MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 69778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014216	AGCCC	2	10	66099	66108	20 %	0 %	20 %	60 %	297568042
1502	NC_014216	CCA	2	6	66114	66119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568042
1503	NC_014216	GCC	3	9	66143	66151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1504	NC_014216	CCG	2	6	66159	66164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1505	NC_014216	CGC	2	6	66205	66210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1506	NC_014216	GAT	2	6	66238	66243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568042
1507	NC_014216	AGC	2	6	66252	66257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568042
1508	NC_014216	GCC	2	6	66389	66394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1509	NC_014216	GCC	2	6	66407	66412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1510	NC_014216	GCC	2	6	66431	66436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568042
1511	NC_014216	CGT	2	6	66713	66718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568043
1512	NC_014216	GTG	2	6	66770	66775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568043
1513	NC_014216	CCGG	2	8	66792	66799	0 %	0 %	50 %	50 %	297568043
1514	NC_014216	CTG	2	6	66824	66829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568043
1515	NC_014216	GGA	2	6	66850	66855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568043
1516	NC_014216	CTG	2	6	66992	66997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568043
1517	NC_014216	TGG	2	6	67005	67010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568043
1518	NC_014216	ACCT	2	8	67022	67029	25 %	25 %	0 %	50 %	297568043
1519	NC_014216	GCC	2	6	67036	67041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568043
1520	NC_014216	ATC	2	6	67052	67057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568043
1521	NC_014216	GCGG	2	8	67081	67088	0 %	0 %	75 %	25 %	297568043
1522	NC_014216	AGG	2	6	67182	67187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568043
1523	NC_014216	GGC	2	6	67199	67204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568043
1524	NC_014216	CAG	2	6	67223	67228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568043
1525	NC_014216	TC	3	6	67260	67265	0 %	50 %	0 %	50 %	297568043
1526	NC_014216	CAG	2	6	67268	67273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568043
1527	NC_014216	GGT	2	6	67297	67302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568043
1528	NC_014216	C	6	6	67365	67370	0 %	0 %	0 %	100 %	297568044
1529	NC_014216	GCC	2	6	67404	67409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568044
1530	NC_014216	GCG	2	6	67454	67459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568044
1531	NC_014216	CCA	2	6	67559	67564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568044
1532	NC_014216	CCA	2	6	67566	67571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568044
1533	NC_014216	GGGC	2	8	67592	67599	0 %	0 %	75 %	25 %	297568044
1534	NC_014216	CAG	3	9	67620	67628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1535	NC_014216	CAC	2	6	67629	67634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568044
1536	NC_014216	GTG	2	6	67669	67674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568044
1537	NC_014216	GCC	2	6	67685	67690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568044
1538	NC_014216	GCT	2	6	67697	67702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1539	NC_014216	CCA	2	6	67724	67729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568044
1540	NC_014216	GCC	2	6	67732	67737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568044
1541	NC_014216	AGC	2	6	67738	67743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1542	NC_014216	CAG	2	6	67746	67751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1543	NC_014216	TTG	2	6	67759	67764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568044
1544	NC_014216	TCA	2	6	67808	67813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568044
1545	NC_014216	GCG	2	6	67816	67821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568044
1546	NC_014216	GGGC	2	8	67833	67840	0 %	0 %	75 %	25 %	297568044
1547	NC_014216	GCA	2	6	67856	67861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1548	NC_014216	GGC	2	6	67908	67913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568044
1549	NC_014216	CGG	2	6	67919	67924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568044
1550	NC_014216	AACA	2	8	67953	67960	75 %	0 %	0 %	25 %	297568044
1551	NC_014216	GCA	2	6	67961	67966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1552	NC_014216	ACG	2	6	67976	67981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1553	NC_014216	CCG	2	6	68004	68009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568044
1554	NC_014216	TCA	2	6	68051	68056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568044
1555	NC_014216	A	7	7	68065	68071	100 %	0 %	0 %	0 %	297568044
1556	NC_014216	G	6	6	68108	68113	0 %	0 %	100 %	0 %	297568044
1557	NC_014216	CAG	2	6	68130	68135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1558	NC_014216	CTC	2	6	68166	68171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568044
1559	NC_014216	CAG	2	6	68175	68180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1560	NC_014216	GCT	2	6	68198	68203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568044
1561	NC_014216	CG	3	6	68234	68239	0 %	0 %	50 %	50 %	297568045
