MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 52955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014836	GAAG	2	8	131371	131378	50 %	0 %	50 %	0 %	317050320
2502	NC_014836	GAG	2	6	131392	131397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050320
2503	NC_014836	CAGG	2	8	131416	131423	25 %	0 %	50 %	25 %	317050320
2504	NC_014836	GCA	2	6	131451	131456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050320
2505	NC_014836	CTG	2	6	131513	131518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050320
2506	NC_014836	TGT	2	6	131567	131572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050320
2507	NC_014836	AGC	2	6	131621	131626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050320
2508	NC_014836	CTG	2	6	131642	131647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050320
2509	NC_014836	CAGC	2	8	131649	131656	25 %	0 %	25 %	50 %	317050320
2510	NC_014836	ATTC	2	8	131755	131762	25 %	50 %	0 %	25 %	317050320
2511	NC_014836	ACC	2	6	131766	131771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050320
2512	NC_014836	CCA	2	6	131835	131840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050320
2513	NC_014836	GCC	2	6	131876	131881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050320
2514	NC_014836	C	7	7	131901	131907	0 %	0 %	0 %	100 %	317050320
2515	NC_014836	TGG	2	6	132093	132098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050320
2516	NC_014836	AGC	2	6	132272	132277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050321
2517	NC_014836	GTG	2	6	132326	132331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050321
2518	NC_014836	CGG	2	6	132351	132356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050321
2519	NC_014836	GGT	2	6	132358	132363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050321
2520	NC_014836	CCA	2	6	132396	132401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050321
2521	NC_014836	AAT	2	6	132430	132435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050321
2522	NC_014836	TGC	2	6	132450	132455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050321
2523	NC_014836	GTGG	2	8	132505	132512	0 %	25 %	75 %	0 %	317050321
2524	NC_014836	GC	3	6	132614	132619	0 %	0 %	50 %	50 %	317050321
2525	NC_014836	GTGG	2	8	132763	132770	0 %	25 %	75 %	0 %	317050321
2526	NC_014836	GCG	2	6	132827	132832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050321
2527	NC_014836	GACT	2	8	132839	132846	25 %	25 %	25 %	25 %	317050321
2528	NC_014836	GCC	2	6	132877	132882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050321
2529	NC_014836	A	6	6	132889	132894	100 %	0 %	0 %	0 %	317050321
2530	NC_014836	GTG	2	6	132916	132921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050321
2531	NC_014836	GCCCG	2	10	132930	132939	0 %	0 %	40 %	60 %	317050321
2532	NC_014836	GGC	2	6	132940	132945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050321
2533	NC_014836	TAC	2	6	133011	133016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050321
2534	NC_014836	AGCC	2	8	133028	133035	25 %	0 %	25 %	50 %	317050322
2535	NC_014836	AAG	2	6	133079	133084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050322
2536	NC_014836	GCT	2	6	133155	133160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050322
2537	NC_014836	CAG	3	9	133199	133207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050322
2538	NC_014836	CAG	2	6	133238	133243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050322
2539	NC_014836	TGC	2	6	133345	133350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050322
2540	NC_014836	CCA	2	6	133373	133378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050322
2541	NC_014836	GGC	2	6	133418	133423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050322
2542	NC_014836	GGA	2	6	133484	133489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050322
2543	NC_014836	CGG	2	6	133513	133518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050322
2544	NC_014836	ATA	2	6	133554	133559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050322
2545	NC_014836	C	6	6	133632	133637	0 %	0 %	0 %	100 %	317050322
2546	NC_014836	CAG	2	6	133676	133681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050322
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2551	NC_014836	GAT	2	6	133814	133819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050322
2552	NC_014836	G	6	6	133837	133842	0 %	0 %	100 %	0 %	317050322
2553	NC_014836	AGCAC	2	10	133891	133900	40 %	0 %	20 %	40 %	317050322
2554	NC_014836	CAG	2	6	133907	133912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050322
2555	NC_014836	CCTG	2	8	134008	134015	0 %	25 %	25 %	50 %	317050323
2556	NC_014836	TGCCT	2	10	134022	134031	0 %	40 %	20 %	40 %	317050323
2557	NC_014836	CAG	2	6	134034	134039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
2558	NC_014836	GCGG	2	8	134040	134047	0 %	0 %	75 %	25 %	317050323
2559	NC_014836	C	6	6	134114	134119	0 %	0 %	0 %	100 %	317050323
2560	NC_014836	CAAG	2	8	134123	134130	50 %	0 %	25 %	25 %	317050323
2561	NC_014836	GT	3	6	134138	134143	0 %	50 %	50 %	0 %	317050323
2562	NC_014836	GGC	2	6	134279	134284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050323
2563	NC_014836	CTGC	2	8	134372	134379	0 %	25 %	25 %	50 %	317050323
2564	NC_014836	AAG	2	6	134382	134387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050323
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2567	NC_014836	CAG	2	6	134559	134564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
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2572	NC_014836	GCA	3	9	134771	134779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
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2578	NC_014836	TGG	2	6	135073	135078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050323
2579	NC_014836	GTGCAG	2	12	135090	135101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317050323
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2581	NC_014836	GCGCTG	2	12	135153	135164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317050323
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2584	NC_014836	AGAC	2	8	135308	135315	50 %	0 %	25 %	25 %	317050323
2585	NC_014836	CCG	2	6	135316	135321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050323
