MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Delftia acidovorans SPH-1 chromosome

Total Repeats: 160519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010002	TCA	2	6	157447	157452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895592
4002	NC_010002	GC	3	6	157462	157467	0 %	0 %	50 %	50 %	160895592
4003	NC_010002	GTT	2	6	157475	157480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160895592
4004	NC_010002	GTC	2	6	157502	157507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895592
4005	NC_010002	GCG	2	6	157513	157518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895592
4006	NC_010002	GAC	2	6	157529	157534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895592
4007	NC_010002	CAG	2	6	157553	157558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895592
4008	NC_010002	CGGCC	2	10	157571	157580	0 %	0 %	40 %	60 %	160895592
4009	NC_010002	CG	3	6	157585	157590	0 %	0 %	50 %	50 %	160895592
4010	NC_010002	GCGG	3	12	157618	157629	0 %	0 %	75 %	25 %	160895592
4011	NC_010002	G	6	6	157633	157638	0 %	0 %	100 %	0 %	160895592
4012	NC_010002	GAT	2	6	157745	157750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895593
4013	NC_010002	GCC	2	6	157785	157790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4014	NC_010002	GCA	2	6	157801	157806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4015	NC_010002	GC	4	8	157809	157816	0 %	0 %	50 %	50 %	160895593
4016	NC_010002	GCC	2	6	157903	157908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4017	NC_010002	CGG	2	6	157930	157935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4018	NC_010002	GCT	2	6	157967	157972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4019	NC_010002	GCG	2	6	157975	157980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4020	NC_010002	CGG	2	6	158005	158010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4021	NC_010002	GGCG	2	8	158015	158022	0 %	0 %	75 %	25 %	160895593
4022	NC_010002	TGC	2	6	158023	158028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4023	NC_010002	GC	4	8	158053	158060	0 %	0 %	50 %	50 %	160895593
4024	NC_010002	CTG	2	6	158073	158078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4025	NC_010002	TGG	2	6	158119	158124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895593
4026	NC_010002	GCA	2	6	158147	158152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4027	NC_010002	GCG	2	6	158161	158166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4028	NC_010002	GCT	2	6	158219	158224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4029	NC_010002	GGC	2	6	158231	158236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4030	NC_010002	GCC	2	6	158240	158245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4031	NC_010002	TGC	3	9	158251	158259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4032	NC_010002	GGC	2	6	158276	158281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4033	NC_010002	CGC	2	6	158389	158394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4034	NC_010002	TGG	2	6	158395	158400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895593
4035	NC_010002	TGC	2	6	158425	158430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895593
4036	NC_010002	TGG	2	6	158437	158442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895593
4037	NC_010002	ACGGCC	2	12	158446	158457	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	160895593
4038	NC_010002	GGT	2	6	158480	158485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895593
4039	NC_010002	GCCTG	2	10	158509	158518	0 %	20 %	40 %	40 %	160895593
4040	NC_010002	CCG	2	6	158519	158524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4041	NC_010002	C	6	6	158542	158547	0 %	0 %	0 %	100 %	160895593
4042	NC_010002	GTG	2	6	158553	158558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895593
4043	NC_010002	CGG	2	6	158569	158574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4044	NC_010002	CGC	2	6	158584	158589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895593
4045	NC_010002	GCG	2	6	158636	158641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895593
4046	NC_010002	CCG	2	6	158931	158936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895594
4047	NC_010002	GCC	3	9	158956	158964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895594
4048	NC_010002	GCC	2	6	158974	158979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895594
4049	NC_010002	CGC	2	6	159047	159052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895594
4050	NC_010002	AAG	2	6	159082	159087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895594
4051	NC_010002	GAT	2	6	159111	159116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895594
4052	NC_010002	CCTGGC	2	12	159135	159146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	160895594
4053	NC_010002	CCA	3	9	159170	159178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895594
4054	NC_010002	GC	3	6	159323	159328	0 %	0 %	50 %	50 %	160895594
4055	NC_010002	GGCCT	2	10	159349	159358	0 %	20 %	40 %	40 %	160895594
4056	NC_010002	TGC	2	6	159362	159367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895594
4057	NC_010002	GGCC	2	8	159441	159448	0 %	0 %	50 %	50 %	160895594
4058	NC_010002	CCA	2	6	159485	159490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895594
4059	NC_010002	CCA	3	9	159524	159532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895594
4060	NC_010002	GCC	3	9	159595	159603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895594
4061	NC_010002	CCT	2	6	159722	159727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160895594
4062	NC_010002	TTC	2	6	159763	159768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895594
4063	NC_010002	AGG	2	6	159815	159820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895594
4064	NC_010002	CAT	2	6	159825	159830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895594
4065	NC_010002	ACG	2	6	159863	159868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895594
4066	NC_010002	CGCTCC	2	12	159969	159980	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	160895595
4067	NC_010002	CGC	2	6	159981	159986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895595
4068	NC_010002	CCG	4	12	160002	160013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895595
4069	NC_010002	CTT	2	6	160068	160073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895595
4070	NC_010002	TTCT	2	8	160081	160088	0 %	75 %	0 %	25 %	160895595
