MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012797	CGA	2	6	25829	25834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835361
502	NC_012797	CGT	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835361
503	NC_012797	CGA	2	6	25863	25868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835362
504	NC_012797	CGC	2	6	25880	25885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835362
505	NC_012797	TTA	2	6	25923	25928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239835362
506	NC_012797	CTG	2	6	25952	25957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835362
507	NC_012797	TGG	2	6	25979	25984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835362
508	NC_012797	AGG	2	6	25993	25998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835362
509	NC_012797	CGA	2	6	26140	26145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835362
510	NC_012797	CCAG	2	8	26202	26209	25 %	0 %	25 %	50 %	239835362
511	NC_012797	GAC	2	6	26252	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835362
512	NC_012797	GCC	2	6	26263	26268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835362
513	NC_012797	CTTC	2	8	26290	26297	0 %	50 %	0 %	50 %	239835362
514	NC_012797	CAA	2	6	26305	26310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835362
515	NC_012797	CAG	2	6	26344	26349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835363
516	NC_012797	T	6	6	26369	26374	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
517	NC_012797	GGC	2	6	26375	26380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835363
518	NC_012797	CTGG	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	239835363
519	NC_012797	GGC	2	6	26414	26419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835363
520	NC_012797	T	7	7	26479	26485	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
521	NC_012797	CCG	2	6	26553	26558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835363
522	NC_012797	TCC	2	6	26568	26573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239835363
523	NC_012797	CAC	2	6	26606	26611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835363
524	NC_012797	GCA	2	6	26706	26711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835363
525	NC_012797	TCG	2	6	26721	26726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835363
526	NC_012797	CCG	3	9	26787	26795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835363
527	NC_012797	GCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835363
528	NC_012797	CGC	2	6	26873	26878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835363
529	NC_012797	ACC	2	6	26892	26897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835363
530	NC_012797	CAT	2	6	26917	26922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835363
531	NC_012797	GAAG	2	8	26971	26978	50 %	0 %	50 %	0 %	239835363
532	NC_012797	CTG	2	6	26981	26986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835363
533	NC_012797	CGA	2	6	27007	27012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835363
534	NC_012797	CTC	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239835363
535	NC_012797	CGC	2	6	27070	27075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835363
536	NC_012797	ACG	2	6	27114	27119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835363
537	NC_012797	CGG	4	12	27184	27195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835363
538	NC_012797	TGC	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835363
539	NC_012797	CTG	2	6	27257	27262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835363
540	NC_012797	TGC	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835363
541	NC_012797	T	6	6	27303	27308	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
542	NC_012797	CCG	2	6	27315	27320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835363
543	NC_012797	G	6	6	27400	27405	0 %	0 %	100 %	0 %	239835363
544	NC_012797	TGC	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835364
545	NC_012797	CGC	2	6	27549	27554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835364
546	NC_012797	CGA	2	6	27579	27584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835364
547	NC_012797	ACC	2	6	27599	27604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835364
548	NC_012797	CGGCCA	2	12	27606	27617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239835364
549	NC_012797	GCT	2	6	27680	27685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835364
550	NC_012797	GGC	2	6	27688	27693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835364
551	NC_012797	CGG	2	6	27696	27701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835364
552	NC_012797	CTC	2	6	27744	27749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239835364
553	NC_012797	GGC	3	9	27757	27765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835364
554	NC_012797	CCAG	2	8	27812	27819	25 %	0 %	25 %	50 %	239835364
555	NC_012797	CGA	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835364
556	NC_012797	GGA	2	6	27921	27926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835364
557	NC_012797	ACG	2	6	28034	28039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835364
558	NC_012797	GGC	2	6	28065	28070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835364
559	NC_012797	CAT	2	6	28128	28133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835364
560	NC_012797	CGA	2	6	28286	28291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835364
561	NC_012797	CGG	2	6	28295	28300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835364
562	NC_012797	ACG	2	6	28346	28351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835364
