MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 4844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	CCAA	2	8	212	219	50 %	0 %	0 %	50 %	258404139
2	NC_013223	GTCC	2	8	2905	2912	0 %	25 %	25 %	50 %	258404142
3	NC_013223	TGGC	2	8	2969	2976	0 %	25 %	50 %	25 %	258404142
4	NC_013223	GGGA	2	8	5425	5432	25 %	0 %	75 %	0 %	258404144
5	NC_013223	GGGA	2	8	5776	5783	25 %	0 %	75 %	0 %	258404144
6	NC_013223	AACC	2	8	6227	6234	50 %	0 %	0 %	50 %	258404144
7	NC_013223	GGCT	2	8	6260	6267	0 %	25 %	50 %	25 %	258404144
8	NC_013223	GCCA	2	8	6270	6277	25 %	0 %	25 %	50 %	258404144
9	NC_013223	TGGC	2	8	6492	6499	0 %	25 %	50 %	25 %	258404144
10	NC_013223	AGGA	2	8	6601	6608	50 %	0 %	50 %	0 %	258404144
11	NC_013223	GGGC	2	8	7287	7294	0 %	0 %	75 %	25 %	258404145
12	NC_013223	AAGG	2	8	7752	7759	50 %	0 %	50 %	0 %	258404145
13	NC_013223	TCAG	2	8	8322	8329	25 %	25 %	25 %	25 %	258404146
14	NC_013223	GGCT	2	8	8397	8404	0 %	25 %	50 %	25 %	258404146
15	NC_013223	GCTG	2	8	9204	9211	0 %	25 %	50 %	25 %	258404147
16	NC_013223	GGGA	2	8	9882	9889	25 %	0 %	75 %	0 %	258404147
17	NC_013223	GACG	2	8	10162	10169	25 %	0 %	50 %	25 %	258404147
18	NC_013223	CCAT	2	8	10262	10269	25 %	25 %	0 %	50 %	258404147
19	NC_013223	CGCT	2	8	10584	10591	0 %	25 %	25 %	50 %	258404148
20	NC_013223	GCCA	2	8	11185	11192	25 %	0 %	25 %	50 %	258404148
21	NC_013223	AGGG	2	8	12382	12389	25 %	0 %	75 %	0 %	258404149
22	NC_013223	GAGC	2	8	12415	12422	25 %	0 %	50 %	25 %	258404149
23	NC_013223	CAGC	2	8	14029	14036	25 %	0 %	25 %	50 %	258404151
24	NC_013223	GGGC	2	8	14924	14931	0 %	0 %	75 %	25 %	258404151
25	NC_013223	GGGC	2	8	15009	15016	0 %	0 %	75 %	25 %	258404151
26	NC_013223	TCGG	2	8	15284	15291	0 %	25 %	50 %	25 %	258404152
27	NC_013223	CCCT	2	8	15622	15629	0 %	25 %	0 %	75 %	258404152
28	NC_013223	GACC	2	8	16420	16427	25 %	0 %	25 %	50 %	258404152
29	NC_013223	CTGT	2	8	16966	16973	0 %	50 %	25 %	25 %	258404152
30	NC_013223	GCTG	2	8	17210	17217	0 %	25 %	50 %	25 %	258404153
31	NC_013223	GCGG	2	8	17384	17391	0 %	0 %	75 %	25 %	258404153
32	NC_013223	CTGC	2	8	17465	17472	0 %	25 %	25 %	50 %	258404153
33	NC_013223	AAAG	2	8	17546	17553	75 %	0 %	25 %	0 %	258404153
34	NC_013223	CGGT	2	8	18949	18956	0 %	25 %	50 %	25 %	258404155
35	NC_013223	CTGC	2	8	19064	19071	0 %	25 %	25 %	50 %	258404155
36	NC_013223	CTGC	2	8	19413	19420	0 %	25 %	25 %	50 %	258404155
37	NC_013223	CTCG	2	8	19684	19691	0 %	25 %	25 %	50 %	258404156
38	NC_013223	CGGA	2	8	21078	21085	25 %	0 %	50 %	25 %	258404157
39	NC_013223	CAGG	2	8	21270	21277	25 %	0 %	50 %	25 %	258404157
40	NC_013223	CCTC	2	8	21487	21494	0 %	25 %	0 %	75 %	258404157
41	NC_013223	GGGC	2	8	22506	22513	0 %	0 %	75 %	25 %	258404158
42	NC_013223	ATTG	2	8	22752	22759	25 %	50 %	25 %	0 %	258404159
43	NC_013223	GCCA	2	8	22801	22808	25 %	0 %	25 %	50 %	258404159
44	NC_013223	GCAG	2	8	23064	23071	25 %	0 %	50 %	25 %	258404159
45	NC_013223	GCAT	2	8	23339	23346	25 %	25 %	25 %	25 %	258404159
46	NC_013223	GCTG	2	8	24006	24013	0 %	25 %	50 %	25 %	258404159
47	NC_013223	GACG	2	8	24183	24190	25 %	0 %	50 %	25 %	258404159
48	NC_013223	TGGT	2	8	24191	24198	0 %	50 %	50 %	0 %	258404159
