MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013223	GTG	2	6	388796	388801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404452
6002	NC_013223	GAA	2	6	388865	388870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404452
6003	NC_013223	GGAGCA	2	12	388876	388887	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258404452
6004	NC_013223	TAC	2	6	388916	388921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404452
6005	NC_013223	TGG	2	6	388965	388970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404452
6006	NC_013223	GAT	2	6	388999	389004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404452
6007	NC_013223	CCGG	2	8	389022	389029	0 %	0 %	50 %	50 %	258404452
6008	NC_013223	A	6	6	389063	389068	100 %	0 %	0 %	0 %	258404452
6009	NC_013223	CGG	2	6	389125	389130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404452
6010	NC_013223	CTG	2	6	389152	389157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404452
6011	NC_013223	TGT	2	6	389262	389267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404452
6012	NC_013223	CCG	2	6	389406	389411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404452
6013	NC_013223	AGGAAC	2	12	389418	389429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258404452
6014	NC_013223	GAG	2	6	389438	389443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404452
6015	NC_013223	GCA	2	6	389482	389487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404452
6016	NC_013223	CGCCTG	2	12	389526	389537	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258404452
6017	NC_013223	A	6	6	389619	389624	100 %	0 %	0 %	0 %	258404452
6018	NC_013223	A	8	8	389658	389665	100 %	0 %	0 %	0 %	258404452
6019	NC_013223	AGG	2	6	389721	389726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404452
6020	NC_013223	TTA	2	6	389998	390003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404453
6021	NC_013223	TAT	2	6	390020	390025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404453
6022	NC_013223	T	6	6	390116	390121	0 %	100 %	0 %	0 %	258404453
6023	NC_013223	CGA	2	6	390133	390138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6024	NC_013223	CAG	2	6	390208	390213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6025	NC_013223	CAG	2	6	390221	390226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6026	NC_013223	GCA	2	6	390310	390315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6027	NC_013223	CGG	2	6	390352	390357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404453
6028	NC_013223	TAT	2	6	390359	390364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404453
6029	NC_013223	TCG	2	6	390402	390407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6030	NC_013223	ATT	2	6	390459	390464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404453
6031	NC_013223	CTGG	2	8	390490	390497	0 %	25 %	50 %	25 %	258404453
6032	NC_013223	CGA	2	6	390580	390585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6033	NC_013223	GAC	2	6	390641	390646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6034	NC_013223	TGG	2	6	390753	390758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404453
6035	NC_013223	TCT	2	6	390786	390791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404453
6036	NC_013223	C	6	6	390903	390908	0 %	0 %	0 %	100 %	258404453
6037	NC_013223	GAA	2	6	390995	391000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404453
6038	NC_013223	GGC	2	6	391088	391093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404453
6039	NC_013223	GGA	2	6	391117	391122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404453
6040	NC_013223	GC	3	6	391153	391158	0 %	0 %	50 %	50 %	258404453
6041	NC_013223	CCTTTG	2	12	391188	391199	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258404453
6042	NC_013223	AATA	2	8	391241	391248	75 %	25 %	0 %	0 %	258404453
6043	NC_013223	CCGA	2	8	391409	391416	25 %	0 %	25 %	50 %	258404453
6044	NC_013223	CGGA	2	8	391423	391430	25 %	0 %	50 %	25 %	258404453
6045	NC_013223	GGA	3	9	391435	391443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404453
6046	NC_013223	A	6	6	391487	391492	100 %	0 %	0 %	0 %	258404453
6047	NC_013223	AAGA	2	8	391526	391533	75 %	0 %	25 %	0 %	258404453
6048	NC_013223	A	6	6	391574	391579	100 %	0 %	0 %	0 %	258404453
6049	NC_013223	TGG	2	6	391650	391655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404453
6050	NC_013223	GCA	2	6	391667	391672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6051	NC_013223	TTGCAA	2	12	391700	391711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258404453
6052	NC_013223	GAA	2	6	391724	391729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404453
6053	NC_013223	GGT	2	6	391741	391746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404453
6054	NC_013223	GGT	2	6	391780	391785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404453
6055	NC_013223	GCA	2	6	391789	391794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404453
6056	NC_013223	TGG	2	6	391803	391808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404453
6057	NC_013223	AGTT	2	8	391931	391938	25 %	50 %	25 %	0 %	258404453
6058	NC_013223	CCG	2	6	392396	392401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6059	NC_013223	GGCTT	2	10	392603	392612	0 %	40 %	40 %	20 %	258404454
6060	NC_013223	CCG	2	6	392681	392686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6061	NC_013223	GCT	2	6	392796	392801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404454
6062	NC_013223	GCC	2	6	392828	392833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6063	NC_013223	GCC	2	6	392855	392860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6064	NC_013223	GGAA	2	8	392892	392899	50 %	0 %	50 %	0 %	258404454
6065	NC_013223	GCCC	2	8	392935	392942	0 %	0 %	25 %	75 %	258404454
6066	NC_013223	CGC	2	6	393024	393029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6067	NC_013223	G	6	6	393049	393054	0 %	0 %	100 %	0 %	258404454
6068	NC_013223	GAT	2	6	393088	393093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404454
6069	NC_013223	CGA	2	6	393138	393143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404454
6070	NC_013223	AGG	2	6	393197	393202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404454
6071	NC_013223	TCC	2	6	393428	393433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404454
6072	NC_013223	ATGATC	2	12	393455	393466	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258404454
6073	NC_013223	CAG	2	6	393517	393522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404454
6074	NC_013223	GCC	2	6	393548	393553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404454
