MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 1297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	CTCAC	2	10	1101	1110	20 %	20 %	0 %	60 %	317050200
2	NC_014836	AGAAA	2	10	1693	1702	80 %	0 %	20 %	0 %	317050201
3	NC_014836	AAGAT	2	10	2532	2541	60 %	20 %	20 %	0 %	317050201
4	NC_014836	TGGGG	2	10	4591	4600	0 %	20 %	80 %	0 %	317050204
5	NC_014836	CCGCT	2	10	4652	4661	0 %	20 %	20 %	60 %	317050204
6	NC_014836	TGCCG	2	10	6561	6570	0 %	20 %	40 %	40 %	317050206
7	NC_014836	ATCAC	2	10	8156	8165	40 %	20 %	0 %	40 %	317050207
8	NC_014836	ATCCC	2	10	9637	9646	20 %	20 %	0 %	60 %	317050210
9	NC_014836	CGCTG	2	10	9780	9789	0 %	20 %	40 %	40 %	317050210
10	NC_014836	TGCCG	2	10	13685	13694	0 %	20 %	40 %	40 %	317050215
11	NC_014836	CGGGA	2	10	17858	17867	20 %	0 %	60 %	20 %	317050219
12	NC_014836	GAGAA	2	10	18223	18232	60 %	0 %	40 %	0 %	317050219
13	NC_014836	GGCGG	2	10	20357	20366	0 %	0 %	80 %	20 %	317050220
14	NC_014836	GCAGC	2	10	23558	23567	20 %	0 %	40 %	40 %	317050222
15	NC_014836	TGGCG	2	10	24052	24061	0 %	20 %	60 %	20 %	317050222
16	NC_014836	GAGAG	2	10	24355	24364	40 %	0 %	60 %	0 %	317050222
17	NC_014836	GCTCC	2	10	25855	25864	0 %	20 %	20 %	60 %	317050224
18	NC_014836	GGGGA	2	10	28753	28762	20 %	0 %	80 %	0 %	317050226
19	NC_014836	GGCCA	2	10	30732	30741	20 %	0 %	40 %	40 %	317050228
20	NC_014836	GATCG	2	10	34202	34211	20 %	20 %	40 %	20 %	317050232
21	NC_014836	CCGCC	2	10	38131	38140	0 %	0 %	20 %	80 %	317050234
22	NC_014836	AGGTA	2	10	39952	39961	40 %	20 %	40 %	0 %	317050235
23	NC_014836	ATCTT	2	10	41107	41116	20 %	60 %	0 %	20 %	317050238
24	NC_014836	CCCTG	2	10	41424	41433	0 %	20 %	20 %	60 %	317050238
25	NC_014836	ACCGC	2	10	42296	42305	20 %	0 %	20 %	60 %	317050240
26	NC_014836	TCCAC	2	10	45677	45686	20 %	20 %	0 %	60 %	317050243
27	NC_014836	GCAGT	2	10	52255	52264	20 %	20 %	40 %	20 %	317050250
28	NC_014836	AGCTG	2	10	58501	58510	20 %	20 %	40 %	20 %	317050258
29	NC_014836	TGTCC	2	10	58895	58904	0 %	40 %	20 %	40 %	317050259
30	NC_014836	CAGGC	2	10	59718	59727	20 %	0 %	40 %	40 %	317050259
31	NC_014836	GCATC	2	10	60517	60526	20 %	20 %	20 %	40 %	317050260
32	NC_014836	TGGTC	2	10	62307	62316	0 %	40 %	40 %	20 %	317050262
33	NC_014836	GCGTA	2	10	63359	63368	20 %	20 %	40 %	20 %	317050262
34	NC_014836	TGCGG	2	10	68375	68384	0 %	20 %	60 %	20 %	317050264
35	NC_014836	CAGAA	2	10	69586	69595	60 %	0 %	20 %	20 %	317050265
36	NC_014836	AGCGA	2	10	72886	72895	40 %	0 %	40 %	20 %	317050269
37	NC_014836	CCATC	2	10	73719	73728	20 %	20 %	0 %	60 %	317050269
38	NC_014836	ATGAA	2	10	76062	76071	60 %	20 %	20 %	0 %	317050271
39	NC_014836	AATAC	2	10	78090	78099	60 %	20 %	0 %	20 %	317050273
40	NC_014836	GCGAG	2	10	78652	78661	20 %	0 %	60 %	20 %	317050274
41	NC_014836	GGCCA	2	10	80693	80702	20 %	0 %	40 %	40 %	317050277
