MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio aespoeensis Aspo-2 chromosome

Total Repeats: 70619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014844	TCGA	2	8	134489	134496	25 %	25 %	25 %	25 %	317151844
2502	NC_014844	GAT	2	6	134534	134539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151844
2503	NC_014844	GCC	2	6	134643	134648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151844
2504	NC_014844	CG	3	6	134665	134670	0 %	0 %	50 %	50 %	317151844
2505	NC_014844	CAGG	2	8	134674	134681	25 %	0 %	50 %	25 %	317151844
2506	NC_014844	GCC	2	6	134720	134725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151844
2507	NC_014844	ATC	2	6	134736	134741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151844
2508	NC_014844	GCC	2	6	134743	134748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151844
2509	NC_014844	ACGG	2	8	134781	134788	25 %	0 %	50 %	25 %	317151844
2510	NC_014844	CAG	2	6	134807	134812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151844
2511	NC_014844	G	6	6	134812	134817	0 %	0 %	100 %	0 %	317151844
2512	NC_014844	CGC	2	6	134824	134829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151844
2513	NC_014844	GCGCCC	2	12	134917	134928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151844
2514	NC_014844	GGA	2	6	134987	134992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151844
2515	NC_014844	AGC	2	6	134994	134999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151844
2516	NC_014844	GCA	2	6	135001	135006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151844
2517	NC_014844	CGG	2	6	135084	135089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151844
2518	NC_014844	GGCCG	2	10	135179	135188	0 %	0 %	60 %	40 %	317151845
2519	NC_014844	CTT	2	6	135212	135217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151845
2520	NC_014844	C	7	7	135300	135306	0 %	0 %	0 %	100 %	317151845
2521	NC_014844	CGA	2	6	135310	135315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151845
2522	NC_014844	CGTT	2	8	135339	135346	0 %	50 %	25 %	25 %	317151845
2523	NC_014844	GCA	3	9	135414	135422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151845
2524	NC_014844	GCC	3	9	135456	135464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151845
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2529	NC_014844	TCT	2	6	135634	135639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151845
2530	NC_014844	CG	3	6	135649	135654	0 %	0 %	50 %	50 %	317151845
2531	NC_014844	AGC	2	6	135918	135923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151845
2532	NC_014844	CTG	2	6	135926	135931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151845
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2534	NC_014844	TCA	2	6	136071	136076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151845
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2536	NC_014844	CG	3	6	136116	136121	0 %	0 %	50 %	50 %	317151845
2537	NC_014844	CGG	2	6	136141	136146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151845
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2544	NC_014844	GTT	2	6	136415	136420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317151845
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2553	NC_014844	CCCGG	2	10	136769	136778	0 %	0 %	40 %	60 %	317151845
2554	NC_014844	GCC	2	6	136868	136873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151845
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2557	NC_014844	TGT	2	6	137137	137142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317151845
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2559	NC_014844	A	8	8	137338	137345	100 %	0 %	0 %	0 %	317151845
2560	NC_014844	TCCT	2	8	137379	137386	0 %	50 %	0 %	50 %	317151845
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2562	NC_014844	GCA	2	6	137596	137601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151845
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2565	NC_014844	GTCC	2	8	137671	137678	0 %	25 %	25 %	50 %	317151845
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2592	NC_014844	CGG	3	9	139256	139264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151848
2593	NC_014844	TGC	2	6	139267	139272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151848
2594	NC_014844	GCCC	2	8	139277	139284	0 %	0 %	25 %	75 %	317151848
2595	NC_014844	TGG	2	6	139399	139404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151848
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2600	NC_014844	GGCGC	2	10	139629	139638	0 %	0 %	60 %	40 %	317151848
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2605	NC_014844	ACG	2	6	139810	139815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151849
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2607	NC_014844	TGC	2	6	139954	139959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151849
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2610	NC_014844	CAAG	2	8	140018	140025	50 %	0 %	25 %	25 %	317151849
2611	NC_014844	GAA	2	6	140033	140038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317151849
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2621	NC_014844	GGC	2	6	140314	140319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151850
2622	NC_014844	CGC	2	6	140323	140328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151850
2623	NC_014844	AGC	2	6	140498	140503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151851
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2725	NC_014844	GGGCC	2	10	146716	146725	0 %	0 %	60 %	40 %	317151855
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2734	NC_014844	CTGG	2	8	147591	147598	0 %	25 %	50 %	25 %	317151856
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2741	NC_014844	CAA	2	6	147990	147995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317151856
2742	NC_014844	GCT	2	6	148014	148019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151856
2743	NC_014844	TGC	2	6	148022	148027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151856
2744	NC_014844	CGGCG	2	10	148038	148047	0 %	0 %	60 %	40 %	317151856
2745	NC_014844	TAT	2	6	148120	148125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317151856
2746	NC_014844	CG	3	6	148209	148214	0 %	0 %	50 %	50 %	317151856
2747	NC_014844	CCG	3	9	148286	148294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151856
2748	NC_014844	GC	3	6	148423	148428	0 %	0 %	50 %	50 %	317151856
2749	NC_014844	TGG	2	6	148433	148438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151856