4071	NC_010002	GGC	2	6	160095	160100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895595
4072	NC_010002	GGC	2	6	160111	160116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895595
4073	NC_010002	GC	3	6	160156	160161	0 %	0 %	50 %	50 %	160895595
4074	NC_010002	TGC	2	6	160169	160174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895595
4075	NC_010002	GGC	2	6	160231	160236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895595
4076	NC_010002	CTT	2	6	160305	160310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895595
4077	NC_010002	CGGCCT	2	12	160343	160354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	160895595
4078	NC_010002	GCT	2	6	160362	160367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895595
4079	NC_010002	GCT	2	6	160401	160406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895595
4080	NC_010002	TGG	2	6	160445	160450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895595
4081	NC_010002	GCG	2	6	160463	160468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895595
4082	NC_010002	CG	3	6	160467	160472	0 %	0 %	50 %	50 %	160895595
4083	NC_010002	TGG	2	6	160481	160486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895595
4084	NC_010002	GCC	2	6	160489	160494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895595
4085	NC_010002	GTG	2	6	160522	160527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895595
4086	NC_010002	CGC	2	6	160528	160533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895595
4087	NC_010002	GCGCC	2	10	160547	160556	0 %	0 %	40 %	60 %	160895595
4088	NC_010002	GCTGG	2	10	160584	160593	0 %	20 %	60 %	20 %	160895595
4089	NC_010002	GCT	2	6	160671	160676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895595
4090	NC_010002	ATC	2	6	160690	160695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895595
4091	NC_010002	CAT	2	6	160701	160706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895595
4092	NC_010002	TGA	2	6	160786	160791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895595
4093	NC_010002	CTG	2	6	160794	160799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4094	NC_010002	CTG	2	6	160857	160862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4095	NC_010002	CCA	2	6	160930	160935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895596
4096	NC_010002	TGC	2	6	160936	160941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4097	NC_010002	GCG	2	6	160947	160952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895596
4098	NC_010002	TGC	2	6	160981	160986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4099	NC_010002	CGGGC	2	10	161006	161015	0 %	0 %	60 %	40 %	160895596
4100	NC_010002	CCGA	2	8	161017	161024	25 %	0 %	25 %	50 %	160895596
4101	NC_010002	ACT	2	6	161137	161142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895596
4102	NC_010002	AGC	2	6	161188	161193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4103	NC_010002	GCA	2	6	161207	161212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4104	NC_010002	GC	5	10	161226	161235	0 %	0 %	50 %	50 %	160895596
4105	NC_010002	GCT	3	9	161315	161323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4106	NC_010002	CGA	2	6	161375	161380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4107	NC_010002	GC	4	8	161416	161423	0 %	0 %	50 %	50 %	160895596
4108	NC_010002	GCT	2	6	161553	161558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895596
4109	NC_010002	ACG	2	6	161631	161636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4110	NC_010002	CAG	2	6	161661	161666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4111	NC_010002	TGC	2	6	161680	161685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4112	NC_010002	CGGC	2	8	161710	161717	0 %	0 %	50 %	50 %	160895597
4113	NC_010002	CG	3	6	161781	161786	0 %	0 %	50 %	50 %	160895597
4114	NC_010002	GCT	2	6	161870	161875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4115	NC_010002	ACC	2	6	161920	161925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895597
4116	NC_010002	GGC	3	9	161969	161977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895597
4117	NC_010002	ACG	2	6	162037	162042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4118	NC_010002	TGG	2	6	162172	162177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895597
4119	NC_010002	TGC	2	6	162184	162189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4120	NC_010002	GC	3	6	162204	162209	0 %	0 %	50 %	50 %	160895597
4121	NC_010002	CTGACG	2	12	162240	162251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4122	NC_010002	CGC	2	6	162252	162257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895597
4123	NC_010002	CGG	2	6	162344	162349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895597
4124	NC_010002	ACG	2	6	162355	162360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895597
4125	NC_010002	TCCCG	2	10	162509	162518	0 %	20 %	20 %	60 %	160895598
4126	NC_010002	CAG	2	6	162575	162580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895598
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4130	NC_010002	GCA	2	6	162646	162651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895598
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4140	NC_010002	GGT	2	6	163021	163026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895598
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4142	NC_010002	GGCCCT	2	12	163123	163134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	160895598
4143	NC_010002	CGGC	2	8	163167	163174	0 %	0 %	50 %	50 %	160895598
4144	NC_010002	TGG	2	6	163176	163181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895598
4145	NC_010002	CG	3	6	163231	163236	0 %	0 %	50 %	50 %	160895598
4146	NC_010002	GC	3	6	163247	163252	0 %	0 %	50 %	50 %	160895598
4147	NC_010002	GCC	3	9	163277	163285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895598
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4149	NC_010002	GCCT	2	8	163388	163395	0 %	25 %	25 %	50 %	160895598
4150	NC_010002	CGC	2	6	163441	163446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895598
4151	NC_010002	GGC	2	6	163490	163495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895598
4152	NC_010002	CAT	2	6	163531	163536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895598
4153	NC_010002	GCCCTG	2	12	163538	163549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	160895598
