MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI04

Total Repeats: 1314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009958	AGC	2	6	67359	67364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046658
1002	NC_009958	TGT	2	6	67379	67384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046658
1003	NC_009958	G	7	7	67415	67421	0 %	0 %	100 %	0 %	159046658
1004	NC_009958	TGGC	2	8	67488	67495	0 %	25 %	50 %	25 %	159046658
1005	NC_009958	CAC	2	6	67527	67532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046658
1006	NC_009958	AGG	2	6	67691	67696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046658
1007	NC_009958	GCA	2	6	67731	67736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046658
1008	NC_009958	GCT	2	6	67756	67761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046658
1009	NC_009958	CGC	2	6	67800	67805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046658
1010	NC_009958	GGC	3	9	67911	67919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046658
1011	NC_009958	TGAC	2	8	68034	68041	25 %	25 %	25 %	25 %	159046658
1012	NC_009958	CCG	2	6	68076	68081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046659
1013	NC_009958	GC	3	6	68103	68108	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1014	NC_009958	GC	3	6	68134	68139	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1015	NC_009958	ATC	2	6	68177	68182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046659
1016	NC_009958	CGCC	2	8	68198	68205	0 %	0 %	25 %	75 %	159046659
1017	NC_009958	CTG	2	6	68282	68287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046659
1018	NC_009958	TGG	3	9	68301	68309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046659
1019	NC_009958	GTC	2	6	68352	68357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046659
1020	NC_009958	CACC	2	8	68386	68393	25 %	0 %	0 %	75 %	159046659
1021	NC_009958	TGG	3	9	68409	68417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046659
1022	NC_009958	CGC	2	6	68418	68423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046659
1023	NC_009958	GC	3	6	68480	68485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1024	NC_009958	CGGGA	2	10	68504	68513	20 %	0 %	60 %	20 %	159046659
1025	NC_009958	CG	5	10	68527	68536	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1026	NC_009958	CCCG	2	8	68596	68603	0 %	0 %	25 %	75 %	159046659
1027	NC_009958	CGG	2	6	68617	68622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046659
1028	NC_009958	CTG	2	6	68654	68659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046659
1029	NC_009958	CTCG	2	8	68698	68705	0 %	25 %	25 %	50 %	159046659
1030	NC_009958	TGA	2	6	68718	68723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046659
1031	NC_009958	GGA	2	6	68806	68811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046659
1032	NC_009958	TA	3	6	68900	68905	50 %	50 %	0 %	0 %	159046659
1033	NC_009958	T	6	6	68917	68922	0 %	100 %	0 %	0 %	159046659
1034	NC_009958	ATGC	2	8	68936	68943	25 %	25 %	25 %	25 %	159046659
1035	NC_009958	GGT	2	6	68974	68979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046659
1036	NC_009958	CG	4	8	69100	69107	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1037	NC_009958	GCC	2	6	69131	69136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046659
1038	NC_009958	CGGC	2	8	69145	69152	0 %	0 %	50 %	50 %	159046659
1039	NC_009958	GCC	3	9	69220	69228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046660
1040	NC_009958	GCC	2	6	69343	69348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046660
1041	NC_009958	GGT	2	6	69491	69496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046660
1042	NC_009958	GAT	2	6	69705	69710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046660
1043	NC_009958	GA	3	6	69751	69756	50 %	0 %	50 %	0 %	159046660
1044	NC_009958	ATT	2	6	69784	69789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159046660
1045	NC_009958	CAA	2	6	69792	69797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046660
1046	NC_009958	CCA	2	6	69831	69836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046660
1047	NC_009958	CCCAG	2	10	69861	69870	20 %	0 %	20 %	60 %	159046660
1048	NC_009958	GAA	2	6	69899	69904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046660
1049	NC_009958	ACC	2	6	70057	70062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046660
1050	NC_009958	GC	3	6	70152	70157	0 %	0 %	50 %	50 %	159046660
1051	NC_009958	AAC	2	6	70210	70215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046660
1052	NC_009958	CGA	2	6	70226	70231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046660
1053	NC_009958	CCA	2	6	70262	70267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046660
1054	NC_009958	CGA	2	6	70301	70306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046660
1055	NC_009958	GGTAC	2	10	70432	70441	20 %	20 %	40 %	20 %	159046660
1056	NC_009958	CAG	2	6	70446	70451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046660
1057	NC_009958	GCC	2	6	70558	70563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046660
1058	NC_009958	GAT	2	6	70802	70807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046661
1059	NC_009958	ATC	2	6	70881	70886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046661
1060	NC_009958	CTGC	2	8	70921	70928	0 %	25 %	25 %	50 %	159046661
1061	NC_009958	GC	3	6	70927	70932	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
1062	NC_009958	ATC	2	6	71003	71008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046661