42	NC_014836	CAGCA	2	10	82257	82266	40 %	0 %	20 %	40 %	317050278
43	NC_014836	GTCCA	2	10	82944	82953	20 %	20 %	20 %	40 %	317050278
44	NC_014836	CTTTT	2	10	90016	90025	0 %	80 %	0 %	20 %	317050285
45	NC_014836	CGCCT	2	10	91939	91948	0 %	20 %	20 %	60 %	317050286
46	NC_014836	CTGTG	2	10	94130	94139	0 %	40 %	40 %	20 %	317050288
47	NC_014836	GGACT	2	10	94145	94154	20 %	20 %	40 %	20 %	317050288
48	NC_014836	GGGAA	2	10	104485	104494	40 %	0 %	60 %	0 %	317050297
49	NC_014836	CGCTG	2	10	108099	108108	0 %	20 %	40 %	40 %	317050301
50	NC_014836	GATGT	2	10	110125	110134	20 %	40 %	40 %	0 %	317050303
51	NC_014836	CAGGC	2	10	110671	110680	20 %	0 %	40 %	40 %	317050303
52	NC_014836	GTTCA	2	10	111445	111454	20 %	40 %	20 %	20 %	317050303
53	NC_014836	GCTCA	2	10	113174	113183	20 %	20 %	20 %	40 %	317050305
54	NC_014836	TTCCA	2	10	119491	119500	20 %	40 %	0 %	40 %	317050311
55	NC_014836	GTAGA	2	10	121925	121934	40 %	20 %	40 %	0 %	317050315
56	NC_014836	GTGGC	2	10	122040	122049	0 %	20 %	60 %	20 %	317050315
57	NC_014836	TGACT	2	10	123367	123376	20 %	40 %	20 %	20 %	317050316
58	NC_014836	GGCCA	2	10	129437	129446	20 %	0 %	40 %	40 %	317050320
59	NC_014836	GCCCG	2	10	132930	132939	0 %	0 %	40 %	60 %	317050321
60	NC_014836	AGCAC	2	10	133891	133900	40 %	0 %	20 %	40 %	317050322
61	NC_014836	TGCCT	2	10	134022	134031	0 %	40 %	20 %	40 %	317050323
62	NC_014836	GGGTG	2	10	134504	134513	0 %	20 %	80 %	0 %	317050323
63	NC_014836	CTGGC	2	10	135679	135688	0 %	20 %	40 %	40 %	317050323
64	NC_014836	CCCGG	2	10	137642	137651	0 %	0 %	40 %	60 %	317050325
65	NC_014836	TTGAT	2	10	143250	143259	20 %	60 %	20 %	0 %	317050332
66	NC_014836	GAGTG	2	10	143489	143498	20 %	20 %	60 %	0 %	317050332
67	NC_014836	GAGTG	2	10	146457	146466	20 %	20 %	60 %	0 %	317050336
68	NC_014836	GGGTC	2	10	147727	147736	0 %	20 %	60 %	20 %	317050337
69	NC_014836	CGAAC	2	10	152310	152319	40 %	0 %	20 %	40 %	317050344
70	NC_014836	TTGCT	2	10	152479	152488	0 %	60 %	20 %	20 %	317050344
71	NC_014836	CTCTG	2	10	159396	159405	0 %	40 %	20 %	40 %	317050350
72	NC_014836	AGGTC	2	10	159436	159445	20 %	20 %	40 %	20 %	317050350
73	NC_014836	TGCGC	2	10	162221	162230	0 %	20 %	40 %	40 %	317050353
74	NC_014836	ATGCA	2	10	178098	178107	40 %	20 %	20 %	20 %	317050359
75	NC_014836	CCGTG	2	10	178972	178981	0 %	20 %	40 %	40 %	317050361
76	NC_014836	CGCTG	2	10	181997	182006	0 %	20 %	40 %	40 %	317050363
77	NC_014836	GTTGT	2	10	182385	182394	0 %	60 %	40 %	0 %	317050364
78	NC_014836	CGAAA	2	10	182952	182961	60 %	0 %	20 %	20 %	317050364
79	NC_014836	TTCGG	2	10	185176	185185	0 %	40 %	40 %	20 %	317050366
80	NC_014836	GCCAG	2	10	185735	185744	20 %	0 %	40 %	40 %	317050367
81	NC_014836	ATTTT	2	10	190888	190897	20 %	80 %	0 %	0 %	317050371
