MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio salexigens DSM 2638 chromosome

Total Repeats: 2441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012881	TTTTC	2	10	1070	1079	0 %	80 %	0 %	20 %	242277484
2	NC_012881	GTGAT	2	10	2591	2600	20 %	40 %	40 %	0 %	242277486
3	NC_012881	GAAGA	2	10	3055	3064	60 %	0 %	40 %	0 %	242277486
4	NC_012881	GGGCA	2	10	3875	3884	20 %	0 %	60 %	20 %	242277487
5	NC_012881	GTTCC	2	10	4266	4275	0 %	40 %	20 %	40 %	242277487
6	NC_012881	CAGAG	2	10	4408	4417	40 %	0 %	40 %	20 %	242277487
7	NC_012881	TGCTG	2	10	6109	6118	0 %	40 %	40 %	20 %	242277490
8	NC_012881	AGGGC	2	10	6482	6491	20 %	0 %	60 %	20 %	242277490
9	NC_012881	ATGCC	2	10	9088	9097	20 %	20 %	20 %	40 %	242277494
10	NC_012881	CGGTC	2	10	9353	9362	0 %	20 %	40 %	40 %	242277494
11	NC_012881	AGCAG	2	10	10255	10264	40 %	0 %	40 %	20 %	242277495
12	NC_012881	GAAAA	2	10	10807	10816	80 %	0 %	20 %	0 %	242277495
13	NC_012881	AGGAA	2	10	12214	12223	60 %	0 %	40 %	0 %	242277496
14	NC_012881	GGATA	2	10	17246	17255	40 %	20 %	40 %	0 %	242277500
15	NC_012881	ATGAT	2	10	18876	18885	40 %	40 %	20 %	0 %	242277502
16	NC_012881	TCCGG	2	10	19943	19952	0 %	20 %	40 %	40 %	242277503
17	NC_012881	ATATT	2	10	20623	20632	40 %	60 %	0 %	0 %	242277504
18	NC_012881	ATTCC	2	10	23636	23645	20 %	40 %	0 %	40 %	242277506
19	NC_012881	ACCGG	2	10	24329	24338	20 %	0 %	40 %	40 %	242277507
20	NC_012881	GACCT	2	10	26343	26352	20 %	20 %	20 %	40 %	242277509
21	NC_012881	TGGCA	2	10	26555	26564	20 %	20 %	40 %	20 %	242277509
22	NC_012881	GACAG	2	10	28797	28806	40 %	0 %	40 %	20 %	242277512
23	NC_012881	TGCGC	2	10	30318	30327	0 %	20 %	40 %	40 %	242277514
24	NC_012881	TTTCC	2	10	31144	31153	0 %	60 %	0 %	40 %	242277514
25	NC_012881	TTTCA	2	10	32240	32249	20 %	60 %	0 %	20 %	242277514
26	NC_012881	GTTTT	2	10	32589	32598	0 %	80 %	20 %	0 %	242277514
27	NC_012881	TTGGT	2	10	35624	35633	0 %	60 %	40 %	0 %	242277518
28	NC_012881	TTTCT	2	10	37902	37911	0 %	80 %	0 %	20 %	242277519
29	NC_012881	TTCCG	2	10	43901	43910	0 %	40 %	20 %	40 %	242277523
30	NC_012881	CCGTA	2	10	48994	49003	20 %	20 %	20 %	40 %	242277527
31	NC_012881	GCAGA	2	10	52233	52242	40 %	0 %	40 %	20 %	242277531
32	NC_012881	CTATG	2	10	54895	54904	20 %	40 %	20 %	20 %	242277532
33	NC_012881	GTATC	2	10	55728	55737	20 %	40 %	20 %	20 %	242277534
34	NC_012881	TTTTC	2	10	56166	56175	0 %	80 %	0 %	20 %	242277535
35	NC_012881	CATTC	2	10	56283	56292	20 %	40 %	0 %	40 %	242277535
36	NC_012881	CTGCA	2	10	56957	56966	20 %	20 %	20 %	40 %	242277536
37	NC_012881	CCGCA	2	10	57313	57322	20 %	0 %	20 %	60 %	242277536
38	NC_012881	GAATG	2	10	58751	58760	40 %	20 %	40 %	0 %	242277538
39	NC_012881	CAAAA	2	10	71886	71895	80 %	0 %	0 %	20 %	242277548
40	NC_012881	TCCGG	2	10	72283	72292	0 %	20 %	40 %	40 %	242277549
41	NC_012881	GCCCT	2	10	73214	73223	0 %	20 %	20 %	60 %	242277550
42	NC_012881	CTGAG	2	10	73427	73436	20 %	20 %	40 %	20 %	242277551
43	NC_012881	GAAAA	2	10	74430	74439	80 %	0 %	20 %	0 %	242277552
44	NC_012881	CCAGC	2	10	75374	75383	20 %	0 %	20 %	60 %	242277552
45	NC_012881	GATCA	2	10	77184	77193	40 %	20 %	20 %	20 %	242277552
46	NC_012881	TACAA	2	10	78580	78589	60 %	20 %	0 %	20 %	242277554
47	NC_012881	TGTCC	2	10	80915	80924	0 %	40 %	20 %	40 %	242277556
