MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 5956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012529	CCA	2	6	264117	264122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358222
5002	NC_012529	CAC	2	6	264133	264138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358222
5003	NC_012529	CCG	2	6	264143	264148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358222
5004	NC_012529	CAT	2	6	264214	264219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358222
5005	NC_012529	CTG	2	6	264248	264253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358222
5006	NC_012529	CAGT	2	8	264328	264335	25 %	25 %	25 %	25 %	226358222
5007	NC_012529	GCC	2	6	264341	264346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358222
5008	NC_012529	TGG	2	6	264378	264383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358222
5009	NC_012529	ATC	2	6	264389	264394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358222
5010	NC_012529	TGGC	2	8	264449	264456	0 %	25 %	50 %	25 %	226358222
5011	NC_012529	CTG	2	6	264482	264487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358222
5012	NC_012529	GTG	2	6	264503	264508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358222
5013	NC_012529	CTT	2	6	264565	264570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358222
5014	NC_012529	GCT	2	6	264592	264597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358222
5015	NC_012529	AAC	3	9	264620	264628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358222
5016	NC_012529	ACC	2	6	264632	264637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358222
5017	NC_012529	CTT	2	6	264646	264651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358222
5018	NC_012529	GCC	2	6	264655	264660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358222
5019	NC_012529	CGTGA	2	10	264740	264749	20 %	20 %	40 %	20 %	226358222
5020	NC_012529	CG	3	6	264821	264826	0 %	0 %	50 %	50 %	226358222
5021	NC_012529	CAT	2	6	264850	264855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358222
5022	NC_012529	GCG	2	6	264858	264863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358222
5023	NC_012529	CG	3	6	264881	264886	0 %	0 %	50 %	50 %	226358222
5024	NC_012529	CGT	2	6	265027	265032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358222
5025	NC_012529	TTC	2	6	265052	265057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358222
5026	NC_012529	CG	3	6	265096	265101	0 %	0 %	50 %	50 %	226358222
5027	NC_012529	CGC	2	6	265107	265112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358222
5028	NC_012529	CG	3	6	265127	265132	0 %	0 %	50 %	50 %	226358223
5029	NC_012529	CCG	2	6	265176	265181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358223
5030	NC_012529	CTG	2	6	265192	265197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5031	NC_012529	GGGC	2	8	265200	265207	0 %	0 %	75 %	25 %	226358223
5032	NC_012529	CTG	2	6	265213	265218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5033	NC_012529	CTG	2	6	265225	265230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5034	NC_012529	GTG	2	6	265231	265236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358223
5035	NC_012529	CAC	2	6	265238	265243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358223
5036	NC_012529	CTG	2	6	265264	265269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5037	NC_012529	CTT	2	6	265299	265304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358223
5038	NC_012529	CGG	3	9	265335	265343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358223
5039	NC_012529	GCT	2	6	265344	265349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5040	NC_012529	GTG	2	6	265402	265407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358223
5041	NC_012529	CGG	2	6	265419	265424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358223
5042	NC_012529	TCTT	2	8	265427	265434	0 %	75 %	0 %	25 %	226358223
5043	NC_012529	GGCG	2	8	265566	265573	0 %	0 %	75 %	25 %	226358223
5044	NC_012529	TGA	2	6	265592	265597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358223
5045	NC_012529	GTG	2	6	265606	265611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358223
5046	NC_012529	CAC	2	6	265614	265619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358223
5047	NC_012529	TGC	2	6	265709	265714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5048	NC_012529	CTG	4	12	265715	265726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5049	NC_012529	GCTGGC	2	12	265749	265760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	226358223
5050	NC_012529	GC	3	6	265759	265764	0 %	0 %	50 %	50 %	226358223
5051	NC_012529	GCG	2	6	265777	265782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358223
5052	NC_012529	GCT	2	6	265785	265790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5053	NC_012529	CCA	2	6	265874	265879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358223
5054	NC_012529	ACG	2	6	265886	265891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5055	NC_012529	CTG	3	9	265921	265929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5056	NC_012529	CTG	2	6	265954	265959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358223
5057	NC_012529	GC	3	6	265960	265965	0 %	0 %	50 %	50 %	226358223