4154	NC_010002	CTG	3	9	163586	163594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895598
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4200	NC_010002	GCTG	2	8	165327	165334	0 %	25 %	50 %	25 %	160895599
4201	NC_010002	GC	3	6	165341	165346	0 %	0 %	50 %	50 %	160895599
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4203	NC_010002	CTG	2	6	165382	165387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895599
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4221	NC_010002	TGC	2	6	166031	166036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
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4224	NC_010002	GCT	2	6	166133	166138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
4225	NC_010002	GCT	2	6	166140	166145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
4226	NC_010002	GGC	2	6	166147	166152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895600
4227	NC_010002	GGCGC	2	10	166176	166185	0 %	0 %	60 %	40 %	160895600
4228	NC_010002	GGCG	2	8	166193	166200	0 %	0 %	75 %	25 %	160895600
4229	NC_010002	GCCG	2	8	166231	166238	0 %	0 %	50 %	50 %	160895600
4230	NC_010002	TGC	2	6	166262	166267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
4231	NC_010002	GCGCT	2	10	166289	166298	0 %	20 %	40 %	40 %	160895600
4232	NC_010002	TGG	2	6	166318	166323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895600
4233	NC_010002	GC	3	6	166325	166330	0 %	0 %	50 %	50 %	160895600
4234	NC_010002	AGC	2	6	166331	166336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895600
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4237	NC_010002	CG	3	6	166371	166376	0 %	0 %	50 %	50 %	160895600
4238	NC_010002	TGC	3	9	166388	166396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
4239	NC_010002	CTG	2	6	166401	166406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895600
4240	NC_010002	GCT	2	6	166504	166509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895601
4241	NC_010002	GGCC	2	8	166544	166551	0 %	0 %	50 %	50 %	160895601
4242	NC_010002	GGA	2	6	166568	166573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895601
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4365	NC_010002	ACCAG	2	10	170772	170781	40 %	0 %	20 %	40 %	160895604
4366	NC_010002	CGG	2	6	170788	170793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895604
4367	NC_010002	GCC	2	6	170797	170802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895604
4368	NC_010002	GC	3	6	170803	170808	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
4369	NC_010002	GC	3	6	170816	170821	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
4370	NC_010002	GCA	2	6	170829	170834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895604
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4372	NC_010002	CTG	2	6	170852	170857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895604
4373	NC_010002	CTG	2	6	170864	170869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895604
4374	NC_010002	GC	4	8	170876	170883	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
4375	NC_010002	GC	3	6	170920	170925	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
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4379	NC_010002	TCCACA	2	12	170991	171002	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	160895604
4380	NC_010002	AGG	2	6	171018	171023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160895604
4381	NC_010002	GAC	2	6	171026	171031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895604
4382	NC_010002	GCCTG	2	10	171033	171042	0 %	20 %	40 %	40 %	160895604
4383	NC_010002	GCT	2	6	171067	171072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895604
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4385	NC_010002	CCAC	2	8	171114	171121	25 %	0 %	0 %	75 %	160895604
4386	NC_010002	CG	3	6	171148	171153	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
4387	NC_010002	GCG	2	6	171156	171161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895604
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4390	NC_010002	CTG	2	6	171296	171301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895604
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4394	NC_010002	CAG	2	6	171449	171454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895604
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4398	NC_010002	GGCC	2	8	171595	171602	0 %	0 %	50 %	50 %	160895604
4399	NC_010002	GGC	2	6	171619	171624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895604
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4401	NC_010002	CCCT	2	8	171744	171751	0 %	25 %	0 %	75 %	160895605
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4407	NC_010002	TGG	2	6	171947	171952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895605
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4478	NC_010002	GCAGGA	2	12	174631	174642	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	160895609
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4485	NC_010002	GCC	2	6	174909	174914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895609
4486	NC_010002	CGGC	2	8	174919	174926	0 %	0 %	50 %	50 %	160895609
4487	NC_010002	CCA	2	6	174929	174934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895609
4488	NC_010002	GGC	2	6	174971	174976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895609
4489	NC_010002	GCGG	2	8	174999	175006	0 %	0 %	75 %	25 %	160895609
4490	NC_010002	CG	3	6	175022	175027	0 %	0 %	50 %	50 %	160895609
4491	NC_010002	CAG	2	6	175103	175108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895609
4492	NC_010002	GCC	2	6	175112	175117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895609
4493	NC_010002	GGGCT	2	10	175169	175178	0 %	20 %	60 %	20 %	160895609
4494	NC_010002	CCTGCC	2	12	175180	175191	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	160895609
4495	NC_010002	GCG	2	6	175236	175241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895609
4496	NC_010002	CG	3	6	175261	175266	0 %	0 %	50 %	50 %	160895609
4497	NC_010002	CAC	2	6	175289	175294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895609
4498	NC_010002	CCT	2	6	175306	175311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160895609
4499	NC_010002	GGC	3	9	175312	175320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895609
4500	NC_010002	TCG	2	6	175365	175370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895609

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