MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	CTTTA	2	10	3482	3491	20 %	60 %	0 %	20 %	289431958
2	NC_013890	GCTGG	2	10	3493	3502	0 %	20 %	60 %	20 %	289431958
3	NC_013890	GTTTG	2	10	7248	7257	0 %	60 %	40 %	0 %	289431960
4	NC_013890	GCATG	2	10	8589	8598	20 %	20 %	40 %	20 %	289431961
5	NC_013890	GCTCA	2	10	9412	9421	20 %	20 %	20 %	40 %	289431961
6	NC_013890	ACTGA	2	10	12500	12509	40 %	20 %	20 %	20 %	289431965
7	NC_013890	CTTAG	2	10	12836	12845	20 %	40 %	20 %	20 %	289431965
8	NC_013890	GGGGT	2	10	13770	13779	0 %	20 %	80 %	0 %	289431966
9	NC_013890	TCGGG	2	10	14626	14635	0 %	20 %	60 %	20 %	289431967
10	NC_013890	GTGAA	2	10	15198	15207	40 %	20 %	40 %	0 %	289431968
11	NC_013890	CTGAA	2	10	15471	15480	40 %	20 %	20 %	20 %	289431968
12	NC_013890	ATGAA	2	10	16736	16745	60 %	20 %	20 %	0 %	289431970
13	NC_013890	CGCTC	2	10	17524	17533	0 %	20 %	20 %	60 %	289431970
14	NC_013890	TATTC	2	10	17825	17834	20 %	60 %	0 %	20 %	289431971
15	NC_013890	TAATT	2	10	19571	19580	40 %	60 %	0 %	0 %	289431974
16	NC_013890	TTTCT	2	10	21314	21323	0 %	80 %	0 %	20 %	289431976
17	NC_013890	CTGTG	2	10	21715	21724	0 %	40 %	40 %	20 %	289431977
18	NC_013890	CGGCA	2	10	22187	22196	20 %	0 %	40 %	40 %	289431977
19	NC_013890	GGCAG	2	10	22405	22414	20 %	0 %	60 %	20 %	289431977
20	NC_013890	CAGGT	2	10	22416	22425	20 %	20 %	40 %	20 %	289431977
21	NC_013890	CATAT	2	10	23786	23795	40 %	40 %	0 %	20 %	289431978
22	NC_013890	GGGCA	2	10	23920	23929	20 %	0 %	60 %	20 %	289431978
23	NC_013890	CGGGG	2	10	24528	24537	0 %	0 %	80 %	20 %	289431979
24	NC_013890	TTGCT	2	10	29545	29554	0 %	60 %	20 %	20 %	289431985
25	NC_013890	ACCGC	2	10	31565	31574	20 %	0 %	20 %	60 %	289431988
26	NC_013890	ATTTC	2	10	33879	33888	20 %	60 %	0 %	20 %	289431990
27	NC_013890	ATGGT	2	10	36346	36355	20 %	40 %	40 %	0 %	289431994
28	NC_013890	GGCGG	2	10	42439	42448	0 %	0 %	80 %	20 %	289432002
29	NC_013890	CTGAA	2	10	43755	43764	40 %	20 %	20 %	20 %	289432002
30	NC_013890	CTGAT	2	10	44016	44025	20 %	40 %	20 %	20 %	289432002
31	NC_013890	CAGCT	2	10	46645	46654	20 %	20 %	20 %	40 %	289432005
32	NC_013890	AGGTG	2	10	51597	51606	20 %	20 %	60 %	0 %	289432006
33	NC_013890	GTTCG	2	10	52365	52374	0 %	40 %	40 %	20 %	289432006
34	NC_013890	GGAAT	2	10	53621	53630	40 %	20 %	40 %	0 %	289432007
35	NC_013890	TGAAA	2	10	54326	54335	60 %	20 %	20 %	0 %	289432007
36	NC_013890	GCCGC	2	10	54491	54500	0 %	0 %	40 %	60 %	289432007
37	NC_013890	TACCT	2	10	56238	56247	20 %	40 %	0 %	40 %	289432010
38	NC_013890	CCATC	2	10	58738	58747	20 %	20 %	0 %	60 %	289432011
39	NC_013890	ATGTT	2	10	60160	60169	20 %	60 %	20 %	0 %	289432013
40	NC_013890	CTTCC	2	10	60852	60861	0 %	40 %	0 %	60 %	289432014
41	NC_013890	AGCTG	2	10	63785	63794	20 %	20 %	40 %	20 %	289432016
