MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 52955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014836	TGC	2	6	156171	156176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3002	NC_014836	TGG	2	6	156219	156224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3003	NC_014836	AAT	2	6	156248	156253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050349
3004	NC_014836	CGG	2	6	156299	156304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3005	NC_014836	TCC	2	6	156313	156318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050349
3006	NC_014836	ACC	2	6	156368	156373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050349
3007	NC_014836	CGC	2	6	156384	156389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050349
3008	NC_014836	CTG	2	6	156395	156400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3009	NC_014836	GTG	2	6	156470	156475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3010	NC_014836	TCG	2	6	156526	156531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3011	NC_014836	CAG	2	6	156533	156538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3012	NC_014836	TGG	2	6	156541	156546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3013	NC_014836	GGA	2	6	156589	156594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050349
3014	NC_014836	GGC	2	6	156604	156609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3015	NC_014836	GGA	2	6	156622	156627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050349
3016	NC_014836	CT	3	6	156764	156769	0 %	50 %	0 %	50 %	317050349
3017	NC_014836	CT	3	6	156774	156779	0 %	50 %	0 %	50 %	317050349
3018	NC_014836	TGA	2	6	156832	156837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050349
3019	NC_014836	TCC	2	6	156846	156851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050349
3020	NC_014836	AGG	2	6	156852	156857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050349
3021	NC_014836	AGC	2	6	156897	156902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3022	NC_014836	GAC	2	6	156914	156919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3023	NC_014836	TGG	2	6	156963	156968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3024	NC_014836	CTG	2	6	157016	157021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3025	NC_014836	CTG	2	6	157091	157096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3026	NC_014836	GGC	2	6	157104	157109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3027	NC_014836	GGC	3	9	157216	157224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3028	NC_014836	GCT	2	6	157246	157251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3029	NC_014836	GCG	2	6	157271	157276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3030	NC_014836	CTG	2	6	157355	157360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3031	NC_014836	GCT	2	6	157403	157408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3032	NC_014836	GCT	3	9	157423	157431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050349
3033	NC_014836	GCG	2	6	157460	157465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050349
3034	NC_014836	GTG	2	6	157466	157471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3035	NC_014836	TTC	2	6	157473	157478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050349
3036	NC_014836	TGG	2	6	157479	157484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3037	NC_014836	AAC	2	6	157511	157516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050349
3038	NC_014836	TGGCGG	2	12	157596	157607	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	317050349
3039	NC_014836	GTTC	2	8	157620	157627	0 %	50 %	25 %	25 %	317050349
3040	NC_014836	GGA	2	6	157673	157678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050349
3041	NC_014836	ACT	2	6	157692	157697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050349
3042	NC_014836	TGG	3	9	157725	157733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
3043	NC_014836	GGC	2	6	157967	157972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050350
3044	NC_014836	TGG	3	9	158035	158043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050350
3045	NC_014836	CTG	3	9	158048	158056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3046	NC_014836	GCT	2	6	158058	158063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3047	NC_014836	CCTG	2	8	158130	158137	0 %	25 %	25 %	50 %	317050350
3048	NC_014836	CCG	2	6	158194	158199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050350
3049	NC_014836	TGCC	2	8	158204	158211	0 %	25 %	25 %	50 %	317050350
3050	NC_014836	TGG	2	6	158556	158561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050350
3051	NC_014836	GCT	2	6	158743	158748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3052	NC_014836	CAGC	2	8	158770	158777	25 %	0 %	25 %	50 %	317050350
3053	NC_014836	CCT	2	6	158809	158814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050350
3054	NC_014836	C	6	6	158824	158829	0 %	0 %	0 %	100 %	317050350
3055	NC_014836	ATG	2	6	158913	158918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050350
3056	NC_014836	GAT	2	6	158967	158972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050350
3057	NC_014836	GGC	2	6	158978	158983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050350
3058	NC_014836	CCA	2	6	159007	159012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050350
3059	NC_014836	CCA	2	6	159166	159171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050350
3060	NC_014836	GC	3	6	159222	159227	0 %	0 %	50 %	50 %	317050350
3061	NC_014836	CAG	2	6	159233	159238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3062	NC_014836	GC	3	6	159348	159353	0 %	0 %	50 %	50 %	317050350
3063	NC_014836	CTCTG	2	10	159396	159405	0 %	40 %	20 %	40 %	317050350
3064	NC_014836	AGGTC	2	10	159436	159445	20 %	20 %	40 %	20 %	317050350
3065	NC_014836	TCG	2	6	159495	159500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
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3067	NC_014836	TGC	3	9	159613	159621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3068	NC_014836	TTG	2	6	159686	159691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050350
3069	NC_014836	GCA	2	6	159694	159699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3070	NC_014836	GCT	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050350
3071	NC_014836	T	7	7	159738	159744	0 %	100 %	0 %	0 %	317050350
3072	NC_014836	ATGG	2	8	160347	160354	25 %	25 %	50 %	0 %	317050351
3073	NC_014836	CTG	3	9	160419	160427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050351
3074	NC_014836	CG	4	8	160557	160564	0 %	0 %	50 %	50 %	317050351
3075	NC_014836	GCG	2	6	160568	160573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050351
