MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013223	TCC	3	9	103817	103825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404216
1502	NC_013223	GCC	2	6	103828	103833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404216
1503	NC_013223	CCG	3	9	103850	103858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404216
1504	NC_013223	TGA	2	6	103881	103886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404216
1505	NC_013223	TGT	2	6	103887	103892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404216
1506	NC_013223	GTC	2	6	103912	103917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1507	NC_013223	GGCAG	2	10	103943	103952	20 %	0 %	60 %	20 %	258404216
1508	NC_013223	GCG	2	6	103973	103978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404216
1509	NC_013223	GGA	2	6	104010	104015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404216
1510	NC_013223	TGGC	2	8	104040	104047	0 %	25 %	50 %	25 %	258404216
1511	NC_013223	GCA	2	6	104121	104126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1512	NC_013223	CTT	2	6	104158	104163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404216
1513	NC_013223	GAT	2	6	104188	104193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404216
1514	NC_013223	CCA	2	6	104229	104234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404216
1515	NC_013223	GCA	2	6	104265	104270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1516	NC_013223	ATG	2	6	104333	104338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404216
1517	NC_013223	AT	3	6	104339	104344	50 %	50 %	0 %	0 %	258404216
1518	NC_013223	GAC	2	6	104386	104391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1519	NC_013223	GGA	2	6	104406	104411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404216
1520	NC_013223	CGGCC	2	10	104464	104473	0 %	0 %	40 %	60 %	258404216
1521	NC_013223	TCCGC	2	10	104493	104502	0 %	20 %	20 %	60 %	258404216
1522	NC_013223	GGCA	2	8	104539	104546	25 %	0 %	50 %	25 %	258404216
1523	NC_013223	T	6	6	104623	104628	0 %	100 %	0 %	0 %	258404216
1524	NC_013223	CCAG	2	8	104639	104646	25 %	0 %	25 %	50 %	258404216
1525	NC_013223	GAC	2	6	104683	104688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1526	NC_013223	TGG	2	6	104739	104744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404216
1527	NC_013223	TTC	2	6	104755	104760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404216
1528	NC_013223	TGG	2	6	104843	104848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404216
1529	NC_013223	GAT	2	6	104953	104958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404216
1530	NC_013223	CAGGA	2	10	104972	104981	40 %	0 %	40 %	20 %	258404216
1531	NC_013223	CGT	2	6	105033	105038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1532	NC_013223	TGC	2	6	105316	105321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1533	NC_013223	TCG	2	6	105364	105369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1534	NC_013223	GCAG	2	8	105386	105393	25 %	0 %	50 %	25 %	258404217
1535	NC_013223	CGT	2	6	105395	105400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1536	NC_013223	CAC	2	6	105420	105425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404217
1537	NC_013223	TG	3	6	105449	105454	0 %	50 %	50 %	0 %	258404217
1538	NC_013223	GCC	2	6	105463	105468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404217
1539	NC_013223	CGGG	2	8	105534	105541	0 %	0 %	75 %	25 %	258404217
1540	NC_013223	GGC	2	6	105561	105566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404217
1541	NC_013223	AT	3	6	105568	105573	50 %	50 %	0 %	0 %	258404217
1542	NC_013223	GGC	2	6	105645	105650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404217
1543	NC_013223	CTG	2	6	105816	105821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1544	NC_013223	CCA	2	6	105822	105827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404217
1545	NC_013223	TGG	2	6	105852	105857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404217
1546	NC_013223	TCG	2	6	105880	105885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1547	NC_013223	GCT	2	6	105935	105940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
1548	NC_013223	TGAGGA	2	12	105980	105991	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	258404217
1549	NC_013223	CCT	2	6	106067	106072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404217
1550	NC_013223	GCC	2	6	106080	106085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404217
1551	NC_013223	GGA	2	6	106166	106171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404217
1552	NC_013223	GCC	2	6	106191	106196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404217
1553	NC_013223	GTA	2	6	106248	106253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404217
1554	NC_013223	AACGG	2	10	106392	106401	40 %	0 %	40 %	20 %	258404217
1555	NC_013223	CCG	2	6	107043	107048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404218
1556	NC_013223	GCCTG	2	10	107082	107091	0 %	20 %	40 %	40 %	258404218