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2588	NC_014836	CAG	2	6	135393	135398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
2589	NC_014836	CTG	2	6	135399	135404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050323
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2592	NC_014836	G	7	7	135542	135548	0 %	0 %	100 %	0 %	317050323
2593	NC_014836	GCA	2	6	135599	135604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
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2595	NC_014836	G	6	6	135620	135625	0 %	0 %	100 %	0 %	317050323
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2597	NC_014836	CTGGC	2	10	135679	135688	0 %	20 %	40 %	40 %	317050323
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2602	NC_014836	GCG	2	6	135951	135956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050323
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2604	NC_014836	GAT	2	6	136080	136085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050323
2605	NC_014836	GGCG	2	8	136124	136131	0 %	0 %	75 %	25 %	317050323
2606	NC_014836	GCA	3	9	136148	136156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
2607	NC_014836	GC	5	10	136243	136252	0 %	0 %	50 %	50 %	317050323
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2610	NC_014836	TCTG	2	8	136319	136326	0 %	50 %	25 %	25 %	317050323
2611	NC_014836	CAG	2	6	136341	136346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050323
2612	NC_014836	GCT	2	6	136480	136485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050324
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2617	NC_014836	CTGG	2	8	136751	136758	0 %	25 %	50 %	25 %	317050324
2618	NC_014836	GC	3	6	136800	136805	0 %	0 %	50 %	50 %	317050324
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2622	NC_014836	GCTG	2	8	137088	137095	0 %	25 %	50 %	25 %	317050325
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2865	NC_014836	GTG	2	6	149961	149966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050340
2866	NC_014836	CGA	2	6	150080	150085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050340
2867	NC_014836	AGG	2	6	150247	150252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050340
2868	NC_014836	GCG	2	6	150268	150273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050340
2869	NC_014836	GAC	2	6	150294	150299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050340
2870	NC_014836	GTATCA	2	12	150414	150425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317050341
2871	NC_014836	CGCAGC	2	12	150494	150505	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317050341
2872	NC_014836	CTG	2	6	150513	150518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050341
2873	NC_014836	TGCC	2	8	150600	150607	0 %	25 %	25 %	50 %	317050341
2874	NC_014836	AGC	2	6	150642	150647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050341
2875	NC_014836	CTG	2	6	150670	150675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050341
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2880	NC_014836	TGG	2	6	150788	150793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050341
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2882	NC_014836	GAA	2	6	150895	150900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050341
2883	NC_014836	AGC	2	6	150902	150907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050341
2884	NC_014836	GTC	2	6	150913	150918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050341
2885	NC_014836	CGG	2	6	150930	150935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050341
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2888	NC_014836	TGC	2	6	151085	151090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050341
2889	NC_014836	G	6	6	151110	151115	0 %	0 %	100 %	0 %	317050341
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2892	NC_014836	CG	3	6	151309	151314	0 %	0 %	50 %	50 %	317050342
2893	NC_014836	GTG	2	6	151355	151360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050342
2894	NC_014836	TATC	2	8	151366	151373	25 %	50 %	0 %	25 %	317050342
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2901	NC_014836	A	6	6	151790	151795	100 %	0 %	0 %	0 %	317050343
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2964	NC_014836	GGTG	2	8	154739	154746	0 %	25 %	75 %	0 %	317050348
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2970	NC_014836	GCT	2	6	154913	154918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050348
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2979	NC_014836	TGA	2	6	155204	155209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050348
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2981	NC_014836	CGA	2	6	155279	155284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050348
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2984	NC_014836	TGG	2	6	155353	155358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050348
2985	NC_014836	CAG	3	9	155367	155375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050348
2986	NC_014836	GCT	2	6	155390	155395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050348
2987	NC_014836	TGG	2	6	155407	155412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050348
2988	NC_014836	AGT	2	6	155415	155420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050348
2989	NC_014836	CTG	2	6	155520	155525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050348
2990	NC_014836	CGG	2	6	155581	155586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050348
2991	NC_014836	ACCT	2	8	155637	155644	25 %	25 %	0 %	50 %	317050348
2992	NC_014836	CAA	2	6	155663	155668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050348
2993	NC_014836	CGG	2	6	155683	155688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050348
2994	NC_014836	CTG	3	9	155712	155720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050348
2995	NC_014836	TGGG	2	8	155725	155732	0 %	25 %	75 %	0 %	317050348
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2997	NC_014836	TGG	2	6	156006	156011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
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2999	NC_014836	TGG	2	6	156039	156044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050349
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