MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009958	TCAT	2	8	38	45	25 %	50 %	0 %	25 %	159046606
2	NC_009958	AACC	2	8	133	140	50 %	0 %	0 %	50 %	159046606
3	NC_009958	ATGG	2	8	325	332	25 %	25 %	50 %	0 %	159046606
4	NC_009958	TTAC	2	8	430	437	25 %	50 %	0 %	25 %	159046606
5	NC_009958	TCTG	2	8	470	477	0 %	50 %	25 %	25 %	159046606
6	NC_009958	CGAT	2	8	3451	3458	25 %	25 %	25 %	25 %	159046607
7	NC_009958	GGAG	2	8	3980	3987	25 %	0 %	75 %	0 %	159046607
8	NC_009958	CCCT	2	8	4151	4158	0 %	25 %	0 %	75 %	159046607
9	NC_009958	GACG	2	8	4328	4335	25 %	0 %	50 %	25 %	159046607
10	NC_009958	TGGA	2	8	4498	4505	25 %	25 %	50 %	0 %	159046607
11	NC_009958	GGCT	2	8	4896	4903	0 %	25 %	50 %	25 %	159046607
12	NC_009958	GGTG	2	8	5291	5298	0 %	25 %	75 %	0 %	159046607
13	NC_009958	TTTA	2	8	5763	5770	25 %	75 %	0 %	0 %	159046607
14	NC_009958	TGCT	2	8	7655	7662	0 %	50 %	25 %	25 %	159046608
15	NC_009958	TTGT	2	8	7751	7758	0 %	75 %	25 %	0 %	159046608
16	NC_009958	CGCT	2	8	8906	8913	0 %	25 %	25 %	50 %	159046609
17	NC_009958	GACC	2	8	9089	9096	25 %	0 %	25 %	50 %	159046609
18	NC_009958	GCCC	2	8	9630	9637	0 %	0 %	25 %	75 %	159046610
19	NC_009958	CGGT	2	8	10567	10574	0 %	25 %	50 %	25 %	159046610
20	NC_009958	TCCT	2	8	10786	10793	0 %	50 %	0 %	50 %	159046610
21	NC_009958	GGGC	2	8	10983	10990	0 %	0 %	75 %	25 %	159046611
22	NC_009958	ACCT	2	8	11288	11295	25 %	25 %	0 %	50 %	159046611
23	NC_009958	CTGG	2	8	12976	12983	0 %	25 %	50 %	25 %	159046613
24	NC_009958	CGCC	2	8	13291	13298	0 %	0 %	25 %	75 %	159046613
25	NC_009958	GAAA	2	8	13341	13348	75 %	0 %	25 %	0 %	159046613
26	NC_009958	TGCG	2	8	15479	15486	0 %	25 %	50 %	25 %	159046614
27	NC_009958	CCTT	2	8	16445	16452	0 %	50 %	0 %	50 %	159046615
28	NC_009958	ACCG	2	8	16613	16620	25 %	0 %	25 %	50 %	159046615
29	NC_009958	GTCG	2	8	16798	16805	0 %	25 %	50 %	25 %	159046615
30	NC_009958	CGCT	2	8	17402	17409	0 %	25 %	25 %	50 %	159046616
31	NC_009958	CAGA	2	8	17488	17495	50 %	0 %	25 %	25 %	159046616
32	NC_009958	AGCA	2	8	17737	17744	50 %	0 %	25 %	25 %	159046616
33	NC_009958	GGCC	2	8	17797	17804	0 %	0 %	50 %	50 %	159046616
34	NC_009958	GGCT	2	8	18022	18029	0 %	25 %	50 %	25 %	159046616
35	NC_009958	CAGA	2	8	18348	18355	50 %	0 %	25 %	25 %	159046616
36	NC_009958	CGGG	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	159046617
37	NC_009958	CGAC	2	8	19440	19447	25 %	0 %	25 %	50 %	159046618
38	NC_009958	CGCC	2	8	19707	19714	0 %	0 %	25 %	75 %	159046618
39	NC_009958	AAAG	2	8	20539	20546	75 %	0 %	25 %	0 %	159046620
40	NC_009958	TGAG	2	8	21478	21485	25 %	25 %	50 %	0 %	159046623
41	NC_009958	GCCC	2	8	22174	22181	0 %	0 %	25 %	75 %	159046623
42	NC_009958	TGGT	2	8	22734	22741	0 %	50 %	50 %	0 %	159046625
43	NC_009958	GTAC	2	8	22753	22760	25 %	25 %	25 %	25 %	159046625
44	NC_009958	CGCC	2	8	24406	24413	0 %	0 %	25 %	75 %	159046626
45	NC_009958	GATT	2	8	24447	24454	25 %	50 %	25 %	0 %	159046626
46	NC_009958	GGCC	2	8	24469	24476	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
