MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013940	GAATT	2	10	3503	3512	40 %	40 %	20 %	0 %	291280554
2	NC_013940	AAATA	2	10	5065	5074	80 %	20 %	0 %	0 %	291280558
3	NC_013940	AGATA	2	10	6499	6508	60 %	20 %	20 %	0 %	291280558
4	NC_013940	ATATT	2	10	7096	7105	40 %	60 %	0 %	0 %	291280559
5	NC_013940	TAAAA	2	10	7739	7748	80 %	20 %	0 %	0 %	291280559
6	NC_013940	AGAAA	2	10	7868	7877	80 %	0 %	20 %	0 %	291280559
7	NC_013940	ATGGT	2	10	8596	8605	20 %	40 %	40 %	0 %	291280559
8	NC_013940	AATAA	2	10	11872	11881	80 %	20 %	0 %	0 %	291280561
9	NC_013940	TAAGT	2	10	12584	12593	40 %	40 %	20 %	0 %	291280562
10	NC_013940	TGTAT	2	10	12836	12845	20 %	60 %	20 %	0 %	291280562
11	NC_013940	GATCA	2	10	12867	12876	40 %	20 %	20 %	20 %	291280562
12	NC_013940	ATAAA	2	10	13150	13159	80 %	20 %	0 %	0 %	291280562
13	NC_013940	GTGAA	2	10	13309	13318	40 %	20 %	40 %	0 %	291280562
14	NC_013940	AAAAG	2	10	13870	13879	80 %	0 %	20 %	0 %	291280563
15	NC_013940	AGGAG	2	10	15792	15801	40 %	0 %	60 %	0 %	291280564
16	NC_013940	ATAAA	2	10	15983	15992	80 %	20 %	0 %	0 %	291280564
17	NC_013940	ATGTT	2	10	16383	16392	20 %	60 %	20 %	0 %	291280565
18	NC_013940	TCAAA	2	10	16995	17004	60 %	20 %	0 %	20 %	291280566
19	NC_013940	TAATA	2	10	17176	17185	60 %	40 %	0 %	0 %	291280566
20	NC_013940	TTTAG	2	10	17247	17256	20 %	60 %	20 %	0 %	291280567
21	NC_013940	TTACT	2	10	19407	19416	20 %	60 %	0 %	20 %	291280568
22	NC_013940	AGTTT	2	10	20866	20875	20 %	60 %	20 %	0 %	291280570
23	NC_013940	ACAAA	2	10	21126	21135	80 %	0 %	0 %	20 %	291280570
24	NC_013940	TAAAA	2	10	22461	22470	80 %	20 %	0 %	0 %	291280571
25	NC_013940	TATGG	2	10	23928	23937	20 %	40 %	40 %	0 %	291280572
26	NC_013940	TTTCT	2	10	26075	26084	0 %	80 %	0 %	20 %	291280574
27	NC_013940	ATTTA	2	10	26988	26997	40 %	60 %	0 %	0 %	291280575
28	NC_013940	AGTTT	2	10	27163	27172	20 %	60 %	20 %	0 %	291280576
29	NC_013940	ATTAT	2	10	27485	27494	40 %	60 %	0 %	0 %	291280576
30	NC_013940	GTTAT	2	10	27655	27664	20 %	60 %	20 %	0 %	291280576
31	NC_013940	TATAA	2	10	27717	27726	60 %	40 %	0 %	0 %	291280576
32	NC_013940	TTTTA	2	10	27799	27808	20 %	80 %	0 %	0 %	291280577
33	NC_013940	TGTTA	2	10	28501	28510	20 %	60 %	20 %	0 %	291280577
34	NC_013940	TTAGA	2	10	30727	30736	40 %	40 %	20 %	0 %	291280579
35	NC_013940	ATGCA	2	10	31404	31413	40 %	20 %	20 %	20 %	291280580
36	NC_013940	AATTT	2	10	33012	33021	40 %	60 %	0 %	0 %	291280582
37	NC_013940	AGAAA	2	10	33512	33521	80 %	0 %	20 %	0 %	291280582
38	NC_013940	AAAAG	2	10	35819	35828	80 %	0 %	20 %	0 %	291280583
39	NC_013940	TTTAT	2	10	35959	35968	20 %	80 %	0 %	0 %	291280583
40	NC_013940	AAATA	2	10	36107	36116	80 %	20 %	0 %	0 %	291280583
41	NC_013940	TAAAA	2	10	38862	38871	80 %	20 %	0 %	0 %	291280584
42	NC_013940	ATTAT	2	10	54411	54420	40 %	60 %	0 %	0 %	291280592
43	NC_013940	TAAAT	2	10	55822	55831	60 %	40 %	0 %	0 %	291280594
44	NC_013940	AGAAA	2	10	57279	57288	80 %	0 %	20 %	0 %	291280595
45	NC_013940	GTTAA	2	10	57529	57538	40 %	40 %	20 %	0 %	291280595
46	NC_013940	TTTAG	2	10	58542	58551	20 %	60 %	20 %	0 %	291280596