48	NC_012881	GACAG	2	10	81076	81085	40 %	0 %	40 %	20 %	242277556
49	NC_012881	TGCCT	2	10	85354	85363	0 %	40 %	20 %	40 %	242277560
50	NC_012881	CAGCC	2	10	91130	91139	20 %	0 %	20 %	60 %	242277564
51	NC_012881	TCTTT	2	10	93158	93167	0 %	80 %	0 %	20 %	242277566
52	NC_012881	AGCGG	2	10	94263	94272	20 %	0 %	60 %	20 %	242277566
53	NC_012881	TCCAA	2	10	94311	94320	40 %	20 %	0 %	40 %	242277566
54	NC_012881	ATTTC	2	10	94624	94633	20 %	60 %	0 %	20 %	242277567
55	NC_012881	TTATC	2	10	96885	96894	20 %	60 %	0 %	20 %	242277572
56	NC_012881	GTGAT	2	10	99047	99056	20 %	40 %	40 %	0 %	242277573
57	NC_012881	GCAGC	2	10	104140	104149	20 %	0 %	40 %	40 %	242277578
58	NC_012881	TGAGT	2	10	105277	105286	20 %	40 %	40 %	0 %	242277578
59	NC_012881	GTTGC	2	10	105849	105858	0 %	40 %	40 %	20 %	242277578
60	NC_012881	TCCGG	2	10	106017	106026	0 %	20 %	40 %	40 %	242277578
61	NC_012881	ACTGT	2	10	106210	106219	20 %	40 %	20 %	20 %	242277578
62	NC_012881	TGTTC	2	10	107085	107094	0 %	60 %	20 %	20 %	242277579
63	NC_012881	AAAGA	2	10	108645	108654	80 %	0 %	20 %	0 %	242277579
64	NC_012881	CCTTT	2	10	109258	109267	0 %	60 %	0 %	40 %	242277580
65	NC_012881	TCATT	2	10	117287	117296	20 %	60 %	0 %	20 %	242277588
66	NC_012881	CGTAT	2	10	117570	117579	20 %	40 %	20 %	20 %	242277589
67	NC_012881	GGAAA	2	10	118574	118583	60 %	0 %	40 %	0 %	242277591
68	NC_012881	GGTGC	2	10	119717	119726	0 %	20 %	60 %	20 %	242277592
69	NC_012881	TTCTT	2	10	122119	122128	0 %	80 %	0 %	20 %	242277593
70	NC_012881	AATCC	2	10	123803	123812	40 %	20 %	0 %	40 %	242277596
71	NC_012881	GGCGC	2	10	124535	124544	0 %	0 %	60 %	40 %	242277596
72	NC_012881	GAAAA	2	10	125169	125178	80 %	0 %	20 %	0 %	242277597
73	NC_012881	AGTTC	2	10	125511	125520	20 %	40 %	20 %	20 %	242277597
74	NC_012881	AATGG	2	10	128857	128866	40 %	20 %	40 %	0 %	242277600
75	NC_012881	GGGTT	2	10	129009	129018	0 %	40 %	60 %	0 %	242277601
76	NC_012881	CTTTC	2	10	129630	129639	0 %	60 %	0 %	40 %	242277601
77	NC_012881	AGCTC	2	10	130706	130715	20 %	20 %	20 %	40 %	242277602
78	NC_012881	GAATA	2	10	131158	131167	60 %	20 %	20 %	0 %	242277602
79	NC_012881	TGAAC	2	10	134081	134090	40 %	20 %	20 %	20 %	242277605
80	NC_012881	ATTTT	2	10	134644	134653	20 %	80 %	0 %	0 %	242277605
81	NC_012881	CTTTT	2	10	136549	136558	0 %	80 %	0 %	20 %	242277606
82	NC_012881	GGTGC	2	10	136886	136895	0 %	20 %	60 %	20 %	242277606
83	NC_012881	TGTCG	2	10	137441	137450	0 %	40 %	40 %	20 %	242277606
84	NC_012881	TTTCT	2	10	139120	139129	0 %	80 %	0 %	20 %	242277606
85	NC_012881	AGGCA	2	10	142009	142018	40 %	0 %	40 %	20 %	242277607
86	NC_012881	TGAAC	2	10	142826	142835	40 %	20 %	20 %	20 %	242277608
87	NC_012881	GGGGC	2	10	146426	146435	0 %	0 %	80 %	20 %	242277610
88	NC_012881	CGATG	2	10	148605	148614	20 %	20 %	40 %	20 %	242277614
89	NC_012881	TGCAG	2	10	151060	151069	20 %	20 %	40 %	20 %	242277616
90	NC_012881	CAGGT	2	10	151914	151923	20 %	20 %	40 %	20 %	242277617
91	NC_012881	AAAAT	2	10	156363	156372	80 %	20 %	0 %	0 %	242277623
92	NC_012881	GAATT	2	10	156572	156581	40 %	40 %	20 %	0 %	242277623
93	NC_012881	TGGAT	2	10	156862	156871	20 %	40 %	40 %	0 %	242277623
94	NC_012881	AACGG	2	10	157247	157256	40 %	0 %	40 %	20 %	242277623