5058	NC_012529	GCC	2	6	265973	265978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358223
5059	NC_012529	ACC	2	6	266021	266026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358224
5060	NC_012529	ACG	2	6	266040	266045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358224
5061	NC_012529	CTA	2	6	266053	266058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358224
5062	NC_012529	TGACC	2	10	266179	266188	20 %	20 %	20 %	40 %	226358224
5063	NC_012529	CGG	2	6	266270	266275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358224
5064	NC_012529	CCA	2	6	266310	266315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358224
5065	NC_012529	GTG	2	6	266333	266338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358224
5066	NC_012529	GCTG	2	8	266350	266357	0 %	25 %	50 %	25 %	226358224
5067	NC_012529	GCAA	2	8	266370	266377	50 %	0 %	25 %	25 %	226358224
5068	NC_012529	GCG	2	6	266406	266411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358224
5069	NC_012529	CGG	2	6	266467	266472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358224
5070	NC_012529	GCA	3	9	266473	266481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358224
5071	NC_012529	CTG	2	6	266525	266530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358224
5072	NC_012529	CCA	2	6	266541	266546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358224
5073	NC_012529	TGA	2	6	266586	266591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358224
5074	NC_012529	GAA	2	6	266599	266604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358224
5075	NC_012529	CAC	2	6	266608	266613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358224
5076	NC_012529	GGC	2	6	266644	266649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358224
5077	NC_012529	GC	3	6	266648	266653	0 %	0 %	50 %	50 %	226358224
5078	NC_012529	ACC	2	6	266663	266668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358224
5079	NC_012529	TTC	2	6	266672	266677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358224
5080	NC_012529	TCAGC	2	10	266849	266858	20 %	20 %	20 %	40 %	226358225
5081	NC_012529	GCA	3	9	266905	266913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358225
5082	NC_012529	GGC	2	6	266984	266989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358225
5083	NC_012529	GCT	2	6	267010	267015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358225
5084	NC_012529	TGA	2	6	267024	267029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358225
5085	NC_012529	GCG	2	6	267063	267068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358225
5086	NC_012529	TGC	2	6	267168	267173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358225
5087	NC_012529	GCC	2	6	267182	267187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358225
5088	NC_012529	ATC	2	6	267201	267206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358225
5089	NC_012529	CTC	2	6	267287	267292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358225
5090	NC_012529	CAG	2	6	267362	267367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358225
5091	NC_012529	GCA	3	9	267418	267426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358225
5092	NC_012529	GCC	2	6	267434	267439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358225
5093	NC_012529	GCG	2	6	267464	267469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358225
5094	NC_012529	CCT	2	6	267502	267507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358225
5095	NC_012529	GCCTG	2	10	267630	267639	0 %	20 %	40 %	40 %	226358226
5096	NC_012529	ACGCC	2	10	267652	267661	20 %	0 %	20 %	60 %	226358226
5097	NC_012529	CGA	2	6	267693	267698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5098	NC_012529	CG	3	6	267708	267713	0 %	0 %	50 %	50 %	226358226
5099	NC_012529	CAAT	2	8	267792	267799	50 %	25 %	0 %	25 %	226358226
5100	NC_012529	TCG	2	6	267824	267829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5101	NC_012529	CACG	2	8	267841	267848	25 %	0 %	25 %	50 %	226358226
5102	NC_012529	CCG	2	6	267858	267863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358226
5103	NC_012529	GGT	2	6	267864	267869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358226
5104	NC_012529	CGGT	2	8	267938	267945	0 %	25 %	50 %	25 %	226358226
5105	NC_012529	GAA	3	9	267946	267954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358226
5106	NC_012529	GTC	2	6	268036	268041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5107	NC_012529	AAT	2	6	268081	268086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226358226
5108	NC_012529	ATG	2	6	268136	268141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358226
5109	NC_012529	AGGC	2	8	268294	268301	25 %	0 %	50 %	25 %	226358226
5110	NC_012529	CGC	3	9	268305	268313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358226
5111	NC_012529	CCG	2	6	268341	268346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358226
5112	NC_012529	TGG	2	6	268383	268388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358226
5113	NC_012529	CG	3	6	268433	268438	0 %	0 %	50 %	50 %	226358226
5114	NC_012529	ATG	2	6	268460	268465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358226