82	NC_014836	ACACC	2	10	192200	192209	40 %	0 %	0 %	60 %	317050372
83	NC_014836	GGTCA	2	10	193404	193413	20 %	20 %	40 %	20 %	317050373
84	NC_014836	TTTTC	2	10	196875	196884	0 %	80 %	0 %	20 %	317050376
85	NC_014836	GCTTC	2	10	197031	197040	0 %	40 %	20 %	40 %	317050376
86	NC_014836	TGCCA	2	10	198276	198285	20 %	20 %	20 %	40 %	317050378
87	NC_014836	ATGTC	2	10	198765	198774	20 %	40 %	20 %	20 %	317050378
88	NC_014836	GGCCA	2	10	199142	199151	20 %	0 %	40 %	40 %	317050379
89	NC_014836	CAGGG	2	10	201672	201681	20 %	0 %	60 %	20 %	317050381
90	NC_014836	CGCTG	2	10	206241	206250	0 %	20 %	40 %	40 %	317050385
91	NC_014836	GTGCT	2	10	206392	206401	0 %	40 %	40 %	20 %	317050385
92	NC_014836	AGCTC	2	10	209804	209813	20 %	20 %	20 %	40 %	317050387
93	NC_014836	GGCCA	2	10	211486	211495	20 %	0 %	40 %	40 %	317050389
94	NC_014836	TGGGC	2	10	213251	213260	0 %	20 %	60 %	20 %	317050391
95	NC_014836	ACGGA	2	10	215857	215866	40 %	0 %	40 %	20 %	317050393
96	NC_014836	GACGG	2	10	217191	217200	20 %	0 %	60 %	20 %	317050393
97	NC_014836	CTTGT	2	10	217521	217530	0 %	60 %	20 %	20 %	317050394
98	NC_014836	TCTGC	2	10	218798	218807	0 %	40 %	20 %	40 %	317050396
99	NC_014836	CCTGC	2	10	219758	219767	0 %	20 %	20 %	60 %	317050397
100	NC_014836	CCCGC	2	10	221752	221761	0 %	0 %	20 %	80 %	317050398
101	NC_014836	CACAT	2	10	222195	222204	40 %	20 %	0 %	40 %	317050399
102	NC_014836	GCAGG	2	10	223342	223351	20 %	0 %	60 %	20 %	317050400
103	NC_014836	CGTTG	2	10	225904	225913	0 %	40 %	40 %	20 %	317050401
104	NC_014836	ATGGG	2	10	227020	227029	20 %	20 %	60 %	0 %	317050402
105	NC_014836	AAGAT	2	10	229900	229909	60 %	20 %	20 %	0 %	317050405
106	NC_014836	TGTGG	2	10	230157	230166	0 %	40 %	60 %	0 %	317050405
107	NC_014836	TCCCT	2	10	232549	232558	0 %	40 %	0 %	60 %	317050406
108	NC_014836	CAAAG	2	10	233890	233899	60 %	0 %	20 %	20 %	317050407
109	NC_014836	AGCTC	2	10	235188	235197	20 %	20 %	20 %	40 %	317050409
110	NC_014836	AAATA	2	10	236269	236278	80 %	20 %	0 %	0 %	317050409
111	NC_014836	AAGGA	2	10	245989	245998	60 %	0 %	40 %	0 %	317050415
112	NC_014836	GAGCC	2	10	246458	246467	20 %	0 %	40 %	40 %	317050415
113	NC_014836	ACATC	2	10	249190	249199	40 %	20 %	0 %	40 %	317050417
114	NC_014836	TCAGC	2	10	249964	249973	20 %	20 %	20 %	40 %	317050417
115	NC_014836	GTTTC	2	10	252325	252334	0 %	60 %	20 %	20 %	317050419
116	NC_014836	CAGGC	2	10	254848	254857	20 %	0 %	40 %	40 %	317050421
117	NC_014836	CTTCC	2	10	256232	256241	0 %	40 %	0 %	60 %	317050422
118	NC_014836	TGGCA	2	10	260313	260322	20 %	20 %	40 %	20 %	317050424
119	NC_014836	TGCCC	2	10	261797	261806	0 %	20 %	20 %	60 %	317050425
120	NC_014836	GCTCC	2	10	263558	263567	0 %	20 %	20 %	60 %	317050426
121	NC_014836	CAGGC	2	10	263991	264000	20 %	0 %	40 %	40 %	317050427
