MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 598

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013224	GAA	2	6	40473	40478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406659
502	NC_013224	AAT	2	6	40507	40512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406659
503	NC_013224	AT	3	6	40520	40525	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
504	NC_013224	A	6	6	40544	40549	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
505	NC_013224	TA	3	6	40634	40639	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
506	NC_013224	TAA	2	6	40643	40648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406659
507	NC_013224	A	7	7	40647	40653	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
508	NC_013224	GGT	2	6	40660	40665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406659
509	NC_013224	AAT	2	6	40684	40689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406659
510	NC_013224	ATA	2	6	40741	40746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406659
511	NC_013224	GTAG	2	8	40750	40757	25 %	25 %	50 %	0 %	258406659
512	NC_013224	T	6	6	40782	40787	0 %	100 %	0 %	0 %	258406659
513	NC_013224	TGC	2	6	40811	40816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406659
514	NC_013224	AGA	2	6	40824	40829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406659
515	NC_013224	GCAG	2	8	40837	40844	25 %	0 %	50 %	25 %	258406659
516	NC_013224	A	8	8	40927	40934	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
517	NC_013224	AC	3	6	41020	41025	50 %	0 %	0 %	50 %	258406659
518	NC_013224	GAAA	2	8	41028	41035	75 %	0 %	25 %	0 %	258406659
519	NC_013224	ATG	2	6	41104	41109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406659
520	NC_013224	CCT	2	6	41110	41115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406659
521	NC_013224	ACAA	2	8	41150	41157	75 %	0 %	0 %	25 %	258406659
522	NC_013224	A	6	6	41221	41226	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
523	NC_013224	AAACA	2	10	41241	41250	80 %	0 %	0 %	20 %	258406659
524	NC_013224	GAA	2	6	41260	41265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406659
525	NC_013224	AAAAT	2	10	41279	41288	80 %	20 %	0 %	0 %	258406659
526	NC_013224	AGA	2	6	41352	41357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406659
527	NC_013224	TGA	2	6	41475	41480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406659
528	NC_013224	AG	3	6	41503	41508	50 %	0 %	50 %	0 %	258406659
529	NC_013224	AGC	2	6	41526	41531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406659
530	NC_013224	AAAG	2	8	41569	41576	75 %	0 %	25 %	0 %	258406659
531	NC_013224	GAC	2	6	41626	41631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406659
532	NC_013224	A	6	6	41667	41672	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
533	NC_013224	A	6	6	41765	41770	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
534	NC_013224	ATCA	2	8	41864	41871	50 %	25 %	0 %	25 %	258406660
535	NC_013224	TAT	2	6	41878	41883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406660
536	NC_013224	ATA	2	6	41929	41934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406660
537	NC_013224	AAT	2	6	41949	41954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406660
538	NC_013224	TTA	2	6	42007	42012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406660
539	NC_013224	ATT	2	6	42038	42043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406660
540	NC_013224	TAAAA	2	10	42065	42074	80 %	20 %	0 %	0 %	258406660
541	NC_013224	TAAGA	2	10	42089	42098	60 %	20 %	20 %	0 %	258406660
542	NC_013224	ACA	2	6	42103	42108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406660
543	NC_013224	TAA	2	6	42116	42121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406660
544	NC_013224	A	7	7	42245	42251	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
545	NC_013224	A	6	6	42279	42284	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
546	NC_013224	T	7	7	42474	42480	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
547	NC_013224	TAT	2	6	42541	42546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406661
548	NC_013224	A	7	7	42589	42595	100 %	0 %	0 %	0 %	258406661
549	NC_013224	TAAA	2	8	42633	42640	75 %	25 %	0 %	0 %	258406661
550	NC_013224	T	9	9	42705	42713	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
551	NC_013224	AAC	2	6	42719	42724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406661
552	NC_013224	GTT	2	6	42852	42857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406661
553	NC_013224	ATT	2	6	42899	42904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406661
554	NC_013224	CAT	3	9	42911	42919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406661
555	NC_013224	ATC	2	6	42956	42961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406661
556	NC_013224	CAA	2	6	42974	42979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406661
557	NC_013224	TAA	2	6	43009	43014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406661
558	NC_013224	A	8	8	43144	43151	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
559	NC_013224	CA	3	6	43202	43207	50 %	0 %	0 %	50 %	258406662
560	NC_013224	GTT	2	6	43247	43252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406662
561	NC_013224	ACTA	2	8	43373	43380	50 %	25 %	0 %	25 %	258406662
562	NC_013224	CAA	2	6	43419	43424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406662
563	NC_013224	A	6	6	43503	43508	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
564	NC_013224	T	7	7	43579	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
565	NC_013224	AGA	2	6	43681	43686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406662
566	NC_013224	A	7	7	43705	43711	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
567	NC_013224	T	7	7	43720	43726	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
568	NC_013224	TCT	2	6	43787	43792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406662
569	NC_013224	AGC	2	6	43858	43863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406662
570	NC_013224	A	6	6	43878	43883	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
571	NC_013224	AT	3	6	43918	43923	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
572	NC_013224	A	6	6	43941	43946	100 %	0 %	0 %	0 %	258406663
573	NC_013224	TTG	2	6	43962	43967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406663
574	NC_013224	T	7	7	43990	43996	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
575	NC_013224	T	7	7	44028	44034	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
576	NC_013224	TTA	2	6	44104	44109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406663
577	NC_013224	TTGG	2	8	44112	44119	0 %	50 %	50 %	0 %	258406663
578	NC_013224	TTAT	2	8	44139	44146	25 %	75 %	0 %	0 %	258406663
579	NC_013224	T	7	7	44174	44180	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
580	NC_013224	AT	3	6	44186	44191	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
581	NC_013224	GTTT	2	8	44202	44209	0 %	75 %	25 %	0 %	258406663
582	NC_013224	T	6	6	44268	44273	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
583	NC_013224	T	7	7	44283	44289	0 %	100 %	0 %	0 %	258406664
584	NC_013224	GGT	2	6	44321	44326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406664
585	NC_013224	CGGG	2	8	44340	44347	0 %	0 %	75 %	25 %	258406664
586	NC_013224	GTT	2	6	44380	44385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406664
587	NC_013224	GAGG	2	8	44400	44407	25 %	0 %	75 %	0 %	258406664
588	NC_013224	GTGTT	2	10	44452	44461	0 %	60 %	40 %	0 %	258406664
589	NC_013224	AGTT	2	8	44508	44515	25 %	50 %	25 %	0 %	258406664
590	NC_013224	GCT	2	6	44546	44551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406664
591	NC_013224	TGC	2	6	44632	44637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406664
592	NC_013224	ACC	2	6	44638	44643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406664
593	NC_013224	CCA	2	6	44696	44701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406664
594	NC_013224	CCTGG	2	10	44903	44912	0 %	20 %	40 %	40 %	258406665
595	NC_013224	GCT	2	6	44995	45000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406665
596	NC_013224	CCT	2	6	45006	45011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406665
597	NC_013224	GGA	2	6	45029	45034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406665
598	NC_013224	TG	3	6	45049	45054	0 %	50 %	50 %	0 %	258406665

< Previous 12Next >