MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 3

Total Repeats: 4738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012528	CTT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357667
2	NC_012528	CAA	2	6	244	249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357667
3	NC_012528	TGA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357667
4	NC_012528	CAT	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357667
5	NC_012528	GCG	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357667
6	NC_012528	CTG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357667
7	NC_012528	TGA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357667
8	NC_012528	TTG	2	6	611	616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226357667
9	NC_012528	AGC	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357667
10	NC_012528	AAG	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357667
11	NC_012528	ATG	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357667
12	NC_012528	CAG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357667
13	NC_012528	CTG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357668
14	NC_012528	CAA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357668
15	NC_012528	GCG	2	6	1226	1231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357668
16	NC_012528	TGG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357668
17	NC_012528	GAG	2	6	1329	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357668
18	NC_012528	TGA	3	9	1369	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357668
19	NC_012528	GAC	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357668
20	NC_012528	CTG	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357668
21	NC_012528	GAG	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357668
22	NC_012528	AGA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357668
23	NC_012528	GGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357668
24	NC_012528	CAG	2	6	1659	1664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357668
25	NC_012528	TGA	2	6	2631	2636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357669
26	NC_012528	CGT	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
27	NC_012528	GAC	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
28	NC_012528	CGG	2	6	2974	2979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357669
29	NC_012528	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
30	NC_012528	ATT	2	6	3053	3058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226357669
31	NC_012528	ACG	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
32	NC_012528	GAG	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357669
33	NC_012528	GAC	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
34	NC_012528	AGC	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
35	NC_012528	CTG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
36	NC_012528	CCG	2	6	3409	3414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
37	NC_012528	GAG	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357669
38	NC_012528	CGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
39	NC_012528	GAG	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357669
40	NC_012528	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357669
41	NC_012528	GAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
42	NC_012528	GCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
43	NC_012528	GCT	2	6	3712	3717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
44	NC_012528	GTG	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357669
45	NC_012528	GCT	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
46	NC_012528	GCC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
47	NC_012528	CCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
48	NC_012528	CGC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
49	NC_012528	GAC	3	9	3968	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
50	NC_012528	CCG	2	6	4054	4059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
51	NC_012528	CCA	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357669
52	NC_012528	CGC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357669
53	NC_012528	AGC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
54	NC_012528	TGG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357669
55	NC_012528	TGC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
56	NC_012528	GCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357669
57	NC_012528	GGT	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357669
58	NC_012528	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
59	NC_012528	TGC	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
60	NC_012528	TGC	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357669
61	NC_012528	ATC	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357669
62	NC_012528	GCA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357669
63	NC_012528	CAG	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357670
64	NC_012528	TCA	2	6	5201	5206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357670
65	NC_012528	CGT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357670
66	NC_012528	CGG	2	6	5266	5271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357670
67	NC_012528	GAG	2	6	5275	5280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357670
68	NC_012528	GGC	2	6	5346	5351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357670
69	NC_012528	CTA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357671
70	NC_012528	GGC	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357671
71	NC_012528	TCT	2	6	6048	6053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357671
72	NC_012528	TCG	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357671
73	NC_012528	GCC	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357671
74	NC_012528	CGA	2	6	6210	6215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357671
75	NC_012528	CGA	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357671
76	NC_012528	GGC	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357671
77	NC_012528	CCG	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357671
78	NC_012528	GCC	2	6	6479	6484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357671
79	NC_012528	CTC	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357671
80	NC_012528	GAT	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357671
81	NC_012528	CAG	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357671
82	NC_012528	GCT	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357671
83	NC_012528	AGT	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357671
84	NC_012528	CAG	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357671
85	NC_012528	CTG	2	6	6792	6797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357671
86	NC_012528	GTC	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357671
87	NC_012528	GCC	2	6	6983	6988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357671
88	NC_012528	CGC	2	6	7417	7422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357672
89	NC_012528	CAG	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357672
90	NC_012528	CGC	2	6	7442	7447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357672
91	NC_012528	TGC	2	6	7692	7697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
92	NC_012528	GAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357672
93	NC_012528	CTG	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
94	NC_012528	TCG	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
95	NC_012528	CGC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357672
96	NC_012528	TGC	3	9	7955	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
97	NC_012528	CTG	2	6	8000	8005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
98	NC_012528	TGC	2	6	8061	8066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357672
