MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013223	C	6	6	200809	200814	0 %	0 %	0 %	100 %	258404295
3002	NC_013223	GAA	2	6	200824	200829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404295
3003	NC_013223	GGC	2	6	200854	200859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3004	NC_013223	A	6	6	200906	200911	100 %	0 %	0 %	0 %	258404295
3005	NC_013223	TCG	2	6	200942	200947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3006	NC_013223	GCC	2	6	200993	200998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404295
3007	NC_013223	TCA	3	9	201059	201067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404295
3008	NC_013223	CGG	2	6	201141	201146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3009	NC_013223	CGG	2	6	201234	201239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3010	NC_013223	G	7	7	201250	201256	0 %	0 %	100 %	0 %	258404295
3011	NC_013223	G	7	7	201327	201333	0 %	0 %	100 %	0 %	258404295
3012	NC_013223	GC	3	6	201348	201353	0 %	0 %	50 %	50 %	258404295
3013	NC_013223	GCA	2	6	201360	201365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3014	NC_013223	CG	4	8	201408	201415	0 %	0 %	50 %	50 %	258404295
3015	NC_013223	CGG	3	9	201535	201543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404296
3016	NC_013223	TCT	2	6	201705	201710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404296
3017	NC_013223	ATC	2	6	201728	201733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404296
3018	NC_013223	CGC	2	6	201760	201765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404296
3019	NC_013223	TGC	2	6	201831	201836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404296
3020	NC_013223	GCA	2	6	201840	201845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404296
3021	NC_013223	T	6	6	201912	201917	0 %	100 %	0 %	0 %	258404296
3022	NC_013223	CGG	3	9	201934	201942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404296
3023	NC_013223	GCC	2	6	202007	202012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404296
3024	NC_013223	ATT	2	6	202127	202132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404296
3025	NC_013223	TGCTG	2	10	202210	202219	0 %	40 %	40 %	20 %	258404296
3026	NC_013223	AGG	2	6	202832	202837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404297
3027	NC_013223	GTC	2	6	202840	202845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3028	NC_013223	CGG	2	6	202883	202888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404297
3029	NC_013223	T	6	6	202902	202907	0 %	100 %	0 %	0 %	258404297
3030	NC_013223	ATT	2	6	202930	202935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404297
3031	NC_013223	CGG	2	6	203073	203078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404297
3032	NC_013223	ACG	2	6	203087	203092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3033	NC_013223	GAT	2	6	203218	203223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404297
3034	NC_013223	GT	3	6	203226	203231	0 %	50 %	50 %	0 %	258404297
3035	NC_013223	GCT	2	6	203261	203266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3036	NC_013223	GCC	2	6	203591	203596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404298
3037	NC_013223	TCC	2	6	203624	203629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404298
3038	NC_013223	CAG	2	6	203668	203673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404298
3039	NC_013223	GTC	2	6	203722	203727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404298
3040	NC_013223	TACA	2	8	203800	203807	50 %	25 %	0 %	25 %	258404298
3041	NC_013223	GAG	2	6	203884	203889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404298
3042	NC_013223	ATG	2	6	204041	204046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404298
3043	NC_013223	CGG	2	6	204081	204086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404298
3044	NC_013223	GCC	2	6	204103	204108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404298
3045	NC_013223	GA	3	6	204140	204145	50 %	0 %	50 %	0 %	258404298
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3047	NC_013223	TGGC	2	8	204224	204231	0 %	25 %	50 %	25 %	258404298
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3051	NC_013223	CGT	2	6	204485	204490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404299
3052	NC_013223	CGA	2	6	204560	204565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404299
3053	NC_013223	T	8	8	204567	204574	0 %	100 %	0 %	0 %	258404299
3054	NC_013223	C	7	7	204576	204582	0 %	0 %	0 %	100 %	258404299
3055	NC_013223	GTC	2	6	204732	204737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404299
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3057	NC_013223	TGC	2	6	204829	204834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404299
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3061	NC_013223	GCA	2	6	205026	205031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404300
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3063	NC_013223	CCGG	2	8	205129	205136	0 %	0 %	50 %	50 %	258404300
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3070	NC_013223	GCG	2	6	205613	205618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404300
3071	NC_013223	CCG	2	6	205637	205642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404300
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3087	NC_013223	TGA	2	6	206733	206738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404301
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3089	NC_013223	CGA	2	6	206851	206856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404301