1562	NC_014216	GCG	2	6	68242	68247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568045
1563	NC_014216	CGG	2	6	68269	68274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568045
1564	NC_014216	GCCCG	2	10	68350	68359	0 %	0 %	40 %	60 %	297568045
1565	NC_014216	CCA	3	9	68397	68405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568045
1566	NC_014216	GGC	2	6	68406	68411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568045
1567	NC_014216	CCCGGT	2	12	68421	68432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297568045
1568	NC_014216	CAG	2	6	68488	68493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568045
1569	NC_014216	CAG	2	6	68530	68535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568045
1570	NC_014216	GGC	4	12	68689	68700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568045
1571	NC_014216	GCCA	2	8	68795	68802	25 %	0 %	25 %	50 %	297568045
1572	NC_014216	GCCG	2	8	68829	68836	0 %	0 %	50 %	50 %	297568045
1573	NC_014216	TGC	2	6	68874	68879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568045
1574	NC_014216	ATG	2	6	68882	68887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568045
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1576	NC_014216	CAG	3	9	68974	68982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568045
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1578	NC_014216	CCGGA	2	10	69294	69303	20 %	0 %	40 %	40 %	297568046
1579	NC_014216	GCG	2	6	69323	69328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568046
1580	NC_014216	GGAGCA	2	12	69379	69390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297568046
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1582	NC_014216	GCC	2	6	69476	69481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568046
1583	NC_014216	A	6	6	69497	69502	100 %	0 %	0 %	0 %	297568046
1584	NC_014216	GAG	2	6	69542	69547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568046
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1587	NC_014216	GCT	2	6	69664	69669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568046
1588	NC_014216	AGGCC	2	10	69712	69721	20 %	0 %	40 %	40 %	297568046
1589	NC_014216	GGCCAT	2	12	69742	69753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297568046
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1594	NC_014216	CAC	2	6	70082	70087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568047
1595	NC_014216	GGT	2	6	70094	70099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568047
1596	NC_014216	ATG	2	6	70108	70113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568047
1597	NC_014216	TGG	2	6	70126	70131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568047
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1599	NC_014216	CGG	2	6	70315	70320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568047
1600	NC_014216	CGC	2	6	70325	70330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568047
1601	NC_014216	CCG	2	6	70357	70362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568047
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1603	NC_014216	ATC	2	6	70482	70487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568047
1604	NC_014216	GCT	2	6	70500	70505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568047
1605	NC_014216	AAG	2	6	70527	70532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568047
1606	NC_014216	GCG	2	6	70564	70569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568047
1607	NC_014216	CCAC	2	8	70624	70631	25 %	0 %	0 %	75 %	297568047
1608	NC_014216	GTG	2	6	70648	70653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568047
1609	NC_014216	CTGG	2	8	70679	70686	0 %	25 %	50 %	25 %	297568047
1610	NC_014216	CGA	2	6	70688	70693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568047
1611	NC_014216	CT	3	6	70782	70787	0 %	50 %	0 %	50 %	297568047
1612	NC_014216	CCA	2	6	70789	70794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568047
1613	NC_014216	TCA	2	6	70819	70824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568047
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1616	NC_014216	TGG	2	6	70981	70986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568047
1617	NC_014216	CGA	2	6	71066	71071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568047
1618	NC_014216	GGT	2	6	71072	71077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568047
1619	NC_014216	GCC	2	6	71088	71093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568047
1620	NC_014216	TGC	3	9	71131	71139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568047
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1622	NC_014216	ACC	2	6	71211	71216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568047
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1994	NC_014216	GCC	2	6	89985	89990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568062
1995	NC_014216	TCC	2	6	89995	90000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568062
1996	NC_014216	G	6	6	90065	90070	0 %	0 %	100 %	0 %	297568062
1997	NC_014216	CGG	2	6	90076	90081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568062
1998	NC_014216	TCG	2	6	90088	90093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568062
1999	NC_014216	CTC	2	6	90165	90170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297568062
2000	NC_014216	GGGC	2	8	90218	90225	0 %	0 %	75 %	25 %	297568062

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