MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013223	CGC	2	6	31275	31280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404166
502	NC_013223	TAC	2	6	31344	31349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404166
503	NC_013223	AT	3	6	31350	31355	50 %	50 %	0 %	0 %	258404166
504	NC_013223	GGC	2	6	31414	31419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404166
505	NC_013223	AGG	2	6	31628	31633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404166
506	NC_013223	CT	3	6	31717	31722	0 %	50 %	0 %	50 %	258404166
507	NC_013223	A	6	6	31761	31766	100 %	0 %	0 %	0 %	258404166
508	NC_013223	TGT	2	6	31821	31826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404166
509	NC_013223	GGC	2	6	32032	32037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404167
510	NC_013223	GGA	2	6	32044	32049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404167
511	NC_013223	GGT	2	6	32059	32064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404167
512	NC_013223	GGT	2	6	32119	32124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404167
513	NC_013223	GCA	2	6	32159	32164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404167
514	NC_013223	GTC	2	6	32267	32272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404167
515	NC_013223	CGT	2	6	32448	32453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404167
516	NC_013223	TCGGGG	2	12	32496	32507	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258404167
517	NC_013223	G	6	6	32543	32548	0 %	0 %	100 %	0 %	258404167
518	NC_013223	GGC	2	6	32642	32647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404167
519	NC_013223	AAG	2	6	32669	32674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404167
520	NC_013223	GGT	2	6	32897	32902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404168
521	NC_013223	CTG	2	6	33464	33469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
522	NC_013223	CCGG	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
523	NC_013223	GCC	2	6	33552	33557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
524	NC_013223	TCC	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404169
525	NC_013223	GCT	2	6	33752	33757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
526	NC_013223	T	7	7	33770	33776	0 %	100 %	0 %	0 %	258404169
527	NC_013223	GCGG	2	8	33801	33808	0 %	0 %	75 %	25 %	258404169
528	NC_013223	CGC	2	6	33846	33851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
529	NC_013223	GTG	2	6	33852	33857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404169
530	NC_013223	TTG	2	6	33873	33878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404169
531	NC_013223	ATC	2	6	33912	33917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404169
532	NC_013223	GC	3	6	34099	34104	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
533	NC_013223	GCG	2	6	34124	34129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404169
534	NC_013223	GGT	2	6	34175	34180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404169
535	NC_013223	TG	3	6	34186	34191	0 %	50 %	50 %	0 %	258404169
536	NC_013223	GCG	3	9	34282	34290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404169
537	NC_013223	GCC	2	6	34331	34336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404169
538	NC_013223	TGC	2	6	34393	34398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404169
539	NC_013223	GGA	2	6	34406	34411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404169
540	NC_013223	GGT	2	6	34471	34476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404170
541	NC_013223	GGC	2	6	34492	34497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
542	NC_013223	GGC	2	6	34506	34511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
543	NC_013223	GCGG	2	8	34590	34597	0 %	0 %	75 %	25 %	258404170
544	NC_013223	G	8	8	34609	34616	0 %	0 %	100 %	0 %	258404170
545	NC_013223	GCG	3	9	34633	34641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
546	NC_013223	GGT	2	6	34681	34686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404170
547	NC_013223	GGAC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	50 %	25 %	258404170
548	NC_013223	GGCT	2	8	34739	34746	0 %	25 %	50 %	25 %	258404170
549	NC_013223	GAG	2	6	34781	34786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
550	NC_013223	ATC	2	6	34809	34814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404170
551	NC_013223	CG	3	6	34819	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	258404170
552	NC_013223	GGA	2	6	34831	34836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
553	NC_013223	GCG	2	6	34842	34847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
554	NC_013223	TGC	2	6	34899	34904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404170
555	NC_013223	GGC	2	6	35026	35031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404170
556	NC_013223	CGT	2	6	35047	35052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404170
557	NC_013223	TTG	2	6	35054	35059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404170
558	NC_013223	AGG	2	6	35061	35066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404170
559	NC_013223	GCC	2	6	35086	35091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404170
560	NC_013223	GA	3	6	35094	35099	50 %	0 %	50 %	0 %	258404170
561	NC_013223	AATAA	2	10	35205	35214	80 %	20 %	0 %	0 %	258404170
562	NC_013223	C	6	6	35461	35466	0 %	0 %	0 %	100 %	258404171
563	NC_013223	TCCT	2	8	35487	35494	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
564	NC_013223	CCG	2	6	35498	35503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
