MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013223	GCC	2	6	264638	264643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404346
4002	NC_013223	AGGT	2	8	264740	264747	25 %	25 %	50 %	0 %	258404346
4003	NC_013223	TGGA	2	8	265117	265124	25 %	25 %	50 %	0 %	258404347
4004	NC_013223	TTCCAC	2	12	265134	265145	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258404347
4005	NC_013223	GCG	2	6	265186	265191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404347
4006	NC_013223	GAC	2	6	265197	265202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404347
4007	NC_013223	TCC	2	6	265318	265323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404347
4008	NC_013223	GCTG	2	8	265370	265377	0 %	25 %	50 %	25 %	258404347
4009	NC_013223	TCG	2	6	265387	265392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404347
4010	NC_013223	TCA	2	6	265421	265426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404347
4011	NC_013223	ACCTGG	2	12	265432	265443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404347
4012	NC_013223	TCG	2	6	265468	265473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404347
4013	NC_013223	GCGCTG	2	12	265513	265524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404347
4014	NC_013223	AGG	2	6	265609	265614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404347
4015	NC_013223	TGG	2	6	265741	265746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404347
4016	NC_013223	GCCG	2	8	265821	265828	0 %	0 %	50 %	50 %	258404347
4017	NC_013223	GGT	2	6	265868	265873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4018	NC_013223	TGG	2	6	265906	265911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4019	NC_013223	ATG	2	6	265914	265919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404348
4020	NC_013223	GAT	2	6	266015	266020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404348
4021	NC_013223	TGG	3	9	266070	266078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4022	NC_013223	CTG	2	6	266135	266140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404348
4023	NC_013223	TCG	2	6	266211	266216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404348
4024	NC_013223	TTG	2	6	266220	266225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404348
4025	NC_013223	T	6	6	266461	266466	0 %	100 %	0 %	0 %	258404349
4026	NC_013223	GCG	2	6	266580	266585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404349
4027	NC_013223	ACG	2	6	266612	266617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404349
4028	NC_013223	CGC	2	6	266635	266640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404349
4029	NC_013223	CGG	2	6	266788	266793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404349
4030	NC_013223	CG	3	6	266794	266799	0 %	0 %	50 %	50 %	258404349
4031	NC_013223	AGGC	2	8	266838	266845	25 %	0 %	50 %	25 %	258404349
4032	NC_013223	CCGG	2	8	266846	266853	0 %	0 %	50 %	50 %	258404349
4033	NC_013223	TGT	2	6	266866	266871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404349
4034	NC_013223	CCGG	2	8	266898	266905	0 %	0 %	50 %	50 %	258404349
4035	NC_013223	CGGT	2	8	266952	266959	0 %	25 %	50 %	25 %	258404349
4036	NC_013223	GCC	2	6	267014	267019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404349
4037	NC_013223	GAC	2	6	267039	267044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404349
4038	NC_013223	AGG	2	6	267051	267056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404350
4039	NC_013223	AGG	2	6	267197	267202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404350
4040	NC_013223	GGT	2	6	267231	267236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404350
4041	NC_013223	CGG	2	6	267305	267310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404350
4042	NC_013223	GCC	2	6	267346	267351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404350
4043	NC_013223	GTT	2	6	267370	267375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404350
4044	NC_013223	GGA	2	6	267383	267388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404350
4045	NC_013223	CCGT	2	8	267420	267427	0 %	25 %	25 %	50 %	258404350
4046	NC_013223	GTG	2	6	267476	267481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404350
4047	NC_013223	GGC	2	6	267573	267578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404350
4048	NC_013223	CGCCA	2	10	267679	267688	20 %	0 %	20 %	60 %	258404350
4049	NC_013223	ACC	2	6	267812	267817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404350
4050	NC_013223	CCG	2	6	267832	267837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404350
4051	NC_013223	GGC	2	6	267865	267870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404350
4052	NC_013223	TGA	2	6	267951	267956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404350
4053	NC_013223	CTGG	2	8	267973	267980	0 %	25 %	50 %	25 %	258404350
4054	NC_013223	GTTG	2	8	268005	268012	0 %	50 %	50 %	0 %	258404350
4055	NC_013223	G	6	6	268020	268025	0 %	0 %	100 %	0 %	258404350
4056	NC_013223	CAT	2	6	268059	268064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404350
4057	NC_013223	GCT	2	6	268098	268103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404350
4058	NC_013223	GCC	2	6	268133	268138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404350
4059	NC_013223	CGA	2	6	268260	268265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404350
4060	NC_013223	GCG	2	6	268327	268332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404350
4061	NC_013223	CGGC	2	8	268376	268383	0 %	0 %	50 %	50 %	258404350
4062	NC_013223	TTG	2	6	268472	268477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404350
4063	NC_013223	GAACC	2	10	268482	268491	40 %	0 %	20 %	40 %	258404350
4064	NC_013223	CTGTC	2	10	268545	268554	0 %	40 %	20 %	40 %	258404351
4065	NC_013223	GCC	2	6	268652	268657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404351
4066	NC_013223	CCG	2	6	268658	268663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404351
4067	NC_013223	GTC	2	6	268743	268748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404351
4068	NC_013223	GAT	2	6	268872	268877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404351
4069	NC_013223	GCC	2	6	268893	268898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404351
4070	NC_013223	GCCAG	2	10	268946	268955	20 %	0 %	40 %	40 %	258404351
