MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012529	CCGGT	2	10	111911	111920	0 %	20 %	40 %	40 %	226358106
2002	NC_012529	CAG	2	6	111928	111933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2003	NC_012529	GCGTTC	2	12	111940	111951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2004	NC_012529	GCT	3	9	112122	112130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2005	NC_012529	GC	3	6	112188	112193	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2006	NC_012529	GCC	2	6	112216	112221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358106
2007	NC_012529	CGA	2	6	112233	112238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2008	NC_012529	GC	3	6	112242	112247	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2009	NC_012529	CCG	3	9	112311	112319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358106
2010	NC_012529	CG	3	6	112318	112323	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2011	NC_012529	GCC	2	6	112364	112369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358106
2012	NC_012529	TGC	2	6	112397	112402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2013	NC_012529	CTG	2	6	112408	112413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2014	NC_012529	GGC	2	6	112474	112479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358106
2015	NC_012529	TTC	2	6	112537	112542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358106
2016	NC_012529	AGC	2	6	112562	112567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2017	NC_012529	TGC	2	6	112568	112573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2018	NC_012529	GC	3	6	112609	112614	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2019	NC_012529	TCAA	2	8	112616	112623	50 %	25 %	0 %	25 %	226358106
2020	NC_012529	GAC	2	6	112693	112698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2021	NC_012529	GCC	2	6	112718	112723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358106
2022	NC_012529	GC	3	6	112776	112781	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2023	NC_012529	ACG	2	6	112802	112807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
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2025	NC_012529	CGA	2	6	112875	112880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2026	NC_012529	GC	3	6	112903	112908	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2027	NC_012529	GCT	2	6	112929	112934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2028	NC_012529	GCT	2	6	112971	112976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2029	NC_012529	GGTC	3	12	112985	112996	0 %	25 %	50 %	25 %	226358106
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2032	NC_012529	CTG	2	6	113233	113238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2033	NC_012529	GTG	2	6	113338	113343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358106
2034	NC_012529	GCGCG	2	10	113373	113382	0 %	0 %	60 %	40 %	226358106
2035	NC_012529	GAC	2	6	113383	113388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2036	NC_012529	CAGC	2	8	113406	113413	25 %	0 %	25 %	50 %	226358106
2037	NC_012529	GCG	3	9	113613	113621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358106
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2039	NC_012529	TTCG	2	8	113679	113686	0 %	50 %	25 %	25 %	226358106
2040	NC_012529	CGC	2	6	113703	113708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358106
2041	NC_012529	GGGC	2	8	113820	113827	0 %	0 %	75 %	25 %	226358106
2042	NC_012529	CG	3	6	113833	113838	0 %	0 %	50 %	50 %	226358106
2043	NC_012529	CTG	2	6	113875	113880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358106
2044	NC_012529	CGG	2	6	113891	113896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358106
2045	NC_012529	ACG	2	6	113897	113902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358106
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2048	NC_012529	GAA	2	6	113988	113993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358106
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2053	NC_012529	TGC	2	6	114224	114229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358107
2054	NC_012529	CGG	2	6	114236	114241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358107
2055	NC_012529	CTG	2	6	114256	114261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358107
2056	NC_012529	C	6	6	114346	114351	0 %	0 %	0 %	100 %	226358107
2057	NC_012529	CCG	2	6	114417	114422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358107
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2059	NC_012529	GTG	2	6	114427	114432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358107
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2061	NC_012529	GGC	2	6	114474	114479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358107
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2105	NC_012529	CGGG	2	8	116491	116498	0 %	0 %	75 %	25 %	226358109
2106	NC_012529	GAG	2	6	116505	116510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358109
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2120	NC_012529	C	7	7	117037	117043	0 %	0 %	0 %	100 %	226358109
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2122	NC_012529	CCCA	2	8	117103	117110	25 %	0 %	0 %	75 %	226358109
2123	NC_012529	CGC	2	6	117115	117120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358109
2124	NC_012529	GAAC	2	8	117152	117159	50 %	0 %	25 %	25 %	226358109
2125	NC_012529	TGG	2	6	117169	117174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358109
2126	NC_012529	ACC	2	6	117195	117200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358109
2127	NC_012529	CGC	3	9	117231	117239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358109
2128	NC_012529	CGC	2	6	117278	117283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358109
2129	NC_012529	TGC	2	6	117286	117291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358109
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2132	NC_012529	GAC	2	6	117381	117386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358109
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2144	NC_012529	CTG	2	6	117741	117746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358109
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2150	NC_012529	CTG	2	6	118005	118010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358109
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2226	NC_012529	CAA	2	6	120909	120914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358110
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2233	NC_012529	TGC	2	6	121776	121781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