122	NC_014836	CTGAT	2	10	264965	264974	20 %	40 %	20 %	20 %	317050428
123	NC_014836	ACGAT	2	10	265259	265268	40 %	20 %	20 %	20 %	317050428
124	NC_014836	TGGCT	2	10	266784	266793	0 %	40 %	40 %	20 %	317050428
125	NC_014836	AAAAT	2	10	268058	268067	80 %	20 %	0 %	0 %	317050429
126	NC_014836	CTGGT	2	10	270415	270424	0 %	40 %	40 %	20 %	317050431
127	NC_014836	CAGCT	2	10	270600	270609	20 %	20 %	20 %	40 %	317050431
128	NC_014836	CGCTG	2	10	270626	270635	0 %	20 %	40 %	40 %	317050431
129	NC_014836	GTAAA	2	10	276031	276040	60 %	20 %	20 %	0 %	317050437
130	NC_014836	CTGAT	2	10	280974	280983	20 %	40 %	20 %	20 %	317050442
131	NC_014836	GCTGA	2	10	284985	284994	20 %	20 %	40 %	20 %	317050443
132	NC_014836	GCTCT	2	10	285285	285294	0 %	40 %	20 %	40 %	317050444
133	NC_014836	GTGCG	2	10	286728	286737	0 %	20 %	60 %	20 %	317050445
134	NC_014836	CATCA	2	10	287225	287234	40 %	20 %	0 %	40 %	317050446
135	NC_014836	GGCAG	2	10	307731	307740	20 %	0 %	60 %	20 %	317050467
136	NC_014836	CAGCC	2	10	309750	309759	20 %	0 %	20 %	60 %	317050468
137	NC_014836	CTTTG	2	10	319240	319249	0 %	60 %	20 %	20 %	317050477
138	NC_014836	CAAAA	2	10	322323	322332	80 %	0 %	0 %	20 %	317050480
139	NC_014836	ATTGC	2	10	322381	322390	20 %	40 %	20 %	20 %	317050480
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141	NC_014836	GGGAT	2	10	322561	322570	20 %	20 %	60 %	0 %	317050480
142	NC_014836	TGGTG	2	10	322769	322778	0 %	40 %	60 %	0 %	317050480
143	NC_014836	TTCCA	2	10	323829	323838	20 %	40 %	0 %	40 %	317050482
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145	NC_014836	TGCTA	2	10	326142	326151	20 %	40 %	20 %	20 %	317050484
146	NC_014836	GGTGA	2	10	326643	326652	20 %	20 %	60 %	0 %	317050485
147	NC_014836	CGGGG	2	10	327313	327322	0 %	0 %	80 %	20 %	317050486
148	NC_014836	GCGCT	2	10	336160	336169	0 %	20 %	40 %	40 %	317050496
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151	NC_014836	GCTCC	2	10	343974	343983	0 %	20 %	20 %	60 %	317050501
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164	NC_014836	CGCCC	2	10	368459	368468	0 %	0 %	20 %	80 %	317050523
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247	NC_014836	GGTCA	2	10	547053	547062	20 %	20 %	40 %	20 %	317050702
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251	NC_014836	GACCC	2	10	549345	549354	20 %	0 %	20 %	60 %	317050704
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258	NC_014836	TGTGA	2	10	571099	571108	20 %	40 %	40 %	0 %	317050721
259	NC_014836	CCCCG	2	10	572192	572201	0 %	0 %	20 %	80 %	317050722
260	NC_014836	AAACG	2	10	575311	575320	60 %	0 %	20 %	20 %	317050725
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262	NC_014836	GTGCT	2	10	578624	578633	0 %	40 %	40 %	20 %	317050729
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