47	NC_009958	CTTT	2	8	24487	24494	0 %	75 %	0 %	25 %	159046626
48	NC_009958	CCGG	2	8	24883	24890	0 %	0 %	50 %	50 %	159046626
49	NC_009958	ACAA	2	8	25206	25213	75 %	0 %	0 %	25 %	159046626
50	NC_009958	CAAT	2	8	30508	30515	50 %	25 %	0 %	25 %	159046631
51	NC_009958	GCCA	2	8	30842	30849	25 %	0 %	25 %	50 %	159046631
52	NC_009958	CTGG	2	8	33531	33538	0 %	25 %	50 %	25 %	159046633
53	NC_009958	GATC	2	8	33576	33583	25 %	25 %	25 %	25 %	159046633
54	NC_009958	CTGA	2	8	34195	34202	25 %	25 %	25 %	25 %	159046634
55	NC_009958	GCAG	2	8	34318	34325	25 %	0 %	50 %	25 %	159046634
56	NC_009958	CCGG	2	8	34904	34911	0 %	0 %	50 %	50 %	159046634
57	NC_009958	GCTG	2	8	36038	36045	0 %	25 %	50 %	25 %	159046635
58	NC_009958	TGGA	2	8	36256	36263	25 %	25 %	50 %	0 %	159046635
59	NC_009958	GACG	2	8	36519	36526	25 %	0 %	50 %	25 %	159046636
60	NC_009958	CCGA	2	8	37893	37900	25 %	0 %	25 %	50 %	159046637
61	NC_009958	CGAT	2	8	40128	40135	25 %	25 %	25 %	25 %	159046639
62	NC_009958	GACA	2	8	40266	40273	50 %	0 %	25 %	25 %	159046639
63	NC_009958	CCAC	2	8	40572	40579	25 %	0 %	0 %	75 %	159046639
64	NC_009958	GGAG	2	8	40951	40958	25 %	0 %	75 %	0 %	159046639
65	NC_009958	CTGC	2	8	41051	41058	0 %	25 %	25 %	50 %	159046639
66	NC_009958	TCGG	2	8	41069	41076	0 %	25 %	50 %	25 %	159046639
67	NC_009958	GATC	2	8	42582	42589	25 %	25 %	25 %	25 %	159046640
68	NC_009958	GCTG	2	8	42723	42730	0 %	25 %	50 %	25 %	159046640
69	NC_009958	GACT	2	8	43572	43579	25 %	25 %	25 %	25 %	159046640
70	NC_009958	GACC	2	8	44076	44083	25 %	0 %	25 %	50 %	159046640
71	NC_009958	TGGC	2	8	46106	46113	0 %	25 %	50 %	25 %	159046642
72	NC_009958	GCGG	2	8	46645	46652	0 %	0 %	75 %	25 %	159046643
73	NC_009958	TGGG	2	8	47317	47324	0 %	25 %	75 %	0 %	159046644
74	NC_009958	ACCG	2	8	47824	47831	25 %	0 %	25 %	50 %	159046644
75	NC_009958	GCCA	2	8	48109	48116	25 %	0 %	25 %	50 %	159046645
76	NC_009958	GATC	2	8	48414	48421	25 %	25 %	25 %	25 %	159046645
77	NC_009958	CGGG	2	8	48777	48784	0 %	0 %	75 %	25 %	159046645
78	NC_009958	GGGC	2	8	49156	49163	0 %	0 %	75 %	25 %	159046646
79	NC_009958	GGGC	2	8	49376	49383	0 %	0 %	75 %	25 %	159046646
80	NC_009958	CCTG	2	8	49411	49418	0 %	25 %	25 %	50 %	159046646
81	NC_009958	CGCC	2	8	49576	49583	0 %	0 %	25 %	75 %	159046646
82	NC_009958	GGTC	2	8	50207	50214	0 %	25 %	50 %	25 %	159046647
83	NC_009958	GGCG	2	8	51577	51584	0 %	0 %	75 %	25 %	159046648
84	NC_009958	GCTG	2	8	51876	51883	0 %	25 %	50 %	25 %	159046649
85	NC_009958	CGCC	2	8	51956	51963	0 %	0 %	25 %	75 %	159046649
86	NC_009958	TCGG	2	8	52171	52178	0 %	25 %	50 %	25 %	159046649
87	NC_009958	GGCG	2	8	52709	52716	0 %	0 %	75 %	25 %	159046650
88	NC_009958	GGCG	2	8	53597	53604	0 %	0 %	75 %	25 %	159046650
89	NC_009958	GCCT	2	8	53613	53620	0 %	25 %	25 %	50 %	159046650
90	NC_009958	GCCC	2	8	54260	54267	0 %	0 %	25 %	75 %	159046650
91	NC_009958	CCGA	2	8	54566	54573	25 %	0 %	25 %	50 %	159046650
92	NC_009958	GCGG	2	8	54883	54890	0 %	0 %	75 %	25 %	159046650
93	NC_009958	CCAT	2	8	54992	54999	25 %	25 %	0 %	50 %	159046651