1557	NC_013223	GCG	2	6	107148	107153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404218
1558	NC_013223	GGT	2	6	107155	107160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404218
1559	NC_013223	GCG	2	6	107187	107192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404218
1560	NC_013223	GGT	2	6	107251	107256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404218
1561	NC_013223	GT	3	6	107275	107280	0 %	50 %	50 %	0 %	258404218
1562	NC_013223	AGG	2	6	107334	107339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404218
1563	NC_013223	TC	3	6	107378	107383	0 %	50 %	0 %	50 %	258404219
1564	NC_013223	GCG	2	6	107386	107391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404219
1565	NC_013223	CGG	2	6	107432	107437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404219
1566	NC_013223	GGT	2	6	107561	107566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404219
1567	NC_013223	CGG	2	6	107615	107620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404219
1568	NC_013223	CGGG	2	8	107672	107679	0 %	0 %	75 %	25 %	258404219
1569	NC_013223	CCT	2	6	107689	107694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404219
1570	NC_013223	TCG	2	6	107701	107706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404219
1571	NC_013223	CAGC	2	8	107792	107799	25 %	0 %	25 %	50 %	258404219
1572	NC_013223	GCA	2	6	107812	107817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404219
1573	NC_013223	CGGCC	2	10	107828	107837	0 %	0 %	40 %	60 %	258404219
1574	NC_013223	TACC	2	8	107876	107883	25 %	25 %	0 %	50 %	258404219
1575	NC_013223	G	6	6	107918	107923	0 %	0 %	100 %	0 %	258404219
1576	NC_013223	CGC	2	6	107982	107987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404219
1577	NC_013223	GCCCT	2	10	108105	108114	0 %	20 %	20 %	60 %	258404219
1578	NC_013223	CGG	2	6	108142	108147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404219
1579	NC_013223	CGGTT	2	10	108252	108261	0 %	40 %	40 %	20 %	258404219
1580	NC_013223	GGA	2	6	108368	108373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404219
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1582	NC_013223	CTTGC	2	10	108525	108534	0 %	40 %	20 %	40 %	258404219
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1585	NC_013223	TGG	2	6	108766	108771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404219
1586	NC_013223	GGC	2	6	108908	108913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404219
1587	NC_013223	GGT	2	6	108971	108976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404219
1588	NC_013223	CAC	2	6	109001	109006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404219
1589	NC_013223	GAAC	2	8	109037	109044	50 %	0 %	25 %	25 %	258404219
1590	NC_013223	GGGCC	2	10	109046	109055	0 %	0 %	60 %	40 %	258404219
1591	NC_013223	GCC	2	6	109080	109085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404219
1592	NC_013223	GCC	2	6	109112	109117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404219
1593	NC_013223	TGG	2	6	109417	109422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404220
1594	NC_013223	TCT	2	6	109427	109432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404220
1595	NC_013223	TGC	2	6	109435	109440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404220
1596	NC_013223	CGC	2	6	109481	109486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404220
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1602	NC_013223	GGC	2	6	109709	109714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404220
1603	NC_013223	TGG	2	6	109783	109788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404220
1604	NC_013223	CT	3	6	109814	109819	0 %	50 %	0 %	50 %	258404220
1605	NC_013223	CGC	2	6	110136	110141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404220
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1608	NC_013223	TTGA	2	8	110382	110389	25 %	50 %	25 %	0 %	258404220
1609	NC_013223	GTG	2	6	110465	110470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404220
1610	NC_013223	GGA	2	6	110480	110485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404220
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1612	NC_013223	AGGTG	2	10	110528	110537	20 %	20 %	60 %	0 %	258404220
1613	NC_013223	ATT	2	6	110590	110595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404220
1614	NC_013223	GGACG	2	10	110649	110658	20 %	0 %	60 %	20 %	258404220
1615	NC_013223	GGA	2	6	110690	110695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404220
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1618	NC_013223	ACG	2	6	110815	110820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404220
1619	NC_013223	GTG	2	6	110967	110972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404220
1620	NC_013223	G	6	6	111011	111016	0 %	0 %	100 %	0 %	258404220
1621	NC_013223	GGA	2	6	111071	111076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404220
1622	NC_013223	GCC	2	6	111129	111134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404220