99	NC_012528	GAA	2	6	8609	8614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357673
100	NC_012528	CTG	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357673
101	NC_012528	GCC	2	6	8658	8663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357673
102	NC_012528	TGC	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357673
103	NC_012528	AAG	2	6	8676	8681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357673
104	NC_012528	GCT	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357673
105	NC_012528	TGG	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357673
106	NC_012528	GAA	2	6	8763	8768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357673
107	NC_012528	TCG	2	6	8794	8799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357673
108	NC_012528	AAG	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357673
109	NC_012528	GGC	2	6	8939	8944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357673
110	NC_012528	CAC	2	6	8945	8950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357673
111	NC_012528	ACC	2	6	9806	9811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357674
112	NC_012528	AGA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357674
113	NC_012528	CGA	2	6	9935	9940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357674
114	NC_012528	TTC	2	6	9942	9947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357674
115	NC_012528	GCC	2	6	9952	9957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357674
116	NC_012528	CGA	2	6	10127	10132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357674
117	NC_012528	GCG	2	6	10145	10150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357674
118	NC_012528	ATG	2	6	10168	10173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357674
119	NC_012528	GAG	3	9	10185	10193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357674
120	NC_012528	ATC	2	6	10231	10236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357674
121	NC_012528	CTG	2	6	10993	10998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357675
122	NC_012528	AGC	2	6	11042	11047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357675
123	NC_012528	CAG	2	6	11062	11067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357675
124	NC_012528	TCC	2	6	11089	11094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357675
125	NC_012528	GCA	2	6	11172	11177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357675
126	NC_012528	AAG	2	6	11263	11268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357675
127	NC_012528	ACG	2	6	11289	11294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357675
128	NC_012528	CTG	2	6	11374	11379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357675
129	NC_012528	ACG	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357675
130	NC_012528	TTC	2	6	11449	11454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357675
131	NC_012528	GGC	2	6	11541	11546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357675
132	NC_012528	TGG	2	6	11559	11564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357675
133	NC_012528	GTG	2	6	11955	11960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357676
134	NC_012528	AGC	2	6	12049	12054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357676
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137	NC_012528	TGG	2	6	12184	12189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357676
138	NC_012528	CGA	2	6	12218	12223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357676
139	NC_012528	CAT	2	6	12269	12274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357676
140	NC_012528	CGA	2	6	12362	12367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357676
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149	NC_012528	TGG	2	6	12850	12855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357676
150	NC_012528	GAC	2	6	12890	12895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357676
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152	NC_012528	TGC	2	6	13202	13207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357677
153	NC_012528	CCG	2	6	13288	13293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357677
154	NC_012528	CTG	2	6	13324	13329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357677
155	NC_012528	GCT	2	6	13365	13370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357677
156	NC_012528	TGG	2	6	13484	13489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357677
157	NC_012528	GAT	2	6	13524	13529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357677
158	NC_012528	CAG	2	6	13585	13590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357677
159	NC_012528	TGC	2	6	13613	13618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357677
160	NC_012528	TGG	2	6	13631	13636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357677
161	NC_012528	ACT	2	6	13916	13921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357677
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250	NC_012528	GAA	2	6	21998	22003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357684
251	NC_012528	CTC	2	6	22043	22048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357684
252	NC_012528	GGA	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357684
253	NC_012528	TCA	2	6	22068	22073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357684
254	NC_012528	GTC	2	6	22103	22108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357684
255	NC_012528	GGA	2	6	22243	22248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357684
256	NC_012528	ACA	2	6	22259	22264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357684
257	NC_012528	GCC	2	6	22301	22306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357684
258	NC_012528	CAG	2	6	22374	22379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357684
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260	NC_012528	AAC	2	6	23225	23230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357685
261	NC_012528	TGG	3	9	23232	23240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357685
262	NC_012528	CTT	2	6	23482	23487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357685
263	NC_012528	TGC	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357685
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265	NC_012528	GAG	2	6	23549	23554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357685
266	NC_012528	GGC	2	6	23578	23583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357685
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269	NC_012528	AGC	2	6	24018	24023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357685
270	NC_012528	TGC	2	6	24063	24068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357685
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273	NC_012528	TCG	2	6	24218	24223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357685
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281	NC_012528	GAG	2	6	24740	24745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357685
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285	NC_012528	TCA	2	6	24975	24980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357685
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373	NC_012528	GAA	2	6	32039	32044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357691
374	NC_012528	TGC	2	6	33468	33473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357692
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376	NC_012528	TGT	2	6	33540	33545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226357692
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499	NC_012528	GCG	2	6	45242	45247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357700
500	NC_012528	GCG	2	6	45319	45324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357700

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