94	NC_009958	CGGC	2	8	57133	57140	0 %	0 %	50 %	50 %	159046652
95	NC_009958	CAAC	2	8	58787	58794	50 %	0 %	0 %	50 %	159046652
96	NC_009958	CAAC	2	8	60350	60357	50 %	0 %	0 %	50 %	159046653
97	NC_009958	CGCT	2	8	61518	61525	0 %	25 %	25 %	50 %	159046654
98	NC_009958	ATCC	2	8	61543	61550	25 %	25 %	0 %	50 %	159046654
99	NC_009958	CGAT	2	8	62626	62633	25 %	25 %	25 %	25 %	159046655
100	NC_009958	GGAG	2	8	63155	63162	25 %	0 %	75 %	0 %	159046655
101	NC_009958	CCCT	2	8	63326	63333	0 %	25 %	0 %	75 %	159046655
102	NC_009958	GACG	2	8	63503	63510	25 %	0 %	50 %	25 %	159046655
103	NC_009958	TGGA	2	8	63673	63680	25 %	25 %	50 %	0 %	159046655
104	NC_009958	GGCT	2	8	64071	64078	0 %	25 %	50 %	25 %	159046655
105	NC_009958	GCCT	2	8	65871	65878	0 %	25 %	25 %	50 %	159046656
106	NC_009958	GTCC	2	8	66243	66250	0 %	25 %	25 %	50 %	159046656
107	NC_009958	CATG	2	8	66656	66663	25 %	25 %	25 %	25 %	159046657
108	NC_009958	TGGC	2	8	67488	67495	0 %	25 %	50 %	25 %	159046658
109	NC_009958	TGAC	2	8	68034	68041	25 %	25 %	25 %	25 %	159046658
110	NC_009958	CGCC	2	8	68198	68205	0 %	0 %	25 %	75 %	159046659
111	NC_009958	CACC	2	8	68386	68393	25 %	0 %	0 %	75 %	159046659
112	NC_009958	CCCG	2	8	68596	68603	0 %	0 %	25 %	75 %	159046659
113	NC_009958	CTCG	2	8	68698	68705	0 %	25 %	25 %	50 %	159046659
114	NC_009958	ATGC	2	8	68936	68943	25 %	25 %	25 %	25 %	159046659
115	NC_009958	CGGC	2	8	69145	69152	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
116	NC_009958	CTGC	2	8	70921	70928	0 %	25 %	25 %	50 %	159046661
117	NC_009958	CGGG	2	8	71141	71148	0 %	0 %	75 %	25 %	159046661
118	NC_009958	TTCC	2	8	72059	72066	0 %	50 %	0 %	50 %	159046662
119	NC_009958	GTCA	2	8	72567	72574	25 %	25 %	25 %	25 %	159046662
120	NC_009958	CCAG	2	8	73137	73144	25 %	0 %	25 %	50 %	159046663
121	NC_009958	CCAG	2	8	74375	74382	25 %	0 %	25 %	50 %	159046664
122	NC_009958	TGGC	2	8	74693	74700	0 %	25 %	50 %	25 %	159046665
123	NC_009958	ACCA	2	8	74755	74762	50 %	0 %	0 %	50 %	159046665
124	NC_009958	CGGG	2	8	74956	74963	0 %	0 %	75 %	25 %	159046665
125	NC_009958	CGGG	2	8	75936	75943	0 %	0 %	75 %	25 %	159046666
126	NC_009958	GCCC	2	8	76915	76922	0 %	0 %	25 %	75 %	159046667
127	NC_009958	CGGG	2	8	77132	77139	0 %	0 %	75 %	25 %	159046667
128	NC_009958	CCGT	2	8	78125	78132	0 %	25 %	25 %	50 %	159046668
129	NC_009958	ATCC	2	8	78328	78335	25 %	25 %	0 %	50 %	159046669
130	NC_009958	TCGA	2	8	78896	78903	25 %	25 %	25 %	25 %	159046669
131	NC_009958	AGGT	2	8	79070	79077	25 %	25 %	50 %	0 %	159046669
132	NC_009958	TCGG	2	8	79151	79158	0 %	25 %	50 %	25 %	159046669
133	NC_009958	CCAG	2	8	79173	79180	25 %	0 %	25 %	50 %	159046669
134	NC_009958	GCCA	2	8	79854	79861	25 %	0 %	25 %	50 %	159046670
135	NC_009958	GATG	2	8	79889	79896	25 %	25 %	50 %	0 %	159046670
136	NC_009958	CCCG	2	8	80077	80084	0 %	0 %	25 %	75 %	159046670
137	NC_009958	CCCG	2	8	80163	80170	0 %	0 %	25 %	75 %	159046670
138	NC_009958	CGGT	2	8	80362	80369	0 %	25 %	50 %	25 %	159046670
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.