MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012529	CGC	2	6	160644	160649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358140
3002	NC_012529	TGG	2	6	160680	160685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358140
3003	NC_012529	GCA	2	6	160691	160696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358140
3004	NC_012529	CTG	2	6	160787	160792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
3005	NC_012529	GCG	2	6	160831	160836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358140
3006	NC_012529	GGT	2	6	160864	160869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358140
3007	NC_012529	CTG	2	6	160886	160891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
3008	NC_012529	CTG	2	6	160910	160915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
3009	NC_012529	AGCC	2	8	160934	160941	25 %	0 %	25 %	50 %	226358140
3010	NC_012529	GAG	2	6	160946	160951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358140
3011	NC_012529	GGC	2	6	160966	160971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358140
3012	NC_012529	ATC	2	6	161126	161131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358140
3013	NC_012529	CGG	2	6	161140	161145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358140
3014	NC_012529	AGG	2	6	161166	161171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358140
3015	NC_012529	CG	3	6	161202	161207	0 %	0 %	50 %	50 %	226358140
3016	NC_012529	ACC	3	9	161446	161454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358141
3017	NC_012529	CGG	2	6	161479	161484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358141
3018	NC_012529	CGG	2	6	161486	161491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358141
3019	NC_012529	AGC	2	6	161533	161538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358141
3020	NC_012529	CAGG	2	8	161546	161553	25 %	0 %	50 %	25 %	226358141
3021	NC_012529	CAG	3	9	161688	161696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358141
3022	NC_012529	CCG	2	6	161728	161733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3023	NC_012529	GAAGGT	2	12	161767	161778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	226358142
3024	NC_012529	GCC	2	6	161815	161820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3025	NC_012529	GT	3	6	161871	161876	0 %	50 %	50 %	0 %	226358142
3026	NC_012529	CTG	3	9	162128	162136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3027	NC_012529	ACC	2	6	162170	162175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358142
3028	NC_012529	AG	3	6	162182	162187	50 %	0 %	50 %	0 %	226358142
3029	NC_012529	CGA	2	6	162194	162199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3030	NC_012529	CCG	2	6	162204	162209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3031	NC_012529	AGC	2	6	162218	162223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3032	NC_012529	ATC	2	6	162290	162295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358142
3033	NC_012529	TCG	2	6	162308	162313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3034	NC_012529	AAC	2	6	162338	162343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358142
3035	NC_012529	GAC	2	6	162454	162459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3036	NC_012529	GCT	2	6	162479	162484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3037	NC_012529	CTT	2	6	162510	162515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358142
3038	NC_012529	GCG	2	6	162580	162585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3039	NC_012529	G	6	6	162613	162618	0 %	0 %	100 %	0 %	226358142
3040	NC_012529	GTC	2	6	162641	162646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3041	NC_012529	CAG	2	6	162703	162708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3042	NC_012529	GCCT	2	8	162785	162792	0 %	25 %	25 %	50 %	226358142
3043	NC_012529	AGC	2	6	162806	162811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3044	NC_012529	GGAC	2	8	162823	162830	25 %	0 %	50 %	25 %	226358142
3045	NC_012529	CGC	2	6	162879	162884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3046	NC_012529	GC	3	6	162887	162892	0 %	0 %	50 %	50 %	226358142
3047	NC_012529	GGC	2	6	162952	162957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3048	NC_012529	TG	3	6	162969	162974	0 %	50 %	50 %	0 %	226358142
3049	NC_012529	GC	3	6	163016	163021	0 %	0 %	50 %	50 %	226358142
3050	NC_012529	GACCTG	2	12	163027	163038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3051	NC_012529	GCC	2	6	163050	163055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3052	NC_012529	CAC	2	6	163090	163095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358142
3053	NC_012529	TGA	2	6	163109	163114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358142
3054	NC_012529	CCGT	2	8	163135	163142	0 %	25 %	25 %	50 %	226358142
3055	NC_012529	TGC	2	6	163215	163220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3056	NC_012529	CGC	2	6	163230	163235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3057	NC_012529	GCA	2	6	163317	163322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3058	NC_012529	GTC	2	6	163399	163404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3059	NC_012529	GCG	2	6	163405	163410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3060	NC_012529	GCC	2	6	163499	163504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3061	NC_012529	GCA	2	6	163509	163514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3062	NC_012529	CGGTG	2	10	163626	163635	0 %	20 %	60 %	20 %	226358142
3063	NC_012529	G	6	6	163720	163725	0 %	0 %	100 %	0 %	226358142
3064	NC_012529	AGG	2	6	163763	163768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3065	NC_012529	AGG	2	6	163790	163795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3066	NC_012529	GCG	2	6	163796	163801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3067	NC_012529	GGA	2	6	163839	163844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3068	NC_012529	CAG	2	6	163870	163875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3069	NC_012529	GCTCGC	2	12	163914	163925	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	226358142
3070	NC_012529	GGT	2	6	163933	163938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358142
3071	NC_012529	GGTC	2	8	163942	163949	0 %	25 %	50 %	25 %	226358142
3072	NC_012529	GGTG	2	8	163960	163967	0 %	25 %	75 %	0 %	226358142