565	NC_013223	GCC	2	6	35625	35630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
566	NC_013223	CGA	2	6	35735	35740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404171
567	NC_013223	CTG	2	6	35782	35787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404171
568	NC_013223	GCC	2	6	35814	35819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
569	NC_013223	AGC	2	6	35902	35907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404171
570	NC_013223	TC	3	6	35996	36001	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
571	NC_013223	GGCGG	2	10	36042	36051	0 %	0 %	80 %	20 %	258404171
572	NC_013223	CGG	2	6	36081	36086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404171
573	NC_013223	CGG	2	6	36104	36109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404171
574	NC_013223	CGA	2	6	36203	36208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404171
575	NC_013223	GCC	3	9	36327	36335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
576	NC_013223	AGGC	2	8	36352	36359	25 %	0 %	50 %	25 %	258404171
577	NC_013223	CCG	2	6	36438	36443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404171
578	NC_013223	ACCC	2	8	36463	36470	25 %	0 %	0 %	75 %	258404171
579	NC_013223	GGCTGA	2	12	36530	36541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404171
580	NC_013223	GAAAT	2	10	36592	36601	60 %	20 %	20 %	0 %	258404171
581	NC_013223	A	8	8	36606	36613	100 %	0 %	0 %	0 %	258404171
582	NC_013223	CGA	2	6	36638	36643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404171
583	NC_013223	GCTGG	2	10	36664	36673	0 %	20 %	60 %	20 %	258404171
584	NC_013223	ACAA	2	8	36683	36690	75 %	0 %	0 %	25 %	258404171
585	NC_013223	A	7	7	37289	37295	100 %	0 %	0 %	0 %	258404172
586	NC_013223	ACG	2	6	37494	37499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404172
587	NC_013223	GAA	2	6	37597	37602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404172
588	NC_013223	ACG	2	6	37605	37610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404172
589	NC_013223	CGG	2	6	37642	37647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404172
590	NC_013223	GC	3	6	37657	37662	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
591	NC_013223	CGAC	2	8	37669	37676	25 %	0 %	25 %	50 %	258404172
592	NC_013223	TTC	2	6	37738	37743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404172
593	NC_013223	GGA	2	6	37747	37752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404172
594	NC_013223	CTG	2	6	37790	37795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404172
595	NC_013223	CGG	2	6	37822	37827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404172
596	NC_013223	CG	3	6	37863	37868	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
597	NC_013223	CGC	2	6	37945	37950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404172
598	NC_013223	TGC	2	6	37956	37961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404172
599	NC_013223	GCC	2	6	37999	38004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404172
600	NC_013223	AC	3	6	38020	38025	50 %	0 %	0 %	50 %	258404172
601	NC_013223	CAA	2	6	38041	38046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404172
602	NC_013223	ACC	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404172
603	NC_013223	A	6	6	38306	38311	100 %	0 %	0 %	0 %	258404172
604	NC_013223	GGA	2	6	38365	38370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404172
605	NC_013223	GGC	2	6	38555	38560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404172
606	NC_013223	TCG	2	6	38631	38636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404172
607	NC_013223	T	6	6	38653	38658	0 %	100 %	0 %	0 %	258404172
608	NC_013223	CGG	2	6	38713	38718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404172
609	NC_013223	TGC	2	6	38733	38738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404172
610	NC_013223	GAA	2	6	38828	38833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404172
611	NC_013223	CCGG	2	8	38878	38885	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
612	NC_013223	TCA	2	6	38901	38906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404172
613	NC_013223	GCCGAG	2	12	39014	39025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404172
614	NC_013223	TCG	2	6	39036	39041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404172
615	NC_013223	TGA	2	6	39094	39099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404172
616	NC_013223	GAG	2	6	39149	39154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404172
617	NC_013223	TCT	2	6	39159	39164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404172
618	NC_013223	AGA	2	6	39404	39409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404173
619	NC_013223	TCA	2	6	39707	39712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404173
620	NC_013223	CA	3	6	39730	39735	50 %	0 %	0 %	50 %	258404173
621	NC_013223	CG	3	6	39837	39842	0 %	0 %	50 %	50 %	258404173
622	NC_013223	ATC	2	6	39844	39849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404173
623	NC_013223	TAT	2	6	39901	39906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404173
624	NC_013223	CTGG	2	8	39990	39997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404173
625	NC_013223	CCAA	2	8	40154	40161	50 %	0 %	0 %	50 %	258404173
626	NC_013223	GGCGAC	2	12	40189	40200	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404173
627	NC_013223	TGGA	2	8	40255	40262	25 %	25 %	50 %	0 %	258404173
628	NC_013223	CCGG	2	8	40309	40316	0 %	0 %	50 %	50 %	258404173
629	NC_013223	CGG	2	6	40444	40449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404173
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