MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	CGACGG	2	12	229	240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239835335
2	NC_012797	TTGGCC	2	12	5144	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835339
3	NC_012797	CCTGGG	2	12	5271	5282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239835339
4	NC_012797	GGCCAA	2	12	9535	9546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835345
5	NC_012797	TTGGCC	2	12	17806	17817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835353
6	NC_012797	CCTGGG	2	12	17933	17944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239835353
7	NC_012797	GGCCAA	2	12	20258	20269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835356
8	NC_012797	AGACTC	2	12	20901	20912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239835357
9	NC_012797	GGCCGA	2	12	24545	24556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239835361
10	NC_012797	CGGCCA	2	12	27606	27617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239835364
11	NC_012797	TTCCTG	2	12	28710	28721	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239835365
12	NC_012797	TCGAGG	2	12	29143	29154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239835365
13	NC_012797	CGCCCA	2	12	30397	30408	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239835367
14	NC_012797	GCCCTG	2	12	30605	30616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239835367
15	NC_012797	CGCATG	2	12	32186	32197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239835368
16	NC_012797	TCGACC	2	12	32526	32537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239835368
17	NC_012797	TGGCTG	2	12	33408	33419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239835370
18	NC_012797	ATTTTC	2	12	36647	36658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239835372
19	NC_012797	GCCCTG	3	18	36740	36757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239835372
20	NC_012797	CTTCGC	2	12	38951	38962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	239835374
21	NC_012797	CGTTGG	2	12	44946	44957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239835386
22	NC_012797	CCCAAG	2	12	48567	48578	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	239835391
23	NC_012797	ACACCG	2	12	50170	50181	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	239835391
24	NC_012797	ACATCG	2	12	53406	53417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239835394
25	NC_012797	GGCCGC	2	12	54470	54481	0 %	0 %	50 %	50 %	239835395
26	NC_012797	GCCGAA	2	12	54684	54695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835395
27	NC_012797	CCGAGG	2	12	55281	55292	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239835396
28	NC_012797	CGGGGC	2	12	55633	55644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835396

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.