5115	NC_012529	CAG	2	6	268495	268500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5116	NC_012529	GAAA	2	8	268524	268531	75 %	0 %	25 %	0 %	226358226
5117	NC_012529	AGCG	2	8	268544	268551	25 %	0 %	50 %	25 %	226358226
5118	NC_012529	CCAC	2	8	268569	268576	25 %	0 %	0 %	75 %	226358226
5119	NC_012529	CGTG	2	8	268611	268618	0 %	25 %	50 %	25 %	226358226
5120	NC_012529	TGCA	2	8	268619	268626	25 %	25 %	25 %	25 %	226358226
5121	NC_012529	AGGC	2	8	268633	268640	25 %	0 %	50 %	25 %	226358226
5122	NC_012529	GGT	2	6	268642	268647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358226
5123	NC_012529	AC	3	6	268667	268672	50 %	0 %	0 %	50 %	226358226
5124	NC_012529	GTC	2	6	268675	268680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5125	NC_012529	GCT	2	6	268681	268686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5126	NC_012529	GCG	3	9	268703	268711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358226
5127	NC_012529	TGC	2	6	268712	268717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358226
5128	NC_012529	CTT	2	6	268722	268727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358226
5129	NC_012529	GC	3	6	268789	268794	0 %	0 %	50 %	50 %	226358226
5130	NC_012529	CGGT	2	8	268802	268809	0 %	25 %	50 %	25 %	226358226
5131	NC_012529	ATG	2	6	268817	268822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358226
5132	NC_012529	GGC	2	6	268825	268830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358226
5133	NC_012529	CG	3	6	268929	268934	0 %	0 %	50 %	50 %	226358226
5134	NC_012529	CTGG	2	8	269056	269063	0 %	25 %	50 %	25 %	226358226
5135	NC_012529	CAGGGT	2	12	269200	269211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226358226
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5137	NC_012529	GGGT	2	8	269238	269245	0 %	25 %	75 %	0 %	226358226
5138	NC_012529	TGC	2	6	269535	269540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358227
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5141	NC_012529	CAA	2	6	269635	269640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358227
5142	NC_012529	AAG	2	6	269693	269698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358227
5143	NC_012529	CCG	2	6	269805	269810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358227
5144	NC_012529	CCG	2	6	269856	269861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358227
5145	NC_012529	GAT	2	6	270006	270011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358228
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5147	NC_012529	CGC	3	9	270153	270161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358228
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5151	NC_012529	GGGT	2	8	270260	270267	0 %	25 %	75 %	0 %	226358228
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5153	NC_012529	CTG	2	6	270346	270351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358228
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5156	NC_012529	CCGTCA	2	12	270428	270439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226358228
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5160	NC_012529	GCG	2	6	270569	270574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358228
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5243	NC_012529	GGT	2	6	273972	273977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358232
5244	NC_012529	CTG	2	6	274014	274019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358232
5245	NC_012529	CCA	2	6	274098	274103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358232
5246	NC_012529	TGA	2	6	274115	274120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358232
5247	NC_012529	TCG	2	6	274126	274131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358232
5248	NC_012529	CACG	2	8	274136	274143	25 %	0 %	25 %	50 %	226358232
5249	NC_012529	TGG	2	6	274160	274165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358232
5250	NC_012529	CTG	2	6	274171	274176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358232
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5254	NC_012529	GGC	2	6	274417	274422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358232
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5262	NC_012529	CT	3	6	274987	274992	0 %	50 %	0 %	50 %	226358234
5263	NC_012529	TGA	2	6	275126	275131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358234
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5276	NC_012529	TGA	2	6	275764	275769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358235
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5350	NC_012529	GTC	2	6	279173	279178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358238
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5358	NC_012529	CGTTT	2	10	279459	279468	0 %	60 %	20 %	20 %	226358238
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5363	NC_012529	CGC	2	6	279632	279637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358238
5364	NC_012529	GGCA	2	8	279727	279734	25 %	0 %	50 %	25 %	226358238
5365	NC_012529	CGGG	2	8	279784	279791	0 %	0 %	75 %	25 %	226358238
5366	NC_012529	GCA	2	6	279820	279825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358238
5367	NC_012529	GTG	2	6	279837	279842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358238