4071	NC_013223	TTC	2	6	269062	269067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404352
4072	NC_013223	AGG	2	6	269121	269126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404352
4073	NC_013223	GCA	2	6	269160	269165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
4074	NC_013223	CAG	2	6	269167	269172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
4075	NC_013223	GCC	2	6	269268	269273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404352
4076	NC_013223	CGG	2	6	269316	269321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404352
4077	NC_013223	GACC	2	8	269376	269383	25 %	0 %	25 %	50 %	258404352
4078	NC_013223	CCG	2	6	269390	269395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404352
4079	NC_013223	GCC	2	6	269408	269413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404352
4080	NC_013223	GTCC	2	8	269495	269502	0 %	25 %	25 %	50 %	258404352
4081	NC_013223	GCA	3	9	269526	269534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
4082	NC_013223	CAGGA	2	10	269596	269605	40 %	0 %	40 %	20 %	258404352
4083	NC_013223	CAG	2	6	269782	269787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
4084	NC_013223	CAT	2	6	269848	269853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404352
4085	NC_013223	GCC	2	6	269945	269950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404352
4086	NC_013223	GGT	2	6	270067	270072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404353
4087	NC_013223	GAA	2	6	270111	270116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404353
4088	NC_013223	CAA	2	6	270135	270140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404353
4089	NC_013223	GGC	2	6	270168	270173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404353
4090	NC_013223	AGA	2	6	270226	270231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404353
4091	NC_013223	CGATGC	2	12	270239	270250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404353
4092	NC_013223	GCCA	2	8	270268	270275	25 %	0 %	25 %	50 %	258404353
4093	NC_013223	GCCG	2	8	270326	270333	0 %	0 %	50 %	50 %	258404353
4094	NC_013223	ACC	2	6	270400	270405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404353
4095	NC_013223	CGC	2	6	270435	270440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404353
4096	NC_013223	CGC	2	6	270452	270457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404353
4097	NC_013223	CA	3	6	270522	270527	50 %	0 %	0 %	50 %	258404353
4098	NC_013223	AGG	2	6	270563	270568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404353
4099	NC_013223	GAT	2	6	270570	270575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404353
4100	NC_013223	CGG	2	6	270578	270583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404353
4101	NC_013223	GAT	2	6	270693	270698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404353
4102	NC_013223	TCC	2	6	270750	270755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404353
4103	NC_013223	AGC	2	6	270787	270792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404353
4104	NC_013223	GCC	2	6	270823	270828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404353
4105	NC_013223	TCC	2	6	270978	270983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404353
4106	NC_013223	GCG	2	6	271010	271015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404353
4107	NC_013223	GTG	2	6	271108	271113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404353
4108	NC_013223	CAG	2	6	271131	271136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404353
4109	NC_013223	GTC	2	6	271249	271254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404354
4110	NC_013223	GAT	2	6	271458	271463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404354
4111	NC_013223	CTT	2	6	271715	271720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404354
4112	NC_013223	GAC	2	6	271755	271760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404354
4113	NC_013223	GGC	2	6	271842	271847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404354
4114	NC_013223	GC	3	6	271948	271953	0 %	0 %	50 %	50 %	258404354
4115	NC_013223	TGG	2	6	272033	272038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404354
4116	NC_013223	CAG	2	6	272073	272078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404354
4117	NC_013223	AGG	2	6	272120	272125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404354
4118	NC_013223	CAGA	2	8	272253	272260	50 %	0 %	25 %	25 %	258404354
4119	NC_013223	GGC	2	6	272268	272273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404354
4120	NC_013223	CGT	2	6	272500	272505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4121	NC_013223	CAGC	2	8	272594	272601	25 %	0 %	25 %	50 %	258404355
4122	NC_013223	GCA	2	6	272623	272628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4123	NC_013223	CTG	2	6	272630	272635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4124	NC_013223	CTGG	2	8	272644	272651	0 %	25 %	50 %	25 %	258404355
4125	NC_013223	GCCT	2	8	272666	272673	0 %	25 %	25 %	50 %	258404355
4126	NC_013223	G	6	6	272688	272693	0 %	0 %	100 %	0 %	258404355
4127	NC_013223	ACC	2	6	272723	272728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404355
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4129	NC_013223	CCG	2	6	272832	272837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404355
4130	NC_013223	GTCC	2	8	272851	272858	0 %	25 %	25 %	50 %	258404355
4131	NC_013223	TCCT	2	8	273073	273080	0 %	50 %	0 %	50 %	258404355
4132	NC_013223	CCA	2	6	273094	273099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404355
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4134	NC_013223	CCG	2	6	273149	273154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404355
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4140	NC_013223	CGT	2	6	273343	273348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4141	NC_013223	CTG	2	6	273349	273354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
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4147	NC_013223	GGCA	2	8	273780	273787	25 %	0 %	50 %	25 %	258404356
4148	NC_013223	CCGTG	2	10	273818	273827	0 %	20 %	40 %	40 %	258404356
4149	NC_013223	CGA	2	6	273860	273865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404356
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4151	NC_013223	CGA	2	6	273878	273883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404356