563	NC_012797	CGC	3	9	28472	28480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
564	NC_012797	CGA	2	6	28514	28519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835365
565	NC_012797	CGA	2	6	28547	28552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835365
566	NC_012797	AACG	2	8	28602	28609	50 %	0 %	25 %	25 %	239835365
567	NC_012797	TTCCTG	2	12	28710	28721	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239835365
568	NC_012797	CGC	2	6	28745	28750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
569	NC_012797	CGG	2	6	28831	28836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835365
570	NC_012797	ACG	2	6	28912	28917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835365
571	NC_012797	GCC	2	6	28935	28940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
572	NC_012797	GAC	2	6	28947	28952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835365
573	NC_012797	ATC	2	6	28965	28970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835365
574	NC_012797	ACC	2	6	28972	28977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835365
575	NC_012797	GCC	2	6	29076	29081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
576	NC_012797	GGC	2	6	29111	29116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835365
577	NC_012797	TCGAGG	2	12	29143	29154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239835365
578	NC_012797	GCA	2	6	29167	29172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835365
579	NC_012797	GAG	2	6	29187	29192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835365
580	NC_012797	CT	3	6	29204	29209	0 %	50 %	0 %	50 %	239835365
581	NC_012797	TGG	3	9	29227	29235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835365
582	NC_012797	CGG	2	6	29255	29260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835365
583	NC_012797	GCC	2	6	29277	29282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
584	NC_012797	CGGC	2	8	29356	29363	0 %	0 %	50 %	50 %	239835365
585	NC_012797	GCC	2	6	29376	29381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835365
586	NC_012797	GCG	2	6	29417	29422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835365
587	NC_012797	ACG	2	6	29473	29478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835366
588	NC_012797	CGG	3	9	29495	29503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835366
589	NC_012797	GC	3	6	29528	29533	0 %	0 %	50 %	50 %	239835366
590	NC_012797	GCC	2	6	29601	29606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835366
591	NC_012797	CGG	2	6	29654	29659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835366
592	NC_012797	CCAC	2	8	29728	29735	25 %	0 %	0 %	75 %	239835366
593	NC_012797	CGC	2	6	29751	29756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835366
594	NC_012797	CTG	2	6	29792	29797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835366
595	NC_012797	GAG	2	6	29829	29834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835366
596	NC_012797	CCA	2	6	29860	29865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835366
597	NC_012797	CCA	2	6	29956	29961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835366
598	NC_012797	CGA	2	6	29978	29983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835366
599	NC_012797	GCT	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835366
600	NC_012797	CGC	2	6	30035	30040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835366
601	NC_012797	CGA	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835366
602	NC_012797	CGA	2	6	30155	30160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835366
603	NC_012797	CGG	2	6	30179	30184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835366
604	NC_012797	TC	3	6	30191	30196	0 %	50 %	0 %	50 %	239835366
605	NC_012797	GGC	2	6	30209	30214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835366
606	NC_012797	GTC	2	6	30228	30233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835366
607	NC_012797	GC	3	6	30244	30249	0 %	0 %	50 %	50 %	239835366
608	NC_012797	ATG	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835366
609	NC_012797	CTG	2	6	30309	30314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835366
610	NC_012797	TACC	2	8	30362	30369	25 %	25 %	0 %	50 %	239835366
611	NC_012797	CGCCCA	2	12	30397	30408	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239835367
612	NC_012797	C	8	8	30457	30464	0 %	0 %	0 %	100 %	239835367
613	NC_012797	TCA	2	6	30477	30482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835367
614	NC_012797	GAA	2	6	30536	30541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835367
615	NC_012797	GCT	2	6	30553	30558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835367
616	NC_012797	GCCCTG	2	12	30605	30616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239835367
617	NC_012797	TGC	2	6	30621	30626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835367
618	NC_012797	TCA	2	6	30657	30662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835367
619	NC_012797	CAT	2	6	30802	30807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835367
620	NC_012797	CGG	2	6	30831	30836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835367
621	NC_012797	CAT	2	6	30847	30852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835367
622	NC_012797	CGC	2	6	30859	30864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835367
623	NC_012797	GTG	2	6	30881	30886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835367
624	NC_012797	CGC	2	6	30892	30897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835367
625	NC_012797	CAT	2	6	30979	30984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835367
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