MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 22210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013890	ATT	2	6	30592	30597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
502	NC_013890	CGG	2	6	30636	30641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431986
503	NC_013890	GCGT	2	8	30665	30672	0 %	25 %	50 %	25 %	289431986
504	NC_013890	CTG	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431986
505	NC_013890	TTC	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431986
506	NC_013890	TAT	2	6	30789	30794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431986
507	NC_013890	GCT	2	6	30864	30869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431986
508	NC_013890	T	6	6	30897	30902	0 %	100 %	0 %	0 %	289431986
509	NC_013890	GTTT	2	8	30911	30918	0 %	75 %	25 %	0 %	289431986
510	NC_013890	AAT	2	6	30975	30980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431987
511	NC_013890	CGG	2	6	31129	31134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431987
512	NC_013890	AAAT	2	8	31166	31173	75 %	25 %	0 %	0 %	289431987
513	NC_013890	T	7	7	31190	31196	0 %	100 %	0 %	0 %	289431987
514	NC_013890	CAG	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431987
515	NC_013890	TCGGTT	2	12	31381	31392	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289431987
516	NC_013890	GTG	2	6	31408	31413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431987
517	NC_013890	TA	3	6	31422	31427	50 %	50 %	0 %	0 %	289431987
518	NC_013890	CAG	2	6	31506	31511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431987
519	NC_013890	TTA	2	6	31525	31530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431987
520	NC_013890	TCA	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431987
521	NC_013890	ACCGC	2	10	31565	31574	20 %	0 %	20 %	60 %	289431988
522	NC_013890	GCC	2	6	31619	31624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431988
523	NC_013890	TGT	2	6	31818	31823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431988
524	NC_013890	GTAT	2	8	32026	32033	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
525	NC_013890	TTG	2	6	32038	32043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431989
526	NC_013890	TTG	2	6	32055	32060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431989
527	NC_013890	GCG	2	6	32106	32111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431989
528	NC_013890	GCG	2	6	32341	32346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431989
529	NC_013890	TAA	2	6	32407	32412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431989
530	NC_013890	TCT	2	6	32443	32448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431989
531	NC_013890	TGA	2	6	32495	32500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431989
532	NC_013890	GTTA	2	8	32522	32529	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
533	NC_013890	TTC	2	6	32552	32557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431989
534	NC_013890	GTAATA	2	12	32577	32588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289431989
535	NC_013890	ATG	2	6	32601	32606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431989
536	NC_013890	ACC	2	6	32622	32627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431989
537	NC_013890	TG	3	6	32736	32741	0 %	50 %	50 %	0 %	289431989
538	NC_013890	GA	3	6	32832	32837	50 %	0 %	50 %	0 %	289431989
539	NC_013890	ATTT	2	8	33054	33061	25 %	75 %	0 %	0 %	289431990
540	NC_013890	A	6	6	33187	33192	100 %	0 %	0 %	0 %	289431990
541	NC_013890	A	6	6	33298	33303	100 %	0 %	0 %	0 %	289431990
542	NC_013890	GCG	2	6	33304	33309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431990
543	NC_013890	ATG	2	6	33368	33373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431990
544	NC_013890	CGG	2	6	33402	33407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431990
545	NC_013890	GCCT	2	8	33437	33444	0 %	25 %	25 %	50 %	289431990
546	NC_013890	TGA	2	6	33534	33539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431990
547	NC_013890	CAAG	2	8	33546	33553	50 %	0 %	25 %	25 %	289431990
548	NC_013890	TGA	2	6	33668	33673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431990
549	NC_013890	GCC	2	6	33760	33765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431990
550	NC_013890	GAA	2	6	33790	33795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431990
551	NC_013890	TAT	2	6	33801	33806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431990
552	NC_013890	CCG	2	6	33810	33815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431990
553	NC_013890	GAA	2	6	33844	33849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431990
554	NC_013890	GAG	2	6	33865	33870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431990
555	NC_013890	ATTTC	2	10	33879	33888	20 %	60 %	0 %	20 %	289431990
556	NC_013890	GCC	3	9	33983	33991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431990
557	NC_013890	TAT	2	6	34041	34046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431990
558	NC_013890	GAG	2	6	34254	34259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431990
559	NC_013890	CGG	2	6	34270	34275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431991
560	NC_013890	TCA	2	6	34277	34282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431991