2750	NC_014844	GGA	2	6	148455	148460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151856
2751	NC_014844	GCT	3	9	148518	148526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151856
2752	NC_014844	CTGGCC	2	12	148552	148563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317151856
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2754	NC_014844	CGCAAG	2	12	148615	148626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151856
2755	NC_014844	CTC	2	6	148666	148671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317151856
2756	NC_014844	GGCGTG	2	12	148678	148689	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	317151856
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2764	NC_014844	CGGCTG	2	12	149021	149032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317151857
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2768	NC_014844	G	6	6	149299	149304	0 %	0 %	100 %	0 %	317151857
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2771	NC_014844	CAGG	2	8	149551	149558	25 %	0 %	50 %	25 %	317151857
2772	NC_014844	CGA	2	6	149573	149578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151857
2773	NC_014844	TCA	2	6	149627	149632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151857
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2777	NC_014844	GC	3	6	149803	149808	0 %	0 %	50 %	50 %	317151858
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2780	NC_014844	GCG	2	6	149882	149887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151858
2781	NC_014844	TGACC	2	10	149964	149973	20 %	20 %	20 %	40 %	317151858
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2784	NC_014844	TCC	2	6	150157	150162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317151858
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2815	NC_014844	CT	3	6	151722	151727	0 %	50 %	0 %	50 %	317151859
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2834	NC_014844	TGA	2	6	152524	152529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151860
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2839	NC_014844	ACA	2	6	152668	152673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317151860
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2843	NC_014844	CGC	2	6	152832	152837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151860
2844	NC_014844	GCC	2	6	152859	152864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151860
2845	NC_014844	GCC	2	6	152948	152953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151860
2846	NC_014844	TCA	2	6	152986	152991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151860
2847	NC_014844	GAG	2	6	153108	153113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151860
2848	NC_014844	CAA	2	6	153138	153143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317151861
2849	NC_014844	CCAG	2	8	153257	153264	25 %	0 %	25 %	50 %	317151861
2850	NC_014844	AGGCCC	2	12	153278	153289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317151861
2851	NC_014844	A	6	6	153340	153345	100 %	0 %	0 %	0 %	317151861
2852	NC_014844	GC	3	6	153551	153556	0 %	0 %	50 %	50 %	317151862
2853	NC_014844	CTGGCC	2	12	153582	153593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317151862
2854	NC_014844	CG	3	6	153595	153600	0 %	0 %	50 %	50 %	317151862
2855	NC_014844	GGA	2	6	153614	153619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151862
2856	NC_014844	CGA	2	6	153650	153655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151862
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2858	NC_014844	CAA	2	6	153734	153739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317151862
2859	NC_014844	GGA	2	6	153791	153796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151862
2860	NC_014844	CAT	2	6	153797	153802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151862
2861	NC_014844	GGC	2	6	153813	153818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151862
2862	NC_014844	CGA	2	6	153905	153910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151862
2863	NC_014844	CTG	2	6	153917	153922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151862
2864	NC_014844	CGCCC	2	10	153927	153936	0 %	0 %	20 %	80 %	317151862
2865	NC_014844	TCA	2	6	153958	153963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151862
2866	NC_014844	TCA	2	6	154000	154005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151862
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2868	NC_014844	CG	3	6	154113	154118	0 %	0 %	50 %	50 %	317151863
2869	NC_014844	GCG	2	6	154120	154125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151863
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2872	NC_014844	TGG	2	6	154318	154323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151863
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2978	NC_014844	GAC	2	6	159429	159434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151867
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2983	NC_014844	GCT	2	6	159584	159589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151867
2984	NC_014844	CGA	2	6	159752	159757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151867
2985	NC_014844	GGC	2	6	159758	159763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151867
2986	NC_014844	CAT	2	6	159773	159778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151867
2987	NC_014844	CAGC	2	8	160016	160023	25 %	0 %	25 %	50 %	317151867
2988	NC_014844	GGT	2	6	160055	160060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151867
2989	NC_014844	GCC	2	6	160062	160067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151867
2990	NC_014844	GCGG	2	8	160111	160118	0 %	0 %	75 %	25 %	317151867
2991	NC_014844	T	7	7	160283	160289	0 %	100 %	0 %	0 %	317151868
2992	NC_014844	A	6	6	160292	160297	100 %	0 %	0 %	0 %	317151868
2993	NC_014844	T	6	6	160302	160307	0 %	100 %	0 %	0 %	317151868
2994	NC_014844	GCCGG	3	15	160340	160354	0 %	0 %	60 %	40 %	317151868
2995	NC_014844	GGT	2	6	160409	160414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151868
2996	NC_014844	GGC	2	6	160518	160523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151868
2997	NC_014844	AAC	2	6	160539	160544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317151868
2998	NC_014844	TC	3	6	160576	160581	0 %	50 %	0 %	50 %	317151868
2999	NC_014844	CGG	2	6	160622	160627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151868
3000	NC_014844	CGC	2	6	160667	160672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151868

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