MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013223	CCG	2	6	67673	67678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404191
1002	NC_013223	TCG	2	6	67794	67799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1003	NC_013223	GCC	2	6	67800	67805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404191
1004	NC_013223	CGC	2	6	67912	67917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404191
1005	NC_013223	CGG	2	6	67918	67923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404191
1006	NC_013223	CGCC	2	8	67939	67946	0 %	0 %	25 %	75 %	258404191
1007	NC_013223	CGG	2	6	67971	67976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404191
1008	NC_013223	CGG	2	6	68051	68056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404191
1009	NC_013223	GAC	2	6	68120	68125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1010	NC_013223	CAA	2	6	68140	68145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404191
1011	NC_013223	TGC	2	6	68163	68168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1012	NC_013223	CGA	2	6	68377	68382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1013	NC_013223	GAG	2	6	68429	68434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404191
1014	NC_013223	CAG	2	6	68444	68449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1015	NC_013223	CGA	2	6	68455	68460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1016	NC_013223	ACG	2	6	68499	68504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1017	NC_013223	CTT	2	6	68530	68535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404191
1018	NC_013223	TCG	2	6	68613	68618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1019	NC_013223	GTC	2	6	68726	68731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404191
1020	NC_013223	GGT	2	6	68749	68754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404191
1021	NC_013223	T	6	6	68790	68795	0 %	100 %	0 %	0 %	258404191
1022	NC_013223	TC	3	6	69161	69166	0 %	50 %	0 %	50 %	258404192
1023	NC_013223	T	6	6	69224	69229	0 %	100 %	0 %	0 %	258404192
1024	NC_013223	TCCAG	2	10	69278	69287	20 %	20 %	20 %	40 %	258404192
1025	NC_013223	TCA	2	6	69313	69318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404192
1026	NC_013223	ACG	2	6	69349	69354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404192
1027	NC_013223	TCT	2	6	69466	69471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404192
1028	NC_013223	CGG	2	6	69504	69509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404192
1029	NC_013223	CGG	2	6	69528	69533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404192
1030	NC_013223	CGCGG	2	10	69554	69563	0 %	0 %	60 %	40 %	258404192
1031	NC_013223	GGA	2	6	69597	69602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404192
1032	NC_013223	GCT	2	6	69645	69650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404192
1033	NC_013223	CTG	2	6	69663	69668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404192
1034	NC_013223	GCG	2	6	69689	69694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404192
1035	NC_013223	GCC	2	6	69803	69808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404192
1036	NC_013223	CAT	2	6	69812	69817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404192
1037	NC_013223	GCT	2	6	69843	69848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404192
1038	NC_013223	GAGC	2	8	69906	69913	25 %	0 %	50 %	25 %	258404192
1039	NC_013223	TAT	2	6	69972	69977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404192
1040	NC_013223	T	7	7	69996	70002	0 %	100 %	0 %	0 %	258404192
1041	NC_013223	TAT	2	6	70008	70013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404192
1042	NC_013223	CGA	2	6	70557	70562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1043	NC_013223	CGC	2	6	70582	70587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404193
1044	NC_013223	ATG	2	6	70601	70606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404193
1045	NC_013223	GCA	2	6	70707	70712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1046	NC_013223	GCCG	2	8	70789	70796	0 %	0 %	50 %	50 %	258404193
1047	NC_013223	GC	4	8	70798	70805	0 %	0 %	50 %	50 %	258404193
1048	NC_013223	GCC	2	6	70855	70860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404193
1049	NC_013223	AGGC	2	8	70970	70977	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
1050	NC_013223	CAG	2	6	71017	71022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1051	NC_013223	GAAG	2	8	71069	71076	50 %	0 %	50 %	0 %	258404193
1052	NC_013223	AGC	2	6	71123	71128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1053	NC_013223	TGA	2	6	71184	71189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404193
1054	NC_013223	GCC	2	6	71206	71211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404193
1055	NC_013223	CGG	2	6	71274	71279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404193
1056	NC_013223	GTG	2	6	71303	71308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404193
1057	NC_013223	CAG	2	6	71335	71340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1058	NC_013223	CGG	2	6	71393	71398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404193
1059	NC_013223	GAT	2	6	71407	71412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404193
1060	NC_013223	CGA	2	6	71424	71429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1061	NC_013223	GGA	2	6	71430	71435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404193
1062	NC_013223	AAT	2	6	71437	71442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404193
1063	NC_013223	A	7	7	71583	71589	100 %	0 %	0 %	0 %	258404193
1064	NC_013223	GCAG	2	8	71600	71607	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
1065	NC_013223	CATGGC	2	12	71623	71634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404193
1066	NC_013223	CTC	2	6	73725	73730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404194
1067	NC_013223	GC	3	6	73770	73775	0 %	0 %	50 %	50 %	258404194
1068	NC_013223	TCG	2	6	73839	73844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1069	NC_013223	GCT	2	6	73940	73945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1070	NC_013223	AACG	2	8	74043	74050	50 %	0 %	25 %	25 %	258404194