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3092	NC_013223	CAA	2	6	207227	207232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404302
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3094	NC_013223	CGG	3	9	207278	207286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404302
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3100	NC_013223	G	6	6	207626	207631	0 %	0 %	100 %	0 %	258404302
3101	NC_013223	CCGC	2	8	207632	207639	0 %	0 %	25 %	75 %	258404302
3102	NC_013223	CGG	2	6	207684	207689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404302
3103	NC_013223	CAA	2	6	207699	207704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404302
3104	NC_013223	TCGA	2	8	207998	208005	25 %	25 %	25 %	25 %	258404302
3105	NC_013223	TTC	2	6	208068	208073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404302
3106	NC_013223	AGG	2	6	208169	208174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404302
3107	NC_013223	GCT	2	6	208225	208230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404303
3108	NC_013223	TAT	2	6	208283	208288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404303
3109	NC_013223	GCTG	2	8	208311	208318	0 %	25 %	50 %	25 %	258404303
3110	NC_013223	TGG	2	6	208377	208382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404303
3111	NC_013223	GCTC	2	8	208390	208397	0 %	25 %	25 %	50 %	258404303
3112	NC_013223	ACG	2	6	208535	208540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404303
3113	NC_013223	TCA	2	6	208572	208577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404303
3114	NC_013223	TGG	2	6	208587	208592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404303
3115	NC_013223	T	6	6	209041	209046	0 %	100 %	0 %	0 %	258404304
3116	NC_013223	ATTCCC	2	12	209049	209060	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258404304
3117	NC_013223	CTT	2	6	209082	209087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404304
3118	NC_013223	GTC	2	6	209138	209143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404304
3119	NC_013223	TGA	2	6	209157	209162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404304
3120	NC_013223	ACC	2	6	209182	209187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404304
3121	NC_013223	TAG	2	6	209258	209263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404304
3122	NC_013223	ATC	2	6	209465	209470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404304
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3236	NC_013223	GA	3	6	216871	216876	50 %	0 %	50 %	0 %	258404309
3237	NC_013223	CTG	2	6	216896	216901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404309
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3240	NC_013223	TGG	2	6	217018	217023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404309
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3242	NC_013223	TGA	2	6	217196	217201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404309
3243	NC_013223	G	6	6	217223	217228	0 %	0 %	100 %	0 %	258404309
3244	NC_013223	GCG	2	6	217248	217253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404309
3245	NC_013223	AGC	2	6	217297	217302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404309
3246	NC_013223	CGG	2	6	217311	217316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404309
3247	NC_013223	GTTCGA	2	12	217526	217537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258404309
3248	NC_013223	CAGC	2	8	217538	217545	25 %	0 %	25 %	50 %	258404309
3249	NC_013223	GC	3	6	217638	217643	0 %	0 %	50 %	50 %	258404309
3250	NC_013223	GTT	2	6	217667	217672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404309
3251	NC_013223	GGT	2	6	217767	217772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404309
3252	NC_013223	TGA	2	6	217784	217789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404309
3253	NC_013223	GTT	2	6	217808	217813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404309
3254	NC_013223	ACG	2	6	217870	217875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404309
3255	NC_013223	AGG	2	6	217886	217891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404309
3256	NC_013223	CTG	2	6	217908	217913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404309
3257	NC_013223	GTT	2	6	217934	217939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404309
3258	NC_013223	CAGT	2	8	218122	218129	25 %	25 %	25 %	25 %	258404310
3259	NC_013223	CTG	2	6	218168	218173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
3260	NC_013223	TTCT	2	8	218213	218220	0 %	75 %	0 %	25 %	258404310
3261	NC_013223	T	6	6	218285	218290	0 %	100 %	0 %	0 %	258404310
3262	NC_013223	TGC	2	6	218329	218334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
3263	NC_013223	GTG	2	6	218546	218551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404310
3264	NC_013223	GCG	2	6	218555	218560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404310
3265	NC_013223	GTT	2	6	218585	218590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404310
3266	NC_013223	GAG	2	6	218601	218606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404310
3267	NC_013223	GGC	2	6	218741	218746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404310
3268	NC_013223	GCAA	2	8	218865	218872	50 %	0 %	25 %	25 %	258404310
3269	NC_013223	GTT	2	6	218974	218979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404310
3270	NC_013223	CAG	2	6	219014	219019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404310