1623	NC_013223	CAA	2	6	111143	111148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404220
1624	NC_013223	GCC	2	6	111216	111221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404220
1625	NC_013223	TGC	2	6	111239	111244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404220
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1643	NC_013223	CCA	2	6	112520	112525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404221
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1645	NC_013223	TGA	2	6	112808	112813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404221
1646	NC_013223	CTG	2	6	112869	112874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404221
1647	NC_013223	CCG	2	6	112988	112993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404221
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1651	NC_013223	CGAGG	2	10	113367	113376	20 %	0 %	60 %	20 %	258404221
1652	NC_013223	CCGGG	2	10	113397	113406	0 %	0 %	60 %	40 %	258404221
1653	NC_013223	TAG	2	6	113578	113583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404221
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1732	NC_013223	TGG	2	6	118898	118903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404225
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1734	NC_013223	GGC	2	6	119014	119019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404225
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1739	NC_013223	G	6	6	119179	119184	0 %	0 %	100 %	0 %	258404225
1740	NC_013223	A	6	6	119240	119245	100 %	0 %	0 %	0 %	258404225
1741	NC_013223	GCCTCA	2	12	119280	119291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258404225
1742	NC_013223	GAC	2	6	119374	119379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404225
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1744	NC_013223	CCG	2	6	119467	119472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404225
1745	NC_013223	AAC	2	6	119507	119512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404225
1746	NC_013223	GGC	2	6	119780	119785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404226
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1748	NC_013223	TGG	2	6	119835	119840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404226
1749	NC_013223	C	6	6	120071	120076	0 %	0 %	0 %	100 %	258404226
1750	NC_013223	GCG	2	6	120153	120158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404226
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1753	NC_013223	GAT	2	6	120533	120538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404226
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1758	NC_013223	GAT	2	6	121000	121005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404227
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1765	NC_013223	TGG	2	6	121307	121312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404228
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1774	NC_013223	ATGG	2	8	121963	121970	25 %	25 %	50 %	0 %	258404228
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1848	NC_013223	CGGG	2	8	127387	127394	0 %	0 %	75 %	25 %	258404233
1849	NC_013223	GAC	2	6	127528	127533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404233
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1853	NC_013223	A	6	6	127742	127747	100 %	0 %	0 %	0 %	258404233
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1860	NC_013223	ATG	2	6	128053	128058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404233
1861	NC_013223	TCAA	2	8	128078	128085	50 %	25 %	0 %	25 %	258404234
1862	NC_013223	GTC	2	6	128134	128139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404234
1863	NC_013223	CGA	2	6	128163	128168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404234
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1865	NC_013223	AAC	2	6	128206	128211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404234
1866	NC_013223	GCT	2	6	128253	128258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404234
1867	NC_013223	CAC	2	6	128341	128346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404234
1868	NC_013223	C	8	8	128396	128403	0 %	0 %	0 %	100 %	258404234
1869	NC_013223	AT	3	6	128418	128423	50 %	50 %	0 %	0 %	258404234
1870	NC_013223	ATT	2	6	128459	128464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404234
1871	NC_013223	TCCGGG	2	12	128474	128485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404234
1872	NC_013223	ATCG	2	8	128515	128522	25 %	25 %	25 %	25 %	258404234
1873	NC_013223	CAA	2	6	128523	128528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404234
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1877	NC_013223	GCA	2	6	128685	128690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404234
1878	NC_013223	CCT	2	6	128726	128731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404234
1879	NC_013223	CTG	2	6	128790	128795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404234
