MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012797	GAT	2	6	50981	50986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835392
1002	NC_012797	ATG	2	6	51030	51035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835392
1003	NC_012797	GCCG	2	8	51098	51105	0 %	0 %	50 %	50 %	239835392
1004	NC_012797	GTT	2	6	51136	51141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239835393
1005	NC_012797	CCCG	2	8	51209	51216	0 %	0 %	25 %	75 %	239835393
1006	NC_012797	GTC	2	6	51271	51276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1007	NC_012797	GGC	2	6	51301	51306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835393
1008	NC_012797	AAGC	2	8	51307	51314	50 %	0 %	25 %	25 %	239835393
1009	NC_012797	CGT	2	6	51351	51356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1010	NC_012797	A	6	6	51409	51414	100 %	0 %	0 %	0 %	239835393
1011	NC_012797	GGA	2	6	51454	51459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835393
1012	NC_012797	TCA	2	6	51468	51473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835393
1013	NC_012797	GCA	2	6	51489	51494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1014	NC_012797	CGC	2	6	51594	51599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835393
1015	NC_012797	AAC	2	6	51620	51625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835393
1016	NC_012797	CGC	2	6	51657	51662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835393
1017	NC_012797	GC	3	6	51776	51781	0 %	0 %	50 %	50 %	239835393
1018	NC_012797	CGT	2	6	51789	51794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1019	NC_012797	CGT	2	6	51885	51890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1020	NC_012797	CGG	2	6	51942	51947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835393
1021	NC_012797	GTC	2	6	52057	52062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1022	NC_012797	GCC	2	6	52076	52081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835393
1023	NC_012797	GTC	2	6	52108	52113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1024	NC_012797	TGGCC	2	10	52152	52161	0 %	20 %	40 %	40 %	239835393
1025	NC_012797	GCGCA	2	10	52181	52190	20 %	0 %	40 %	40 %	239835393
1026	NC_012797	ACG	2	6	52271	52276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835393
1027	NC_012797	GCC	2	6	52310	52315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835393
1028	NC_012797	ATC	2	6	52748	52753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835394
1029	NC_012797	CAA	3	9	52762	52770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835394
1030	NC_012797	G	6	6	52771	52776	0 %	0 %	100 %	0 %	239835394
1031	NC_012797	TGG	3	9	52842	52850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835394
1032	NC_012797	CCA	2	6	52971	52976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835394
1033	NC_012797	GCT	2	6	53074	53079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835394
1034	NC_012797	ATC	2	6	53117	53122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835394
1035	NC_012797	CGC	2	6	53127	53132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835394
1036	NC_012797	TGC	2	6	53148	53153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835394
1037	NC_012797	AGC	2	6	53259	53264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835394
1038	NC_012797	AAG	2	6	53270	53275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835394
1039	NC_012797	GTG	2	6	53291	53296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835394
1040	NC_012797	GGCCG	2	10	53312	53321	0 %	0 %	60 %	40 %	239835394
1041	NC_012797	AAG	2	6	53330	53335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835394
1042	NC_012797	ACATCG	2	12	53406	53417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239835394
1043	NC_012797	CCA	2	6	53460	53465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835394
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1045	NC_012797	CCG	2	6	53562	53567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835395
1046	NC_012797	CG	3	6	53566	53571	0 %	0 %	50 %	50 %	239835395
1047	NC_012797	GGC	2	6	53597	53602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835395
1048	NC_012797	CGG	2	6	53644	53649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835395
1049	NC_012797	TC	3	6	53683	53688	0 %	50 %	0 %	50 %	239835395
1050	NC_012797	AGCC	2	8	53689	53696	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1051	NC_012797	CAGC	2	8	53712	53719	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1052	NC_012797	AAC	2	6	53722	53727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835395
1053	NC_012797	CCG	2	6	53736	53741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835395
1054	NC_012797	CAGC	2	8	53744	53751	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1055	NC_012797	CCAG	3	12	53759	53770	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1056	NC_012797	CA	4	8	53780	53787	50 %	0 %	0 %	50 %	239835395
1057	NC_012797	AGCC	2	8	53801	53808	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1058	NC_012797	ACA	2	6	53835	53840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835395
1059	NC_012797	GGGCC	2	10	53936	53945	0 %	0 %	60 %	40 %	239835395
1060	NC_012797	CCA	2	6	54001	54006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835395
1061	NC_012797	GCG	2	6	54080	54085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835395
1062	NC_012797	GTC	2	6	54168	54173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835395
1063	NC_012797	ACA	2	6	54219	54224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835395
1064	NC_012797	ATC	2	6	54230	54235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835395
1065	NC_012797	AAAC	2	8	54244	54251	75 %	0 %	0 %	25 %	239835395
1066	NC_012797	AGCC	2	8	54297	54304	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1067	NC_012797	CAGC	2	8	54328	54335	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
1068	NC_012797	CA	3	6	54336	54341	50 %	0 %	0 %	50 %	239835395
1069	NC_012797	AGA	2	6	54358	54363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835395
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1072	NC_012797	GGCCGC	2	12	54470	54481	0 %	0 %	50 %	50 %	239835395
1073	NC_012797	CCGAG	2	10	54536	54545	20 %	0 %	40 %	40 %	239835395
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1089	NC_012797	GTG	2	6	55229	55234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835396
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1096	NC_012797	GC	3	6	55482	55487	0 %	0 %	50 %	50 %	239835396
1097	NC_012797	GACCT	2	10	55589	55598	20 %	20 %	20 %	40 %	239835396
1098	NC_012797	GT	3	6	55625	55630	0 %	50 %	50 %	0 %	239835396
1099	NC_012797	CGGGGC	2	12	55633	55644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835396
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1105	NC_012797	GC	3	6	56022	56027	0 %	0 %	50 %	50 %	239835396
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1109	NC_012797	GCG	2	6	56130	56135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835396
1110	NC_012797	ACG	2	6	56136	56141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835396
1111	NC_012797	CAG	2	6	56219	56224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835396
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