49	NC_013223	ATGA	2	8	24239	24246	50 %	25 %	25 %	0 %	258404159
50	NC_013223	CGGT	2	8	24674	24681	0 %	25 %	50 %	25 %	258404160
51	NC_013223	ACTG	2	8	26444	26451	25 %	25 %	25 %	25 %	258404162
52	NC_013223	CTTG	2	8	27203	27210	0 %	50 %	25 %	25 %	258404163
53	NC_013223	CAGT	2	8	27268	27275	25 %	25 %	25 %	25 %	258404163
54	NC_013223	GTCA	2	8	28673	28680	25 %	25 %	25 %	25 %	258404164
55	NC_013223	TCCC	2	8	28831	28838	0 %	25 %	0 %	75 %	258404164
56	NC_013223	GGCC	2	8	28920	28927	0 %	0 %	50 %	50 %	258404165
57	NC_013223	CTGG	2	8	28990	28997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404165
58	NC_013223	TGGG	2	8	30455	30462	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
59	NC_013223	CCGC	2	8	30980	30987	0 %	0 %	25 %	75 %	258404166
60	NC_013223	TGGG	2	8	31129	31136	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
61	NC_013223	CCGG	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
62	NC_013223	GCGG	2	8	33801	33808	0 %	0 %	75 %	25 %	258404169
63	NC_013223	GCGG	2	8	34590	34597	0 %	0 %	75 %	25 %	258404170
64	NC_013223	GGAC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	50 %	25 %	258404170
65	NC_013223	GGCT	2	8	34739	34746	0 %	25 %	50 %	25 %	258404170
66	NC_013223	TCCT	2	8	35487	35494	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
67	NC_013223	AGGC	2	8	36352	36359	25 %	0 %	50 %	25 %	258404171
68	NC_013223	ACCC	2	8	36463	36470	25 %	0 %	0 %	75 %	258404171
69	NC_013223	ACAA	2	8	36683	36690	75 %	0 %	0 %	25 %	258404171
70	NC_013223	CGAC	2	8	37669	37676	25 %	0 %	25 %	50 %	258404172
71	NC_013223	CCGG	2	8	38878	38885	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
72	NC_013223	CTGG	2	8	39990	39997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404173
73	NC_013223	CCAA	2	8	40154	40161	50 %	0 %	0 %	50 %	258404173
74	NC_013223	TGGA	2	8	40255	40262	25 %	25 %	50 %	0 %	258404173
75	NC_013223	CCGG	2	8	40309	40316	0 %	0 %	50 %	50 %	258404173
76	NC_013223	GGCT	2	8	41902	41909	0 %	25 %	50 %	25 %	258404173
77	NC_013223	AGCC	2	8	42338	42345	25 %	0 %	25 %	50 %	258404173
78	NC_013223	TTGA	2	8	42604	42611	25 %	50 %	25 %	0 %	258404173
79	NC_013223	GGAC	2	8	43083	43090	25 %	0 %	50 %	25 %	258404174
80	NC_013223	GACC	2	8	43104	43111	25 %	0 %	25 %	50 %	258404174
81	NC_013223	TGGA	2	8	43192	43199	25 %	25 %	50 %	0 %	258404174
82	NC_013223	ACGT	2	8	43321	43328	25 %	25 %	25 %	25 %	258404174
83	NC_013223	GCAC	2	8	43559	43566	25 %	0 %	25 %	50 %	258404174
84	NC_013223	CCGG	2	8	43902	43909	0 %	0 %	50 %	50 %	258404174
85	NC_013223	GGAG	2	8	44673	44680	25 %	0 %	75 %	0 %	258404174
86	NC_013223	CGGG	2	8	45719	45726	0 %	0 %	75 %	25 %	258404175
87	NC_013223	TGGA	2	8	47260	47267	25 %	25 %	50 %	0 %	258404176
88	NC_013223	GGTT	2	8	48310	48317	0 %	50 %	50 %	0 %	258404176
89	NC_013223	TGGC	2	8	50073	50080	0 %	25 %	50 %	25 %	258404177
90	NC_013223	GGCT	2	8	53108	53115	0 %	25 %	50 %	25 %	258404179
91	NC_013223	TCCG	2	8	53418	53425	0 %	25 %	25 %	50 %	258404179
92	NC_013223	GCAC	2	8	53874	53881	25 %	0 %	25 %	50 %	258404179
93	NC_013223	CTGG	2	8	54154	54161	0 %	25 %	50 %	25 %	258404179