47	NC_013940	ATGGA	2	10	59221	59230	40 %	20 %	40 %	0 %	291280596
48	NC_013940	AAAGA	2	10	59319	59328	80 %	0 %	20 %	0 %	291280596
49	NC_013940	TAATT	2	10	59885	59894	40 %	60 %	0 %	0 %	291280596
50	NC_013940	TTTAT	2	10	60406	60415	20 %	80 %	0 %	0 %	291280596
51	NC_013940	TTCTT	2	10	61784	61793	0 %	80 %	0 %	20 %	291280597
52	NC_013940	AAGTA	2	10	62347	62356	60 %	20 %	20 %	0 %	291280598
53	NC_013940	TTACA	2	10	64895	64904	40 %	40 %	0 %	20 %	291280602
54	NC_013940	ATATT	2	10	65260	65269	40 %	60 %	0 %	0 %	291280602
55	NC_013940	AAATT	2	10	65360	65369	60 %	40 %	0 %	0 %	291280602
56	NC_013940	TATAG	2	10	65948	65957	40 %	40 %	20 %	0 %	291280602
57	NC_013940	AATTT	2	10	66339	66348	40 %	60 %	0 %	0 %	291280602
58	NC_013940	TAAAC	2	10	66571	66580	60 %	20 %	0 %	20 %	291280602
59	NC_013940	GTTAA	2	10	67825	67834	40 %	40 %	20 %	0 %	291280603
60	NC_013940	ATATA	2	10	69585	69594	60 %	40 %	0 %	0 %	291280605
61	NC_013940	AGTTT	2	10	70415	70424	20 %	60 %	20 %	0 %	291280606
62	NC_013940	AATAA	2	10	73109	73118	80 %	20 %	0 %	0 %	291280608
63	NC_013940	ATTTT	2	10	73224	73233	20 %	80 %	0 %	0 %	291280608
64	NC_013940	TAAAT	2	10	74210	74219	60 %	40 %	0 %	0 %	291280609
65	NC_013940	ATTTA	2	10	75158	75167	40 %	60 %	0 %	0 %	291280609
66	NC_013940	TAATT	2	10	77235	77244	40 %	60 %	0 %	0 %	291280613
67	NC_013940	AATTA	2	10	77487	77496	60 %	40 %	0 %	0 %	291280613
68	NC_013940	AAAAT	2	10	77528	77537	80 %	20 %	0 %	0 %	291280613
69	NC_013940	AAATT	2	10	79647	79656	60 %	40 %	0 %	0 %	291280614
70	NC_013940	ATTTT	2	10	79770	79779	20 %	80 %	0 %	0 %	291280614
71	NC_013940	ATTAT	2	10	80481	80490	40 %	60 %	0 %	0 %	291280614
72	NC_013940	GTTGT	2	10	80596	80605	0 %	60 %	40 %	0 %	291280614
73	NC_013940	TATAA	2	10	81334	81343	60 %	40 %	0 %	0 %	291280615
74	NC_013940	TTTTA	2	10	82676	82685	20 %	80 %	0 %	0 %	291280617
75	NC_013940	TATAA	2	10	84360	84369	60 %	40 %	0 %	0 %	291280617
76	NC_013940	TGTAA	2	10	84516	84525	40 %	40 %	20 %	0 %	291280617
77	NC_013940	ATGCA	2	10	87034	87043	40 %	20 %	20 %	20 %	291280619
78	NC_013940	AAACA	2	10	88882	88891	80 %	0 %	0 %	20 %	291280622
79	NC_013940	TATAT	2	10	89068	89077	40 %	60 %	0 %	0 %	291280623
80	NC_013940	AATAT	2	10	90078	90087	60 %	40 %	0 %	0 %	291280624
81	NC_013940	AATAA	2	10	91130	91139	80 %	20 %	0 %	0 %	291280625
82	NC_013940	TTAAT	2	10	94795	94804	40 %	60 %	0 %	0 %	291280628
83	NC_013940	ATATT	2	10	94970	94979	40 %	60 %	0 %	0 %	291280628
84	NC_013940	AAGTT	2	10	107830	107839	40 %	40 %	20 %	0 %	291280633
85	NC_013940	AATTA	2	10	108337	108346	60 %	40 %	0 %	0 %	291280634
86	NC_013940	TTTAA	2	10	109118	109127	40 %	60 %	0 %	0 %	291280634
87	NC_013940	TATAA	2	10	109270	109279	60 %	40 %	0 %	0 %	291280634
88	NC_013940	ATTAT	2	10	109803	109812	40 %	60 %	0 %	0 %	291280635
89	NC_013940	AATAA	2	10	110162	110171	80 %	20 %	0 %	0 %	291280635
90	NC_013940	CATTT	2	10	111884	111893	20 %	60 %	0 %	20 %	291280637
91	NC_013940	AAATA	2	10	113751	113760	80 %	20 %	0 %	0 %	291280639
92	NC_013940	TAAAA	2	10	113919	113928	80 %	20 %	0 %	0 %	291280639