1063	NC_009958	GC	3	6	71128	71133	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
1064	NC_009958	CGGG	2	8	71141	71148	0 %	0 %	75 %	25 %	159046661
1065	NC_009958	GCG	2	6	71163	71168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046661
1066	NC_009958	ATG	2	6	71226	71231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046661
1067	NC_009958	CG	3	6	71263	71268	0 %	0 %	50 %	50 %	159046661
1068	NC_009958	CCA	2	6	71398	71403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046661
1069	NC_009958	GCC	2	6	71425	71430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046661
1070	NC_009958	GTC	2	6	71465	71470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046661
1071	NC_009958	CAG	2	6	71507	71512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046661
1072	NC_009958	C	6	6	71527	71532	0 %	0 %	0 %	100 %	159046661
1073	NC_009958	GCC	2	6	71572	71577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046661
1074	NC_009958	GCC	2	6	71633	71638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046661
1075	NC_009958	CAG	2	6	71651	71656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046661
1076	NC_009958	CGG	2	6	71680	71685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046661
1077	NC_009958	CCA	2	6	71756	71761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046662
1078	NC_009958	GGT	2	6	71784	71789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046662
1079	NC_009958	GCC	2	6	71795	71800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046662
1080	NC_009958	CAG	2	6	71838	71843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046662
1081	NC_009958	TCGACC	2	12	71875	71886	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046662
1082	NC_009958	CGG	2	6	71900	71905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046662
1083	NC_009958	CGCGC	2	10	71931	71940	0 %	0 %	40 %	60 %	159046662
1084	NC_009958	GCG	2	6	71971	71976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046662
1085	NC_009958	TCC	2	6	72025	72030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046662
1086	NC_009958	CTG	2	6	72039	72044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046662
1087	NC_009958	TTCC	2	8	72059	72066	0 %	50 %	0 %	50 %	159046662
1088	NC_009958	CGC	2	6	72147	72152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046662
1089	NC_009958	GCC	2	6	72289	72294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046662
1090	NC_009958	GGT	2	6	72321	72326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046662
1091	NC_009958	TCT	2	6	72395	72400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046662
1092	NC_009958	CAG	2	6	72426	72431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046662
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1094	NC_009958	CCT	2	6	72536	72541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046662
1095	NC_009958	GTCA	2	8	72567	72574	25 %	25 %	25 %	25 %	159046662
1096	NC_009958	GCG	2	6	72597	72602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046662
1097	NC_009958	CG	3	6	72640	72645	0 %	0 %	50 %	50 %	159046662
1098	NC_009958	ACG	3	9	72653	72661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046662
1099	NC_009958	AGA	2	6	72700	72705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046662
1100	NC_009958	TGC	2	6	72891	72896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046663
1101	NC_009958	CCAG	2	8	73137	73144	25 %	0 %	25 %	50 %	159046663
1102	NC_009958	GTG	2	6	73249	73254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046663
1103	NC_009958	TGA	2	6	73341	73346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046663
1104	NC_009958	GCC	2	6	73370	73375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046663
1105	NC_009958	AGA	2	6	73461	73466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046663
1106	NC_009958	ATG	2	6	73506	73511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046663
1107	NC_009958	CAG	2	6	73824	73829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046664
1108	NC_009958	CAT	2	6	73911	73916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046664
1109	NC_009958	GGC	2	6	73926	73931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046664
1110	NC_009958	GCCGA	2	10	73986	73995	20 %	0 %	40 %	40 %	159046664
1111	NC_009958	GGC	2	6	74226	74231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046664
1112	NC_009958	TCGAAA	2	12	74236	74247	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159046664
1113	NC_009958	TCATG	2	10	74342	74351	20 %	40 %	20 %	20 %	159046664
1114	NC_009958	CCAG	2	8	74375	74382	25 %	0 %	25 %	50 %	159046664
1115	NC_009958	CGG	2	6	74395	74400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046664
1116	NC_009958	GGCGC	2	10	74415	74424	0 %	0 %	60 %	40 %	159046664
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1119	NC_009958	TGG	2	6	74711	74716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046665
1120	NC_009958	ACCA	2	8	74755	74762	50 %	0 %	0 %	50 %	159046665
1121	NC_009958	CTG	2	6	74791	74796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046665
1122	NC_009958	CTT	2	6	74817	74822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046665
1123	NC_009958	GCC	3	9	74854	74862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046665
1124	NC_009958	CTG	2	6	74920	74925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046665
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