3073	NC_012529	CG	4	8	164045	164052	0 %	0 %	50 %	50 %	226358143
3074	NC_012529	ACC	2	6	164059	164064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358143
3075	NC_012529	TCCGG	2	10	164127	164136	0 %	20 %	40 %	40 %	226358143
3076	NC_012529	GCC	2	6	164160	164165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358143
3077	NC_012529	GCCG	2	8	164201	164208	0 %	0 %	50 %	50 %	226358143
3078	NC_012529	GCCC	2	8	164216	164223	0 %	0 %	25 %	75 %	226358143
3079	NC_012529	G	7	7	164285	164291	0 %	0 %	100 %	0 %	226358143
3080	NC_012529	CAG	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358143
3081	NC_012529	ACC	2	6	164419	164424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358143
3082	NC_012529	GTG	2	6	164505	164510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358143
3083	NC_012529	GT	3	6	164685	164690	0 %	50 %	50 %	0 %	226358144
3084	NC_012529	TCC	2	6	164698	164703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358144
3085	NC_012529	CCAGG	2	10	164774	164783	20 %	0 %	40 %	40 %	226358144
3086	NC_012529	ACAT	2	8	164847	164854	50 %	25 %	0 %	25 %	226358144
3087	NC_012529	ACG	2	6	164862	164867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3088	NC_012529	CCG	2	6	164868	164873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358144
3089	NC_012529	GCA	2	6	164878	164883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3090	NC_012529	CCGGG	2	10	164906	164915	0 %	0 %	60 %	40 %	226358144
3091	NC_012529	CGG	2	6	164941	164946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358144
3092	NC_012529	CGT	2	6	164953	164958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3093	NC_012529	GCA	2	6	165043	165048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3094	NC_012529	CAG	2	6	165064	165069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3095	NC_012529	GCG	2	6	165090	165095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358144
3096	NC_012529	CCAG	2	8	165133	165140	25 %	0 %	25 %	50 %	226358144
3097	NC_012529	GCCT	2	8	165157	165164	0 %	25 %	25 %	50 %	226358144
3098	NC_012529	AGC	2	6	165216	165221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3099	NC_012529	CAGGGT	2	12	165290	165301	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226358144
3100	NC_012529	TCC	2	6	165604	165609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358145
3101	NC_012529	GCC	2	6	165614	165619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3102	NC_012529	TGA	2	6	165636	165641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358145
3103	NC_012529	GCT	2	6	165676	165681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3104	NC_012529	CGG	2	6	165689	165694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3105	NC_012529	GCC	2	6	165722	165727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3106	NC_012529	CGA	2	6	165739	165744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3107	NC_012529	TGG	2	6	165794	165799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358145
3108	NC_012529	GAC	2	6	165959	165964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3109	NC_012529	CGG	2	6	165980	165985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3110	NC_012529	CGG	2	6	166021	166026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3111	NC_012529	CA	3	6	166041	166046	50 %	0 %	0 %	50 %	226358145
3112	NC_012529	CGGG	2	8	166126	166133	0 %	0 %	75 %	25 %	226358145
3113	NC_012529	GCT	2	6	166150	166155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3114	NC_012529	CA	3	6	166171	166176	50 %	0 %	0 %	50 %	226358145
3115	NC_012529	TG	3	6	166233	166238	0 %	50 %	50 %	0 %	226358145
3116	NC_012529	GCC	2	6	166316	166321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3117	NC_012529	GCAC	2	8	166322	166329	25 %	0 %	25 %	50 %	226358145
3118	NC_012529	GCC	2	6	166396	166401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3119	NC_012529	GCT	2	6	166417	166422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3120	NC_012529	TTC	2	6	166444	166449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358145
3121	NC_012529	AGC	2	6	166482	166487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3122	NC_012529	CCA	2	6	166573	166578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358146
3123	NC_012529	GGCA	2	8	166614	166621	25 %	0 %	50 %	25 %	226358146
3124	NC_012529	ACGC	2	8	166719	166726	25 %	0 %	25 %	50 %	226358146
3125	NC_012529	TCA	2	6	166760	166765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358146
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3132	NC_012529	TTCG	2	8	167223	167230	0 %	50 %	25 %	25 %	226358146
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3237	NC_012529	GCA	2	6	170970	170975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358149
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3239	NC_012529	CAG	2	6	171010	171015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358149
3240	NC_012529	GCG	2	6	171027	171032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358149
3241	NC_012529	GGCG	2	8	171043	171050	0 %	0 %	75 %	25 %	226358149
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3243	NC_012529	CAT	2	6	171088	171093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358149
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3364	NC_012529	TTC	2	6	176918	176923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358154
3365	NC_012529	GAC	2	6	177011	177016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358154
3366	NC_012529	T	6	6	177185	177190	0 %	100 %	0 %	0 %	226358154
3367	NC_012529	GCT	2	6	177259	177264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358154
3368	NC_012529	CAT	2	6	177344	177349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358154
3369	NC_012529	GTG	2	6	177359	177364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358154
3370	NC_012529	TAC	2	6	177395	177400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358154
3371	NC_012529	CCCG	2	8	177408	177415	0 %	0 %	25 %	75 %	226358154
3372	NC_012529	CAG	2	6	177455	177460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358154
3373	NC_012529	CTA	2	6	177502	177507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358154
3374	NC_012529	GGT	2	6	177520	177525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358154
3375	NC_012529	ACG	2	6	177695	177700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358155