94	NC_013223	GCTG	2	8	55295	55302	0 %	25 %	50 %	25 %	258404180
95	NC_013223	CCGG	2	8	56093	56100	0 %	0 %	50 %	50 %	258404180
96	NC_013223	TTCC	2	8	57861	57868	0 %	50 %	0 %	50 %	258404181
97	NC_013223	GACC	2	8	58188	58195	25 %	0 %	25 %	50 %	258404181
98	NC_013223	TCGT	2	8	58503	58510	0 %	50 %	25 %	25 %	258404181
99	NC_013223	CCGC	2	8	60194	60201	0 %	0 %	25 %	75 %	258404184
100	NC_013223	AGCG	2	8	60626	60633	25 %	0 %	50 %	25 %	258404185
101	NC_013223	GCAC	2	8	60969	60976	25 %	0 %	25 %	50 %	258404185
102	NC_013223	GATC	2	8	61342	61349	25 %	25 %	25 %	25 %	258404185
103	NC_013223	AGGA	2	8	63893	63900	50 %	0 %	50 %	0 %	258404186
104	NC_013223	CGTG	2	8	63917	63924	0 %	25 %	50 %	25 %	258404186
105	NC_013223	CGGT	2	8	66200	66207	0 %	25 %	50 %	25 %	258404189
106	NC_013223	GGCG	2	8	66222	66229	0 %	0 %	75 %	25 %	258404189
107	NC_013223	GCCA	2	8	67160	67167	25 %	0 %	25 %	50 %	258404190
108	NC_013223	CGCC	2	8	67939	67946	0 %	0 %	25 %	75 %	258404191
109	NC_013223	GAGC	2	8	69906	69913	25 %	0 %	50 %	25 %	258404192
110	NC_013223	GCCG	2	8	70789	70796	0 %	0 %	50 %	50 %	258404193
111	NC_013223	AGGC	2	8	70970	70977	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
112	NC_013223	GAAG	2	8	71069	71076	50 %	0 %	50 %	0 %	258404193
113	NC_013223	GCAG	2	8	71600	71607	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
114	NC_013223	AACG	2	8	74043	74050	50 %	0 %	25 %	25 %	258404194
115	NC_013223	CCGG	2	8	75116	75123	0 %	0 %	50 %	50 %	258404195
116	NC_013223	CGTG	2	8	75422	75429	0 %	25 %	50 %	25 %	258404195
117	NC_013223	GGCA	2	8	77263	77270	25 %	0 %	50 %	25 %	258404196
118	NC_013223	GGGT	2	8	78049	78056	0 %	25 %	75 %	0 %	258404197
119	NC_013223	ATCC	2	8	78321	78328	25 %	25 %	0 %	50 %	258404197
120	NC_013223	TACC	2	8	78776	78783	25 %	25 %	0 %	50 %	258404197
121	NC_013223	TCAG	2	8	79357	79364	25 %	25 %	25 %	25 %	258404197
122	NC_013223	CGGG	2	8	82706	82713	0 %	0 %	75 %	25 %	258404201
123	NC_013223	CGTT	2	8	83553	83560	0 %	50 %	25 %	25 %	258404202
124	NC_013223	GAGC	2	8	85003	85010	25 %	0 %	50 %	25 %	258404203
125	NC_013223	CCAT	2	8	85614	85621	25 %	25 %	0 %	50 %	258404203
126	NC_013223	CGGG	2	8	87221	87228	0 %	0 %	75 %	25 %	258404205
127	NC_013223	CAGT	2	8	87648	87655	25 %	25 %	25 %	25 %	258404206
128	NC_013223	CCGG	2	8	87723	87730	0 %	0 %	50 %	50 %	258404206
129	NC_013223	AAGG	2	8	87925	87932	50 %	0 %	50 %	0 %	258404206
130	NC_013223	AGGC	2	8	88259	88266	25 %	0 %	50 %	25 %	258404206
131	NC_013223	GCGA	2	8	89572	89579	25 %	0 %	50 %	25 %	258404206
132	NC_013223	CAGG	2	8	90047	90054	25 %	0 %	50 %	25 %	258404207
133	NC_013223	AGCC	2	8	90368	90375	25 %	0 %	25 %	50 %	258404207
134	NC_013223	TTTA	2	8	91184	91191	25 %	75 %	0 %	0 %	258404208
135	NC_013223	CTAT	2	8	92454	92461	25 %	50 %	0 %	25 %	258404209
136	NC_013223	AGGG	2	8	92777	92784	25 %	0 %	75 %	0 %	258404209
137	NC_013223	CAGC	2	8	92938	92945	25 %	0 %	25 %	50 %	258404210
138	NC_013223	TCGG	2	8	93626	93633	0 %	25 %	50 %	25 %	258404210
139	NC_013223	CTTC	2	8	94766	94773	0 %	50 %	0 %	50 %	258404211
140	NC_013223	TGGC	2	8	94874	94881	0 %	25 %	50 %	25 %	258404211
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