MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome

Total Repeats: 24296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011766	AGA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883315
2	NC_011766	GCA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883315
3	NC_011766	CTAG	2	8	303	310	25 %	25 %	25 %	25 %	218883316
4	NC_011766	C	6	6	324	329	0 %	0 %	0 %	100 %	218883316
5	NC_011766	GAA	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883316
6	NC_011766	ACT	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
7	NC_011766	ACT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883316
8	NC_011766	TC	3	6	672	677	0 %	50 %	0 %	50 %	218883316
9	NC_011766	TAT	2	6	680	685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
10	NC_011766	CTC	2	6	706	711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
11	NC_011766	ATT	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
12	NC_011766	TCC	3	9	785	793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
13	NC_011766	TAT	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883316
14	NC_011766	TA	5	10	863	872	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
15	NC_011766	ATCAAC	2	12	875	886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218883316
16	NC_011766	CAA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883316
17	NC_011766	CGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883316
18	NC_011766	CTTCT	2	10	1100	1109	0 %	60 %	0 %	40 %	218883316
19	NC_011766	GTATT	2	10	1186	1195	20 %	60 %	20 %	0 %	218883316
20	NC_011766	CTC	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883316
21	NC_011766	AT	3	6	1375	1380	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
22	NC_011766	ATTA	2	8	1392	1399	50 %	50 %	0 %	0 %	218883316
23	NC_011766	CAC	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
24	NC_011766	TA	3	6	1503	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	218883317
25	NC_011766	CAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883317
26	NC_011766	ACC	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883317
27	NC_011766	CTT	2	6	1648	1653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883317
28	NC_011766	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883317
29	NC_011766	TGG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883318
30	NC_011766	CAT	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
31	NC_011766	AAAGGA	2	12	2317	2328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883318
32	NC_011766	ATG	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883318
33	NC_011766	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
34	NC_011766	ACT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883318
35	NC_011766	AAGT	2	8	2412	2419	50 %	25 %	25 %	0 %	218883318
36	NC_011766	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
37	NC_011766	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883318
38	NC_011766	AT	3	6	2447	2452	50 %	50 %	0 %	0 %	218883318
39	NC_011766	AAG	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883318
40	NC_011766	AAT	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
41	NC_011766	TC	3	6	2488	2493	0 %	50 %	0 %	50 %	218883319
42	NC_011766	GCC	2	6	2542	2547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218883319
43	NC_011766	AAT	2	6	2581	2586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
44	NC_011766	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883319
45	NC_011766	CAT	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883319
46	NC_011766	TA	3	6	2799	2804	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
47	NC_011766	TA	3	6	2832	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
48	NC_011766	CCTCTA	2	12	2846	2857	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218883319
49	NC_011766	TCT	2	6	2891	2896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
50	NC_011766	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
51	NC_011766	GTA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883319
52	NC_011766	AAT	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883319
53	NC_011766	TA	3	6	3165	3170	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
54	NC_011766	CCA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883319
55	NC_011766	GATT	2	8	3273	3280	25 %	50 %	25 %	0 %	218883319
56	NC_011766	TAAT	2	8	3341	3348	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
57	NC_011766	TTC	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883319
58	NC_011766	AT	3	6	3415	3420	50 %	50 %	0 %	0 %	218883319
59	NC_011766	T	6	6	3420	3425	0 %	100 %	0 %	0 %	218883319
60	NC_011766	TGGT	2	8	3428	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	218883319
61	NC_011766	C	7	7	3478	3484	0 %	0 %	0 %	100 %	218883320
62	NC_011766	TGAG	2	8	3580	3587	25 %	25 %	50 %	0 %	218883320
63	NC_011766	CTTC	2	8	3592	3599	0 %	50 %	0 %	50 %	218883320
64	NC_011766	TAC	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
65	NC_011766	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
66	NC_011766	TA	4	8	3805	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
67	NC_011766	CTA	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