95	NC_012881	TGGGT	2	10	157484	157493	0 %	40 %	60 %	0 %	242277624
96	NC_012881	GATGT	2	10	160097	160106	20 %	40 %	40 %	0 %	242277626
97	NC_012881	CCTTT	2	10	161204	161213	0 %	60 %	0 %	40 %	242277627
98	NC_012881	TGCGC	2	10	161712	161721	0 %	20 %	40 %	40 %	242277627
99	NC_012881	AGCAA	2	10	164247	164256	60 %	0 %	20 %	20 %	242277630
100	NC_012881	CGGAC	2	10	167610	167619	20 %	0 %	40 %	40 %	242277633
101	NC_012881	CCCGT	2	10	168650	168659	0 %	20 %	20 %	60 %	242277633
102	NC_012881	TTTCT	2	10	169553	169562	0 %	80 %	0 %	20 %	242277634
103	NC_012881	CAGTA	2	10	171885	171894	40 %	20 %	20 %	20 %	242277636
104	NC_012881	CCGGT	2	10	175759	175768	0 %	20 %	40 %	40 %	242277640
105	NC_012881	AGGTC	2	10	176234	176243	20 %	20 %	40 %	20 %	242277641
106	NC_012881	TTCCT	2	10	176523	176532	0 %	60 %	0 %	40 %	242277641
107	NC_012881	AGGAC	2	10	176771	176780	40 %	0 %	40 %	20 %	242277641
108	NC_012881	CGTGC	2	10	176826	176835	0 %	20 %	40 %	40 %	242277641
109	NC_012881	TGACC	2	10	180292	180301	20 %	20 %	20 %	40 %	242277644
110	NC_012881	TCATT	2	10	181211	181220	20 %	60 %	0 %	20 %	242277645
111	NC_012881	CCATT	2	10	183303	183312	20 %	40 %	0 %	40 %	242277647
112	NC_012881	ATTCC	2	10	183836	183845	20 %	40 %	0 %	40 %	242277647
113	NC_012881	ACCGG	2	10	185391	185400	20 %	0 %	40 %	40 %	242277649
114	NC_012881	TGCAG	2	10	188414	188423	20 %	20 %	40 %	20 %	242277652
115	NC_012881	AAGCG	2	10	189168	189177	40 %	0 %	40 %	20 %	242277652
116	NC_012881	TTTTC	2	10	190499	190508	0 %	80 %	0 %	20 %	242277653
117	NC_012881	CAGCA	2	10	194932	194941	40 %	0 %	20 %	40 %	242277658
118	NC_012881	ATCAA	2	10	196437	196446	60 %	20 %	0 %	20 %	242277659
119	NC_012881	TAGGA	2	10	204604	204613	40 %	20 %	40 %	0 %	242277667
120	NC_012881	CATGC	2	10	209842	209851	20 %	20 %	20 %	40 %	242277673
121	NC_012881	TGTCT	2	10	212958	212967	0 %	60 %	20 %	20 %	242277677
122	NC_012881	GGAGG	2	10	217641	217650	20 %	0 %	80 %	0 %	242277684
123	NC_012881	ATTGG	2	10	221171	221180	20 %	40 %	40 %	0 %	242277687
124	NC_012881	GGAAG	2	10	223057	223066	40 %	0 %	60 %	0 %	242277689
125	NC_012881	GAACT	2	10	224818	224827	40 %	20 %	20 %	20 %	242277690
126	NC_012881	GGTCA	2	10	235116	235125	20 %	20 %	40 %	20 %	242277700
127	NC_012881	GCTCC	2	10	235300	235309	0 %	20 %	20 %	60 %	242277700
128	NC_012881	TTTTC	2	10	237473	237482	0 %	80 %	0 %	20 %	242277701
129	NC_012881	GCTCT	2	10	237922	237931	0 %	40 %	20 %	40 %	242277701
130	NC_012881	GCAGT	2	10	238887	238896	20 %	20 %	40 %	20 %	242277702
131	NC_012881	CATTG	2	10	241751	241760	20 %	40 %	20 %	20 %	242277704
132	NC_012881	AACTG	2	10	245100	245109	40 %	20 %	20 %	20 %	242277706
133	NC_012881	GCAGA	2	10	246360	246369	40 %	0 %	40 %	20 %	242277707
134	NC_012881	TCCGG	2	10	246534	246543	0 %	20 %	40 %	40 %	242277707
135	NC_012881	AAGGT	2	10	248333	248342	40 %	20 %	40 %	0 %	242277708
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150	NC_012881	TTGCC	2	10	268050	268059	0 %	40 %	20 %	40 %	242277726
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259	NC_012881	CCGGA	2	10	472306	472315	20 %	0 %	40 %	40 %	242277910
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261	NC_012881	GATTG	2	10	475412	475421	20 %	40 %	40 %	0 %	242277912
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