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3077	NC_014836	CGA	2	6	160651	160656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3078	NC_014836	TGC	2	6	160677	160682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3079	NC_014836	GCT	2	6	160706	160711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3080	NC_014836	CAGC	2	8	160754	160761	25 %	0 %	25 %	50 %	317050352
3081	NC_014836	GC	3	6	160831	160836	0 %	0 %	50 %	50 %	317050352
3082	NC_014836	GGGT	2	8	160856	160863	0 %	25 %	75 %	0 %	317050352
3083	NC_014836	GGT	2	6	160954	160959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050352
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3085	NC_014836	CCAC	2	8	161345	161352	25 %	0 %	0 %	75 %	317050352
3086	NC_014836	GC	3	6	161392	161397	0 %	0 %	50 %	50 %	317050352
3087	NC_014836	ATA	2	6	161447	161452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050352
3088	NC_014836	GTG	2	6	161498	161503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050352
3089	NC_014836	TGA	2	6	161594	161599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050352
3090	NC_014836	CTG	2	6	161611	161616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3091	NC_014836	CAG	2	6	161630	161635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3092	NC_014836	GCC	2	6	161638	161643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050352
3093	NC_014836	CT	3	6	161668	161673	0 %	50 %	0 %	50 %	317050352
3094	NC_014836	CCA	2	6	161691	161696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050352
3095	NC_014836	GCA	2	6	161718	161723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050352
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3097	NC_014836	CAG	2	6	161764	161769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3098	NC_014836	TGC	2	6	161771	161776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3099	NC_014836	GCA	2	6	161895	161900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050352
3100	NC_014836	TGCGC	2	10	162221	162230	0 %	20 %	40 %	40 %	317050353
3101	NC_014836	GCC	2	6	162237	162242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050353
3102	NC_014836	TCCC	2	8	162389	162396	0 %	25 %	0 %	75 %	317050353
3103	NC_014836	TGG	2	6	162406	162411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050353
3104	NC_014836	TGC	2	6	162418	162423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050353
3105	NC_014836	ACG	2	6	162543	162548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050353
3106	NC_014836	CTG	2	6	162549	162554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050353
3107	NC_014836	CT	3	6	162657	162662	0 %	50 %	0 %	50 %	317050353
3108	NC_014836	CAG	2	6	168189	168194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050354
3109	NC_014836	CGG	2	6	168195	168200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050354
3110	NC_014836	CAT	2	6	168225	168230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050354
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3112	NC_014836	TGC	2	6	168246	168251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050354
3113	NC_014836	CCA	2	6	168306	168311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050354
3114	NC_014836	GGC	2	6	168435	168440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050354
3115	NC_014836	TGC	2	6	168507	168512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050354
3116	NC_014836	CATGCT	2	12	168517	168528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	317050354
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3118	NC_014836	CAT	3	9	168673	168681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050354
3119	NC_014836	GTT	2	6	168691	168696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050354
3120	NC_014836	GTT	2	6	168703	168708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050354
3121	NC_014836	CAT	2	6	168721	168726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050354
3122	NC_014836	CAT	2	6	168754	168759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050354
3123	NC_014836	CAT	2	6	168904	168909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050354
3124	NC_014836	GCT	2	6	168961	168966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050354
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3132	NC_014836	CTG	2	6	169531	169536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050354
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3143	NC_014836	GCCATG	2	12	170946	170957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317050355
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3149	NC_014836	GAT	2	6	171287	171292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050355
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3223	NC_014836	ATG	2	6	175347	175352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050357
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3227	NC_014836	GAT	2	6	175900	175905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050358
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3231	NC_014836	CCG	2	6	176169	176174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050358
3232	NC_014836	GTC	2	6	176179	176184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050358
3233	NC_014836	GCT	2	6	176187	176192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050358
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3235	NC_014836	A	6	6	176274	176279	100 %	0 %	0 %	0 %	317050358
3236	NC_014836	CCT	2	6	176382	176387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050358
3237	NC_014836	ATG	2	6	176522	176527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050358
3238	NC_014836	CAT	2	6	177907	177912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050359
3239	NC_014836	GCT	2	6	177925	177930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050359
3240	NC_014836	ATGCA	2	10	178098	178107	40 %	20 %	20 %	20 %	317050359
3241	NC_014836	GA	3	6	178140	178145	50 %	0 %	50 %	0 %	317050359
3242	NC_014836	AGT	2	6	178148	178153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050359
3243	NC_014836	GAC	2	6	178160	178165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050359
3244	NC_014836	CAAG	2	8	178189	178196	50 %	0 %	25 %	25 %	317050359
3245	NC_014836	CAG	2	6	178198	178203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050359
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3247	NC_014836	AC	3	6	178220	178225	50 %	0 %	0 %	50 %	317050359
3248	NC_014836	GCA	2	6	178385	178390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050360
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3251	NC_014836	CTG	2	6	178898	178903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050361