68	NC_011766	AAT	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883320
69	NC_011766	CATTAC	2	12	3907	3918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
70	NC_011766	TCG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
71	NC_011766	CCCCT	2	10	3951	3960	0 %	20 %	0 %	80 %	218883320
72	NC_011766	CT	3	6	4048	4053	0 %	50 %	0 %	50 %	218883320
73	NC_011766	TAT	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
74	NC_011766	ACCAT	2	10	4137	4146	40 %	20 %	0 %	40 %	218883320
75	NC_011766	GC	3	6	4174	4179	0 %	0 %	50 %	50 %	218883320
76	NC_011766	TG	3	6	4229	4234	0 %	50 %	50 %	0 %	218883320
77	NC_011766	GAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883320
78	NC_011766	GGGTA	2	10	4284	4293	20 %	20 %	60 %	0 %	218883320
79	NC_011766	ATG	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883320
80	NC_011766	CCT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883320
81	NC_011766	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883320
82	NC_011766	CTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883320
83	NC_011766	TA	3	6	4486	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
84	NC_011766	CCAG	2	8	4521	4528	25 %	0 %	25 %	50 %	218883320
85	NC_011766	AT	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	218883320
86	NC_011766	GCT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883320
87	NC_011766	T	6	6	4751	4756	0 %	100 %	0 %	0 %	218883320
88	NC_011766	TAC	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218883320
89	NC_011766	TCCC	2	8	4901	4908	0 %	25 %	0 %	75 %	218883321
90	NC_011766	GAT	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
91	NC_011766	TAG	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218883321
92	NC_011766	CCT	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
93	NC_011766	ATT	2	6	5070	5075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
94	NC_011766	TCG	2	6	5109	5114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883321
95	NC_011766	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883321
96	NC_011766	TC	3	6	5168	5173	0 %	50 %	0 %	50 %	218883321
97	NC_011766	CCA	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883321
98	NC_011766	CTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218883321
99	NC_011766	TTA	2	6	5320	5325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883321
100	NC_011766	CT	3	6	5392	5397	0 %	50 %	0 %	50 %	218883321
101	NC_011766	GT	3	6	5399	5404	0 %	50 %	50 %	0 %	218883321
102	NC_011766	GGAT	2	8	5462	5469	25 %	25 %	50 %	0 %	218883321
103	NC_011766	ATCAT	2	10	5755	5764	40 %	40 %	0 %	20 %	218883322
104	NC_011766	GAA	2	6	5784	5789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
105	NC_011766	AGG	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
106	NC_011766	CGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218883322
107	NC_011766	GAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
108	NC_011766	ACC	2	6	6009	6014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218883322
109	NC_011766	TGGCT	2	10	6052	6061	0 %	40 %	40 %	20 %	218883322
110	NC_011766	CAG	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883322
111	NC_011766	TA	3	6	6080	6085	50 %	50 %	0 %	0 %	218883322
112	NC_011766	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218883322
113	NC_011766	CA	3	6	6144	6149	50 %	0 %	0 %	50 %	218883322
114	NC_011766	CAA	2	6	6188	6193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218883322
115	NC_011766	AGG	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
116	NC_011766	GA	3	6	6240	6245	50 %	0 %	50 %	0 %	218883322
117	NC_011766	AGG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218883322
118	NC_011766	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218883322
119	NC_011766	GATA	2	8	6441	6448	50 %	25 %	25 %	0 %	218883322
120	NC_011766	GA	3	6	6463	6468	50 %	0 %	50 %	0 %	218883322
121	NC_011766	AT	3	6	6491	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	218883322
122	NC_011766	AAT	2	6	6738	6743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218883322
123	NC_011766	AG	3	6	6920	6925	50 %	0 %	50 %	0 %	218883323
124	NC_011766	TGG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218883323
125	NC_011766	TCAT	2	8	6979	6986	25 %	50 %	0 %	25 %	218883323
126	NC_011766	TC	3	6	7027	7032	0 %	50 %	0 %	50 %	218883323
127	NC_011766	TTG	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218883323
128	NC_011766	ATTAT	2	10	7066	7075	40 %	60 %	0 %	0 %	218883323
129	NC_011766	TA	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	218883323
130	NC_011766	GCATA	2	10	7133	7142	40 %	20 %	20 %	20 %	218883323
131	NC_011766	AGC	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218883323
132	NC_011766	TA	3	6	7178	7183	50 %	50 %	0 %	0 %	218883323
133	NC_011766	TC	3	6	7192	7197	0 %	50 %	0 %	50 %	218883323
134	NC_011766	TA	3	6	7238	7243	50 %	50 %	0 %	0 %	218883323
135	NC_011766	CTT	2	6	7288	7293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218883323
136	NC_011766	TA	3	6	7522	7527	50 %	50 %	0 %	0 %	218883323
137	NC_011766	T	6	6	7563	7568	0 %	100 %	0 %	0 %	218883323
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