3376	NC_012529	CTG	2	6	177811	177816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358155
3377	NC_012529	CAT	2	6	177841	177846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358155
3378	NC_012529	GCT	2	6	177861	177866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358155
3379	NC_012529	TGG	2	6	177887	177892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358155
3380	NC_012529	GAA	2	6	177916	177921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358155
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3382	NC_012529	CTG	2	6	178000	178005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358155
3383	NC_012529	CGC	2	6	178006	178011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358155
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3385	NC_012529	GGGAC	2	10	178062	178071	20 %	0 %	60 %	20 %	226358155
3386	NC_012529	T	6	6	178134	178139	0 %	100 %	0 %	0 %	226358155
3387	NC_012529	CCTC	2	8	178153	178160	0 %	25 %	0 %	75 %	226358155
3388	NC_012529	GCA	2	6	178179	178184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358155
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3391	NC_012529	CGCTG	2	10	178278	178287	0 %	20 %	40 %	40 %	226358155
3392	NC_012529	CGG	2	6	178375	178380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358155
3393	NC_012529	TAC	2	6	178381	178386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358155
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3396	NC_012529	TGA	2	6	178553	178558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358156
3397	NC_012529	GTGG	2	8	178595	178602	0 %	25 %	75 %	0 %	226358156
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3400	NC_012529	GGC	2	6	178725	178730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358156
3401	NC_012529	GTC	2	6	178735	178740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358156
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3403	NC_012529	AATCC	2	10	178775	178784	40 %	20 %	0 %	40 %	226358156
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3407	NC_012529	TGC	3	9	178904	178912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358156
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3415	NC_012529	TGG	2	6	180167	180172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358157
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3421	NC_012529	TTTTGA	2	12	180261	180272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226358157
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3424	NC_012529	CAG	2	6	180421	180426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358157
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3429	NC_012529	AGT	2	6	180597	180602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358157
3430	NC_012529	TCGA	2	8	180640	180647	25 %	25 %	25 %	25 %	226358157
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3435	NC_012529	TGTGGC	2	12	180771	180782	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226358157
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3437	NC_012529	CAT	2	6	180885	180890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358157
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3442	NC_012529	ACA	2	6	181052	181057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358157
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3444	NC_012529	GCC	2	6	181075	181080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358157
3445	NC_012529	GGC	3	9	181153	181161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358157
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3452	NC_012529	GTC	2	6	181414	181419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358157
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3470	NC_012529	CCG	2	6	182178	182183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358157
3471	NC_012529	GCTG	2	8	182211	182218	0 %	25 %	50 %	25 %	226358157
3472	NC_012529	GGA	2	6	182247	182252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358157
3473	NC_012529	GCG	2	6	182315	182320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358157
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3477	NC_012529	CTG	2	6	182413	182418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358157
3478	NC_012529	GCA	2	6	182442	182447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358157
3479	NC_012529	GC	3	6	182546	182551	0 %	0 %	50 %	50 %	355004724
3480	NC_012529	CAT	2	6	182557	182562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	355004724
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3482	NC_012529	CAG	2	6	182597	182602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004724
3483	NC_012529	CGC	2	6	182605	182610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	355004724
3484	NC_012529	GGC	2	6	182689	182694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	355004724
3485	NC_012529	GGA	2	6	182707	182712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	355004724
3486	NC_012529	CGGCT	2	10	182737	182746	0 %	20 %	40 %	40 %	355004724
3487	NC_012529	CTG	2	6	182864	182869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004724
3488	NC_012529	CTG	2	6	182885	182890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004724
3489	NC_012529	TG	3	6	182937	182942	0 %	50 %	50 %	0 %	355004724
3490	NC_012529	GCC	2	6	183032	183037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	355004724
3491	NC_012529	GAT	2	6	183169	183174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	355004724
3492	NC_012529	GCCG	2	8	183179	183186	0 %	0 %	50 %	50 %	355004724
3493	NC_012529	CGG	2	6	183265	183270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	355004724
3494	NC_012529	GCTGG	2	10	183307	183316	0 %	20 %	60 %	20 %	355004724
3495	NC_012529	AGG	3	9	183393	183401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	355004724
3496	NC_012529	GGT	2	6	183468	183473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358159
3497	NC_012529	CG	3	6	183493	183498	0 %	0 %	50 %	50 %	226358159
3498	NC_012529	GAAG	2	8	183506	183513	50 %	0 %	50 %	0 %	226358159
3499	NC_012529	ATG	2	6	183831	183836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358159
3500	NC_012529	CCTGG	2	10	183903	183912	0 %	20 %	40 %	40 %	226358159

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