42	NC_013890	AGATG	2	10	64820	64829	40 %	20 %	40 %	0 %	289432017
43	NC_013890	CGACG	2	10	67337	67346	20 %	0 %	40 %	40 %	289432017
44	NC_013890	GTTCT	2	10	67780	67789	0 %	60 %	20 %	20 %	289432018
45	NC_013890	TACGT	2	10	67949	67958	20 %	40 %	20 %	20 %	289432018
46	NC_013890	AAGAT	2	10	68532	68541	60 %	20 %	20 %	0 %	289432018
47	NC_013890	GTTTT	2	10	70357	70366	0 %	80 %	20 %	0 %	289432018
48	NC_013890	TTTTA	2	10	70667	70676	20 %	80 %	0 %	0 %	289432018
49	NC_013890	AATTG	2	10	73892	73901	40 %	40 %	20 %	0 %	289432020
50	NC_013890	TCAAC	2	10	75237	75246	40 %	20 %	0 %	40 %	289432021
51	NC_013890	CCTTC	2	10	78438	78447	0 %	40 %	0 %	60 %	289432026
52	NC_013890	GCTTC	2	10	79617	79626	0 %	40 %	20 %	40 %	289432029
53	NC_013890	CAAGC	2	10	81137	81146	40 %	0 %	20 %	40 %	289432030
54	NC_013890	ATAGG	2	10	81549	81558	40 %	20 %	40 %	0 %	289432030
55	NC_013890	TTTCG	2	10	84071	84080	0 %	60 %	20 %	20 %	289432033
56	NC_013890	CCTGT	2	10	84748	84757	0 %	40 %	20 %	40 %	289432033
57	NC_013890	TTAAA	2	10	85348	85357	60 %	40 %	0 %	0 %	289432035
58	NC_013890	ACCGC	2	10	87007	87016	20 %	0 %	20 %	60 %	289432038
59	NC_013890	CTTGC	2	10	89878	89887	0 %	40 %	20 %	40 %	289432043
60	NC_013890	ATCTC	2	10	90569	90578	20 %	40 %	0 %	40 %	289432043
61	NC_013890	TGCTG	2	10	94683	94692	0 %	40 %	40 %	20 %	289432052
62	NC_013890	CTTTC	2	10	97120	97129	0 %	60 %	0 %	40 %	289432058
63	NC_013890	TATGG	2	10	99828	99837	20 %	40 %	40 %	0 %	289432062
64	NC_013890	TTCTC	2	10	102161	102170	0 %	60 %	0 %	40 %	289432064
65	NC_013890	GGAAG	2	10	103523	103532	40 %	0 %	60 %	0 %	289432066
66	NC_013890	CTCTT	2	10	107307	107316	0 %	60 %	0 %	40 %	289432068
67	NC_013890	GGGCA	2	10	107612	107621	20 %	0 %	60 %	20 %	289432068
68	NC_013890	TGTAT	2	10	110183	110192	20 %	60 %	20 %	0 %	289432072
69	NC_013890	GGTTT	2	10	111849	111858	0 %	60 %	40 %	0 %	289432075
70	NC_013890	GATTT	2	10	117258	117267	20 %	60 %	20 %	0 %	289432080
71	NC_013890	TAGGG	2	10	120386	120395	20 %	20 %	60 %	0 %	289432082
72	NC_013890	GAACC	2	10	122757	122766	40 %	0 %	20 %	40 %	289432083
73	NC_013890	ATAAA	2	10	125044	125053	80 %	20 %	0 %	0 %	289432085
74	NC_013890	GCTGG	2	10	127195	127204	0 %	20 %	60 %	20 %	289432087
75	NC_013890	GCTGT	2	10	127358	127367	0 %	40 %	40 %	20 %	289432087
76	NC_013890	TTCGG	2	10	129045	129054	0 %	40 %	40 %	20 %	289432089
77	NC_013890	CGCGG	2	10	133373	133382	0 %	0 %	60 %	40 %	289432092
78	NC_013890	TCATC	2	10	136235	136244	20 %	40 %	0 %	40 %	289432094
79	NC_013890	CCGGC	2	10	139685	139694	0 %	0 %	40 %	60 %	289432098
80	NC_013890	GTAAA	2	10	141425	141434	60 %	20 %	20 %	0 %	289432099
81	NC_013890	GAAGC	2	10	141679	141688	40 %	0 %	40 %	20 %	289432099
82	NC_013890	GGGCT	2	10	143023	143032	0 %	20 %	60 %	20 %	289432100
83	NC_013890	TCATT	2	10	143344	143353	20 %	60 %	0 %	20 %	289432100
