MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012529	TAC	2	6	285330	285335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358243
5502	NC_012529	CGC	2	6	285356	285361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358243
5503	NC_012529	AACTGC	2	12	285397	285408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226358243
5504	NC_012529	GCT	2	6	285467	285472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358243
5505	NC_012529	GGA	2	6	285512	285517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358243
5506	NC_012529	GGC	2	6	285583	285588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358243
5507	NC_012529	GC	3	6	285620	285625	0 %	0 %	50 %	50 %	226358243
5508	NC_012529	TGC	2	6	285646	285651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358243
5509	NC_012529	GGCA	2	8	285667	285674	25 %	0 %	50 %	25 %	226358243
5510	NC_012529	GCTG	2	8	285697	285704	0 %	25 %	50 %	25 %	226358243
5511	NC_012529	CGG	2	6	285719	285724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358243
5512	NC_012529	GCCA	2	8	285731	285738	25 %	0 %	25 %	50 %	226358243
5513	NC_012529	GCC	2	6	285755	285760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358243
5514	NC_012529	CGA	2	6	285761	285766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358243
5515	NC_012529	GCC	2	6	285926	285931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358244
5516	NC_012529	AGC	2	6	285937	285942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5517	NC_012529	CAG	2	6	285954	285959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5518	NC_012529	CAG	2	6	285975	285980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5519	NC_012529	CGC	2	6	286044	286049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358244
5520	NC_012529	C	6	6	286075	286080	0 %	0 %	0 %	100 %	226358244
5521	NC_012529	CAG	2	6	286083	286088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5522	NC_012529	GT	3	6	286111	286116	0 %	50 %	50 %	0 %	226358244
5523	NC_012529	CAC	2	6	286167	286172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358244
5524	NC_012529	GC	3	6	286207	286212	0 %	0 %	50 %	50 %	226358244
5525	NC_012529	CAG	2	6	286287	286292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5526	NC_012529	GTCAG	2	10	286339	286348	20 %	20 %	40 %	20 %	226358244
5527	NC_012529	AGT	2	6	286382	286387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358244
5528	NC_012529	CGG	2	6	286401	286406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358244
5529	NC_012529	GCA	2	6	286436	286441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5530	NC_012529	ACC	2	6	286448	286453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358244
5531	NC_012529	GTGC	2	8	286462	286469	0 %	25 %	50 %	25 %	226358244
5532	NC_012529	AGC	4	12	286498	286509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5533	NC_012529	CAG	3	9	286539	286547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358244
5534	NC_012529	ATT	2	6	286571	286576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226358244
5535	NC_012529	GAG	2	6	286632	286637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358245
5536	NC_012529	TGA	3	9	286673	286681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358245
5537	NC_012529	CTG	2	6	286686	286691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358245
5538	NC_012529	CTC	2	6	286733	286738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358245
5539	NC_012529	GCA	2	6	286744	286749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358245
5540	NC_012529	GCC	2	6	286785	286790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358245
5541	NC_012529	GCC	2	6	286795	286800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358245
5542	NC_012529	CAG	2	6	286884	286889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358245
5543	NC_012529	GCC	2	6	286897	286902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358245
5544	NC_012529	GACTG	2	10	286992	287001	20 %	20 %	40 %	20 %	226358245
5545	NC_012529	GCT	2	6	287094	287099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358245
5546	NC_012529	CTG	2	6	287161	287166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358245
5547	NC_012529	CCCA	2	8	287286	287293	25 %	0 %	0 %	75 %	226358245
5548	NC_012529	ACAAA	2	10	287316	287325	80 %	0 %	0 %	20 %	226358245
5549	NC_012529	AGTGC	2	10	287868	287877	20 %	20 %	40 %	20 %	226358246
5550	NC_012529	TTA	2	6	287907	287912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226358246
5551	NC_012529	CTGA	2	8	287943	287950	25 %	25 %	25 %	25 %	226358246
5552	NC_012529	CG	3	6	287986	287991	0 %	0 %	50 %	50 %	226358246
5553	NC_012529	GCG	2	6	288092	288097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358246
5554	NC_012529	TA	3	6	288098	288103	50 %	50 %	0 %	0 %	226358246
5555	NC_012529	CG	3	6	288105	288110	0 %	0 %	50 %	50 %	226358246
5556	NC_012529	GGC	2	6	288155	288160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358246
5557	NC_012529	CTT	2	6	288445	288450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358247
5558	NC_012529	CTC	2	6	288462	288467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358247
5559	NC_012529	TCT	2	6	288478	288483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358247
5560	NC_012529	CGC	2	6	288517	288522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5561	NC_012529	CGG	2	6	288549	288554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358247
5562	NC_012529	CGCC	2	8	288573	288580	0 %	0 %	25 %	75 %	226358247
5563	NC_012529	CGG	2	6	288650	288655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358247
5564	NC_012529	ACG	2	6	288684	288689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5565	NC_012529	GGGTGC	2	12	288714	288725	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226358247
5566	NC_012529	GCA	2	6	288799	288804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5567	NC_012529	CAGG	2	8	288838	288845	25 %	0 %	50 %	25 %	226358247
