MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012529	GCTC	2	8	134579	134586	0 %	25 %	25 %	50 %	226358123
2502	NC_012529	GCA	2	6	134591	134596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2503	NC_012529	CG	3	6	134665	134670	0 %	0 %	50 %	50 %	226358123
2504	NC_012529	GCC	2	6	134718	134723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358123
2505	NC_012529	CT	3	6	134746	134751	0 %	50 %	0 %	50 %	226358123
2506	NC_012529	AGGT	2	8	134764	134771	25 %	25 %	50 %	0 %	226358123
2507	NC_012529	C	6	6	134784	134789	0 %	0 %	0 %	100 %	226358123
2508	NC_012529	CTGC	2	8	134891	134898	0 %	25 %	25 %	50 %	226358123
2509	NC_012529	CCG	3	9	134900	134908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358123
2510	NC_012529	GCCA	2	8	134995	135002	25 %	0 %	25 %	50 %	226358123
2511	NC_012529	GCT	2	6	135008	135013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2512	NC_012529	GCG	2	6	135014	135019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358123
2513	NC_012529	GAA	2	6	135057	135062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358123
2514	NC_012529	CG	4	8	135104	135111	0 %	0 %	50 %	50 %	226358123
2515	NC_012529	CAGGC	2	10	135183	135192	20 %	0 %	40 %	40 %	226358123
2516	NC_012529	TGA	2	6	136067	136072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358124
2517	NC_012529	AGC	2	6	136104	136109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2518	NC_012529	CAG	2	6	136174	136179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2519	NC_012529	AGC	3	9	136191	136199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2520	NC_012529	TGC	2	6	136221	136226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2521	NC_012529	GCT	2	6	136393	136398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2522	NC_012529	CGC	2	6	136479	136484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358124
2523	NC_012529	TTG	2	6	136502	136507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226358124
2524	NC_012529	CGG	2	6	136510	136515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358124
2525	NC_012529	TGGC	2	8	136567	136574	0 %	25 %	50 %	25 %	226358124
2526	NC_012529	AC	3	6	136579	136584	50 %	0 %	0 %	50 %	226358124
2527	NC_012529	CTGG	2	8	136764	136771	0 %	25 %	50 %	25 %	226358124
2528	NC_012529	CGGCT	2	10	136831	136840	0 %	20 %	40 %	40 %	226358124
2529	NC_012529	GGA	2	6	136866	136871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358124
2530	NC_012529	TGGT	2	8	136880	136887	0 %	50 %	50 %	0 %	226358124
2531	NC_012529	TGA	2	6	136890	136895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358124
2532	NC_012529	CAG	2	6	136963	136968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2533	NC_012529	GCA	2	6	136986	136991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2534	NC_012529	CTG	2	6	137012	137017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2535	NC_012529	GCT	2	6	137025	137030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358124
2536	NC_012529	CT	3	6	137081	137086	0 %	50 %	0 %	50 %	226358124
2537	NC_012529	CTGC	2	8	137213	137220	0 %	25 %	25 %	50 %	226358125
2538	NC_012529	CGC	2	6	137226	137231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358125
2539	NC_012529	GGT	2	6	137308	137313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358125
2540	NC_012529	CTG	2	6	137335	137340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2541	NC_012529	AAGGC	2	10	137372	137381	40 %	0 %	40 %	20 %	226358125
2542	NC_012529	CG	3	6	137475	137480	0 %	0 %	50 %	50 %	226358125
2543	NC_012529	GAC	2	6	137617	137622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2544	NC_012529	GC	3	6	137673	137678	0 %	0 %	50 %	50 %	226358125
2545	NC_012529	CCA	2	6	137711	137716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2546	NC_012529	CGG	2	6	137721	137726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2547	NC_012529	CGGC	2	8	137802	137809	0 %	0 %	50 %	50 %	226358125
2548	NC_012529	AGC	2	6	137835	137840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2549	NC_012529	TAC	2	6	137890	137895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358125
2550	NC_012529	TTC	2	6	137906	137911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358125
2551	NC_012529	ACG	3	9	137923	137931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2552	NC_012529	GAC	2	6	138015	138020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2553	NC_012529	CGG	2	6	138038	138043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2554	NC_012529	CCA	2	6	138087	138092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2555	NC_012529	CAG	2	6	138105	138110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2556	NC_012529	TC	3	6	138134	138139	0 %	50 %	0 %	50 %	226358125
2557	NC_012529	CG	3	6	138140	138145	0 %	0 %	50 %	50 %	226358125
2558	NC_012529	TCGT	2	8	138158	138165	0 %	50 %	25 %	25 %	226358125
2559	NC_012529	GCC	2	6	138262	138267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358125
2560	NC_012529	TAC	2	6	138425	138430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358125
2561	NC_012529	GGCAGC	2	12	138445	138456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226358125
2562	NC_012529	GAG	2	6	138520	138525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358125
2563	NC_012529	ACC	2	6	138536	138541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2564	NC_012529	TCA	2	6	138560	138565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358125
2565	NC_012529	GGC	2	6	138567	138572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2566	NC_012529	TGC	2	6	138578	138583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2567	NC_012529	CAC	2	6	138612	138617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2568	NC_012529	GAC	2	6	138678	138683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2569	NC_012529	CAC	2	6	138684	138689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2570	NC_012529	AAT	2	6	138772	138777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226358125
2571	NC_012529	TCC	2	6	138784	138789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358125
2572	NC_012529	GAG	3	9	138923	138931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358125
2573	NC_012529	CCGG	2	8	138937	138944	0 %	0 %	50 %	50 %	226358125
2574	NC_012529	CAA	2	6	138948	138953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358125