84	NC_013890	ATGAA	2	10	143376	143385	60 %	20 %	20 %	0 %	289432100
85	NC_013890	TTCTT	2	10	144033	144042	0 %	80 %	0 %	20 %	289432102
86	NC_013890	GAAGG	2	10	145419	145428	40 %	0 %	60 %	0 %	289432102
87	NC_013890	GGCAG	2	10	145511	145520	20 %	0 %	60 %	20 %	289432102
88	NC_013890	GCAGG	2	10	146570	146579	20 %	0 %	60 %	20 %	289432103
89	NC_013890	AGGGA	2	10	147194	147203	40 %	0 %	60 %	0 %	289432103
90	NC_013890	GGGTG	2	10	147664	147673	0 %	20 %	80 %	0 %	289432104
91	NC_013890	GGGCA	2	10	153644	153653	20 %	0 %	60 %	20 %	289432107
92	NC_013890	GGGGC	2	10	155715	155724	0 %	0 %	80 %	20 %	289432111
93	NC_013890	ACGGA	2	10	157585	157594	40 %	0 %	40 %	20 %	289432114
94	NC_013890	TAAAC	2	10	161109	161118	60 %	20 %	0 %	20 %	289432117
95	NC_013890	ATTTC	2	10	162849	162858	20 %	60 %	0 %	20 %	289432119
96	NC_013890	TAAAA	2	10	162904	162913	80 %	20 %	0 %	0 %	289432120
97	NC_013890	TCTGG	2	10	163325	163334	0 %	40 %	40 %	20 %	289432120
98	NC_013890	ATACT	2	10	163480	163489	40 %	40 %	0 %	20 %	289432120
99	NC_013890	GGACT	2	10	163534	163543	20 %	20 %	40 %	20 %	289432120
100	NC_013890	GCTTG	2	10	167619	167628	0 %	40 %	40 %	20 %	289432125
101	NC_013890	CTGAC	2	10	167714	167723	20 %	20 %	20 %	40 %	289432125
102	NC_013890	TAACA	2	10	171480	171489	60 %	20 %	0 %	20 %	289432130
103	NC_013890	GGTGC	2	10	172857	172866	0 %	20 %	60 %	20 %	289432131
104	NC_013890	TCATC	2	10	174557	174566	20 %	40 %	0 %	40 %	289432133
105	NC_013890	GACAA	2	10	176622	176631	60 %	0 %	20 %	20 %	289432134
106	NC_013890	CCATA	2	10	179713	179722	40 %	20 %	0 %	40 %	289432138
107	NC_013890	GAAAG	2	10	182421	182430	60 %	0 %	40 %	0 %	289432142
108	NC_013890	CACAG	2	10	184856	184865	40 %	0 %	20 %	40 %	289432148
109	NC_013890	GAGAT	2	10	188972	188981	40 %	20 %	40 %	0 %	289432157
110	NC_013890	TATTT	2	10	189213	189222	20 %	80 %	0 %	0 %	289432157
111	NC_013890	GCAAG	2	10	189663	189672	40 %	0 %	40 %	20 %	289432157
112	NC_013890	GCGGT	2	10	192534	192543	0 %	20 %	60 %	20 %	289432162
113	NC_013890	TTTAA	2	10	194193	194202	40 %	60 %	0 %	0 %	289432165
114	NC_013890	GACAG	2	10	194792	194801	40 %	0 %	40 %	20 %	289432167
115	NC_013890	CGAAA	2	10	195470	195479	60 %	0 %	20 %	20 %	289432167
116	NC_013890	CCTAT	2	10	197991	198000	20 %	40 %	0 %	40 %	289432170
117	NC_013890	GCTTG	2	10	198403	198412	0 %	40 %	40 %	20 %	289432170
118	NC_013890	GGAAG	2	10	201101	201110	40 %	0 %	60 %	0 %	289432174
119	NC_013890	GAATG	2	10	202457	202466	40 %	20 %	40 %	0 %	289432177
120	NC_013890	ACCCT	2	10	205283	205292	20 %	20 %	0 %	60 %	289432178
121	NC_013890	GGCAA	3	15	207208	207222	40 %	0 %	40 %	20 %	289432179
122	NC_013890	TGATC	2	10	214870	214879	20 %	40 %	20 %	20 %	289432184
123	NC_013890	TCAAA	2	10	215024	215033	60 %	20 %	0 %	20 %	289432184
