %	25 %	50 %	320100517
5217	NC_014961	ATC	2	6	295186	295191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100517
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5220	NC_014961	GCT	2	6	295241	295246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100517
5221	NC_014961	GA	3	6	295256	295261	50 %	0 %	50 %	0 %	320100517
5222	NC_014961	GCTG	2	8	295310	295317	0 %	25 %	50 %	25 %	320100517
5223	NC_014961	GCT	2	6	295343	295348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100517
5224	NC_014961	ACT	2	6	295396	295401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100517
5225	NC_014961	G	6	6	295435	295440	0 %	0 %	100 %	0 %	320100517
5226	NC_014961	CGA	2	6	295625	295630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100517
5227	NC_014961	GGC	2	6	295635	295640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100517
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5229	NC_014961	CGA	2	6	295781	295786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100517
5230	NC_014961	CCT	2	6	295805	295810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5231	NC_014961	CTC	2	6	295857	295862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5232	NC_014961	TCC	2	6	295875	295880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5233	NC_014961	GGA	3	9	295949	295957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100517
5234	NC_014961	GTG	2	6	296127	296132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100517
5235	NC_014961	ACT	2	6	296153	296158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100517
5236	NC_014961	CCT	2	6	296165	296170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5237	NC_014961	ACAT	2	8	296238	296245	50 %	25 %	0 %	25 %	320100517
5238	NC_014961	AGG	2	6	296256	296261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100517
5239	NC_014961	TCA	2	6	296292	296297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100517
5240	NC_014961	CCT	2	6	296300	296305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5241	NC_014961	CTC	2	6	296349	296354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5242	NC_014961	ATG	2	6	296445	296450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100517
5243	NC_014961	CCT	2	6	296537	296542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100517
5244	NC_014961	CAT	2	6	296559	296564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100517
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5248	NC_014961	TC	3	6	296800	296805	0 %	50 %	0 %	50 %	320100518
5249	NC_014961	CTCC	2	8	296850	296857	0 %	25 %	0 %	75 %	320100518
5250	NC_014961	TGG	2	6	296878	296883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100518
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5259	NC_014961	CGT	2	6	297228	297233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100518
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5274	NC_014961	GGA	2	6	298276	298281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100519
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5344	NC_014961	TGA	2	6	302430	302435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100523
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5355	NC_014961	GA	3	6	303005	303010	50 %	0 %	50 %	0 %	320100523
5356	NC_014961	AC	3	6	303016	303021	50 %	0 %	0 %	50 %	320100523
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5360	NC_014961	CT	3	6	303318	303323	0 %	50 %	0 %	50 %	320100524
5361	NC_014961	TAG	2	6	303356	303361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100524
5362	NC_014961	GCCT	2	8	303362	303369	0 %	25 %	25 %	50 %	320100524
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