1071	NC_013223	GT	3	6	74124	74129	0 %	50 %	50 %	0 %	258404194
1072	NC_013223	T	7	7	74145	74151	0 %	100 %	0 %	0 %	258404194
1073	NC_013223	GCA	2	6	74189	74194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1074	NC_013223	GCT	2	6	74197	74202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1075	NC_013223	T	6	6	74232	74237	0 %	100 %	0 %	0 %	258404194
1076	NC_013223	GGC	2	6	74247	74252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404194
1077	NC_013223	AG	3	6	74311	74316	50 %	0 %	50 %	0 %	258404194
1078	NC_013223	CGA	2	6	74504	74509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1079	NC_013223	GGC	2	6	74537	74542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404194
1080	NC_013223	GT	3	6	74556	74561	0 %	50 %	50 %	0 %	258404194
1081	NC_013223	CAA	2	6	74576	74581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404194
1082	NC_013223	GCA	2	6	74596	74601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404194
1083	NC_013223	GGT	2	6	74643	74648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404194
1084	NC_013223	ACG	2	6	74680	74685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404194
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1087	NC_013223	CCGG	2	8	75116	75123	0 %	0 %	50 %	50 %	258404195
1088	NC_013223	CCG	2	6	75163	75168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404195
1089	NC_013223	GCA	2	6	75187	75192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1090	NC_013223	CA	3	6	75191	75196	50 %	0 %	0 %	50 %	258404195
1091	NC_013223	CGC	2	6	75269	75274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404195
1092	NC_013223	CG	3	6	75280	75285	0 %	0 %	50 %	50 %	258404195
1093	NC_013223	TGC	2	6	75331	75336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1094	NC_013223	CGT	2	6	75353	75358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1095	NC_013223	CGTG	2	8	75422	75429	0 %	25 %	50 %	25 %	258404195
1096	NC_013223	CGG	2	6	75430	75435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404195
1097	NC_013223	TGA	2	6	75464	75469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404195
1098	NC_013223	TCG	2	6	75499	75504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1099	NC_013223	TGT	2	6	75538	75543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404195
1100	NC_013223	TGG	2	6	75544	75549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404195
1101	NC_013223	AGG	2	6	75599	75604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404195
1102	NC_013223	AT	3	6	75610	75615	50 %	50 %	0 %	0 %	258404195
1103	NC_013223	GGC	2	6	75653	75658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404195
1104	NC_013223	AGC	2	6	75680	75685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1105	NC_013223	GTC	2	6	75813	75818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1106	NC_013223	GCG	2	6	75822	75827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404195
1107	NC_013223	TTC	2	6	75900	75905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404195
1108	NC_013223	TCT	2	6	75928	75933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404195
1109	NC_013223	CGA	2	6	75941	75946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1110	NC_013223	T	6	6	75951	75956	0 %	100 %	0 %	0 %	258404195
1111	NC_013223	TCG	2	6	76099	76104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404195
1112	NC_013223	CCT	3	9	76259	76267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404195
1113	NC_013223	GAT	2	6	76491	76496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404195
1114	NC_013223	GGC	2	6	76530	76535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404195
1115	NC_013223	CGATGG	2	12	76568	76579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404195
1116	NC_013223	CGC	2	6	77199	77204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404196
1117	NC_013223	GGCA	2	8	77263	77270	25 %	0 %	50 %	25 %	258404196
1118	NC_013223	TGG	2	6	77356	77361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404196
1119	NC_013223	TTC	2	6	77428	77433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404196
1120	NC_013223	CAG	2	6	77484	77489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404196
1121	NC_013223	TGG	2	6	77491	77496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404196
1122	NC_013223	TTC	2	6	77505	77510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404196
1123	NC_013223	GTC	2	6	77538	77543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404196
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1125	NC_013223	GGGT	2	8	78049	78056	0 %	25 %	75 %	0 %	258404197
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1244	NC_013223	GGA	2	6	86945	86950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404205
1245	NC_013223	ATCGGG	2	12	87004	87015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404205
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1376	NC_013223	GGT	2	6	97127	97132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404212
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1380	NC_013223	CGT	2	6	97382	97387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404212
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1485	NC_013223	TGCCGG	2	12	103053	103064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404215
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1492	NC_013223	G	6	6	103362	103367	0 %	0 %	100 %	0 %	258404215
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1495	NC_013223	TCG	3	9	103550	103558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404215
1496	NC_013223	CCG	2	6	103670	103675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404216
1497	NC_013223	AGACCG	2	12	103706	103717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1498	NC_013223	TGG	2	6	103731	103736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404216
1499	NC_013223	TGG	2	6	103767	103772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404216
1500	NC_013223	CAGATC	2	12	103802	103813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258404216

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