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2237	NC_012529	CTCA	2	8	121892	121899	25 %	25 %	0 %	50 %	226358111
2238	NC_012529	GC	3	6	122068	122073	0 %	0 %	50 %	50 %	226358111
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2242	NC_012529	CCG	2	6	122233	122238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358111
2243	NC_012529	CTG	2	6	122297	122302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
2244	NC_012529	GA	3	6	122364	122369	50 %	0 %	50 %	0 %	226358111
2245	NC_012529	TTG	2	6	122382	122387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226358111
2246	NC_012529	GT	3	6	122402	122407	0 %	50 %	50 %	0 %	226358111
2247	NC_012529	GGT	2	6	122443	122448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358111
2248	NC_012529	GC	3	6	122479	122484	0 %	0 %	50 %	50 %	226358111
2249	NC_012529	CCTG	2	8	122529	122536	0 %	25 %	25 %	50 %	226358111
2250	NC_012529	GCTG	2	8	122550	122557	0 %	25 %	50 %	25 %	226358111
2251	NC_012529	GC	3	6	122569	122574	0 %	0 %	50 %	50 %	226358111
2252	NC_012529	ATC	2	6	122577	122582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358111
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2254	NC_012529	CG	3	6	122635	122640	0 %	0 %	50 %	50 %	226358111
2255	NC_012529	GCT	2	6	122680	122685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
2256	NC_012529	CTG	2	6	122705	122710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
2257	NC_012529	CTG	2	6	122780	122785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
2258	NC_012529	GTCG	2	8	122791	122798	0 %	25 %	50 %	25 %	226358111
2259	NC_012529	GCCCGG	2	12	122807	122818	0 %	0 %	50 %	50 %	226358111
2260	NC_012529	CTGG	2	8	122872	122879	0 %	25 %	50 %	25 %	226358111
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2263	NC_012529	CTG	2	6	122996	123001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
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2266	NC_012529	GCT	2	6	123055	123060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
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2271	NC_012529	CGC	3	9	123245	123253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358111
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2273	NC_012529	GGC	2	6	123439	123444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358111
2274	NC_012529	CGCTGG	2	12	123447	123458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	226358111
2275	NC_012529	GCT	2	6	123475	123480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
2276	NC_012529	TCCA	2	8	123515	123522	25 %	25 %	0 %	50 %	226358111
2277	NC_012529	GAGCGG	2	12	123539	123550	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	226358111
2278	NC_012529	GAG	2	6	123605	123610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358111
2279	NC_012529	GTCC	2	8	123621	123628	0 %	25 %	25 %	50 %	226358111
2280	NC_012529	GCT	2	6	123676	123681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
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2282	NC_012529	CCG	2	6	123721	123726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358111
2283	NC_012529	GCT	2	6	123739	123744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358111
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2329	NC_012529	TGC	2	6	126179	126184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358113
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2347	NC_012529	CTG	2	6	126826	126831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358114
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2350	NC_012529	CGC	2	6	126932	126937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358114
2351	NC_012529	GAGC	2	8	127128	127135	25 %	0 %	50 %	25 %	226358114
2352	NC_012529	CGC	2	6	127165	127170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358114
2353	NC_012529	CGC	2	6	127322	127327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358114
2354	NC_012529	AGC	2	6	127418	127423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358114
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2356	NC_012529	GGA	2	6	127464	127469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358114
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2358	NC_012529	GC	3	6	127508	127513	0 %	0 %	50 %	50 %	226358114
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2360	NC_012529	CGC	2	6	127689	127694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358114
2361	NC_012529	CG	3	6	127699	127704	0 %	0 %	50 %	50 %	226358114
2362	NC_012529	TGAAC	2	10	127780	127789	40 %	20 %	20 %	20 %	226358115
2363	NC_012529	CTC	2	6	127799	127804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358115
2364	NC_012529	CGG	2	6	127830	127835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358115
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2366	NC_012529	CTG	2	6	127925	127930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358115
2367	NC_012529	AG	3	6	128002	128007	50 %	0 %	50 %	0 %	226358115
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2370	NC_012529	GAC	2	6	128114	128119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358115
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2486	NC_012529	GCG	2	6	134118	134123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358123
2487	NC_012529	CGG	2	6	134150	134155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358123
2488	NC_012529	GCC	2	6	134218	134223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358123
2489	NC_012529	GCC	2	6	134233	134238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358123
2490	NC_012529	CTC	2	6	134265	134270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358123
2491	NC_012529	GAG	2	6	134301	134306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358123
2492	NC_012529	CAGG	2	8	134327	134334	25 %	0 %	50 %	25 %	226358123
2493	NC_012529	TCG	2	6	134354	134359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2494	NC_012529	CAG	2	6	134374	134379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2495	NC_012529	GCG	2	6	134392	134397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358123
2496	NC_012529	GC	3	6	134423	134428	0 %	0 %	50 %	50 %	226358123
2497	NC_012529	CGT	2	6	134435	134440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2498	NC_012529	GGA	2	6	134441	134446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358123
2499	NC_012529	GCT	2	6	134525	134530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358123
2500	NC_012529	G	6	6	134540	134545	0 %	0 %	100 %	0 %	226358123

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