6075	NC_013223	A	6	6	393578	393583	100 %	0 %	0 %	0 %	258404454
6076	NC_013223	GAT	2	6	393790	393795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404454
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6079	NC_013223	AGCG	2	8	393939	393946	25 %	0 %	50 %	25 %	258404454
6080	NC_013223	CGGT	2	8	393953	393960	0 %	25 %	50 %	25 %	258404454
6081	NC_013223	CGA	2	6	394296	394301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404454
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6086	NC_013223	TGC	2	6	394469	394474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404454
6087	NC_013223	TCC	2	6	394563	394568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404455
6088	NC_013223	GTT	2	6	394598	394603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404455
6089	NC_013223	GCG	2	6	394734	394739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404455
6090	NC_013223	GAT	2	6	394745	394750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404455
6091	NC_013223	GC	3	6	394755	394760	0 %	0 %	50 %	50 %	258404455
6092	NC_013223	TCA	2	6	394801	394806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404455
6093	NC_013223	TGG	2	6	394820	394825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404456
6094	NC_013223	GGT	2	6	394839	394844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404456
6095	NC_013223	AGG	2	6	394907	394912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404456
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6098	NC_013223	CGATGA	2	12	394958	394969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258404456
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6102	NC_013223	ATT	2	6	395796	395801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404458
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6105	NC_013223	CGG	2	6	395860	395865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404458
6106	NC_013223	GAG	2	6	396024	396029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404458
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6108	NC_013223	GGA	2	6	396122	396127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404458
6109	NC_013223	GGC	2	6	396155	396160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404458
6110	NC_013223	TCA	2	6	396253	396258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404458
6111	NC_013223	GACC	2	8	396335	396342	25 %	0 %	25 %	50 %	258404458
6112	NC_013223	CGG	2	6	396404	396409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404458
6113	NC_013223	TGG	2	6	396451	396456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404458
6114	NC_013223	TTC	2	6	396485	396490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404458
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6116	NC_013223	T	6	6	396680	396685	0 %	100 %	0 %	0 %	258404458
6117	NC_013223	GGCC	2	8	396782	396789	0 %	0 %	50 %	50 %	258404458
6118	NC_013223	GCA	2	6	396950	396955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404458
6119	NC_013223	GAA	2	6	397038	397043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404458
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6121	NC_013223	GCG	2	6	397179	397184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404458
6122	NC_013223	TAT	3	9	397206	397214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404458
6123	NC_013223	TGC	2	6	397320	397325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404458
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6130	NC_013223	GGT	2	6	397712	397717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404458
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6225	NC_013223	TGCA	2	8	403982	403989	25 %	25 %	25 %	25 %	258404462
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6240	NC_013223	ATCT	2	8	404522	404529	25 %	50 %	0 %	25 %	258404462
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6242	NC_013223	GGC	2	6	404608	404613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404462
6243	NC_013223	GCC	2	6	404672	404677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404462
6244	NC_013223	GCG	2	6	404756	404761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404462
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6352	NC_013223	G	7	7	411435	411441	0 %	0 %	100 %	0 %	258404467
6353	NC_013223	GAG	2	6	411500	411505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404467
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6356	NC_013223	CAA	2	6	411712	411717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404467
6357	NC_013223	AT	3	6	411751	411756	50 %	50 %	0 %	0 %	258404467
6358	NC_013223	TC	3	6	411783	411788	0 %	50 %	0 %	50 %	258404467
6359	NC_013223	CGGG	2	8	411793	411800	0 %	0 %	75 %	25 %	258404467
6360	NC_013223	AGG	2	6	411888	411893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404467
6361	NC_013223	GAA	2	6	411910	411915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404467
6362	NC_013223	TATTTT	2	12	412509	412520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	258404468
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6364	NC_013223	ATCGCT	2	12	412533	412544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258404468
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6485	NC_013223	A	6	6	419472	419477	100 %	0 %	0 %	0 %	258404472
6486	NC_013223	GCTG	2	8	419900	419907	0 %	25 %	50 %	25 %	258404473
6487	NC_013223	CGA	2	6	419963	419968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404473
6488	NC_013223	GAA	2	6	419985	419990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404473
6489	NC_013223	GGC	2	6	420008	420013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404473
6490	NC_013223	GGAGC	2	10	420033	420042	20 %	0 %	60 %	20 %	258404473
6491	NC_013223	GCA	2	6	420083	420088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404473
6492	NC_013223	A	6	6	420093	420098	100 %	0 %	0 %	0 %	258404473
6493	NC_013223	T	7	7	420175	420181	0 %	100 %	0 %	0 %	258404474
6494	NC_013223	GAG	2	6	420261	420266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404474
6495	NC_013223	CCG	2	6	420412	420417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404475
6496	NC_013223	CTG	2	6	420444	420449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404475
6497	NC_013223	TAT	2	6	420455	420460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404475
6498	NC_013223	TGGA	2	8	420660	420667	25 %	25 %	50 %	0 %	258404476
6499	NC_013223	CCAG	2	8	420729	420736	25 %	0 %	25 %	50 %	258404476
6500	NC_013223	TG	3	6	420818	420823	0 %	50 %	50 %	0 %	258404476

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