5368	NC_012529	GAG	2	6	279855	279860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358238
5369	NC_012529	GCT	2	6	279880	279885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358238
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5371	NC_012529	GC	3	6	279934	279939	0 %	0 %	50 %	50 %	226358238
5372	NC_012529	TGA	2	6	279945	279950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358238
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5377	NC_012529	CGC	2	6	280267	280272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358239
5378	NC_012529	CCG	2	6	280279	280284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358239
5379	NC_012529	CAGCAC	2	12	280303	280314	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226358239
5380	NC_012529	GCC	3	9	280316	280324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358239
5381	NC_012529	CGC	2	6	280351	280356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358239
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5384	NC_012529	GGT	2	6	280492	280497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358239
5385	NC_012529	G	6	6	280498	280503	0 %	0 %	100 %	0 %	226358239
5386	NC_012529	ACAGC	2	10	280530	280539	40 %	0 %	20 %	40 %	226358239
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5388	NC_012529	AGG	2	6	280622	280627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358239
5389	NC_012529	CGGT	2	8	280640	280647	0 %	25 %	50 %	25 %	226358239
5390	NC_012529	GCCG	2	8	280705	280712	0 %	0 %	50 %	50 %	226358239
5391	NC_012529	CCG	2	6	280719	280724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358239
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5393	NC_012529	CAG	2	6	280810	280815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358239
5394	NC_012529	GCG	2	6	280840	280845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358239
5395	NC_012529	GC	3	6	280863	280868	0 %	0 %	50 %	50 %	226358239
5396	NC_012529	GCA	2	6	280911	280916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358239
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5402	NC_012529	CAG	2	6	281035	281040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358239
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5424	NC_012529	TCG	2	6	281829	281834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358240
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5427	NC_012529	TCCA	2	8	281874	281881	25 %	25 %	0 %	50 %	226358240
5428	NC_012529	AGCGC	2	10	281908	281917	20 %	0 %	40 %	40 %	226358240
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5430	NC_012529	CGG	2	6	281998	282003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358240
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5459	NC_012529	CCCA	2	8	282931	282938	25 %	0 %	0 %	75 %	226358241
5460	NC_012529	CAG	2	6	283006	283011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358241
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5465	NC_012529	GCA	3	9	283128	283136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358241
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5472	NC_012529	TGG	2	6	283395	283400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358241
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5475	NC_012529	GTCCC	2	10	283625	283634	0 %	20 %	20 %	60 %	226358241
5476	NC_012529	GCA	2	6	283643	283648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358241
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5478	NC_012529	CAG	2	6	283723	283728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358241
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5483	NC_012529	GCCC	2	8	283881	283888	0 %	0 %	25 %	75 %	226358241
5484	NC_012529	CTC	2	6	283891	283896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358241
5485	NC_012529	GAA	2	6	283912	283917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358241
5486	NC_012529	CCA	2	6	283980	283985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358241
5487	NC_012529	GTTC	2	8	283992	283999	0 %	50 %	25 %	25 %	226358241
5488	NC_012529	GCA	2	6	284117	284122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358241
5489	NC_012529	GC	3	6	284319	284324	0 %	0 %	50 %	50 %	226358242
5490	NC_012529	CCCTC	2	10	284478	284487	0 %	20 %	0 %	80 %	226358242
5491	NC_012529	GGC	2	6	284764	284769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358242
5492	NC_012529	CGC	2	6	284778	284783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358242
5493	NC_012529	GCA	2	6	284859	284864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358242
5494	NC_012529	GGA	2	6	284895	284900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358242
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5496	NC_012529	GCT	2	6	285072	285077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358242
5497	NC_012529	TCT	2	6	285101	285106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358242
5498	NC_012529	CG	3	6	285117	285122	0 %	0 %	50 %	50 %	226358242
5499	NC_012529	GC	3	6	285240	285245	0 %	0 %	50 %	50 %	226358242
5500	NC_012529	CCG	2	6	285255	285260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358242

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