124	NC_013890	AGAAA	2	10	224786	224795	80 %	0 %	20 %	0 %	289432193
125	NC_013890	GTTCT	2	10	225509	225518	0 %	60 %	20 %	20 %	289432194
126	NC_013890	GCAGG	2	10	226895	226904	20 %	0 %	60 %	20 %	289432195
127	NC_013890	CTGGC	2	10	230911	230920	0 %	20 %	40 %	40 %	289432197
128	NC_013890	AACCG	2	10	233446	233455	40 %	0 %	20 %	40 %	289432201
129	NC_013890	GGCAG	2	10	234329	234338	20 %	0 %	60 %	20 %	289432202
130	NC_013890	CATTC	2	10	235312	235321	20 %	40 %	0 %	40 %	289432203
131	NC_013890	CATTA	2	10	236951	236960	40 %	40 %	0 %	20 %	289432203
132	NC_013890	TTGAT	2	10	238032	238041	20 %	60 %	20 %	0 %	289432204
133	NC_013890	GGGGC	2	10	238054	238063	0 %	0 %	80 %	20 %	289432204
134	NC_013890	GCTGA	2	10	239529	239538	20 %	20 %	40 %	20 %	289432206
135	NC_013890	CTTTT	2	10	242623	242632	0 %	80 %	0 %	20 %	289432210
136	NC_013890	CACCC	2	10	243220	243229	20 %	0 %	0 %	80 %	289432212
137	NC_013890	CGGAG	2	10	243281	243290	20 %	0 %	60 %	20 %	289432212
138	NC_013890	ATCAA	2	10	244668	244677	60 %	20 %	0 %	20 %	289432213
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142	NC_013890	GTCAG	2	10	253255	253264	20 %	20 %	40 %	20 %	289432220
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148	NC_013890	TGCCT	2	10	262790	262799	0 %	40 %	20 %	40 %	289432231
149	NC_013890	GATAA	2	10	265042	265051	60 %	20 %	20 %	0 %	289432233
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153	NC_013890	GGGGT	2	10	272446	272455	0 %	20 %	80 %	0 %	289432239
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159	NC_013890	GATTT	2	10	286844	286853	20 %	60 %	20 %	0 %	289432253
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162	NC_013890	CTCTG	2	10	289764	289773	0 %	40 %	20 %	40 %	289432257
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167	NC_013890	ACTAT	2	10	295628	295637	40 %	40 %	0 %	20 %	289432262
168	NC_013890	GCCAG	2	10	297153	297162	20 %	0 %	40 %	40 %	289432262
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173	NC_013890	TTACC	2	10	300311	300320	20 %	40 %	0 %	40 %	289432265
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176	NC_013890	TATTT	2	10	303476	303485	20 %	80 %	0 %	0 %	289432269
177	NC_013890	CTGGT	2	10	304711	304720	0 %	40 %	40 %	20 %	289432271
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254	NC_013890	ATAAA	2	10	430272	430281	80 %	20 %	0 %	0 %	289432419
255	NC_013890	GGCCG	2	10	431563	431572	0 %	0 %	60 %	40 %	289432420
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258	NC_013890	TGGGC	2	10	435445	435454	0 %	20 %	60 %	20 %	289432424
259	NC_013890	CTGGG	2	10	435982	435991	0 %	20 %	60 %	20 %	289432425
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262	NC_013890	GGTCA	2	10	439371	439380	20 %	20 %	40 %	20 %	289432429
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