3271	NC_013223	CGTTT	2	10	219026	219035	0 %	60 %	20 %	20 %	258404310
3272	NC_013223	CCT	2	6	219121	219126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404310
3273	NC_013223	GGC	2	6	219133	219138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404310
3274	NC_013223	CGG	2	6	219230	219235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404310
3275	NC_013223	AGGG	2	8	219276	219283	25 %	0 %	75 %	0 %	258404310
3276	NC_013223	CTG	2	6	219311	219316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
3277	NC_013223	CTG	2	6	219329	219334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
3278	NC_013223	CAGG	2	8	219397	219404	25 %	0 %	50 %	25 %	258404310
3279	NC_013223	GGC	2	6	219416	219421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404310
3280	NC_013223	CGC	2	6	219459	219464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404310
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3282	NC_013223	CGG	2	6	219584	219589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404311
3283	NC_013223	CGT	2	6	219611	219616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404311
3284	NC_013223	AG	3	6	219762	219767	50 %	0 %	50 %	0 %	258404311
3285	NC_013223	TGG	2	6	220035	220040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404312
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3300	NC_013223	TCG	2	6	220865	220870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404313
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3302	NC_013223	CCG	2	6	221027	221032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404313
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3340	NC_013223	GCT	2	6	223940	223945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404314
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3350	NC_013223	CGA	2	6	224648	224653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404314
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3352	NC_013223	GGT	2	6	224753	224758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404314
3353	NC_013223	GCA	2	6	224765	224770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404314
3354	NC_013223	GAT	2	6	224771	224776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404314
3355	NC_013223	GGCCCA	2	12	224786	224797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404314
3356	NC_013223	GAAG	2	8	225024	225031	50 %	0 %	50 %	0 %	258404314
3357	NC_013223	CGG	2	6	225047	225052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404314
3358	NC_013223	GAT	2	6	225054	225059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404314
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3360	NC_013223	GC	3	6	225125	225130	0 %	0 %	50 %	50 %	258404314
3361	NC_013223	CAG	2	6	225150	225155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404314
3362	NC_013223	CGCA	2	8	225159	225166	25 %	0 %	25 %	50 %	258404314
3363	NC_013223	GTG	2	6	225237	225242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404314
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3365	NC_013223	G	6	6	225346	225351	0 %	0 %	100 %	0 %	258404314
3366	NC_013223	AGC	2	6	225594	225599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404315
3367	NC_013223	G	6	6	225658	225663	0 %	0 %	100 %	0 %	258404315
3368	NC_013223	TGGC	2	8	225686	225693	0 %	25 %	50 %	25 %	258404315
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3370	NC_013223	CTCC	2	8	226348	226355	0 %	25 %	0 %	75 %	258404316
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3373	NC_013223	GCCG	2	8	226472	226479	0 %	0 %	50 %	50 %	258404316
3374	NC_013223	GGC	2	6	226625	226630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404316
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3476	NC_013223	GC	3	6	233400	233405	0 %	0 %	50 %	50 %	258404321
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3481	NC_013223	GCCC	2	8	233794	233801	0 %	0 %	25 %	75 %	258404321
3482	NC_013223	CCG	2	6	233835	233840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404321
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3485	NC_013223	TCGT	2	8	233920	233927	0 %	50 %	25 %	25 %	258404322
3486	NC_013223	CAC	2	6	233981	233986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404322
3487	NC_013223	CGG	2	6	234008	234013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404322
3488	NC_013223	CTTGTC	2	12	234144	234155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258404322
3489	NC_013223	T	8	8	234208	234215	0 %	100 %	0 %	0 %	258404322
3490	NC_013223	GGA	2	6	234279	234284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404322
3491	NC_013223	GTC	2	6	234300	234305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3492	NC_013223	TAT	2	6	234351	234356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404322
3493	NC_013223	GCG	2	6	234443	234448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404322
3494	NC_013223	CTGGA	2	10	234495	234504	20 %	20 %	40 %	20 %	258404322
3495	NC_013223	ACAG	2	8	234556	234563	50 %	0 %	25 %	25 %	258404322
3496	NC_013223	GCC	2	6	234670	234675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404322
3497	NC_013223	CAG	2	6	234744	234749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404322
3498	NC_013223	CCG	2	6	234785	234790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404322
3499	NC_013223	A	6	6	234817	234822	100 %	0 %	0 %	0 %	258404322
3500	NC_013223	CCA	2	6	234826	234831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404322

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