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1882	NC_013223	GGC	2	6	128997	129002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404234
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1884	NC_013223	AGCG	2	8	129121	129128	25 %	0 %	50 %	25 %	258404234
1885	NC_013223	T	6	6	129150	129155	0 %	100 %	0 %	0 %	258404234
1886	NC_013223	GGA	2	6	129192	129197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404234
1887	NC_013223	CGT	2	6	129255	129260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404234
1888	NC_013223	GGC	2	6	129373	129378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404234
1889	NC_013223	A	6	6	129495	129500	100 %	0 %	0 %	0 %	258404234
1890	NC_013223	AT	3	6	129537	129542	50 %	50 %	0 %	0 %	258404234
1891	NC_013223	CAGC	2	8	129573	129580	25 %	0 %	25 %	50 %	258404234
1892	NC_013223	AGG	2	6	129703	129708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404235
1893	NC_013223	CGGCA	2	10	129719	129728	20 %	0 %	40 %	40 %	258404235
1894	NC_013223	GTG	2	6	129861	129866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404235
1895	NC_013223	CGA	2	6	129953	129958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404235
1896	NC_013223	CAGC	2	8	129992	129999	25 %	0 %	25 %	50 %	258404235
1897	NC_013223	TGG	2	6	130168	130173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404235
1898	NC_013223	CTG	2	6	130251	130256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404235
1899	NC_013223	GTT	2	6	130265	130270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404235
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1902	NC_013223	CGG	2	6	130337	130342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404235
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1922	NC_013223	CAA	2	6	131622	131627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404236
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1957	NC_013223	GGGCGG	2	12	133305	133316	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	258404236
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1965	NC_013223	A	6	6	133755	133760	100 %	0 %	0 %	0 %	258404237
1966	NC_013223	AAG	2	6	134042	134047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404237
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1972	NC_013223	CCA	2	6	134413	134418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404237
1973	NC_013223	TCCGG	2	10	134657	134666	0 %	20 %	40 %	40 %	258404237
1974	NC_013223	GGT	2	6	134770	134775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404237
1975	NC_013223	GAT	2	6	135124	135129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404238
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1977	NC_013223	TCC	2	6	135161	135166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404238
1978	NC_013223	GGT	2	6	135169	135174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404238
1979	NC_013223	TCG	2	6	135305	135310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404238
1980	NC_013223	AGC	2	6	135311	135316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404238
1981	NC_013223	AT	3	6	135338	135343	50 %	50 %	0 %	0 %	258404238
1982	NC_013223	GTG	2	6	135482	135487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404238
1983	NC_013223	GAT	2	6	135514	135519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404238
1984	NC_013223	TTCCG	2	10	135532	135541	0 %	40 %	20 %	40 %	258404238
1985	NC_013223	CCG	2	6	135544	135549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404238
1986	NC_013223	GCG	2	6	135598	135603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404238
1987	NC_013223	GACGCC	2	12	135613	135624	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404238
1988	NC_013223	TTG	2	6	135794	135799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404238
1989	NC_013223	ATG	2	6	135806	135811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404238
1990	NC_013223	GGC	2	6	135864	135869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404238
1991	NC_013223	T	7	7	135908	135914	0 %	100 %	0 %	0 %	258404238
1992	NC_013223	AAT	2	6	135927	135932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404238
1993	NC_013223	TGG	2	6	135957	135962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404238
1994	NC_013223	GGC	2	6	135997	136002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404238
1995	NC_013223	ATGG	2	8	136003	136010	25 %	25 %	50 %	0 %	258404238
1996	NC_013223	AGG	2	6	136035	136040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404238
1997	NC_013223	TTC	2	6	136051	136056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404238
1998	NC_013223	TAGG	2	8	136165	136172	25 %	25 %	50 %	0 %	258404238
1999	NC_013223	CCT	2	6	136182	136187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404238
2000	NC_013223	TGG	3	9	136206	136214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404238

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