93	NC_013940	TTTAA	2	10	114524	114533	40 %	60 %	0 %	0 %	291280640
94	NC_013940	TAGAT	2	10	117901	117910	40 %	40 %	20 %	0 %	291280645
95	NC_013940	AAAAT	2	10	117951	117960	80 %	20 %	0 %	0 %	291280645
96	NC_013940	ATAAA	2	10	118373	118382	80 %	20 %	0 %	0 %	291280645
97	NC_013940	TATTT	2	10	121595	121604	20 %	80 %	0 %	0 %	291280649
98	NC_013940	TACAT	2	10	123856	123865	40 %	40 %	0 %	20 %	291280650
99	NC_013940	GAAAT	2	10	124124	124133	60 %	20 %	20 %	0 %	291280651
100	NC_013940	AAGTA	2	10	124900	124909	60 %	20 %	20 %	0 %	291280651
101	NC_013940	AATAA	2	10	130858	130867	80 %	20 %	0 %	0 %	291280655
102	NC_013940	ATTTT	2	10	131136	131145	20 %	80 %	0 %	0 %	291280655
103	NC_013940	GTTTG	2	10	132157	132166	0 %	60 %	40 %	0 %	291280656
104	NC_013940	AATTT	2	10	132658	132667	40 %	60 %	0 %	0 %	291280657
105	NC_013940	TTTAA	2	10	135002	135011	40 %	60 %	0 %	0 %	291280658
106	NC_013940	AAATT	2	10	135329	135338	60 %	40 %	0 %	0 %	291280659
107	NC_013940	ATTAA	2	10	136594	136603	60 %	40 %	0 %	0 %	291280661
108	NC_013940	TTTTA	2	10	142836	142845	20 %	80 %	0 %	0 %	291280666
109	NC_013940	ATATA	2	10	143897	143906	60 %	40 %	0 %	0 %	291280667
110	NC_013940	TAAAA	2	10	144879	144888	80 %	20 %	0 %	0 %	291280669
111	NC_013940	GATAT	2	10	147806	147815	40 %	40 %	20 %	0 %	291280673
112	NC_013940	AGGAA	2	10	148668	148677	60 %	0 %	40 %	0 %	291280673
113	NC_013940	TGAAT	2	10	150246	150255	40 %	40 %	20 %	0 %	291280674
114	NC_013940	CATTA	2	10	150716	150725	40 %	40 %	0 %	20 %	291280675
115	NC_013940	TTTAA	2	10	151332	151341	40 %	60 %	0 %	0 %	291280675
116	NC_013940	TTAAA	2	10	151354	151363	60 %	40 %	0 %	0 %	291280675
117	NC_013940	ATTAT	2	10	152780	152789	40 %	60 %	0 %	0 %	291280677
118	NC_013940	TGTAT	2	10	152904	152913	20 %	60 %	20 %	0 %	291280677
119	NC_013940	AAGTA	2	10	154290	154299	60 %	20 %	20 %	0 %	291280679
120	NC_013940	TTTTC	3	15	154448	154462	0 %	80 %	0 %	20 %	291280679
121	NC_013940	TATAT	2	10	154528	154537	40 %	60 %	0 %	0 %	291280680
122	NC_013940	TGTAT	2	10	155234	155243	20 %	60 %	20 %	0 %	291280680
123	NC_013940	CTACC	2	10	155445	155454	20 %	20 %	0 %	60 %	291280680
124	NC_013940	GTATT	2	10	155669	155678	20 %	60 %	20 %	0 %	291280680
125	NC_013940	AATCT	2	10	157130	157139	40 %	40 %	0 %	20 %	291280683
126	NC_013940	TTAAT	2	10	157148	157157	40 %	60 %	0 %	0 %	291280683
127	NC_013940	GTTGT	2	10	157184	157193	0 %	60 %	40 %	0 %	291280683
128	NC_013940	ATCTA	2	10	159633	159642	40 %	40 %	0 %	20 %	291280685
129	NC_013940	TAAGG	2	10	160180	160189	40 %	20 %	40 %	0 %	291280686
130	NC_013940	ATTTT	2	10	161158	161167	20 %	80 %	0 %	0 %	291280686
131	NC_013940	TTTTG	2	10	165826	165835	0 %	80 %	20 %	0 %	291280689
132	NC_013940	CTTTA	2	10	166844	166853	20 %	60 %	0 %	20 %	291280690
133	NC_013940	CTTAT	2	10	167972	167981	20 %	60 %	0 %	20 %	291280691
134	NC_013940	TTATT	2	10	171453	171462	20 %	80 %	0 %	0 %	291280695
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136	NC_013940	TAACT	2	10	171583	171592	40 %	40 %	0 %	20 %	291280695
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.