5568	NC_012529	CTG	2	6	288857	288862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5569	NC_012529	CCG	2	6	288879	288884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5570	NC_012529	GC	3	6	288897	288902	0 %	0 %	50 %	50 %	226358247
5571	NC_012529	CTCG	2	8	288928	288935	0 %	25 %	25 %	50 %	226358247
5572	NC_012529	AC	3	6	288957	288962	50 %	0 %	0 %	50 %	226358247
5573	NC_012529	CGG	2	6	289028	289033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358247
5574	NC_012529	CAG	2	6	289103	289108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5575	NC_012529	CGC	2	6	289120	289125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5576	NC_012529	GCG	2	6	289186	289191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358247
5577	NC_012529	CTG	2	6	289200	289205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5578	NC_012529	GAGGCA	2	12	289262	289273	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	226358247
5579	NC_012529	CGC	2	6	289277	289282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5580	NC_012529	TCC	2	6	289446	289451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358247
5581	NC_012529	GAA	3	9	289652	289660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358247
5582	NC_012529	ACTG	2	8	289771	289778	25 %	25 %	25 %	25 %	226358247
5583	NC_012529	T	6	6	289795	289800	0 %	100 %	0 %	0 %	226358247
5584	NC_012529	ACC	2	6	289808	289813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358247
5585	NC_012529	GC	3	6	289964	289969	0 %	0 %	50 %	50 %	226358247
5586	NC_012529	CGC	2	6	289983	289988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5587	NC_012529	GGA	2	6	290069	290074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358247
5588	NC_012529	TTC	2	6	290078	290083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358247
5589	NC_012529	GAG	2	6	290090	290095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358247
5590	NC_012529	GGC	2	6	290140	290145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358247
5591	NC_012529	CCG	2	6	290151	290156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5592	NC_012529	AGC	2	6	290238	290243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5593	NC_012529	TGG	2	6	290448	290453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358247
5594	NC_012529	CTG	2	6	290459	290464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5595	NC_012529	AC	3	6	290479	290484	50 %	0 %	0 %	50 %	226358247
5596	NC_012529	GCA	2	6	290488	290493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5597	NC_012529	AGG	2	6	290529	290534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358247
5598	NC_012529	ATGC	2	8	290564	290571	25 %	25 %	25 %	25 %	226358247
5599	NC_012529	TGC	2	6	290634	290639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358247
5600	NC_012529	CGC	2	6	290669	290674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358247
5601	NC_012529	TGG	2	6	290875	290880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358247
5602	NC_012529	CTGG	2	8	290887	290894	0 %	25 %	50 %	25 %	226358247
5603	NC_012529	CAC	2	6	290914	290919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358247
5604	NC_012529	T	6	6	290924	290929	0 %	100 %	0 %	0 %	226358247
5605	NC_012529	ATGTTC	2	12	291084	291095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226358248
5606	NC_012529	GCT	2	6	291124	291129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358248
5607	NC_012529	CAG	2	6	291146	291151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358248
5608	NC_012529	TCC	2	6	291181	291186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358248
5609	NC_012529	GCG	2	6	291188	291193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358248
5610	NC_012529	TGG	2	6	291246	291251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358248
5611	NC_012529	GCG	2	6	291258	291263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358248
5612	NC_012529	ACC	2	6	291291	291296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358248
5613	NC_012529	GCC	2	6	291308	291313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358248
5614	NC_012529	TTCC	2	8	291319	291326	0 %	50 %	0 %	50 %	226358248
5615	NC_012529	GCC	2	6	291377	291382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358248
5616	NC_012529	GCA	2	6	291455	291460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358248
5617	NC_012529	GGT	2	6	291566	291571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358248
5618	NC_012529	GACC	2	8	291589	291596	25 %	0 %	25 %	50 %	226358248
5619	NC_012529	CTG	2	6	291602	291607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358248
5620	NC_012529	ACT	2	6	291669	291674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358248
5621	NC_012529	G	6	6	291675	291680	0 %	0 %	100 %	0 %	226358248
5622	NC_012529	GC	3	6	291697	291702	0 %	0 %	50 %	50 %	226358248
5623	NC_012529	GA	3	6	291768	291773	50 %	0 %	50 %	0 %	226358248
5624	NC_012529	G	6	6	291792	291797	0 %	0 %	100 %	0 %	226358248
5625	NC_012529	GCT	2	6	292083	292088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358249
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5651	NC_012529	AG	3	6	292816	292821	50 %	0 %	50 %	0 %	226358249
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5654	NC_012529	ATC	2	6	293332	293337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358250
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5743	NC_012529	CAC	2	6	299054	299059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358253
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5746	NC_012529	CGT	2	6	299432	299437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358254
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5864	NC_012529	TGA	2	6	306187	306192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358258
5865	NC_012529	TCA	2	6	306197	306202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358258
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5867	NC_012529	GGC	2	6	306277	306282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358258
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