561	NC_013890	TAT	2	6	34287	34292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431991
562	NC_013890	CTGA	2	8	34386	34393	25 %	25 %	25 %	25 %	289431991
563	NC_013890	ACTT	2	8	35192	35199	25 %	50 %	0 %	25 %	289431992
564	NC_013890	TGG	2	6	35230	35235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431992
565	NC_013890	TTC	2	6	35264	35269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431992
566	NC_013890	CGC	2	6	35284	35289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431992
567	NC_013890	CCG	2	6	35328	35333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431992
568	NC_013890	TTA	2	6	35353	35358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431992
569	NC_013890	GGCA	2	8	35375	35382	25 %	0 %	50 %	25 %	289431992
570	NC_013890	ACC	2	6	35427	35432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431992
571	NC_013890	GGC	2	6	35590	35595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431992
572	NC_013890	CTGAAC	2	12	35677	35688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289431992
573	NC_013890	CCG	2	6	35721	35726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431992
574	NC_013890	AGT	2	6	35779	35784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431992
575	NC_013890	GAA	2	6	35865	35870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431993
576	NC_013890	CAG	2	6	35874	35879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431993
577	NC_013890	GCG	2	6	35898	35903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431993
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579	NC_013890	GGA	2	6	36197	36202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431994
580	NC_013890	CTG	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431994
581	NC_013890	TGG	2	6	36235	36240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431994
582	NC_013890	GCT	2	6	36296	36301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431994
583	NC_013890	CTGA	2	8	36324	36331	25 %	25 %	25 %	25 %	289431994
584	NC_013890	CTT	2	6	36340	36345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431994
585	NC_013890	ATGGT	2	10	36346	36355	20 %	40 %	40 %	0 %	289431994
586	NC_013890	CGG	2	6	36435	36440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431994
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590	NC_013890	GAA	2	6	36595	36600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431995
591	NC_013890	AG	3	6	36666	36671	50 %	0 %	50 %	0 %	289431995
592	NC_013890	AAC	2	6	36681	36686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431995
593	NC_013890	TAA	2	6	36691	36696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431995
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595	NC_013890	TTGC	2	8	36887	36894	0 %	50 %	25 %	25 %	289431996
596	NC_013890	GGC	2	6	36967	36972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431996
597	NC_013890	GCG	2	6	36999	37004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431996
598	NC_013890	TA	3	6	37309	37314	50 %	50 %	0 %	0 %	289431997
599	NC_013890	CGG	2	6	37368	37373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431997
600	NC_013890	TA	3	6	37408	37413	50 %	50 %	0 %	0 %	289431997
601	NC_013890	GCT	2	6	37445	37450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431997
602	NC_013890	GCC	2	6	37675	37680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431997
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607	NC_013890	CT	3	6	37896	37901	0 %	50 %	0 %	50 %	289431997
608	NC_013890	T	6	6	37947	37952	0 %	100 %	0 %	0 %	289431997
609	NC_013890	AAT	2	6	37954	37959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431997
610	NC_013890	A	6	6	37971	37976	100 %	0 %	0 %	0 %	289431997
611	NC_013890	TGG	2	6	37992	37997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431997
612	NC_013890	GCC	2	6	38020	38025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431997
613	NC_013890	GGCA	2	8	38026	38033	25 %	0 %	50 %	25 %	289431997
614	NC_013890	GCC	2	6	38134	38139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431997
615	NC_013890	GA	3	6	38143	38148	50 %	0 %	50 %	0 %	289431997
616	NC_013890	ACT	2	6	38263	38268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431997
617	NC_013890	GGC	2	6	38287	38292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431997
618	NC_013890	GCG	2	6	38306	38311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431997
619	NC_013890	TGG	2	6	38319	38324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431997
620	NC_013890	TAT	2	6	38347	38352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431997
621	NC_013890	AT	3	6	38369	38374	50 %	50 %	0 %	0 %	289431997
622	NC_013890	CAG	2	6	38491	38496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431998
623	NC_013890	CA	3	6	38499	38504	50 %	0 %	0 %	50 %	289431998
624	NC_013890	TGGCAA	2	12	38580	38591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289431998
625	NC_013890	CTT	2	6	38622	38627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431998
626	NC_013890	TGA	2	6	38785	38790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431999
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