4152	NC_013223	AGC	3	9	273976	273984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404356
4153	NC_013223	GCTG	2	8	274049	274056	0 %	25 %	50 %	25 %	258404356
4154	NC_013223	CT	3	6	274104	274109	0 %	50 %	0 %	50 %	258404356
4155	NC_013223	CGG	2	6	274157	274162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404356
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4158	NC_013223	TCA	2	6	274421	274426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404357
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4162	NC_013223	GGC	2	6	274588	274593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404357
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4182	NC_013223	CG	3	6	275548	275553	0 %	0 %	50 %	50 %	258404358
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4227	NC_013223	C	6	6	277982	277987	0 %	0 %	0 %	100 %	258404360
4228	NC_013223	CAG	2	6	278005	278010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404360
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4230	NC_013223	CCA	2	6	278055	278060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404360
4231	NC_013223	CGG	2	6	278086	278091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404360
4232	NC_013223	GCG	2	6	278238	278243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404360
4233	NC_013223	T	6	6	278261	278266	0 %	100 %	0 %	0 %	258404360
4234	NC_013223	CGG	2	6	278273	278278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404360
4235	NC_013223	GAC	2	6	278346	278351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404360
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4237	NC_013223	G	7	7	278464	278470	0 %	0 %	100 %	0 %	258404360
4238	NC_013223	AGG	2	6	278541	278546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404360
4239	NC_013223	CGG	2	6	278606	278611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404360
4240	NC_013223	CCT	2	6	278612	278617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404360
4241	NC_013223	CAC	2	6	278641	278646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404360
4242	NC_013223	CCCGG	2	10	278658	278667	0 %	0 %	40 %	60 %	258404360
4243	NC_013223	GGC	2	6	278688	278693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404360
4244	NC_013223	GCA	2	6	278796	278801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404360
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4247	NC_013223	GCC	2	6	278911	278916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404360
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4331	NC_013223	GGC	3	9	283965	283973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404364
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4337	NC_013223	AGAGA	2	10	284283	284292	60 %	0 %	40 %	0 %	258404364
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4340	NC_013223	AGAC	2	8	284575	284582	50 %	0 %	25 %	25 %	258404364
4341	NC_013223	TCG	2	6	284593	284598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404364
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4343	NC_013223	CA	3	6	284707	284712	50 %	0 %	0 %	50 %	258404364
4344	NC_013223	TTC	2	6	284736	284741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404364
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4347	NC_013223	ATC	2	6	284970	284975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404364
4348	NC_013223	TCA	2	6	285031	285036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404364
4349	NC_013223	TGGC	2	8	285077	285084	0 %	25 %	50 %	25 %	258404364
4350	NC_013223	CCGG	2	8	285145	285152	0 %	0 %	50 %	50 %	258404364
4351	NC_013223	TAC	2	6	285174	285179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404364
4352	NC_013223	GAA	2	6	285201	285206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404364
4353	NC_013223	GGTCA	2	10	285468	285477	20 %	20 %	40 %	20 %	258404364
4354	NC_013223	CCA	2	6	285536	285541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404364
4355	NC_013223	GCAAG	2	10	285719	285728	40 %	0 %	40 %	20 %	258404365
4356	NC_013223	CGG	2	6	285805	285810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404365
4357	NC_013223	TC	3	6	285851	285856	0 %	50 %	0 %	50 %	258404365
4358	NC_013223	CCG	2	6	285957	285962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404365
4359	NC_013223	ACG	2	6	285985	285990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404365
4360	NC_013223	A	6	6	286047	286052	100 %	0 %	0 %	0 %	258404365
4361	NC_013223	ATG	2	6	286227	286232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404365
4362	NC_013223	CATT	2	8	286347	286354	25 %	50 %	0 %	25 %	258404365
4363	NC_013223	GCC	2	6	286368	286373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404365
4364	NC_013223	CAC	2	6	286427	286432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404365
4365	NC_013223	CAA	2	6	286908	286913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404366
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4368	NC_013223	ACC	2	6	286936	286941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404366
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4470	NC_013223	CG	3	6	293663	293668	0 %	0 %	50 %	50 %	258404370
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4482	NC_013223	T	6	6	294335	294340	0 %	100 %	0 %	0 %	258404370
4483	NC_013223	TCG	2	6	294403	294408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404370
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4486	NC_013223	GGC	2	6	294615	294620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404370
4487	NC_013223	T	6	6	294714	294719	0 %	100 %	0 %	0 %	258404370
4488	NC_013223	GTC	2	6	294771	294776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404370
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4490	NC_013223	CGG	2	6	294866	294871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404370
4491	NC_013223	GTC	2	6	294879	294884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404370
4492	NC_013223	CGG	2	6	294923	294928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404370
4493	NC_013223	GTC	2	6	294930	294935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404370
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4499	NC_013223	CGG	2	6	295396	295401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404371
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