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3254	NC_014836	GGA	2	6	179012	179017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050361
3255	NC_014836	GTG	2	6	179018	179023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050361
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3273	NC_014836	CAG	2	6	180322	180327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050362
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3279	NC_014836	TCG	2	6	180590	180595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050362
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3283	NC_014836	AGC	2	6	180917	180922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050362
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3288	NC_014836	TA	3	6	181637	181642	50 %	50 %	0 %	0 %	317050363
3289	NC_014836	CTG	2	6	181674	181679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050363
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3292	NC_014836	TGG	2	6	181849	181854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050363
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3295	NC_014836	CGCTG	2	10	181997	182006	0 %	20 %	40 %	40 %	317050363
3296	NC_014836	CCG	2	6	182304	182309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050364
3297	NC_014836	CAG	2	6	182375	182380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050364
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3312	NC_014836	GCA	2	6	183253	183258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050364
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3343	NC_014836	GTTATC	2	12	184868	184879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317050366
3344	NC_014836	GGC	2	6	184891	184896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050366
3345	NC_014836	TGAG	2	8	184923	184930	25 %	25 %	50 %	0 %	317050366
3346	NC_014836	TGC	2	6	184966	184971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050366
3347	NC_014836	ATG	2	6	185004	185009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050366
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3349	NC_014836	CGG	2	6	185070	185075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050366
3350	NC_014836	AGC	2	6	185131	185136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050366
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3352	NC_014836	CAA	2	6	185157	185162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050366
3353	NC_014836	TTCGG	2	10	185176	185185	0 %	40 %	40 %	20 %	317050366
3354	NC_014836	GAC	2	6	185365	185370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050367
3355	NC_014836	T	7	7	185450	185456	0 %	100 %	0 %	0 %	317050367
3356	NC_014836	GCT	2	6	185472	185477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050367
3357	NC_014836	GAG	2	6	185506	185511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050367
3358	NC_014836	TGG	2	6	185597	185602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050367
3359	NC_014836	GCT	2	6	185646	185651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050367
3360	NC_014836	TGG	2	6	185668	185673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050367
3361	NC_014836	GCC	2	6	185716	185721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050367
3362	NC_014836	GCCAG	2	10	185735	185744	20 %	0 %	40 %	40 %	317050367
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3454	NC_014836	ATCAGC	2	12	191273	191284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	317050371
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3466	NC_014836	TGCG	2	8	192035	192042	0 %	25 %	50 %	25 %	317050372
3467	NC_014836	GGT	3	9	192075	192083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050372
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3469	NC_014836	ACACC	2	10	192200	192209	40 %	0 %	0 %	60 %	317050372
3470	NC_014836	TGC	2	6	192219	192224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050372
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3472	NC_014836	TCAA	2	8	192307	192314	50 %	25 %	0 %	25 %	317050372
3473	NC_014836	CGA	2	6	192327	192332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050372
3474	NC_014836	ACC	2	6	192412	192417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050372
3475	NC_014836	AG	3	6	192487	192492	50 %	0 %	50 %	0 %	317050372
3476	NC_014836	AGG	2	6	192512	192517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050372
3477	NC_014836	CTG	2	6	192541	192546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050372
3478	NC_014836	ATCAGC	2	12	192559	192570	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	317050372
3479	NC_014836	TGAGGT	2	12	192606	192617	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	317050372
3480	NC_014836	ACT	2	6	192629	192634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050372
3481	NC_014836	CTG	2	6	192649	192654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050372
3482	NC_014836	TCG	2	6	192674	192679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050372
3483	NC_014836	GCC	2	6	192770	192775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050372
3484	NC_014836	GA	3	6	192782	192787	50 %	0 %	50 %	0 %	317050372
3485	NC_014836	GAC	2	6	192829	192834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050372
3486	NC_014836	ATC	2	6	192910	192915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050372
3487	NC_014836	TCT	2	6	193018	193023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050373
3488	NC_014836	TGG	2	6	193039	193044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050373
3489	NC_014836	CAT	2	6	193151	193156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050373
3490	NC_014836	CTG	3	9	193179	193187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050373
3491	NC_014836	CCA	3	9	193231	193239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050373
3492	NC_014836	TGCG	2	8	193251	193258	0 %	25 %	50 %	25 %	317050373
3493	NC_014836	CAA	2	6	193292	193297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050373
3494	NC_014836	GGT	2	6	193319	193324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050373
3495	NC_014836	G	8	8	193331	193338	0 %	0 %	100 %	0 %	317050373
3496	NC_014836	GGTCA	2	10	193404	193413	20 %	20 %	40 %	20 %	317050373
3497	NC_014836	GCG	2	6	193470	193475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050373
3498	NC_014836	TC	3	6	193532	193537	0 %	50 %	0 %	50 %	317050373
3499	NC_014836	ACC	2	6	193569	193574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050373
3500	NC_014836	TGC	2	6	193591	193596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050373

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