2575	NC_012529	CGG	2	6	138981	138986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2576	NC_012529	GAAG	2	8	139014	139021	50 %	0 %	50 %	0 %	226358125
2577	NC_012529	CTG	2	6	139039	139044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2578	NC_012529	TCT	2	6	139142	139147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358125
2579	NC_012529	CGG	2	6	139172	139177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2580	NC_012529	CGGCAG	2	12	139194	139205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226358125
2581	NC_012529	CCGC	2	8	139334	139341	0 %	0 %	25 %	75 %	226358125
2582	NC_012529	GCC	2	6	139348	139353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358125
2583	NC_012529	GGT	2	6	139425	139430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358125
2584	NC_012529	GTC	2	6	139431	139436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2585	NC_012529	TCT	2	6	139501	139506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358125
2586	NC_012529	G	6	6	139541	139546	0 %	0 %	100 %	0 %	226358125
2587	NC_012529	AGCG	2	8	139611	139618	25 %	0 %	50 %	25 %	226358125
2588	NC_012529	ATACCG	2	12	139646	139657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226358125
2589	NC_012529	ACC	2	6	139777	139782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
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2591	NC_012529	GCC	2	6	139886	139891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358125
2592	NC_012529	TGC	2	6	139929	139934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2593	NC_012529	TCAGGT	2	12	139978	139989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226358125
2594	NC_012529	CGT	3	9	139992	140000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2595	NC_012529	GGAG	2	8	140013	140020	25 %	0 %	75 %	0 %	226358125
2596	NC_012529	ACC	2	6	140083	140088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358125
2597	NC_012529	CAG	3	9	140130	140138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2598	NC_012529	GCG	2	6	140174	140179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2599	NC_012529	GCG	2	6	140228	140233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2600	NC_012529	AAC	2	6	140238	140243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358125
2601	NC_012529	GGC	2	6	140248	140253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2602	NC_012529	TC	3	6	140312	140317	0 %	50 %	0 %	50 %	226358125
2603	NC_012529	GAC	2	6	140340	140345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2604	NC_012529	TCA	2	6	140375	140380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358125
2605	NC_012529	T	6	6	140457	140462	0 %	100 %	0 %	0 %	226358125
2606	NC_012529	CGG	2	6	140480	140485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358125
2607	NC_012529	CAG	2	6	140487	140492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2608	NC_012529	CTG	2	6	140615	140620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358125
2609	NC_012529	GCA	2	6	140779	140784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358126
2610	NC_012529	TGC	2	6	140839	140844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358126
2611	NC_012529	GCC	2	6	140862	140867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358126
2612	NC_012529	CAG	2	6	141003	141008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358126
2613	NC_012529	GCT	2	6	141020	141025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358126
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2615	NC_012529	GGC	2	6	141110	141115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358126
2616	NC_012529	CTG	4	12	141309	141320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358126
2617	NC_012529	GCG	2	6	141437	141442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358126
2618	NC_012529	GCC	2	6	141615	141620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358126
2619	NC_012529	CAG	2	6	141659	141664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358126
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2621	NC_012529	ACG	2	6	141703	141708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358126
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2738	NC_012529	AACC	2	8	147098	147105	50 %	0 %	0 %	50 %	226358131
2739	NC_012529	TGC	2	6	147124	147129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358131
2740	NC_012529	CTG	2	6	147144	147149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358131
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2982	NC_012529	GCC	2	6	159687	159692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358139
2983	NC_012529	GGC	2	6	159704	159709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358139
2984	NC_012529	CAG	2	6	159744	159749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358139
2985	NC_012529	GGC	2	6	159967	159972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358140
2986	NC_012529	AGG	2	6	159984	159989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358140
2987	NC_012529	GC	4	8	160034	160041	0 %	0 %	50 %	50 %	226358140
2988	NC_012529	CTG	2	6	160052	160057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2989	NC_012529	CAG	2	6	160111	160116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2990	NC_012529	GAC	2	6	160148	160153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2991	NC_012529	GCG	2	6	160180	160185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358140
2992	NC_012529	TTC	2	6	160193	160198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358140
2993	NC_012529	GGT	2	6	160264	160269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358140
2994	NC_012529	GGCC	2	8	160301	160308	0 %	0 %	50 %	50 %	226358140
2995	NC_012529	GTCCTG	2	12	160316	160327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2996	NC_012529	ACG	2	6	160479	160484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2997	NC_012529	GCA	2	6	160495	160500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358140
2998	NC_012529	GCTGA	2	10	160502	160511	20 %	20 %	40 %	20 %	226358140
2999	NC_012529	CTG	2	6	160622	160627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358140
3000	NC_012529	CGC	2	6	160628	160633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358140

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